EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAMXG00000004611 (Gene tree)
Gene ID: 103027219
Gene Symbol: papolg
Alias: zgc:63762
Full Name: poly(A) polymerase gamma
Gene Type: protein_coding
Species: Astyanax_mexicanus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 12378 bases
Position: chr25:14689502-14701879
Accession: 103027219
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAMXP00000004745	PAP_RNA-bind	PF04926.15	3.8e-29	1	2
ENSAMXP00000004745	PAP_RNA-bind	PF04926.15	3.8e-29	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAMXT00000004745	-	5955	XM_007252239	ENSAMXP00000004745	744 (aa)	XP_007252301	W5KAY4

Gene Model

Click here to download ENSAMXG00000004611's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
amex03015	mRNA surveillance pathway	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSAMXG00000004611's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSAMXG00000004611	papolg	72	73.970	ENSAMXG00000018141	papola	98	72.043

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAMXG00000004611	papolg	100	72.980	ENSG00000115421	PAPOLG	100	87.179	Homo_sapiens
ENSAMXG00000004611	papolg	100	78.723	ENSAPOG00000004798	papolg	99	79.122	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAMXG00000004611	papolg	99	73.056	ENSAMEG00000018227	PAPOLG	99	73.056	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAMXG00000004611	papolg	100	73.762	ENSACIG00000010546	papolg	99	73.635	Amphilophus_citrinellus
ENSAMXG00000004611	papolg	100	78.723	ENSAOCG00000010254	papolg	99	79.122	Amphiprion_ocellaris
ENSAMXG00000004611	papolg	100	78.723	ENSAPEG00000006944	papolg	99	79.122	Amphiprion_percula
ENSAMXG00000004611	papolg	100	78.486	ENSATEG00000009007	papolg	99	79.017	Anabas_testudineus
ENSAMXG00000004611	papolg	99	66.799	ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	66.799	Anas_platyrhynchos
ENSAMXG00000004611	papolg	80	58.937	ENSACAG00000015048	-	100	58.937	Anolis_carolinensis
ENSAMXG00000004611	papolg	100	72.715	ENSANAG00000024627	PAPOLG	100	72.715	Aotus_nancymaae
ENSAMXG00000004611	papolg	100	75.974	ENSACLG00000015592	papolg	99	76.333	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000004611	papolg	100	72.991	ENSBTAG00000007414	PAPOLG	100	72.991	Bos_taurus
ENSAMXG00000004611	papolg	100	72.848	ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	72.848	Callithrix_jacchus
ENSAMXG00000004611	papolg	100	72.691	ENSCAFG00000002975	PAPOLG	91	72.691	Canis_familiaris
ENSAMXG00000004611	papolg	100	72.405	ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	72.405	Canis_lupus_dingo
ENSAMXG00000004611	papolg	100	72.859	ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	72.859	Capra_hircus
ENSAMXG00000004611	papolg	100	72.368	ENSTSYG00000004947	PAPOLG	100	72.368	Carlito_syrichta
ENSAMXG00000004611	papolg	51	81.365	ENSCAPG00000014901	-	100	81.365	Cavia_aperea
ENSAMXG00000004611	papolg	100	73.642	ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	73.642	Cavia_porcellus
