EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAMXG00000000568 (Gene tree)
Gene ID: 103026464
Gene Symbol: eftud2
Alias: wu:fi20f05|zgc:66214
Full Name: elongation factor Tu GTP binding domain containing 2
Gene Type: protein_coding
Species: Astyanax_mexicanus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 27741 bases
Position: chr2:4363021-4390761
Accession: 103026464
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAMXP00000000576	GTP_EFTU	PF00009.27	2.4e-45	1	1
ENSAMXP00000000576	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	6.2e-13	1	1
ENSAMXP00000000576	EFG_IV	PF03764.18	1.3e-24	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAMXT00000000576	-	4250	XM_007256294	ENSAMXP00000000576	977 (aa)	XP_007256356	W5JZ16

Gene Model

Click here to download ENSAMXG00000000568's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
amex03040	Spliceosome	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSAMXG00000000568's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSAMXG00000000568	eftud2	88	37.808	ENSAMXG00000006645	eef2b	99	37.808
ENSAMXG00000000568	eftud2	83	31.690	ENSAMXG00000019529	efl1	86	31.690

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.607	ENSG00000108883	EFTUD2	100	100.000	Homo_sapiens
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	94.882	ENSAPOG00000002433	eftud2	100	94.882	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.607	ENSAMEG00000018390	EFTUD2	100	91.709	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.300	ENSACIG00000009096	eftud2	100	91.300	Amphilophus_citrinellus
ENSAMXG00000000568	eftud2	87	91.176	ENSAOCG00000023385	eftud2	100	91.176	Amphiprion_ocellaris
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	94.780	ENSAPEG00000003321	eftud2	100	94.780	Amphiprion_percula
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	95.706	ENSATEG00000000457	eftud2	100	95.706	Anabas_testudineus
ENSAMXG00000000568	eftud2	99	88.012	ENSAPLG00000011036	EFTUD2	99	88.115	Anas_platyrhynchos
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.198	ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	91.198	Anolis_carolinensis
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.607	ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	91.709	Aotus_nancymaae
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	94.473	ENSACLG00000001296	eftud2	100	94.473	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.505	ENSBTAG00000013526	EFTUD2	100	91.505	Bos_taurus
ENSAMXG00000000568	eftud2	99	70.000	WBGene00001166	eftu-2	99	70.000	Caenorhabditis_elegans
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.607	ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	91.709	Callithrix_jacchus
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.607	ENSCAFG00000014065	EFTUD2	100	91.709	Canis_familiaris
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.607	ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	91.709	Canis_lupus_dingo
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.505	ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	91.505	Capra_hircus
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.709	ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	91.709	Carlito_syrichta
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.505	ENSCAPG00000014639	EFTUD2	100	91.607	Cavia_aperea
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.505	ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	91.607	Cavia_porcellus
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.607	ENSCCAG00000035302	EFTUD2	100	91.709	Cebus_capucinus
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.607	ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	91.709	Cercocebus_atys
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.709	ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	91.709	Chinchilla_lanigera
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.607	ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	91.709	Chlorocebus_sabaeus
ENSAMXG00000000568	eftud2	91	81.644	ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	81.623	Choloepus_hoffmanni
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.300	ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	91.300	Chrysemys_picta_bellii
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	77.857	ENSCING00000009372	-	100	77.551	Ciona_intestinalis
ENSAMXG00000000568	eftud2	99	78.243	ENSCSAVG00000004985	-	99	79.599	Ciona_savignyi
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.607	ENSCANG00000026557	EFTUD2	100	91.709	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.607	ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	91.709	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.607	ENSCGRG00000003825	Eftud2	100	91.709	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	94.371	ENSCSEG00000016775	eftud2	100	94.371	Cynoglossus_semilaevis
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	94.063	ENSCVAG00000012537	eftud2	100	94.063	Cyprinodon_variegatus
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	96.315	ENSDARG00000012261	eftud2	100	96.315	Danio_rerio
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.505	ENSDNOG00000008033	EFTUD2	100	91.607	Dasypus_novemcinctus
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.607	ENSDORG00000011566	Eftud2	100	91.607	Dipodomys_ordii
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	74.668	FBgn0039566	CG4849	100	73.926	Drosophila_melanogaster
ENSAMXG00000000568	eftud2	92	98.370	ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	98.370	Echinops_telfairi
ENSAMXG00000000568	eftud2	73	93.532	ENSEBUG00000004047	-	96	87.761	Eptatretus_burgeri
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.607	ENSEASG00005010321	EFTUD2	100	91.709	Equus_asinus_asinus
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.505	ENSECAG00000019363	EFTUD2	93	91.607	Equus_caballus
