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Description

Ensembl ID: ENSAMXG00000002499 (Gene tree)
Gene ID: 103040882
Gene Symbol: aco1
Alias: IRP1|wu:fo75b03
Full Name: aconitase 1
Gene Type: protein_coding
Species: Astyanax_mexicanus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 42087 bases
Position: chrAPWO02000275.1:16034-58120
Accession: 103040882
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAMXP00000044758	Aconitase	PF00330.20	2.6e-181	1	1
ENSAMXP00000002569	Aconitase	PF00330.20	6.9e-181	1	1
ENSAMXP00000044758	Aconitase_C	PF00694.19	7.2e-46	1	1
ENSAMXP00000002569	Aconitase_C	PF00694.19	1.1e-45	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAMXT00000002569	-	4195	-	ENSAMXP00000002569	1371 (aa)	-	W5K4Q8
ENSAMXT00000056761	-	5508	XM_007255187	ENSAMXP00000044758	890 (aa)	XP_007255249	UPI000BBD6F95

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
amex00020	Citrate cycle (TCA cycle)	KEGG
amex00630	Glyoxylate and dicarboxylate metabolism	KEGG
amex01100	Metabolic pathways	KEGG
amex01200	Carbon metabolism	KEGG
amex01210	2-Oxocarboxylic acid metabolism	KEGG
amex01230	Biosynthesis of amino acids	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSAMXG00000002499	aco1	72	33.546	ENSAMXG00000015485	ACO2	82	33.546
ENSAMXG00000002499	aco1	99	63.158	ENSAMXG00000008756	ireb2	91	63.158

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAMXG00000002499	aco1	99	82.545	ENSG00000122729	ACO1	99	82.545	Homo_sapiens
ENSAMXG00000002499	aco1	100	86.180	ENSAPOG00000008670	aco1	99	86.180	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAMXG00000002499	aco1	99	82.320	ENSAMEG00000003746	ACO1	99	82.320	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAMXG00000002499	aco1	100	86.629	ENSACIG00000014377	aco1	99	86.629	Amphilophus_citrinellus
ENSAMXG00000002499	aco1	100	86.742	ENSAOCG00000007699	aco1	99	86.742	Amphiprion_ocellaris
ENSAMXG00000002499	aco1	100	86.629	ENSAPEG00000014370	aco1	99	86.629	Amphiprion_percula
ENSAMXG00000002499	aco1	100	87.640	ENSATEG00000000560	aco1	99	87.640	Anabas_testudineus
ENSAMXG00000002499	aco1	99	82.187	ENSAPLG00000015490	ACO1	99	82.187	Anas_platyrhynchos
ENSAMXG00000002499	aco1	97	81.860	ENSACAG00000001541	ACO1	99	81.860	Anolis_carolinensis
ENSAMXG00000002499	aco1	99	81.172	ENSANAG00000003359	ACO1	99	81.172	Aotus_nancymaae
ENSAMXG00000002499	aco1	100	85.955	ENSACLG00000007755	aco1	99	85.955	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000002499	aco1	99	82.995	ENSBTAG00000000555	ACO1	99	82.995	Bos_taurus
ENSAMXG00000002499	aco1	99	81.962	ENSCJAG00000007687	ACO1	99	81.869	Callithrix_jacchus
ENSAMXG00000002499	aco1	99	82.212	ENSCAFG00000001786	ACO1	99	82.002	Canis_familiaris
ENSAMXG00000002499	aco1	99	82.212	ENSCAFG00020014553	ACO1	99	82.095	Canis_lupus_dingo
ENSAMXG00000002499	aco1	99	83.108	ENSCHIG00000007667	ACO1	99	83.108	Capra_hircus
