EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAMXG00000004157 (Gene tree)
Gene ID: 103036157
Gene Symbol: tyw1
Alias: im:6898509|wu:fb74d01|zgc:153368
Full Name: S-adenosyl-L-methionine-dependent tRNA 4-demethylwyosine synthase
Gene Type: protein_coding
Species: Astyanax_mexicanus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 84873 bases
Position: chr1:23741105-23825977
Accession: 103036157
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAMXP00000004282	Wyosine_form	PF08608.12	1.9e-28	1	1
ENSAMXP00000004285	Wyosine_form	PF08608.12	2e-28	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAMXT00000004282	-	2049	-	ENSAMXP00000004282	682 (aa)	-	W5K9M1
ENSAMXT00000004285	-	2184	XM_007248655	ENSAMXP00000004285	727 (aa)	XP_007248717	W5K9M4

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAMXG00000004157	tyw1	97	64.933	ENSG00000277149	TYW1B	98	64.053	Homo_sapiens
ENSAMXG00000004157	tyw1	98	68.000	ENSG00000198874	TYW1	98	68.560	Homo_sapiens
ENSAMXG00000004157	tyw1	99	77.040	ENSAPOG00000014391	tyw1	96	76.210	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAMXG00000004157	tyw1	98	74.444	ENSACIG00000007325	tyw1	99	73.296	Amphilophus_citrinellus
ENSAMXG00000004157	tyw1	99	76.796	ENSAOCG00000016792	tyw1	96	76.243	Amphiprion_ocellaris
ENSAMXG00000004157	tyw1	99	76.796	ENSAPEG00000015939	tyw1	97	75.721	Amphiprion_percula
ENSAMXG00000004157	tyw1	89	75.688	ENSATEG00000006856	tyw1	91	73.242	Anabas_testudineus
ENSAMXG00000004157	tyw1	98	68.837	ENSANAG00000037051	-	98	67.590	Aotus_nancymaae
ENSAMXG00000004157	tyw1	99	75.510	ENSACLG00000018688	tyw1	97	74.523	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000004157	tyw1	98	68.603	ENSBTAG00000008446	TYW1	98	68.239	Bos_taurus
ENSAMXG00000004157	tyw1	98	68.560	ENSCJAG00000004295	-	98	68.006	Callithrix_jacchus
ENSAMXG00000004157	tyw1	98	68.156	ENSCAFG00000010867	-	98	67.877	Canis_familiaris
ENSAMXG00000004157	tyw1	97	63.664	ENSCAFG00020005367	-	99	63.610	Canis_lupus_dingo
ENSAMXG00000004157	tyw1	98	69.295	ENSCHIG00000019510	-	98	68.880	Capra_hircus
ENSAMXG00000004157	tyw1	89	66.565	ENSTSYG00000008236	-	95	73.669	Carlito_syrichta
ENSAMXG00000004157	tyw1	91	66.032	ENSCAPG00000013569	-	98	66.188	Cavia_aperea
ENSAMXG00000004157	tyw1	97	65.655	ENSCPOG00000011182	-	98	65.158	Cavia_porcellus
ENSAMXG00000004157	tyw1	98	68.421	ENSCCAG00000026643	-	98	67.036	Cebus_capucinus
ENSAMXG00000004157	tyw1	98	67.724	ENSCATG00000043677	-	98	68.283	Cercocebus_atys
ENSAMXG00000004157	tyw1	98	66.391	ENSCLAG00000006321	-	98	66.391	Chinchilla_lanigera
ENSAMXG00000004157	tyw1	98	62.610	ENSCSAG00000018274	-	98	68.908	Chlorocebus_sabaeus
ENSAMXG00000004157	tyw1	53	85.470	ENSCHOG00000003801	-	56	85.470	Choloepus_hoffmanni
ENSAMXG00000004157	tyw1	99	70.685	ENSCPBG00000014896	-	96	75.830	Chrysemys_picta_bellii
