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Description

Ensembl ID: ENSAMXG00000009842 (Gene tree)
Gene ID: 103021680
Gene Symbol: tnpo1
Alias: Kapbeta2|karyopherin beta 2
Full Name: transportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Astyanax_mexicanus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 32944 bases
Position: chrAPWO02000139.1:4840569-4873512
Accession: 103021680
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAMXP00000010109	IBN_N	PF03810.19	7.8e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAMXT00000010109	-	7481	XM_007259621	ENSAMXP00000010109	892 (aa)	XP_007259683	W5KR97

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSAMXG00000009842	tnpo1	99	86.142	ENSAMXG00000010246	tnpo2	98	87.781

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	92.377	ENSG00000083312	TNPO1	100	93.264	Homo_sapiens
ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	94.731	ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	95.179	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	91.444	ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	91.889	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAMXG00000009842	tnpo1	87	93.299	ENSACIG00000003711	tnpo1	99	93.557	Amphilophus_citrinellus
ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	94.731	ENSAOCG00000008154	tnpo1	100	95.179	Amphiprion_ocellaris
ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	94.731	ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	95.179	Amphiprion_percula
ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	94.507	ENSATEG00000010408	tnpo1	100	94.731	Anabas_testudineus
ENSAMXG00000009842	tnpo1	99	88.839	ENSAPLG00000009619	-	96	90.603	Anas_platyrhynchos
ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	92.937	ENSACAG00000009599	TNPO1	100	92.825	Anolis_carolinensis
ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	59.181	ENSANAG00000027118	-	99	60.309	Aotus_nancymaae
ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	91.928	ENSANAG00000022453	-	99	92.265	Aotus_nancymaae
ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	83.184	ENSANAG00000025351	-	99	83.184	Aotus_nancymaae
ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	92.040	ENSACLG00000027223	tnpo1	100	92.265	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	92.489	ENSBTAG00000007979	TNPO1	99	92.825	Bos_taurus
ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	92.040	ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	92.377	Callithrix_jacchus
ENSAMXG00000009842	tnpo1	96	92.433	ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	92.782	Canis_familiaris
ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	89.910	ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	90.247	Canis_lupus_dingo
ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	92.601	ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	92.713	Capra_hircus
ENSAMXG00000009842	tnpo1	99	89.177	ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	91.599	Carlito_syrichta
ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	91.928	ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	92.265	Cebus_capucinus
ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	92.377	ENSCATG00000043792	TNPO1	100	92.713	Cercocebus_atys
ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	91.928	ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	92.265	Chinchilla_lanigera
ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	92.377	ENSCSAG00000015616	TNPO1	99	92.713	Chlorocebus_sabaeus
ENSAMXG00000009842	tnpo1	94	80.618	ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	81.094	Choloepus_hoffmanni
ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	92.937	ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	92.937	Chrysemys_picta_bellii
ENSAMXG00000009842	tnpo1	99	76.148	ENSCSAVG00000010981	-	99	76.148	Ciona_savignyi
ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	92.377	ENSCANG00000004353	TNPO1	99	92.713	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	92.265	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	92.601	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAMXG00000009842	tnpo1	96	92.532	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	100	92.882	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	93.161	ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	93.610	Cynoglossus_semilaevis
ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	94.619	ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	94.731	Cyprinodon_variegatus
ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	94.507	ENSDARG00000035390	tnpo1	100	94.507	Danio_rerio
ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	86.704	ENSDNOG00000006647	TNPO1	99	87.151	Dasypus_novemcinctus
ENSAMXG00000009842	tnpo1	93	92.428	ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	92.900	Dipodomys_ordii
ENSAMXG00000009842	tnpo1	99	58.493	FBgn0035693	CG8219	99	57.930	Drosophila_melanogaster
ENSAMXG00000009842	tnpo1	86	94.007	ENSETEG00000017805	TNPO1	89	94.007	Echinops_telfairi
ENSAMXG00000009842	tnpo1	94	86.223	ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	86.223	Eptatretus_burgeri
ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	92.377	ENSEASG00005018055	TNPO1	100	92.713	Equus_asinus_asinus
ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	92.601	ENSECAG00000024424	TNPO1	99	92.937	Equus_caballus
ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	87.800	ENSELUG00000002821	tnpo1	100	87.800	Esox_lucius
ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	92.377	ENSFCAG00000013181	TNPO1	100	92.713	Felis_catus
ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	92.713	ENSFALG00000010292	TNPO1	100	93.049	Ficedula_albicollis
ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	92.040	ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	92.377	Fukomys_damarensis
ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	94.395	ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	94.619	Fundulus_heteroclitus
ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	92.617	ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	92.953	Gadus_morhua
ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	91.704	ENSGALG00000015014	TNPO1	100	92.152	Gallus_gallus
ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	94.507	ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	94.625	Gambusia_affinis
ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	93.498	ENSGACG00000015841	tnpo1	99	94.170	Gasterosteus_aculeatus
ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	92.601	ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	92.713	Gopherus_agassizii
ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	77.466	ENSGGOG00000022535	-	98	77.828	Gorilla_gorilla
ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	92.377	ENSGGOG00000026800	TNPO1	100	92.713	Gorilla_gorilla
ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	93.498	ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	94.170	Haplochromis_burtoni
ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	92.152	ENSHGLG00000000970	-	99	92.265	Heterocephalus_glaber_female
ENSAMXG00000009842	tnpo1	96	92.308	ENSHGLG00100017090	-	99	92.424	Heterocephalus_glaber_male
