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Description

Ensembl ID: ENSAMXG00000007266 (Gene tree)
Gene ID: 103029310
Gene Symbol: caprin2
Alias: c1qdc1|wu:fj80b02
Full Name: caprin-2-like
Gene Type: protein_coding
Species: Astyanax_mexicanus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 12534 bases
Position: chr7:32616216-32628749
Accession: 103029310
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAMXP00000031978	Caprin-1_C	PF12287.8	6.6e-27	1	1
ENSAMXP00000033004	Caprin-1_C	PF12287.8	6.8e-27	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAMXT00000040533	-	4265	XM_007233687	ENSAMXP00000033004	972 (aa)	XP_007233749	UPI000BBDF347
ENSAMXT00000042102	-	4178	-	ENSAMXP00000031978	943 (aa)	-	-
ENSAMXT00000007468	-	2625	-	ENSAMXP00000007468	874 (aa)	-	W5KIQ6

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSAMXG00000007266	caprin2	56	42.289	ENSAMXG00000006601	caprin1a	82	42.289

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAMXG00000007266	caprin2	66	55.747	ENSG00000110888	CAPRIN2	87	68.269	Homo_sapiens
ENSAMXG00000007266	caprin2	57	33.333	ENSAPOG00000004726	caprin1a	86	32.110	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAMXG00000007266	caprin2	99	46.734	ENSAPOG00000019808	caprin2	100	50.358	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAMXG00000007266	caprin2	66	33.229	ENSAPOG00000010508	caprin1b	93	32.915	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAMXG00000007266	caprin2	88	45.745	ENSAMEG00000009118	CAPRIN2	74	45.745	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAMXG00000007266	caprin2	97	45.426	ENSACIG00000005589	caprin2	99	45.426	Amphilophus_citrinellus
ENSAMXG00000007266	caprin2	58	32.990	ENSAOCG00000003017	caprin1a	85	33.493	Amphiprion_ocellaris
ENSAMXG00000007266	caprin2	97	50.306	ENSAOCG00000013014	caprin2	100	50.816	Amphiprion_ocellaris
ENSAMXG00000007266	caprin2	58	32.990	ENSAPEG00000008548	caprin1a	85	33.493	Amphiprion_percula
ENSAMXG00000007266	caprin2	94	46.526	ENSAPLG00000006703	CAPRIN2	82	45.217	Anas_platyrhynchos
ENSAMXG00000007266	caprin2	95	42.598	ENSACAG00000012953	CAPRIN2	88	42.598	Anolis_carolinensis
ENSAMXG00000007266	caprin2	88	45.196	ENSANAG00000035460	CAPRIN2	80	45.196	Aotus_nancymaae
ENSAMXG00000007266	caprin2	97	49.591	ENSACLG00000015175	-	100	49.591	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000007266	caprin2	86	46.099	ENSBTAG00000019373	CAPRIN2	78	46.099	Bos_taurus
ENSAMXG00000007266	caprin2	86	45.302	ENSCJAG00000001080	CAPRIN2	77	45.018	Callithrix_jacchus
ENSAMXG00000007266	caprin2	88	46.004	ENSCAFG00000010713	CAPRIN2	78	46.004	Canis_familiaris
ENSAMXG00000007266	caprin2	80	50.000	ENSCAFG00020018961	-	71	50.000	Canis_lupus_dingo
ENSAMXG00000007266	caprin2	86	45.922	ENSCHIG00000026352	CAPRIN2	80	45.922	Capra_hircus
ENSAMXG00000007266	caprin2	65	56.322	ENSTSYG00000008590	CAPRIN2	61	56.322	Carlito_syrichta
ENSAMXG00000007266	caprin2	86	45.406	ENSCPOG00000006625	CAPRIN2	92	51.770	Cavia_porcellus
ENSAMXG00000007266	caprin2	88	45.196	ENSCCAG00000027709	CAPRIN2	100	44.485	Cebus_capucinus
ENSAMXG00000007266	caprin2	88	44.326	ENSCATG00000031463	CAPRIN2	100	44.404	Cercocebus_atys
ENSAMXG00000007266	caprin2	90	45.599	ENSCLAG00000001513	CAPRIN2	92	53.540	Chinchilla_lanigera
ENSAMXG00000007266	caprin2	88	44.662	ENSCSAG00000007446	CAPRIN2	78	44.662	Chlorocebus_sabaeus