ENSAMXG00000004157	tyw1	86	59.459	ENSCING00000004125	-	97	59.831	Ciona_intestinalis
ENSAMXG00000004157	tyw1	93	55.000	ENSCSAVG00000005712	-	100	55.162	Ciona_savignyi
ENSAMXG00000004157	tyw1	98	67.586	ENSCANG00000033209	-	98	68.144	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAMXG00000004157	tyw1	70	77.829	ENSCGRG00001003679	Tyw1	85	78.923	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAMXG00000004157	tyw1	99	75.451	ENSCSEG00000005810	tyw1	95	74.896	Cynoglossus_semilaevis
ENSAMXG00000004157	tyw1	88	74.923	ENSCVAG00000001054	tyw1	92	74.691	Cyprinodon_variegatus
ENSAMXG00000004157	tyw1	100	82.329	ENSDARG00000062987	tyw1	97	82.329	Danio_rerio
ENSAMXG00000004157	tyw1	98	68.889	ENSDNOG00000024165	-	98	69.167	Dasypus_novemcinctus
ENSAMXG00000004157	tyw1	98	63.501	ENSDORG00000014772	Tyw1	97	63.205	Dipodomys_ordii
ENSAMXG00000004157	tyw1	65	72.222	ENSEBUG00000004494	tyw1	74	72.222	Eptatretus_burgeri
ENSAMXG00000004157	tyw1	98	68.560	ENSEASG00005008818	-	98	68.698	Equus_asinus_asinus
ENSAMXG00000004157	tyw1	98	62.050	ENSECAG00000023164	-	98	59.695	Equus_caballus
ENSAMXG00000004157	tyw1	60	81.633	ENSEEUG00000005950	-	53	81.633	Erinaceus_europaeus
ENSAMXG00000004157	tyw1	99	75.552	ENSELUG00000008449	tyw1	98	71.752	Esox_lucius
ENSAMXG00000004157	tyw1	98	68.150	ENSFCAG00000014262	-	98	67.082	Felis_catus
ENSAMXG00000004157	tyw1	99	65.527	ENSFALG00000013810	-	99	64.876	Ficedula_albicollis
ENSAMXG00000004157	tyw1	98	66.528	ENSFDAG00000013270	-	98	66.389	Fukomys_damarensis
ENSAMXG00000004157	tyw1	88	76.873	ENSFHEG00000020824	tyw1	85	71.689	Fundulus_heteroclitus
ENSAMXG00000004157	tyw1	100	65.600	ENSGALG00000001110	-	100	66.443	Gallus_gallus
ENSAMXG00000004157	tyw1	99	72.329	ENSGACG00000012692	tyw1	99	72.702	Gasterosteus_aculeatus
ENSAMXG00000004157	tyw1	99	70.082	ENSGAGG00000022393	-	99	69.589	Gopherus_agassizii
ENSAMXG00000004157	tyw1	88	60.709	ENSGGOG00000001473	TYW1	98	59.938	Gorilla_gorilla
ENSAMXG00000004157	tyw1	99	75.441	ENSHBUG00000002640	tyw1	97	74.387	Haplochromis_burtoni
ENSAMXG00000004157	tyw1	93	69.340	ENSHGLG00000012093	-	100	69.340	Heterocephalus_glaber_female
ENSAMXG00000004157	tyw1	98	67.822	ENSHGLG00100011743	TYW1	98	67.822	Heterocephalus_glaber_male
ENSAMXG00000004157	tyw1	99	65.678	ENSHCOG00000019949	tyw1	97	64.797	Hippocampus_comes
ENSAMXG00000004157	tyw1	100	85.714	ENSIPUG00000016330	tyw1	97	85.714	Ictalurus_punctatus
ENSAMXG00000004157	tyw1	99	66.712	ENSSTOG00000004067	-	91	66.576	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAMXG00000004157	tyw1	97	65.608	ENSJJAG00000022959	Tyw1	98	65.972	Jaculus_jaculus
ENSAMXG00000004157	tyw1	98	76.184	ENSKMAG00000018599	tyw1	96	75.348	Kryptolebias_marmoratus
ENSAMXG00000004157	tyw1	100	65.995	ENSLACG00000018917	tyw1	98	65.421	Latimeria_chalumnae
ENSAMXG00000004157	tyw1	99	74.278	ENSLOCG00000004035	tyw1	96	74.278	Lepisosteus_oculatus