ENSAMXG00000002499	aco1	99	82.525	ENSTSYG00000004179	ACO1	99	82.432	Carlito_syrichta
ENSAMXG00000002499	aco1	99	67.117	ENSCAPG00000007254	ACO1	99	67.005	Cavia_aperea
ENSAMXG00000002499	aco1	99	82.864	ENSCPOG00000003768	ACO1	99	82.864	Cavia_porcellus
ENSAMXG00000002499	aco1	99	81.532	ENSCCAG00000022465	ACO1	99	81.532	Cebus_capucinus
ENSAMXG00000002499	aco1	99	82.095	ENSCATG00000045333	ACO1	99	82.095	Cercocebus_atys
ENSAMXG00000002499	aco1	99	81.757	ENSCLAG00000002487	ACO1	99	81.757	Chinchilla_lanigera
ENSAMXG00000002499	aco1	99	82.095	ENSCSAG00000009824	ACO1	99	82.095	Chlorocebus_sabaeus
ENSAMXG00000002499	aco1	90	65.120	ENSCHOG00000008996	ACO1	90	64.962	Choloepus_hoffmanni
ENSAMXG00000002499	aco1	99	82.864	ENSCPBG00000008077	ACO1	99	82.864	Chrysemys_picta_bellii
ENSAMXG00000002499	aco1	99	82.280	ENSCANG00000014847	ACO1	99	82.280	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAMXG00000002499	aco1	99	83.089	ENSCGRG00001024337	Aco1	99	82.995	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAMXG00000002499	aco1	99	82.074	ENSCGRG00000004877	-	99	81.982	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAMXG00000002499	aco1	99	83.465	ENSCSEG00000018262	aco1	99	83.465	Cynoglossus_semilaevis
ENSAMXG00000002499	aco1	99	78.965	ENSCVAG00000020264	aco1	99	78.965	Cyprinodon_variegatus
ENSAMXG00000002499	aco1	100	88.652	ENSDARG00000026376	aco1	100	88.652	Danio_rerio
ENSAMXG00000002499	aco1	99	82.864	ENSDNOG00000003951	ACO1	99	82.770	Dasypus_novemcinctus
ENSAMXG00000002499	aco1	99	82.883	ENSDORG00000014246	Aco1	99	82.883	Dipodomys_ordii
ENSAMXG00000002499	aco1	86	65.241	ENSETEG00000012415	-	85	65.241	Echinops_telfairi
ENSAMXG00000002499	aco1	99	58.705	ENSEBUG00000015441	aco1	97	57.219	Eptatretus_burgeri
ENSAMXG00000002499	aco1	99	83.202	ENSEASG00005004602	ACO1	99	83.108	Equus_asinus_asinus
ENSAMXG00000002499	aco1	99	83.089	ENSECAG00000014846	ACO1	99	82.995	Equus_caballus
ENSAMXG00000002499	aco1	99	71.622	ENSEEUG00000015174	ACO1	99	71.622	Erinaceus_europaeus
ENSAMXG00000002499	aco1	100	86.966	ENSELUG00000016812	aco1	97	86.966	Esox_lucius
ENSAMXG00000002499	aco1	99	82.095	ENSFCAG00000001293	ACO1	99	82.095	Felis_catus
ENSAMXG00000002499	aco1	99	82.413	ENSFALG00000001167	ACO1	99	82.413	Ficedula_albicollis
ENSAMXG00000002499	aco1	99	82.207	ENSFDAG00000016058	ACO1	99	82.207	Fukomys_damarensis
ENSAMXG00000002499	aco1	99	85.602	ENSFHEG00000005619	aco1	99	85.602	Fundulus_heteroclitus
ENSAMXG00000002499	aco1	99	82.638	ENSGMOG00000005514	aco1	99	82.638	Gadus_morhua
ENSAMXG00000002499	aco1	99	82.300	ENSGALG00000002162	ACO1	99	82.300	Gallus_gallus
ENSAMXG00000002499	aco1	99	86.374	ENSGACG00000001637	aco1	99	86.374	Gasterosteus_aculeatus
ENSAMXG00000002499	aco1	99	82.300	ENSGAGG00000023315	ACO1	99	82.300	Gopherus_agassizii
ENSAMXG00000002499	aco1	99	82.320	ENSGGOG00000016306	ACO1	99	82.320	Gorilla_gorilla
