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Description

Ensembl ID: ENSAMXG00000007306 (Gene tree)
Gene ID: 103033241
Gene Symbol: prpf3
Alias: HPRP3|wu:fa11f05
Full Name: pre-mRNA processing factor 3
Gene Type: protein_coding
Species: Astyanax_mexicanus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 12151 bases
Position: chr11:2110841-2122991
Accession: 103033241
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAMXP00000007514	PRP3	PF08572.10	3.7e-76	1	1
ENSAMXP00000007514	PWI	PF01480.17	5.2e-12	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAMXT00000007514	-	4369	XM_007256835	ENSAMXP00000007514	708 (aa)	XP_007256897	W5KIV2

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
amex03040	Spliceosome	KEGG

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAMXG00000007306	prpf3	99	73.380	ENSG00000117360	PRPF3	100	73.803	Homo_sapiens
ENSAMXG00000007306	prpf3	100	82.725	ENSAPOG00000015584	prpf3	100	83.708	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAMXG00000007306	prpf3	99	73.521	ENSAMEG00000001630	PRPF3	100	73.944	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAMXG00000007306	prpf3	100	81.767	ENSACIG00000007876	prpf3	100	81.767	Amphilophus_citrinellus
ENSAMXG00000007306	prpf3	100	82.444	ENSAOCG00000011449	prpf3	100	83.708	Amphiprion_ocellaris
ENSAMXG00000007306	prpf3	100	82.749	ENSATEG00000023583	prpf3	100	83.170	Anabas_testudineus
ENSAMXG00000007306	prpf3	99	74.085	ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	74.085	Anas_platyrhynchos
ENSAMXG00000007306	prpf3	99	72.893	ENSACAG00000003176	PRPF3	100	73.529	Anolis_carolinensis
ENSAMXG00000007306	prpf3	99	73.380	ENSANAG00000026138	PRPF3	100	73.803	Aotus_nancymaae
ENSAMXG00000007306	prpf3	100	80.699	ENSACLG00000020127	prpf3	100	81.259	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000007306	prpf3	99	73.380	ENSBTAG00000013946	PRPF3	100	73.803	Bos_taurus
ENSAMXG00000007306	prpf3	82	37.797	WBGene00010844	prp-3	96	35.269	Caenorhabditis_elegans
ENSAMXG00000007306	prpf3	99	73.380	ENSCJAG00000009926	PRPF3	100	73.803	Callithrix_jacchus
ENSAMXG00000007306	prpf3	99	73.380	ENSCAFG00000011820	PRPF3	100	73.803	Canis_familiaris
ENSAMXG00000007306	prpf3	81	72.125	ENSCAFG00020019653	PRPF3	100	72.648	Canis_lupus_dingo
ENSAMXG00000007306	prpf3	99	73.380	ENSCHIG00000015434	PRPF3	100	73.803	Capra_hircus
ENSAMXG00000007306	prpf3	99	73.662	ENSTSYG00000001383	PRPF3	100	74.085	Carlito_syrichta
ENSAMXG00000007306	prpf3	93	62.142	ENSCAPG00000017812	PRPF3	95	62.594	Cavia_aperea
ENSAMXG00000007306	prpf3	99	73.521	ENSCPOG00000008068	PRPF3	100	73.944	Cavia_porcellus
ENSAMXG00000007306	prpf3	99	73.380	ENSCCAG00000026380	PRPF3	100	73.803	Cebus_capucinus
ENSAMXG00000007306	prpf3	99	61.259	ENSCATG00000041778	PRPF3	100	61.678	Cercocebus_atys