ENSAMXG00000004157	tyw1	98	67.862	ENSMFAG00000035457	-	98	68.421	Macaca_fascicularis
ENSAMXG00000004157	tyw1	98	67.862	ENSMMUG00000030374	-	98	68.421	Macaca_mulatta
ENSAMXG00000004157	tyw1	98	67.724	ENSMNEG00000041992	-	98	73.211	Macaca_nemestrina
ENSAMXG00000004157	tyw1	98	67.862	ENSMLEG00000039741	-	98	68.421	Mandrillus_leucophaeus
ENSAMXG00000004157	tyw1	98	76.364	ENSMAMG00000016089	tyw1	97	72.874	Mastacembelus_armatus
ENSAMXG00000004157	tyw1	93	78.873	ENSMZEG00005024386	tyw1	96	77.863	Maylandia_zebra
ENSAMXG00000004157	tyw1	99	66.621	ENSMGAG00000002176	-	99	65.710	Meleagris_gallopavo
ENSAMXG00000004157	tyw1	98	67.225	ENSMAUG00000002959	Tyw1	98	67.225	Mesocricetus_auratus
ENSAMXG00000004157	tyw1	98	68.552	ENSMICG00000014374	-	99	68.144	Microcebus_murinus
ENSAMXG00000004157	tyw1	100	65.041	ENSMOCG00000017720	Tyw1	100	65.757	Microtus_ochrogaster
ENSAMXG00000004157	tyw1	99	70.183	ENSMMOG00000005064	tyw1	99	69.902	Mola_mola
ENSAMXG00000004157	tyw1	99	66.981	ENSMODG00000025697	-	99	67.211	Monodelphis_domestica
ENSAMXG00000004157	tyw1	99	76.657	ENSMALG00000010238	tyw1	96	74.931	Monopterus_albus
ENSAMXG00000004157	tyw1	99	66.942	MGP_CAROLIEiJ_G0027801	Tyw1	99	67.080	Mus_caroli
ENSAMXG00000004157	tyw1	98	67.782	ENSMUSG00000056310	Tyw1	98	67.782	Mus_musculus
ENSAMXG00000004157	tyw1	99	67.590	MGP_PahariEiJ_G0024383	Tyw1	99	67.867	Mus_pahari
ENSAMXG00000004157	tyw1	98	67.782	MGP_SPRETEiJ_G0028799	Tyw1	98	67.782	Mus_spretus
ENSAMXG00000004157	tyw1	93	71.272	ENSMPUG00000016191	-	95	70.534	Mustela_putorius_furo
ENSAMXG00000004157	tyw1	98	66.255	ENSMLUG00000013582	-	98	65.844	Myotis_lucifugus
ENSAMXG00000004157	tyw1	98	68.245	ENSNGAG00000002742	Tyw1	98	67.318	Nannospalax_galili
ENSAMXG00000004157	tyw1	93	76.839	ENSNBRG00000016996	tyw1	94	76.183	Neolamprologus_brichardi
ENSAMXG00000004157	tyw1	98	67.448	ENSNLEG00000013210	-	92	72.599	Nomascus_leucogenys
ENSAMXG00000004157	tyw1	93	55.000	ENSOPRG00000008734	-	87	56.079	Ochotona_princeps
ENSAMXG00000004157	tyw1	97	64.829	ENSODEG00000014729	-	97	64.829	Octodon_degus
ENSAMXG00000004157	tyw1	99	74.247	ENSONIG00000005872	tyw1	97	73.324	Oreochromis_niloticus
ENSAMXG00000004157	tyw1	97	68.245	ENSOCUG00000003173	-	98	68.006	Oryctolagus_cuniculus
ENSAMXG00000004157	tyw1	99	74.238	ENSORLG00000001393	tyw1	99	70.492	Oryzias_latipes
ENSAMXG00000004157	tyw1	99	74.100	ENSORLG00020019361	tyw1	99	71.111	Oryzias_latipes_hni
ENSAMXG00000004157	tyw1	99	73.757	ENSORLG00015008095	tyw1	96	72.176	Oryzias_latipes_hsok
ENSAMXG00000004157	tyw1	93	73.023	ENSOGAG00000016555	-	95	70.355	Otolemur_garnettii
ENSAMXG00000004157	tyw1	98	69.093	ENSOARG00000010673	-	98	68.681	Ovis_aries
ENSAMXG00000004157	tyw1	98	68.768	ENSPPRG00000004945	-	98	67.832	Panthera_pardus
ENSAMXG00000004157	tyw1	98	68.768	ENSPTIG00000019545	-	98	67.688	Panthera_tigris_altaica