ENSAMXG00000002499	aco1	100	85.843	ENSHBUG00000008952	aco1	99	85.843	Haplochromis_burtoni
ENSAMXG00000002499	aco1	99	82.095	ENSHGLG00000018922	Aco1	99	82.095	Heterocephalus_glaber_female
ENSAMXG00000002499	aco1	99	82.095	ENSHGLG00100000149	Aco1	99	82.095	Heterocephalus_glaber_male
ENSAMXG00000002499	aco1	99	82.790	ENSHCOG00000015881	aco1	99	82.790	Hippocampus_comes
ENSAMXG00000002499	aco1	99	90.889	ENSIPUG00000020088	ACO1	99	90.889	Ictalurus_punctatus
ENSAMXG00000002499	aco1	99	82.751	ENSSTOG00000006942	ACO1	99	82.658	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAMXG00000002499	aco1	99	82.432	ENSJJAG00000013824	Aco1	99	82.432	Jaculus_jaculus
ENSAMXG00000002499	aco1	99	86.261	ENSKMAG00000015759	aco1	99	86.261	Kryptolebias_marmoratus
ENSAMXG00000002499	aco1	100	81.818	ENSLBEG00000013866	aco1	99	81.818	Labrus_bergylta
ENSAMXG00000002499	aco1	75	69.778	ENSLACG00000000936	ACO1	99	69.598	Latimeria_chalumnae
ENSAMXG00000002499	aco1	99	85.264	ENSLOCG00000011082	aco1	99	85.264	Lepisosteus_oculatus
ENSAMXG00000002499	aco1	99	80.068	ENSLAFG00000013470	ACO1	99	80.068	Loxodonta_africana
ENSAMXG00000002499	aco1	99	82.207	ENSMFAG00000001702	ACO1	99	82.207	Macaca_fascicularis
ENSAMXG00000002499	aco1	99	82.320	ENSMMUG00000008196	ACO1	99	82.320	Macaca_mulatta
ENSAMXG00000002499	aco1	99	82.095	ENSMNEG00000045040	ACO1	99	82.095	Macaca_nemestrina
ENSAMXG00000002499	aco1	99	82.320	ENSMLEG00000005636	ACO1	99	82.320	Mandrillus_leucophaeus
ENSAMXG00000002499	aco1	100	86.854	ENSMAMG00000002915	aco1	99	86.854	Mastacembelus_armatus
ENSAMXG00000002499	aco1	99	82.643	ENSMZEG00005012733	aco1	99	82.307	Maylandia_zebra
ENSAMXG00000002499	aco1	99	66.371	ENSMGAG00000008851	ACO1	99	66.371	Meleagris_gallopavo
ENSAMXG00000002499	aco1	99	82.432	ENSMAUG00000021408	Aco1	99	82.432	Mesocricetus_auratus
ENSAMXG00000002499	aco1	99	81.982	ENSMICG00000006540	ACO1	99	81.982	Microcebus_murinus
ENSAMXG00000002499	aco1	99	83.089	ENSMOCG00000015393	Aco1	99	83.089	Microtus_ochrogaster
ENSAMXG00000002499	aco1	100	85.730	ENSMMOG00000020282	aco1	99	85.730	Mola_mola
ENSAMXG00000002499	aco1	99	81.962	ENSMODG00000004463	ACO1	99	81.869	Monodelphis_domestica
ENSAMXG00000002499	aco1	100	85.843	ENSMALG00000019764	aco1	99	85.843	Monopterus_albus
ENSAMXG00000002499	aco1	99	83.221	MGP_CAROLIEiJ_G0025892	Aco1	99	83.221	Mus_caroli
ENSAMXG00000002499	aco1	99	83.315	ENSMUSG00000028405	Aco1	99	83.221	Mus_musculus
ENSAMXG00000002499	aco1	99	83.108	MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	99	83.108	Mus_pahari
ENSAMXG00000002499	aco1	99	83.427	MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	99	83.333	Mus_spretus
ENSAMXG00000002499	aco1	99	82.638	ENSMPUG00000004340	ACO1	99	82.638	Mustela_putorius_furo
ENSAMXG00000002499	aco1	99	80.947	ENSMLUG00000003029	ACO1	99	80.856	Myotis_lucifugus
ENSAMXG00000002499	aco1	99	82.864	ENSNGAG00000005703	Aco1	99	82.770	Nannospalax_galili