ENSAMXG00000004611	papolg	100	72.848	ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	72.848	Cebus_capucinus
ENSAMXG00000004611	papolg	91	81.974	ENSCATG00000044395	PAPOLG	100	81.974	Cercocebus_atys
ENSAMXG00000004611	papolg	100	73.148	ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	73.148	Chinchilla_lanigera
ENSAMXG00000004611	papolg	100	72.848	ENSCSAG00000014408	PAPOLG	100	72.848	Chlorocebus_sabaeus
ENSAMXG00000004611	papolg	89	71.429	ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	71.429	Choloepus_hoffmanni
ENSAMXG00000004611	papolg	67	63.960	ENSCING00000024664	-	94	63.960	Ciona_intestinalis
ENSAMXG00000004611	papolg	65	64.742	ENSCSAVG00000009085	-	97	64.742	Ciona_savignyi
ENSAMXG00000004611	papolg	100	72.848	ENSCANG00000038120	PAPOLG	100	72.848	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAMXG00000004611	papolg	99	73.557	ENSCGRG00001014951	Papolg	100	73.557	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAMXG00000004611	papolg	99	73.557	ENSCGRG00000005552	-	100	73.557	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAMXG00000004611	papolg	100	75.770	ENSCSEG00000000771	papolg	99	76.037	Cynoglossus_semilaevis
ENSAMXG00000004611	papolg	100	73.514	ENSCVAG00000016602	papolg	89	89.600	Cyprinodon_variegatus
ENSAMXG00000004611	papolg	100	85.867	ENSDARG00000012141	papolg	100	85.867	Danio_rerio
ENSAMXG00000004611	papolg	100	70.503	ENSDNOG00000011326	PAPOLG	100	70.503	Dasypus_novemcinctus
ENSAMXG00000004611	papolg	58	86.079	ENSDORG00000016228	Papolg	100	86.079	Dipodomys_ordii
ENSAMXG00000004611	papolg	99	58.246	ENSETEG00000011815	PAPOLG	100	58.355	Echinops_telfairi
ENSAMXG00000004611	papolg	63	57.325	ENSEBUG00000005042	-	82	56.785	Eptatretus_burgeri
ENSAMXG00000004611	papolg	58	72.063	ENSEBUG00000004020	papolg	87	72.063	Eptatretus_burgeri
ENSAMXG00000004611	papolg	100	72.941	ENSEASG00005002038	PAPOLG	100	72.941	Equus_asinus_asinus
ENSAMXG00000004611	papolg	100	72.941	ENSECAG00000009859	PAPOLG	98	73.052	Equus_caballus
ENSAMXG00000004611	papolg	100	64.418	ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	64.418	Erinaceus_europaeus
ENSAMXG00000004611	papolg	100	81.358	ENSELUG00000014497	papolg	96	81.530	Esox_lucius
ENSAMXG00000004611	papolg	100	72.368	ENSFCAG00000026126	PAPOLG	100	72.368	Felis_catus
ENSAMXG00000004611	papolg	99	60.288	ENSFALG00000011079	PAPOLG	97	60.288	Ficedula_albicollis
ENSAMXG00000004611	papolg	100	73.510	ENSFDAG00000010662	PAPOLG	97	73.510	Fukomys_damarensis
ENSAMXG00000004611	papolg	66	70.414	ENSFHEG00000019080	papolg	90	70.276	Fundulus_heteroclitus
ENSAMXG00000004611	papolg	88	89.388	ENSGMOG00000018772	papolg	94	89.388	Gadus_morhua
ENSAMXG00000004611	papolg	100	64.286	ENSGALG00000007853	PAPOLG	100	64.286	Gallus_gallus
ENSAMXG00000004611	papolg	100	75.328	ENSGAFG00000003263	papolg	99	75.459	Gambusia_affinis
ENSAMXG00000004611	papolg	100	77.748	ENSGACG00000002718	papolg	100	77.559	Gasterosteus_aculeatus
ENSAMXG00000004611	papolg	100	72.715	ENSGGOG00000006083	PAPOLG	100	72.715	Gorilla_gorilla
ENSAMXG00000004611	papolg	100	75.974	ENSHBUG00000004882	papolg	99	76.680	Haplochromis_burtoni
