EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAMXG00000001190 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: si:dkey-98f17.5
Alias: -
Full Name: uncharacterized LOC103046678
Gene Type: protein_coding
Species: Astyanax_mexicanus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 31765 bases
Position: chrAPWO02000130.1:754212-785976
Accession: 103046678
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAMXP00000001215	MMR_HSR1	PF01926.23	3.5e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAMXT00000001215	-	1350	XM_022667290	ENSAMXP00000001215	449 (aa)	XP_022523011	W5K0V5

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	100	60.000	ENSAMXG00000017817	si:ch211-11k18.4	99	60.000

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	100	59.778	ENSAPOG00000018833	si:ch211-11k18.4	99	59.778	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	100	81.960	ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	100	81.960	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	100	81.737	ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	100	81.737	Amphilophus_citrinellus
ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	100	59.161	ENSACIG00000006696	si:ch211-11k18.4	99	59.161	Amphilophus_citrinellus
ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	100	82.628	ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	100	82.628	Amphiprion_ocellaris
ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	100	60.000	ENSAOCG00000014284	si:ch211-11k18.4	99	60.000	Amphiprion_ocellaris
ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	100	82.628	ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	82.628	Amphiprion_percula
ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	100	60.000	ENSAPEG00000014910	si:ch211-11k18.4	99	60.000	Amphiprion_percula
ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	100	60.000	ENSATEG00000004775	si:ch211-11k18.4	99	60.000	Anabas_testudineus
ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	100	81.514	ENSATEG00000007188	si:dkey-98f17.5	100	81.514	Anabas_testudineus
ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	100	58.940	ENSACAG00000028632	-	99	58.940	Anolis_carolinensis
ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	100	81.069	ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	100	81.069	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	100	59.867	ENSACLG00000007907	si:ch211-11k18.4	99	59.867	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	80	58.791	ENSCING00000020807	-	96	58.791	Ciona_intestinalis
ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	100	55.111	ENSCSAVG00000009987	-	100	55.111	Ciona_savignyi
ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	100	59.333	ENSCSEG00000017661	si:ch211-11k18.4	99	60.000	Cynoglossus_semilaevis
ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	99	78.700	ENSCSEG00000017512	si:dkey-98f17.5	94	80.685	Cynoglossus_semilaevis
ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	100	79.733	ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	100	79.733	Cyprinodon_variegatus
ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	100	59.333	ENSCVAG00000015346	si:ch211-11k18.4	99	59.333	Cyprinodon_variegatus
ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	100	61.333	ENSDARG00000087869	si:ch211-11k18.4	100	76.020	Danio_rerio
ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	98	83.636	ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	83.636	Danio_rerio
ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	82	53.495	ENSEBUG00000007620	si:dkey-98f17.5	99	53.495	Eptatretus_burgeri
ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	100	78.842	ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	100	78.842	Esox_lucius
ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	100	79.733	ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	100	79.733	Fundulus_heteroclitus
ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	100	60.089	ENSFHEG00000019820	si:ch211-11k18.4	99	60.089	Fundulus_heteroclitus
ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	90	54.950	ENSGMOG00000003492	si:ch211-11k18.4	100	54.950	Gadus_morhua
ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	100	80.401	ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	80.401	Gambusia_affinis
ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	100	60.222	ENSGAFG00000005677	si:ch211-11k18.4	99	60.222	Gambusia_affinis
ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	58	88.803	ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	88.803	Gasterosteus_aculeatus
ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	80	67.778	ENSGACG00000013134	si:ch211-11k18.4	100	61.386	Gasterosteus_aculeatus
ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	100	60.089	ENSHBUG00000020638	si:ch211-11k18.4	99	60.089	Haplochromis_burtoni
ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	100	80.846	ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	100	80.846	Haplochromis_burtoni
ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	99	76.351	ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	97	76.351	Hippocampus_comes
ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	100	60.000	ENSHCOG00000014773	si:ch211-11k18.4	99	60.000	Hippocampus_comes
ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	96	59.815	ENSIPUG00000016678	si:ch211-11k18.4	99	59.815	Ictalurus_punctatus
ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	100	81.514	ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	99	81.514	Ictalurus_punctatus
ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	85	58.115	ENSIPUG00000016694	si:ch211-11k18.4	84	58.115	Ictalurus_punctatus
ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	100	59.778	ENSKMAG00000009327	si:ch211-11k18.4	99	59.778	Kryptolebias_marmoratus
ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	100	81.514	ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	100	81.514	Kryptolebias_marmoratus
ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	100	79.510	ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	100	79.510	Labrus_bergylta
ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	99	68.071	ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	99	68.071	Latimeria_chalumnae
ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	99	61.124	ENSLACG00000006280	si:ch211-11k18.4	98	61.261	Latimeria_chalumnae
ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	100	62.584	ENSLACG00000004899	-	99	62.584	Latimeria_chalumnae
ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	99	72.931	ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	72.931	Lepisosteus_oculatus
ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	100	81.292	ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	100	81.292	Mastacembelus_armatus
ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	96	60.508	ENSMAMG00000002536	si:ch211-11k18.4	99	60.508	Mastacembelus_armatus
ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	100	59.645	ENSMZEG00005008941	si:ch211-11k18.4	99	59.645	Maylandia_zebra
ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	100	81.069	ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	100	81.069	Maylandia_zebra
ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	100	57.802	ENSMMOG00000012485	si:ch211-11k18.4	99	57.802	Mola_mola
ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	100	58.889	ENSMALG00000019735	si:ch211-11k18.4	99	58.889	Monopterus_albus
ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	98	80.000	ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	80.227	Monopterus_albus
ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	100	80.846	ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	80.846	Neolamprologus_brichardi
ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	96	60.369	ENSNBRG00000002220	si:ch211-11k18.4	98	60.369	Neolamprologus_brichardi
ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	100	60.089	ENSONIG00000019412	si:ch211-11k18.4	99	60.089	Oreochromis_niloticus
ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	100	81.514	ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	100	81.514	Oreochromis_niloticus
ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	100	76.837	ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	100	76.837	Oryzias_latipes
ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	100	59.556	ENSORLG00000012015	si:ch211-11k18.4	99	59.556	Oryzias_latipes
ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	100	79.065	ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	100	79.065	Oryzias_latipes_hni
ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	100	59.333	ENSORLG00020012386	si:ch211-11k18.4	99	59.333	Oryzias_latipes_hni
ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	100	79.510	ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	100	79.510	Oryzias_latipes_hsok
ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	100	60.222	ENSORLG00015022862	si:ch211-11k18.4	99	60.222	Oryzias_latipes_hsok
ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	100	80.846	ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	80.846	Oryzias_melastigma
ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	100	59.778	ENSOMEG00000018686	si:ch211-11k18.4	99	59.778	Oryzias_melastigma
ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	100	75.278	ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	75.278	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	100	57.048	ENSPKIG00000023918	-	98	57.461	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	100	57.987	ENSPKIG00000018807	si:ch211-11k18.4	99	60.000	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	100	59.778	ENSPMGG00000016507	si:ch211-11k18.4	99	59.778	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	100	77.951	ENSPMGG00000019065	si:dkey-98f17.5	100	77.951	Periophthalmus_magnuspinnatus
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