ENSAMXG00000000568	eftud2	83	100.000	ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	94.575	ENSELUG00000017169	eftud2	100	94.575	Esox_lucius
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.607	ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	91.607	Felis_catus
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	90.890	ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	91.198	Ficedula_albicollis
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.402	ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	91.402	Fukomys_damarensis
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	93.859	ENSFHEG00000013479	eftud2	100	93.859	Fundulus_heteroclitus
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	94.371	ENSGMOG00000014277	eftud2	100	94.371	Gadus_morhua
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.095	ENSGALG00000000988	EFTUD2	99	94.009	Gallus_gallus
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	93.961	ENSGAFG00000002263	eftud2	100	93.961	Gambusia_affinis
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	93.961	ENSGACG00000009163	eftud2	100	93.961	Gasterosteus_aculeatus
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.607	ENSGGOG00000012999	EFTUD2	100	91.709	Gorilla_gorilla
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	94.371	ENSHBUG00000023546	eftud2	100	94.371	Haplochromis_burtoni
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	92.025	ENSHGLG00000014497	EFTUD2	100	91.300	Heterocephalus_glaber_female
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	92.025	ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	91.300	Heterocephalus_glaber_male
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	93.449	ENSHCOG00000017689	eftud2	100	93.449	Hippocampus_comes
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	97.134	ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	97.134	Ictalurus_punctatus
ENSAMXG00000000568	eftud2	91	93.694	ENSSTOG00000012188	EFTUD2	99	91.475	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAMXG00000000568	eftud2	94	94.342	ENSJJAG00000018268	Eftud2	98	94.336	Jaculus_jaculus
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	93.961	ENSKMAG00000021027	eftud2	100	93.961	Kryptolebias_marmoratus
ENSAMXG00000000568	eftud2	95	94.206	ENSLBEG00000005875	eftud2	100	96.118	Labrus_bergylta
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	92.016	ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	92.016	Latimeria_chalumnae
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	93.961	ENSLOCG00000011460	eftud2	100	93.961	Lepisosteus_oculatus
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.812	ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	91.300	Loxodonta_africana
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.607	ENSMFAG00000042655	EFTUD2	100	91.709	Macaca_fascicularis
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.607	ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	Macaca_mulatta
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.607	ENSMNEG00000037895	EFTUD2	100	91.709	Macaca_nemestrina
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.607	ENSMLEG00000032960	EFTUD2	100	91.709	Mandrillus_leucophaeus
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	95.910	ENSMAMG00000022190	eftud2	100	95.910	Mastacembelus_armatus
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	94.473	ENSMZEG00005022885	eftud2	100	94.473	Maylandia_zebra
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	90.705	ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	90.909	Meleagris_gallopavo
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.607	ENSMAUG00000021178	Eftud2	100	91.607	Mesocricetus_auratus
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.607	ENSMICG00000016592	EFTUD2	100	91.709	Microcebus_murinus
ENSAMXG00000000568	eftud2	92	74.749	ENSMOCG00000017653	-	90	74.637	Microtus_ochrogaster
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.607	ENSMOCG00000009039	-	100	91.607	Microtus_ochrogaster
ENSAMXG00000000568	eftud2	87	97.412	ENSMMOG00000020811	eftud2	100	97.412	Mola_mola
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.709	ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	91.709	Monodelphis_domestica
ENSAMXG00000000568	eftud2	87	95.412	ENSMALG00000014501	eftud2	100	95.412	Monopterus_albus
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.505	MGP_CAROLIEiJ_G0017263	Eftud2	100	91.607	Mus_caroli
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.812	ENSMUSG00000020929	Eftud2	100	91.812	Mus_musculus
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.505	MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	91.607	Mus_pahari
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.505	MGP_SPRETEiJ_G0018106	Eftud2	100	91.607	Mus_spretus
ENSAMXG00000000568	eftud2	97	91.254	ENSMPUG00000009136	EFTUD2	90	91.254	Mustela_putorius_furo
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.607	ENSMLUG00000012164	EFTUD2	99	91.709	Myotis_lucifugus
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.607	ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	91.505	Nannospalax_galili
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	94.371	ENSNBRG00000020081	eftud2	100	94.371	Neolamprologus_brichardi
ENSAMXG00000000568	eftud2	97	89.535	ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	89.641	Nomascus_leucogenys
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	88.025	ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	88.025	Notamacropus_eugenii
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	83.828	ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	83.726	Ochotona_princeps
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.505	ENSODEG00000018041	-	100	91.198	Octodon_degus
ENSAMXG00000000568	eftud2	93	75.897	ENSODEG00000003385	-	100	76.006	Octodon_degus
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	94.473	ENSONIG00000000912	eftud2	100	94.473	Oreochromis_niloticus