ENSAMXG00000007266	caprin2	88	45.730	ENSCHOG00000008931	CAPRIN2	74	45.730	Choloepus_hoffmanni
ENSAMXG00000007266	caprin2	94	45.541	ENSCPBG00000027227	CAPRIN2	82	44.345	Chrysemys_picta_bellii
ENSAMXG00000007266	caprin2	66	55.874	ENSCANG00000035343	CAPRIN2	61	55.874	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAMXG00000007266	caprin2	93	45.515	ENSCGRG00001002901	Caprin2	96	53.425	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAMXG00000007266	caprin2	80	53.425	ENSCGRG00000001249	Caprin2	92	53.425	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAMXG00000007266	caprin2	58	32.973	ENSCSEG00000013073	caprin1b	78	32.973	Cynoglossus_semilaevis
ENSAMXG00000007266	caprin2	98	60.562	ENSDARG00000020749	caprin2	99	60.562	Danio_rerio
ENSAMXG00000007266	caprin2	69	53.117	ENSDNOG00000009793	CAPRIN2	84	44.681	Dasypus_novemcinctus
ENSAMXG00000007266	caprin2	75	51.381	ENSDORG00000012639	Caprin2	98	51.381	Dipodomys_ordii
ENSAMXG00000007266	caprin2	72	57.299	ENSETEG00000011498	-	71	56.985	Echinops_telfairi
ENSAMXG00000007266	caprin2	86	45.730	ENSEASG00005005997	CAPRIN2	79	44.840	Equus_asinus_asinus
ENSAMXG00000007266	caprin2	86	46.181	ENSECAG00000000608	CAPRIN2	78	46.181	Equus_caballus
ENSAMXG00000007266	caprin2	97	47.130	ENSELUG00000019776	caprin2	100	47.183	Esox_lucius
ENSAMXG00000007266	caprin2	64	57.471	ENSFCAG00000007004	CAPRIN2	61	57.471	Felis_catus
ENSAMXG00000007266	caprin2	94	47.352	ENSFALG00000009038	CAPRIN2	80	46.356	Ficedula_albicollis
ENSAMXG00000007266	caprin2	72	51.990	ENSFDAG00000020134	CAPRIN2	70	52.488	Fukomys_damarensis
ENSAMXG00000007266	caprin2	97	47.817	ENSFHEG00000004435	caprin2	100	48.020	Fundulus_heteroclitus
ENSAMXG00000007266	caprin2	94	47.452	ENSGALG00000012947	CAPRIN2	84	45.509	Gallus_gallus
ENSAMXG00000007266	caprin2	97	48.265	ENSGAFG00000020084	caprin2	100	48.673	Gambusia_affinis
ENSAMXG00000007266	caprin2	94	46.831	ENSGACG00000019233	caprin2	95	46.831	Gasterosteus_aculeatus
ENSAMXG00000007266	caprin2	94	44.643	ENSGAGG00000015057	CAPRIN2	76	44.345	Gopherus_agassizii
ENSAMXG00000007266	caprin2	66	55.747	ENSGGOG00000006182	CAPRIN2	61	55.747	Gorilla_gorilla
ENSAMXG00000007266	caprin2	97	50.358	ENSHBUG00000012107	-	100	50.358	Haplochromis_burtoni
ENSAMXG00000007266	caprin2	80	52.655	ENSHGLG00000007117	CAPRIN2	92	52.655	Heterocephalus_glaber_female
ENSAMXG00000007266	caprin2	97	68.224	ENSIPUG00000016517	caprin2	100	68.224	Ictalurus_punctatus
ENSAMXG00000007266	caprin2	80	53.097	ENSSTOG00000004672	CAPRIN2	76	52.632	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAMXG00000007266	caprin2	77	55.882	ENSJJAG00000018136	Caprin2	92	52.212	Jaculus_jaculus
ENSAMXG00000007266	caprin2	97	45.184	ENSKMAG00000011810	caprin2	100	45.184	Kryptolebias_marmoratus
ENSAMXG00000007266	caprin2	56	40.594	ENSLBEG00000013179	caprin1b	80	30.387	Labrus_bergylta
ENSAMXG00000007266	caprin2	97	48.354	ENSLBEG00000028194	caprin2	100	48.354	Labrus_bergylta
ENSAMXG00000007266	caprin2	92	41.407	ENSLACG00000006297	CAPRIN2	97	41.717	Latimeria_chalumnae
ENSAMXG00000007266	caprin2	69	70.040	ENSLOCG00000015099	caprin2	63	70.040	Lepisosteus_oculatus
ENSAMXG00000007266	caprin2	93	45.664	ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	84	45.664	Loxodonta_africana
ENSAMXG00000007266	caprin2	88	44.326	ENSMFAG00000025167	CAPRIN2	74	44.326	Macaca_fascicularis
ENSAMXG00000007266	caprin2	66	55.874	ENSMMUG00000001359	CAPRIN2	78	51.613	Macaca_mulatta