ENSAMXG00000004611	papolg	99	73.360	ENSHGLG00000019610	PAPOLG	99	73.360	Heterocephalus_glaber_female
ENSAMXG00000004611	papolg	100	73.245	ENSHGLG00100010429	PAPOLG	99	73.245	Heterocephalus_glaber_male
ENSAMXG00000004611	papolg	100	77.346	ENSHCOG00000006782	papolg	99	77.882	Hippocampus_comes
ENSAMXG00000004611	papolg	100	88.313	ENSIPUG00000021642	papolg	100	88.425	Ictalurus_punctatus
ENSAMXG00000004611	papolg	100	72.751	ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	72.751	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAMXG00000004611	papolg	58	86.311	ENSJJAG00000015601	Papolg	100	86.311	Jaculus_jaculus
ENSAMXG00000004611	papolg	100	76.330	ENSKMAG00000016439	papolg	99	76.330	Kryptolebias_marmoratus
ENSAMXG00000004611	papolg	100	73.704	ENSLBEG00000023218	papolg	99	75.000	Labrus_bergylta
ENSAMXG00000004611	papolg	99	67.772	ENSLACG00000009543	PAPOLG	100	67.772	Latimeria_chalumnae
ENSAMXG00000004611	papolg	100	80.859	ENSLOCG00000016130	papolg	100	80.859	Lepisosteus_oculatus
ENSAMXG00000004611	papolg	100	72.691	ENSLAFG00000010404	PAPOLG	99	85.882	Loxodonta_africana
ENSAMXG00000004611	papolg	100	73.245	ENSMFAG00000042450	PAPOLG	100	73.245	Macaca_fascicularis
ENSAMXG00000004611	papolg	100	73.245	ENSMMUG00000000498	PAPOLG	100	73.245	Macaca_mulatta
ENSAMXG00000004611	papolg	100	66.053	ENSMNEG00000035939	PAPOLG	100	66.053	Macaca_nemestrina
ENSAMXG00000004611	papolg	100	73.113	ENSMLEG00000039462	PAPOLG	100	73.113	Mandrillus_leucophaeus
ENSAMXG00000004611	papolg	100	78.590	ENSMAMG00000010667	papolg	99	79.515	Mastacembelus_armatus
ENSAMXG00000004611	papolg	100	75.974	ENSMZEG00005018140	papolg	99	76.333	Maylandia_zebra
ENSAMXG00000004611	papolg	98	64.439	ENSMGAG00000001741	PAPOLG	98	64.439	Meleagris_gallopavo
ENSAMXG00000004611	papolg	99	73.705	ENSMAUG00000009088	Papolg	99	73.705	Mesocricetus_auratus
ENSAMXG00000004611	papolg	100	72.751	ENSMICG00000010042	PAPOLG	100	73.113	Microcebus_murinus
ENSAMXG00000004611	papolg	100	73.775	ENSMOCG00000006857	Papolg	100	73.775	Microtus_ochrogaster
ENSAMXG00000004611	papolg	100	77.321	ENSMMOG00000008020	papolg	99	77.851	Mola_mola
ENSAMXG00000004611	papolg	98	73.138	ENSMODG00000002160	PAPOLG	99	73.138	Monodelphis_domestica
ENSAMXG00000004611	papolg	100	77.689	ENSMALG00000007012	papolg	99	77.822	Monopterus_albus
ENSAMXG00000004611	papolg	100	73.907	MGP_CAROLIEiJ_G0016144	Papolg	99	86.916	Mus_caroli
ENSAMXG00000004611	papolg	100	73.775	ENSMUSG00000020273	Papolg	99	86.916	Mus_musculus
ENSAMXG00000004611	papolg	100	73.377	MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	73.557	Mus_pahari
ENSAMXG00000004611	papolg	100	73.642	MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	86.916	Mus_spretus
ENSAMXG00000004611	papolg	100	72.559	ENSMPUG00000005165	PAPOLG	90	72.559	Mustela_putorius_furo
ENSAMXG00000004611	papolg	99	72.691	ENSMLUG00000009853	PAPOLG	99	72.691	Myotis_lucifugus
ENSAMXG00000004611	papolg	100	73.245	ENSNGAG00000001120	Papolg	100	73.245	Nannospalax_galili