ENSAMXG00000002499	aco1	100	68.715	ENSNBRG00000008973	aco1	99	68.380	Neolamprologus_brichardi
ENSAMXG00000002499	aco1	99	82.545	ENSNLEG00000003409	ACO1	99	82.545	Nomascus_leucogenys
ENSAMXG00000002499	aco1	89	75.973	ENSMEUG00000014756	ACO1	89	75.973	Notamacropus_eugenii
ENSAMXG00000002499	aco1	99	78.241	ENSOPRG00000016791	ACO1	99	78.241	Ochotona_princeps
ENSAMXG00000002499	aco1	99	80.180	ENSODEG00000001240	-	99	80.180	Octodon_degus
ENSAMXG00000002499	aco1	99	77.477	ENSODEG00000015432	-	99	77.027	Octodon_degus
ENSAMXG00000002499	aco1	100	85.843	ENSONIG00000019869	aco1	99	85.843	Oreochromis_niloticus
ENSAMXG00000002499	aco1	81	83.079	ENSOANG00000012132	ACO1	99	83.079	Ornithorhynchus_anatinus
ENSAMXG00000002499	aco1	99	82.163	ENSOCUG00000015960	ACO1	99	81.940	Oryctolagus_cuniculus
ENSAMXG00000002499	aco1	100	85.056	ENSORLG00000020656	aco1	100	85.056	Oryzias_latipes
ENSAMXG00000002499	aco1	100	84.831	ENSORLG00020010991	aco1	100	84.831	Oryzias_latipes_hni
ENSAMXG00000002499	aco1	100	84.719	ENSORLG00015011785	aco1	99	84.719	Oryzias_latipes_hsok
ENSAMXG00000002499	aco1	99	84.520	ENSOMEG00000000660	aco1	99	84.520	Oryzias_melastigma
ENSAMXG00000002499	aco1	99	82.525	ENSOGAG00000010522	ACO1	99	82.525	Otolemur_garnettii
ENSAMXG00000002499	aco1	99	83.108	ENSOARG00000014707	ACO1	98	83.108	Ovis_aries
ENSAMXG00000002499	aco1	99	82.545	ENSPPAG00000033498	ACO1	99	82.545	Pan_paniscus
ENSAMXG00000002499	aco1	99	82.095	ENSPPRG00000009875	ACO1	99	82.095	Panthera_pardus
ENSAMXG00000002499	aco1	99	81.982	ENSPTIG00000016606	ACO1	98	81.982	Panthera_tigris_altaica
ENSAMXG00000002499	aco1	99	82.545	ENSPTRG00000020843	ACO1	99	82.545	Pan_troglodytes
ENSAMXG00000002499	aco1	99	82.320	ENSPANG00000025270	ACO1	99	82.320	Papio_anubis
ENSAMXG00000002499	aco1	99	84.589	ENSPKIG00000023168	aco1	99	84.589	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAMXG00000002499	aco1	99	83.766	ENSPSIG00000008030	ACO1	99	83.766	Pelodiscus_sinensis
ENSAMXG00000002499	aco1	99	86.277	ENSPMGG00000020708	aco1	99	86.277	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSAMXG00000002499	aco1	99	82.864	ENSPEMG00000018464	Aco1	99	82.770	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAMXG00000002499	aco1	99	80.631	ENSPCIG00000029321	ACO1	99	81.418	Phascolarctos_cinereus
ENSAMXG00000002499	aco1	99	84.814	ENSPFOG00000013405	aco1	99	84.814	Poecilia_formosa
ENSAMXG00000002499	aco1	90	85.518	ENSPLAG00000023422	aco1	98	85.518	Poecilia_latipinna
ENSAMXG00000002499	aco1	90	85.430	ENSPMEG00000011800	aco1	98	85.430	Poecilia_mexicana
ENSAMXG00000002499	aco1	99	84.927	ENSPREG00000021791	aco1	99	84.927	Poecilia_reticulata
ENSAMXG00000002499	aco1	99	82.095	ENSPPYG00000019150	ACO1	95	82.095	Pongo_abelii
ENSAMXG00000002499	aco1	78	86.792	ENSPCAG00000013222	ACO1	91	86.792	Procavia_capensis
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