ENSAMXG00000007306	prpf3	99	73.521	ENSCLAG00000015009	PRPF3	100	73.944	Chinchilla_lanigera
ENSAMXG00000007306	prpf3	76	84.307	ENSCHOG00000011645	PRPF3	76	84.307	Choloepus_hoffmanni
ENSAMXG00000007306	prpf3	99	74.225	ENSCPBG00000008216	PRPF3	100	74.648	Chrysemys_picta_bellii
ENSAMXG00000007306	prpf3	59	58.195	ENSCING00000003312	-	100	58.195	Ciona_intestinalis
ENSAMXG00000007306	prpf3	86	50.814	ENSCSAVG00000008720	-	97	51.672	Ciona_savignyi
ENSAMXG00000007306	prpf3	99	72.817	ENSCANG00000036769	PRPF3	100	73.239	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAMXG00000007306	prpf3	99	73.380	ENSCGRG00001019100	Prpf3	100	73.803	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAMXG00000007306	prpf3	99	73.380	ENSCGRG00000007322	Prpf3	100	73.803	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAMXG00000007306	prpf3	100	80.056	ENSCSEG00000002532	prpf3	100	80.505	Cynoglossus_semilaevis
ENSAMXG00000007306	prpf3	100	80.505	ENSCVAG00000009318	prpf3	100	81.066	Cyprinodon_variegatus
ENSAMXG00000007306	prpf3	100	85.028	ENSDARG00000086425	prpf3	100	86.429	Danio_rerio
ENSAMXG00000007306	prpf3	99	63.662	ENSDNOG00000005904	PRPF3	100	69.252	Dasypus_novemcinctus
ENSAMXG00000007306	prpf3	93	73.222	ENSDORG00000008664	Prpf3	100	73.676	Dipodomys_ordii
ENSAMXG00000007306	prpf3	81	51.282	FBgn0036915	Prp3	99	51.394	Drosophila_melanogaster
ENSAMXG00000007306	prpf3	99	73.803	ENSETEG00000019124	PRPF3	100	74.225	Echinops_telfairi
ENSAMXG00000007306	prpf3	100	62.803	ENSEBUG00000011680	prpf3	100	63.023	Eptatretus_burgeri
ENSAMXG00000007306	prpf3	99	73.380	ENSEASG00005001566	PRPF3	100	73.662	Equus_asinus_asinus
ENSAMXG00000007306	prpf3	99	73.380	ENSECAG00000019840	PRPF3	100	73.803	Equus_caballus
ENSAMXG00000007306	prpf3	82	75.057	ENSEEUG00000007338	PRPF3	85	75.057	Erinaceus_europaeus
ENSAMXG00000007306	prpf3	100	74.543	ENSELUG00000013624	prpf3	100	74.402	Esox_lucius
ENSAMXG00000007306	prpf3	99	73.380	ENSFCAG00000013940	PRPF3	100	73.803	Felis_catus
ENSAMXG00000007306	prpf3	99	73.803	ENSFDAG00000010365	PRPF3	100	74.085	Fukomys_damarensis
ENSAMXG00000007306	prpf3	100	80.508	ENSFHEG00000021746	prpf3	100	81.073	Fundulus_heteroclitus
ENSAMXG00000007306	prpf3	100	79.718	ENSGMOG00000008535	prpf3	100	79.577	Gadus_morhua
ENSAMXG00000007306	prpf3	99	74.225	ENSGALG00000028205	PRPF3	100	74.225	Gallus_gallus
ENSAMXG00000007306	prpf3	100	79.102	ENSGAFG00000012671	prpf3	100	79.663	Gambusia_affinis
ENSAMXG00000007306	prpf3	100	81.232	ENSGACG00000011792	prpf3	100	81.653	Gasterosteus_aculeatus
ENSAMXG00000007306	prpf3	99	74.225	ENSGAGG00000013765	PRPF3	100	76.007	Gopherus_agassizii
ENSAMXG00000007306	prpf3	86	80.178	ENSGGOG00000013174	PRPF3	100	80.178	Gorilla_gorilla
ENSAMXG00000007306	prpf3	100	81.690	ENSHBUG00000003493	prpf3	100	82.254	Haplochromis_burtoni