ENSAMXG00000007266	caprin2	88	44.326	ENSMNEG00000029750	CAPRIN2	100	44.404	Macaca_nemestrina
ENSAMXG00000007266	caprin2	66	55.874	ENSMLEG00000034760	CAPRIN2	61	55.874	Mandrillus_leucophaeus
ENSAMXG00000007266	caprin2	97	49.393	ENSMAMG00000023305	caprin2	100	49.393	Mastacembelus_armatus
ENSAMXG00000007266	caprin2	97	49.693	ENSMZEG00005008191	-	100	49.693	Maylandia_zebra
ENSAMXG00000007266	caprin2	94	47.452	ENSMGAG00000013350	CAPRIN2	84	45.509	Meleagris_gallopavo
ENSAMXG00000007266	caprin2	94	45.000	ENSMAUG00000008195	Caprin2	96	53.425	Mesocricetus_auratus
ENSAMXG00000007266	caprin2	86	45.293	ENSMICG00000010650	CAPRIN2	100	44.954	Microcebus_murinus
ENSAMXG00000007266	caprin2	86	43.590	ENSMOCG00000001842	Caprin2	81	42.812	Microtus_ochrogaster
ENSAMXG00000007266	caprin2	65	48.780	ENSMODG00000012642	-	95	37.632	Monodelphis_domestica
ENSAMXG00000007266	caprin2	97	49.126	ENSMALG00000020970	caprin2	100	49.126	Monopterus_albus
ENSAMXG00000007266	caprin2	57	40.299	ENSMALG00000008939	caprin1b	81	40.299	Monopterus_albus
ENSAMXG00000007266	caprin2	71	30.435	MGP_CAROLIEiJ_G0024019	Caprin1	92	31.132	Mus_caroli
ENSAMXG00000007266	caprin2	95	38.607	MGP_CAROLIEiJ_G0029073	Caprin2	91	46.364	Mus_caroli
ENSAMXG00000007266	caprin2	94	44.816	ENSMUSG00000030309	Caprin2	91	54.091	Mus_musculus
ENSAMXG00000007266	caprin2	71	30.163	ENSMUSG00000027184	Caprin1	92	30.660	Mus_musculus
ENSAMXG00000007266	caprin2	94	44.482	MGP_PahariEiJ_G0022834	Caprin2	91	53.182	Mus_pahari
ENSAMXG00000007266	caprin2	71	30.163	MGP_PahariEiJ_G0025455	Caprin1	92	31.132	Mus_pahari
ENSAMXG00000007266	caprin2	94	44.482	MGP_SPRETEiJ_G0030128	Caprin2	91	53.636	Mus_spretus
ENSAMXG00000007266	caprin2	71	30.299	MGP_SPRETEiJ_G0024929	Caprin1	92	31.132	Mus_spretus
ENSAMXG00000007266	caprin2	86	46.099	ENSMPUG00000011164	CAPRIN2	76	46.099	Mustela_putorius_furo
ENSAMXG00000007266	caprin2	94	43.218	ENSMLUG00000008734	CAPRIN2	83	43.218	Myotis_lucifugus
ENSAMXG00000007266	caprin2	88	45.053	ENSNLEG00000005730	CAPRIN2	74	45.053	Nomascus_leucogenys
ENSAMXG00000007266	caprin2	52	45.513	ENSMEUG00000012704	CAPRIN1	80	45.513	Notamacropus_eugenii
ENSAMXG00000007266	caprin2	72	52.036	ENSMEUG00000009176	CAPRIN2	65	52.036	Notamacropus_eugenii
ENSAMXG00000007266	caprin2	80	72.000	ENSOPRG00000011491	CAPRIN2	81	72.000	Ochotona_princeps
ENSAMXG00000007266	caprin2	88	45.000	ENSODEG00000005454	CAPRIN2	81	45.000	Octodon_degus
ENSAMXG00000007266	caprin2	97	50.462	ENSONIG00000012027	caprin2	100	50.000	Oreochromis_niloticus
ENSAMXG00000007266	caprin2	91	44.324	ENSOCUG00000017805	CAPRIN2	81	44.505	Oryctolagus_cuniculus
ENSAMXG00000007266	caprin2	56	41.584	ENSORLG00000004783	caprin1b	78	41.584	Oryzias_latipes
ENSAMXG00000007266	caprin2	93	45.668	ENSORLG00000012576	orla-b2m	100	45.575	Oryzias_latipes
ENSAMXG00000007266	caprin2	56	41.584	ENSORLG00020012514	caprin1b	78	41.584	Oryzias_latipes_hni
ENSAMXG00000007266	caprin2	56	41.584	ENSORLG00015005783	caprin1b	78	41.584	Oryzias_latipes_hsok
ENSAMXG00000007266	caprin2	56	40.099	ENSOMEG00000013708	caprin1b	78	40.099	Oryzias_melastigma
ENSAMXG00000007266	caprin2	94	42.679	ENSOGAG00000010071	CAPRIN2	82	42.679	Otolemur_garnettii
ENSAMXG00000007266	caprin2	86	45.922	ENSOARG00000019503	CAPRIN2	74	45.922	Ovis_aries
ENSAMXG00000007266	caprin2	88	45.053	ENSPPAG00000041410	CAPRIN2	76	45.053	Pan_paniscus