ENSAMXG00000004611	papolg	100	67.500	ENSNBRG00000011943	papolg	99	67.763	Neolamprologus_brichardi
ENSAMXG00000004611	papolg	58	85.847	ENSNLEG00000009507	-	100	85.847	Nomascus_leucogenys
ENSAMXG00000004611	papolg	80	67.568	ENSMEUG00000013605	-	86	67.568	Notamacropus_eugenii
ENSAMXG00000004611	papolg	100	72.487	ENSOPRG00000009630	PAPOLG	100	72.487	Ochotona_princeps
ENSAMXG00000004611	papolg	57	83.688	ENSODEG00000012424	PAPOLG	99	83.688	Octodon_degus
ENSAMXG00000004611	papolg	100	70.573	ENSONIG00000002985	papolg	100	70.895	Oreochromis_niloticus
ENSAMXG00000004611	papolg	99	73.580	ENSOANG00000012403	PAPOLG	99	73.580	Ornithorhynchus_anatinus
ENSAMXG00000004611	papolg	100	72.500	ENSOCUG00000004962	PAPOLG	100	72.500	Oryctolagus_cuniculus
ENSAMXG00000004611	papolg	100	76.096	ENSORLG00000001577	papolg	99	76.821	Oryzias_latipes
ENSAMXG00000004611	papolg	100	76.431	ENSORLG00020002482	papolg	99	76.892	Oryzias_latipes_hni
ENSAMXG00000004611	papolg	100	75.830	ENSORLG00015008836	papolg	99	76.556	Oryzias_latipes_hsok
ENSAMXG00000004611	papolg	100	77.128	ENSOMEG00000001406	papolg	99	77.086	Oryzias_melastigma
ENSAMXG00000004611	papolg	58	62.332	ENSOGAG00000003145	PAPOLG	100	62.332	Otolemur_garnettii
ENSAMXG00000004611	papolg	100	72.727	ENSOARG00000001563	PAPOLG	91	72.727	Ovis_aries
ENSAMXG00000004611	papolg	100	72.980	ENSPPAG00000019917	PAPOLG	100	72.980	Pan_paniscus
ENSAMXG00000004611	papolg	100	72.368	ENSPPRG00000023250	PAPOLG	100	72.368	Panthera_pardus
ENSAMXG00000004611	papolg	100	72.237	ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	72.237	Panthera_tigris_altaica
ENSAMXG00000004611	papolg	100	72.980	ENSPTRG00000011948	PAPOLG	100	72.980	Pan_troglodytes
ENSAMXG00000004611	papolg	100	69.749	ENSPANG00000014543	PAPOLG	100	69.749	Papio_anubis
ENSAMXG00000004611	papolg	100	78.071	ENSPKIG00000003313	papolg	100	78.071	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAMXG00000004611	papolg	92	77.122	ENSPKIG00000006027	PAPOLG	98	77.122	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAMXG00000004611	papolg	98	69.404	ENSPSIG00000013663	PAPOLG	98	69.404	Pelodiscus_sinensis
ENSAMXG00000004611	papolg	99	73.826	ENSPEMG00000008960	-	100	73.826	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAMXG00000004611	papolg	98	53.576	ENSPMAG00000002961	papolg	99	53.756	Petromyzon_marinus
ENSAMXG00000004611	papolg	66	64.185	ENSPMAG00000004864	-	98	64.185	Petromyzon_marinus
ENSAMXG00000004611	papolg	100	73.012	ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	73.012	Phascolarctos_cinereus
ENSAMXG00000004611	papolg	89	86.643	ENSPFOG00000012909	papolg	99	76.084	Poecilia_formosa
ENSAMXG00000004611	papolg	89	86.643	ENSPLAG00000018445	papolg	99	76.184	Poecilia_latipinna
ENSAMXG00000004611	papolg	100	75.197	ENSPMEG00000003961	papolg	99	75.853	Poecilia_mexicana
ENSAMXG00000004611	papolg	100	74.476	ENSPREG00000010358	papolg	99	75.000	Poecilia_reticulata
ENSAMXG00000004611	papolg	100	72.980	ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	72.980	Pongo_abelii