ENSAMXG00000007306	prpf3	99	73.662	ENSHGLG00000016569	PRPF3	100	73.944	Heterocephalus_glaber_female
ENSAMXG00000007306	prpf3	99	53.586	ENSHGLG00000016033	-	100	53.586	Heterocephalus_glaber_female
ENSAMXG00000007306	prpf3	99	53.380	ENSHGLG00100008951	-	100	53.380	Heterocephalus_glaber_male
ENSAMXG00000007306	prpf3	99	73.662	ENSHGLG00100007590	PRPF3	100	73.944	Heterocephalus_glaber_male
ENSAMXG00000007306	prpf3	100	75.978	ENSHCOG00000014058	prpf3	100	76.880	Hippocampus_comes
ENSAMXG00000007306	prpf3	100	86.299	ENSIPUG00000000902	PRPF3	100	86.582	Ictalurus_punctatus
ENSAMXG00000007306	prpf3	99	73.380	ENSSTOG00000001889	PRPF3	100	73.803	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAMXG00000007306	prpf3	100	80.618	ENSKMAG00000001390	prpf3	100	81.180	Kryptolebias_marmoratus
ENSAMXG00000007306	prpf3	100	82.584	ENSLBEG00000026310	prpf3	100	83.193	Labrus_bergylta
ENSAMXG00000007306	prpf3	93	70.588	ENSLACG00000010541	PRPF3	100	70.588	Latimeria_chalumnae
ENSAMXG00000007306	prpf3	99	73.380	ENSLAFG00000004713	PRPF3	100	73.803	Loxodonta_africana
ENSAMXG00000007306	prpf3	99	73.380	ENSMFAG00000039791	PRPF3	100	73.803	Macaca_fascicularis
ENSAMXG00000007306	prpf3	90	73.270	ENSMMUG00000016301	PRPF3	97	73.585	Macaca_mulatta
ENSAMXG00000007306	prpf3	99	73.380	ENSMNEG00000038161	PRPF3	100	73.803	Macaca_nemestrina
ENSAMXG00000007306	prpf3	86	80.178	ENSMLEG00000040609	PRPF3	100	80.178	Mandrillus_leucophaeus
ENSAMXG00000007306	prpf3	98	48.722	ENSMLEG00000041065	-	97	49.006	Mandrillus_leucophaeus
ENSAMXG00000007306	prpf3	100	83.006	ENSMAMG00000014968	prpf3	100	83.006	Mastacembelus_armatus
ENSAMXG00000007306	prpf3	100	81.882	ENSMZEG00005015970	prpf3	100	82.444	Maylandia_zebra
ENSAMXG00000007306	prpf3	99	74.225	ENSMGAG00000000707	PRPF3	100	74.225	Meleagris_gallopavo
ENSAMXG00000007306	prpf3	99	73.380	ENSMAUG00000017112	Prpf3	100	73.803	Mesocricetus_auratus
ENSAMXG00000007306	prpf3	99	73.380	ENSMICG00000015386	PRPF3	100	75.482	Microcebus_murinus
ENSAMXG00000007306	prpf3	99	73.380	ENSMOCG00000000242	Prpf3	100	73.803	Microtus_ochrogaster
ENSAMXG00000007306	prpf3	100	75.208	ENSMMOG00000016131	prpf3	100	76.741	Mola_mola
ENSAMXG00000007306	prpf3	99	73.803	ENSMODG00000018774	PRPF3	100	74.225	Monodelphis_domestica
ENSAMXG00000007306	prpf3	100	78.442	ENSMALG00000007257	prpf3	100	78.442	Monopterus_albus
ENSAMXG00000007306	prpf3	99	73.521	MGP_CAROLIEiJ_G0025354	Prpf3	100	73.944	Mus_caroli
ENSAMXG00000007306	prpf3	99	73.521	ENSMUSG00000015748	Prpf3	100	73.944	Mus_musculus
ENSAMXG00000007306	prpf3	99	72.958	MGP_PahariEiJ_G0026798	Prpf3	100	73.380	Mus_pahari
ENSAMXG00000007306	prpf3	99	73.521	MGP_SPRETEiJ_G0026298	Prpf3	100	73.944	Mus_spretus
ENSAMXG00000007306	prpf3	99	71.690	ENSMPUG00000005080	PRPF3	100	72.113	Mustela_putorius_furo