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.607	ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	91.709	Oryctolagus_cuniculus
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	93.961	ENSORLG00000003109	eftud2	100	93.961	Oryzias_latipes
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	93.859	ENSORLG00020009865	eftud2	100	93.859	Oryzias_latipes_hni
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	93.859	ENSORLG00015002611	eftud2	100	96.950	Oryzias_latipes_hsok
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	89.867	ENSOGAG00000012918	EFTUD2	100	89.969	Otolemur_garnettii
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.505	ENSOARG00000009078	EFTUD2	97	91.505	Ovis_aries
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.607	ENSPPAG00000029450	EFTUD2	100	91.812	Pan_paniscus
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.607	ENSPPRG00000010981	EFTUD2	100	91.709	Panthera_pardus
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.607	ENSPTIG00000007703	EFTUD2	100	91.709	Panthera_tigris_altaica
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.607	ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	91.812	Pan_troglodytes
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.607	ENSPANG00000021284	EFTUD2	100	91.709	Papio_anubis
ENSAMXG00000000568	eftud2	93	89.474	ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	89.693	Pelodiscus_sinensis
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	86.708	ENSPMGG00000007281	eftud2	100	86.708	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.505	ENSPEMG00000005129	Eftud2	100	91.505	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.709	ENSPCIG00000015027	EFTUD2	100	91.709	Phascolarctos_cinereus
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	93.961	ENSPFOG00000008515	eftud2	100	93.961	Poecilia_formosa
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	93.961	ENSPLAG00000010393	eftud2	100	93.961	Poecilia_latipinna
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	93.961	ENSPMEG00000005087	eftud2	100	93.961	Poecilia_mexicana
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	90.276	ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	90.379	Pongo_abelii
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	88.025	ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	87.718	Procavia_capensis
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.607	ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	91.709	Propithecus_coquereli
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	87.206	ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	87.308	Pteropus_vampyrus
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	94.473	ENSPNYG00000012448	eftud2	100	94.473	Pundamilia_nyererei
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	97.748	ENSPNAG00000012490	eftud2	100	97.748	Pygocentrus_nattereri
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.914	ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	91.914	Rattus_norvegicus
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.505	ENSRBIG00000043255	EFTUD2	100	91.607	Rhinopithecus_bieti
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.505	ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	91.607	Rhinopithecus_roxellana
ENSAMXG00000000568	eftud2	97	33.959	YKL173W	SNU114	91	34.644	Saccharomyces_cerevisiae
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.607	ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	91.709	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSAMXG00000000568	eftud2	94	94.342	ENSSHAG00000008134	EFTUD2	98	94.336	Sarcophilus_harrisii
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	95.087	ENSSFOG00015023272	eftud2	100	95.087	Scleropages_formosus
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	93.756	ENSSMAG00000010174	eftud2	100	93.756	Scophthalmus_maximus
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	94.780	ENSSDUG00000022675	eftud2	100	94.780	Seriola_dumerili
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	94.882	ENSSLDG00000001595	eftud2	100	94.882	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	83.521	ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	83.419	Sorex_araneus
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	90.788	ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	90.788	Sphenodon_punctatus
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	94.575	ENSSPAG00000016235	eftud2	99	94.575	Stegastes_partitus
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.607	ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	91.607	Sus_scrofa
ENSAMXG00000000568	eftud2	82	92.902	ENSTGUG00000002065	EFTUD2	98	92.893	Taeniopygia_guttata
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	93.040	ENSTRUG00000016422	eftud2	100	93.040	Takifugu_rubripes
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	88.379	ENSTNIG00000005346	eftud2	99	88.379	Tetraodon_nigroviridis
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	86.285	ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	86.387	Tupaia_belangeri
ENSAMXG00000000568	eftud2	90	90.465	ENSTTRG00000006230	EFTUD2	91	90.465	Tursiops_truncatus
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	90.993	ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	90.993	Ursus_americanus
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.607	ENSUMAG00000014323	EFTUD2	100	91.709	Ursus_maritimus
ENSAMXG00000000568	eftud2	88	100.000	ENSVPAG00000002748	EFTUD2	88	100.000	Vicugna_pacos
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.607	ENSVVUG00000018113	EFTUD2	100	91.709	Vulpes_vulpes
ENSAMXG00000000568	eftud2	96	92.234	ENSXETG00000003394	eftud2	98	93.464	Xenopus_tropicalis
ENSAMXG00000000568	eftud2	80	96.811	ENSXCOG00000017309	eftud2	96	96.811	Xiphophorus_couchianus
ENSAMXG00000000568	eftud2	100	93.961	ENSXMAG00000008494	eftud2	100	93.961	Xiphophorus_maculatus