ENSAMXG00000004611	papolg	99	65.113	ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	65.113	Procavia_capensis
ENSAMXG00000004611	papolg	100	65.079	ENSPCOG00000027306	PAPOLG	100	65.079	Propithecus_coquereli
ENSAMXG00000004611	papolg	87	81.967	ENSPVAG00000013541	PAPOLG	87	81.967	Pteropus_vampyrus
ENSAMXG00000004611	papolg	100	75.974	ENSPNYG00000006729	papolg	99	76.333	Pundamilia_nyererei
ENSAMXG00000004611	papolg	100	90.933	ENSPNAG00000015521	papolg	100	90.933	Pygocentrus_nattereri
ENSAMXG00000004611	papolg	100	73.245	ENSRNOG00000006261	Papolg	100	73.245	Rattus_norvegicus
ENSAMXG00000004611	papolg	100	67.947	ENSRBIG00000040086	PAPOLG	100	67.947	Rhinopithecus_bieti
ENSAMXG00000004611	papolg	100	72.715	ENSRROG00000035954	PAPOLG	100	72.715	Rhinopithecus_roxellana
ENSAMXG00000004611	papolg	100	73.245	ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	73.245	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSAMXG00000004611	papolg	94	73.370	ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	73.370	Sarcophilus_harrisii
ENSAMXG00000004611	papolg	100	75.661	ENSSFOG00015002383	papolg	100	75.661	Scleropages_formosus
ENSAMXG00000004611	papolg	100	65.223	ENSSFOG00015011874	papolg	100	65.223	Scleropages_formosus
ENSAMXG00000004611	papolg	87	88.929	ENSSMAG00000015598	papolg	98	75.097	Scophthalmus_maximus
ENSAMXG00000004611	papolg	100	78.150	ENSSDUG00000000912	papolg	99	78.552	Seriola_dumerili
ENSAMXG00000004611	papolg	100	78.686	ENSSLDG00000001217	papolg	99	79.088	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSAMXG00000004611	papolg	99	70.079	ENSSPUG00000007491	PAPOLG	100	70.079	Sphenodon_punctatus
ENSAMXG00000004611	papolg	100	76.813	ENSSPAG00000009004	papolg	99	77.332	Stegastes_partitus
ENSAMXG00000004611	papolg	100	72.884	ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	72.884	Sus_scrofa
ENSAMXG00000004611	papolg	72	71.805	ENSTGUG00000006762	PAPOLG	98	71.805	Taeniopygia_guttata
ENSAMXG00000004611	papolg	100	74.967	ENSTRUG00000006410	papolg	99	74.967	Takifugu_rubripes
ENSAMXG00000004611	papolg	100	71.713	ENSTNIG00000017106	papolg	100	71.713	Tetraodon_nigroviridis
ENSAMXG00000004611	papolg	99	66.176	ENSTBEG00000002609	PAPOLG	100	66.176	Tupaia_belangeri
ENSAMXG00000004611	papolg	100	68.816	ENSTTRG00000006237	PAPOLG	100	68.816	Tursiops_truncatus
ENSAMXG00000004611	papolg	100	72.414	ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	73.253	Ursus_americanus
ENSAMXG00000004611	papolg	99	73.253	ENSUMAG00000019081	PAPOLG	90	73.253	Ursus_maritimus
ENSAMXG00000004611	papolg	99	69.786	ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	69.786	Vicugna_pacos
ENSAMXG00000004611	papolg	100	72.823	ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	72.823	Vulpes_vulpes
ENSAMXG00000004611	papolg	100	69.935	ENSXETG00000002208	papolg	100	69.935	Xenopus_tropicalis
ENSAMXG00000004611	papolg	67	90.180	ENSXCOG00000006611	papolg	73	90.180	Xiphophorus_couchianus
ENSAMXG00000004611	papolg	74	87.600	ENSXMAG00000007383	papolg	95	87.600	Xiphophorus_maculatus