ENSAMXG00000004157	tyw1	98	63.862	ENSPTRG00000023076	TYW1B	97	63.172	Pan_troglodytes
ENSAMXG00000004157	tyw1	98	67.448	ENSPANG00000019053	-	98	68.006	Papio_anubis
ENSAMXG00000004157	tyw1	99	73.472	ENSPKIG00000006545	tyw1	96	73.056	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAMXG00000004157	tyw1	96	72.199	ENSPMGG00000004240	tyw1	100	71.530	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSAMXG00000004157	tyw1	99	67.667	ENSPEMG00000008274	Tyw1	98	68.524	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAMXG00000004157	tyw1	99	76.138	ENSPFOG00000015855	tyw1	99	75.310	Poecilia_formosa
ENSAMXG00000004157	tyw1	99	75.691	ENSPLAG00000000838	tyw1	96	74.965	Poecilia_latipinna
ENSAMXG00000004157	tyw1	99	75.762	ENSPMEG00000019437	tyw1	100	71.791	Poecilia_mexicana
ENSAMXG00000004157	tyw1	99	71.905	ENSPREG00000018773	tyw1	97	71.389	Poecilia_reticulata
ENSAMXG00000004157	tyw1	98	67.586	ENSPPYG00000017514	TYW1	98	68.283	Pongo_abelii
ENSAMXG00000004157	tyw1	98	54.432	ENSPCOG00000015294	-	98	53.878	Propithecus_coquereli
ENSAMXG00000004157	tyw1	99	75.510	ENSPNYG00000022381	tyw1	97	74.523	Pundamilia_nyererei
ENSAMXG00000004157	tyw1	100	89.026	ENSPNAG00000009001	tyw1	100	89.026	Pygocentrus_nattereri
ENSAMXG00000004157	tyw1	99	66.346	ENSRNOG00000024352	Tyw1	98	66.944	Rattus_norvegicus
ENSAMXG00000004157	tyw1	98	67.724	ENSRBIG00000039619	-	98	68.283	Rhinopithecus_bieti
ENSAMXG00000004157	tyw1	98	67.724	ENSRROG00000039780	-	98	68.283	Rhinopithecus_roxellana
ENSAMXG00000004157	tyw1	90	42.013	YPL207W	-	72	40.121	Saccharomyces_cerevisiae
ENSAMXG00000004157	tyw1	98	68.150	ENSSBOG00000025873	-	98	67.455	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSAMXG00000004157	tyw1	98	67.822	ENSSHAG00000010346	-	99	68.017	Sarcophilus_harrisii
ENSAMXG00000004157	tyw1	99	77.273	ENSSFOG00015001054	tyw1	97	76.309	Scleropages_formosus
ENSAMXG00000004157	tyw1	98	75.939	ENSSMAG00000020514	tyw1	96	74.548	Scophthalmus_maximus
ENSAMXG00000004157	tyw1	98	76.309	ENSSDUG00000001552	tyw1	94	80.061	Seriola_dumerili
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ENSAMXG00000004157	tyw1	99	66.989	ENSSPUG00000002715	-	99	66.758	Sphenodon_punctatus
ENSAMXG00000004157	tyw1	98	69.103	ENSSSCG00000007733	-	98	68.690	Sus_scrofa
ENSAMXG00000004157	tyw1	90	68.684	ENSTGUG00000003428	-	99	67.530	Taeniopygia_guttata
ENSAMXG00000004157	tyw1	98	75.872	ENSTRUG00000016107	tyw1	93	74.477	Takifugu_rubripes
ENSAMXG00000004157	tyw1	93	78.034	ENSTNIG00000018999	tyw1	100	77.477	Tetraodon_nigroviridis
ENSAMXG00000004157	tyw1	98	68.428	ENSUMAG00000015343	-	99	68.403	Ursus_maritimus
ENSAMXG00000004157	tyw1	98	67.877	ENSVVUG00000016457	-	98	67.737	Vulpes_vulpes
ENSAMXG00000004157	tyw1	99	69.986	ENSXETG00000010094	tyw1	99	69.714	Xenopus_tropicalis
ENSAMXG00000004157	tyw1	99	75.589	ENSXMAG00000013125	tyw1	98	76.606	Xiphophorus_maculatus