ENSAMXG00000007266	caprin2	64	57.471	ENSPPRG00000013738	CAPRIN2	62	57.471	Panthera_pardus
ENSAMXG00000007266	caprin2	64	57.471	ENSPTIG00000013003	CAPRIN2	62	57.471	Panthera_tigris_altaica
ENSAMXG00000007266	caprin2	88	45.053	ENSPTRG00000004802	CAPRIN2	80	45.053	Pan_troglodytes
ENSAMXG00000007266	caprin2	88	44.326	ENSPANG00000005858	CAPRIN2	75	44.326	Papio_anubis
ENSAMXG00000007266	caprin2	96	48.233	ENSPKIG00000017980	caprin2	100	48.110	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAMXG00000007266	caprin2	62	35.316	ENSPKIG00000003997	CAPRIN1	78	31.217	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAMXG00000007266	caprin2	94	45.541	ENSPSIG00000016188	CAPRIN2	90	44.940	Pelodiscus_sinensis
ENSAMXG00000007266	caprin2	59	31.148	ENSPMGG00000007228	caprin1b	80	31.148	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSAMXG00000007266	caprin2	87	45.695	ENSPEMG00000006778	Caprin2	91	53.363	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAMXG00000007266	caprin2	87	43.902	ENSPCIG00000015197	CAPRIN2	79	43.902	Phascolarctos_cinereus
ENSAMXG00000007266	caprin2	79	42.303	ENSPFOG00000009034	caprin2	99	42.303	Poecilia_formosa
ENSAMXG00000007266	caprin2	56	42.000	ENSPLAG00000014342	caprin1b	80	42.000	Poecilia_latipinna
ENSAMXG00000007266	caprin2	97	48.367	ENSPMEG00000020786	caprin2	100	48.367	Poecilia_mexicana
ENSAMXG00000007266	caprin2	88	44.583	ENSPPYG00000004394	CAPRIN2	74	44.974	Pongo_abelii
ENSAMXG00000007266	caprin2	92	43.190	ENSPCAG00000015746	CAPRIN2	78	43.369	Procavia_capensis
ENSAMXG00000007266	caprin2	64	56.571	ENSPCOG00000024022	CAPRIN2	61	56.571	Propithecus_coquereli
ENSAMXG00000007266	caprin2	88	45.730	ENSPVAG00000006083	CAPRIN2	68	53.684	Pteropus_vampyrus
ENSAMXG00000007266	caprin2	98	76.121	ENSPNAG00000017781	caprin2	99	76.121	Pygocentrus_nattereri
ENSAMXG00000007266	caprin2	71	30.163	ENSRNOG00000009152	Caprin1	89	30.176	Rattus_norvegicus
ENSAMXG00000007266	caprin2	94	44.482	ENSRNOG00000047319	Caprin2	91	53.182	Rattus_norvegicus
ENSAMXG00000007266	caprin2	88	45.018	ENSRBIG00000033178	CAPRIN2	100	44.485	Rhinopithecus_bieti
ENSAMXG00000007266	caprin2	79	44.938	ENSRROG00000033123	CAPRIN2	78	44.938	Rhinopithecus_roxellana
ENSAMXG00000007266	caprin2	88	45.035	ENSSBOG00000028650	CAPRIN2	78	45.035	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSAMXG00000007266	caprin2	87	43.711	ENSSHAG00000004287	CAPRIN2	79	43.711	Sarcophilus_harrisii
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ENSAMXG00000007266	caprin2	97	48.875	ENSSMAG00000016174	caprin2	100	48.875	Scophthalmus_maximus
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ENSAMXG00000007266	caprin2	88	46.004	ENSSSCG00000022611	CAPRIN2	78	46.004	Sus_scrofa
ENSAMXG00000007266	caprin2	94	46.562	ENSTGUG00000011456	-	83	45.614	Taeniopygia_guttata
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ENSAMXG00000007266	caprin2	56	44.505	ENSUAMG00000012343	-	100	44.505	Ursus_americanus
ENSAMXG00000007266	caprin2	86	46.004	ENSUMAG00000002576	CAPRIN2	78	46.004	Ursus_maritimus
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ENSAMXG00000007266	caprin2	63	52.174	ENSVPAG00000007811	CAPRIN1	78	55.385	Vicugna_pacos
ENSAMXG00000007266	caprin2	88	46.004	ENSVVUG00000007217	CAPRIN2	56	57.184	Vulpes_vulpes
ENSAMXG00000007266	caprin2	92	41.391	ENSXETG00000007516	caprin2	81	55.294	Xenopus_tropicalis