ENSAMXG00000009842	tnpo1	97	72.970	ENSHGLG00100000963	-	99	72.738	Heterocephalus_glaber_male
ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	92.489	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	92.825	Jaculus_jaculus
ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	94.058	ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	94.058	Kryptolebias_marmoratus
ENSAMXG00000009842	tnpo1	91	92.118	ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	92.118	Labrus_bergylta
ENSAMXG00000009842	tnpo1	96	87.239	ENSLACG00000012199	TNPO1	100	87.239	Latimeria_chalumnae
ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	94.170	ENSLOCG00000011092	tnpo1	97	94.170	Lepisosteus_oculatus
ENSAMXG00000009842	tnpo1	97	91.820	ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	92.166	Loxodonta_africana
ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	92.377	ENSMFAG00000003636	TNPO1	99	92.713	Macaca_fascicularis
ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	92.265	ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	92.793	Macaca_mulatta
ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	92.377	ENSMNEG00000044581	TNPO1	99	92.713	Macaca_nemestrina
ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	92.377	ENSMLEG00000030740	TNPO1	99	92.713	Mandrillus_leucophaeus
ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	94.843	ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	95.067	Mastacembelus_armatus
ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	93.274	ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	93.498	Maylandia_zebra
ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	92.265	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	93.258	Mesocricetus_auratus
ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	88.565	ENSMICG00000008468	TNPO1	99	88.901	Microcebus_murinus
ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	92.265	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	92.601	Microtus_ochrogaster
ENSAMXG00000009842	tnpo1	87	93.814	ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	93.822	Mola_mola
ENSAMXG00000009842	tnpo1	99	93.404	ENSMODG00000001721	TNPO1	80	93.404	Monodelphis_domestica
ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	93.498	ENSMALG00000009782	tnpo1	100	93.946	Monopterus_albus
ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	92.377	MGP_CAROLIEiJ_G0018826	Tnpo1	100	93.258	Mus_caroli
ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	92.265	ENSMUSG00000009470	Tnpo1	100	93.258	Mus_musculus
ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	92.377	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	93.258	Mus_pahari
ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	92.265	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	100	93.258	Mus_spretus
ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	92.265	ENSMPUG00000014387	TNPO1	99	92.601	Mustela_putorius_furo
ENSAMXG00000009842	tnpo1	96	91.986	ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	92.334	Myotis_lucifugus
ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	92.377	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	92.713	Nannospalax_galili
ENSAMXG00000009842	tnpo1	87	93.428	ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	93.686	Neolamprologus_brichardi
ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	92.377	ENSNLEG00000004572	TNPO1	100	92.713	Nomascus_leucogenys
ENSAMXG00000009842	tnpo1	90	88.498	ENSOPRG00000012390	TNPO1	89	88.498	Ochotona_princeps
ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	91.928	ENSODEG00000001771	TNPO1	99	92.040	Octodon_degus
ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	92.762	ENSONIG00000011151	tnpo1	99	93.430	Oreochromis_niloticus
ENSAMXG00000009842	tnpo1	92	93.187	ENSOANG00000015785	TNPO1	100	93.309	Ornithorhynchus_anatinus
ENSAMXG00000009842	tnpo1	96	87.179	ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	87.179	Oryctolagus_cuniculus
ENSAMXG00000009842	tnpo1	87	93.661	ENSORLG00000003182	tnpo1	99	94.049	Oryzias_latipes
ENSAMXG00000009842	tnpo1	99	94.038	ENSORLG00020011559	tnpo1	99	94.376	Oryzias_latipes_hni
ENSAMXG00000009842	tnpo1	99	94.151	ENSORLG00015019113	tnpo1	99	94.376	Oryzias_latipes_hsok
ENSAMXG00000009842	tnpo1	99	93.813	ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	94.151	Oryzias_melastigma
ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	92.377	ENSOGAG00000000808	TNPO1	99	92.713	Otolemur_garnettii
ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	92.489	ENSOARG00000005038	TNPO1	84	92.825	Ovis_aries
ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	92.377	ENSPPAG00000042518	TNPO1	99	92.713	Pan_paniscus
ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	92.377	ENSPPRG00000022336	TNPO1	100	92.713	Panthera_pardus
ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	92.377	ENSPTIG00000018839	TNPO1	100	92.713	Panthera_tigris_altaica
ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	92.377	ENSPTRG00000016972	TNPO1	99	92.713	Pan_troglodytes
ENSAMXG00000009842	tnpo1	94	81.492	ENSPTRG00000047731	-	100	81.931	Pan_troglodytes
ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	92.377	ENSPANG00000006074	TNPO1	99	92.713	Papio_anubis
ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	90.471	ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	91.143	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	92.937	ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	93.161	Pelodiscus_sinensis
ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	91.041	ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	91.153	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSAMXG00000009842	tnpo1	96	92.532	ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	92.882	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	92.825	ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	93.161	Phascolarctos_cinereus
ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	94.407	ENSPFOG00000011447	tnpo1	100	94.407	Poecilia_formosa
ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	94.407	ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	94.407	Poecilia_latipinna
ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	94.395	ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	94.507	Poecilia_mexicana
ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	94.731	ENSPREG00000020705	tnpo1	100	94.625	Poecilia_reticulata
ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	92.265	ENSPPYG00000015545	TNPO1	99	92.601	Pongo_abelii
ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	92.377	ENSPCOG00000004254	TNPO1	99	92.713	Propithecus_coquereli
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ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	93.498	ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	94.170	Pundamilia_nyererei
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ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	92.601	ENSVVUG00000007338	TNPO1	100	92.713	Vulpes_vulpes
ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	91.480	ENSXETG00000016812	tnpo1	99	91.480	Xenopus_tropicalis
ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	94.731	ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	94.731	Xiphophorus_maculatus