ENSAMXG00000007306	prpf3	99	73.840	ENSMLUG00000004646	-	100	74.121	Myotis_lucifugus
ENSAMXG00000007306	prpf3	99	73.380	ENSNGAG00000000910	Prpf3	100	73.803	Nannospalax_galili
ENSAMXG00000007306	prpf3	100	81.907	ENSNBRG00000003462	prpf3	100	82.468	Neolamprologus_brichardi
ENSAMXG00000007306	prpf3	90	73.113	ENSNLEG00000009841	PRPF3	99	73.585	Nomascus_leucogenys
ENSAMXG00000007306	prpf3	83	66.272	ENSMEUG00000008733	PRPF3	89	66.272	Notamacropus_eugenii
ENSAMXG00000007306	prpf3	99	73.521	ENSOPRG00000010139	PRPF3	100	73.803	Ochotona_princeps
ENSAMXG00000007306	prpf3	99	54.735	ENSODEG00000014412	-	100	55.014	Octodon_degus
ENSAMXG00000007306	prpf3	99	73.944	ENSODEG00000011363	-	100	74.366	Octodon_degus
ENSAMXG00000007306	prpf3	100	82.163	ENSONIG00000006394	prpf3	100	82.725	Oreochromis_niloticus
ENSAMXG00000007306	prpf3	99	55.927	ENSOANG00000015441	PRPF3	100	55.927	Ornithorhynchus_anatinus
ENSAMXG00000007306	prpf3	99	73.380	ENSOCUG00000011760	PRPF3	100	73.803	Oryctolagus_cuniculus
ENSAMXG00000007306	prpf3	100	80.112	ENSORLG00000010330	prpf3	100	80.112	Oryzias_latipes
ENSAMXG00000007306	prpf3	100	80.112	ENSORLG00020009054	prpf3	100	80.112	Oryzias_latipes_hni
ENSAMXG00000007306	prpf3	100	79.692	ENSORLG00015015016	prpf3	100	79.692	Oryzias_latipes_hsok
ENSAMXG00000007306	prpf3	100	79.412	ENSOMEG00000000940	prpf3	100	79.916	Oryzias_melastigma
ENSAMXG00000007306	prpf3	99	69.198	ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	69.620	Otolemur_garnettii
ENSAMXG00000007306	prpf3	99	73.380	ENSOARG00000020798	PRPF3	100	73.803	Ovis_aries
ENSAMXG00000007306	prpf3	98	56.509	ENSPPAG00000043769	-	99	56.571	Pan_paniscus
ENSAMXG00000007306	prpf3	99	73.239	ENSPPAG00000030983	PRPF3	100	73.662	Pan_paniscus
ENSAMXG00000007306	prpf3	99	73.380	ENSPPRG00000000731	PRPF3	100	73.803	Panthera_pardus
ENSAMXG00000007306	prpf3	99	73.380	ENSPTIG00000005516	PRPF3	100	73.803	Panthera_tigris_altaica
ENSAMXG00000007306	prpf3	99	73.380	ENSPTRG00000001254	PRPF3	100	73.803	Pan_troglodytes
ENSAMXG00000007306	prpf3	98	55.651	ENSPTRG00000047819	-	99	55.714	Pan_troglodytes
ENSAMXG00000007306	prpf3	99	73.239	ENSPANG00000000499	PRPF3	100	73.662	Papio_anubis
ENSAMXG00000007306	prpf3	100	82.889	ENSPKIG00000010501	prpf3	100	82.889	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAMXG00000007306	prpf3	99	74.507	ENSPSIG00000014877	PRPF3	100	74.930	Pelodiscus_sinensis
ENSAMXG00000007306	prpf3	100	70.663	ENSPMGG00000007776	prpf3	100	71.086	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSAMXG00000007306	prpf3	99	73.380	ENSPEMG00000011672	Prpf3	100	73.803	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAMXG00000007306	prpf3	61	70.709	ENSPMAG00000005588	prpf3	99	69.469	Petromyzon_marinus
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