EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAMXG00000009975 (Gene tree)
Gene ID: 103034558
Gene Symbol: srpra
Alias: id:ibd1064|srpr|wu:fd12f02
Full Name: SRP receptor subunit alpha
Gene Type: protein_coding
Species: Astyanax_mexicanus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 22388 bases
Position: chrAPWO02000454.1:31482-53869
Accession: 103034558
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAMXP00000010348	SRP54	PF00448.22	5.5e-48	1	1
ENSAMXP00000010348	SRP54_N	PF02881.19	4.2e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAMXT00000010348	-	1755	XM_022685975	ENSAMXP00000010348	584 (aa)	XP_022541696	W5KRY6

Gene Model

Click here to download ENSAMXG00000009975's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
amex03060	Protein export	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSAMXG00000009975's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAMXG00000009975	srpra	100	65.319	ENSG00000182934	SRPRA	100	65.839	Homo_sapiens
ENSAMXG00000009975	srpra	100	73.538	ENSAPOG00000017588	srpra	100	73.385	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAMXG00000009975	srpra	100	65.062	ENSAMEG00000000117	SRPRA	100	65.528	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAMXG00000009975	srpra	100	71.783	ENSACIG00000021588	srpra	100	71.894	Amphilophus_citrinellus
ENSAMXG00000009975	srpra	100	74.426	ENSAOCG00000018884	srpra	100	75.410	Amphiprion_ocellaris
ENSAMXG00000009975	srpra	100	74.262	ENSAPEG00000022286	srpra	100	75.410	Amphiprion_percula
ENSAMXG00000009975	srpra	100	71.290	ENSATEG00000023578	srpra	100	71.626	Anabas_testudineus
ENSAMXG00000009975	srpra	93	63.427	ENSAPLG00000016079	SRPRA	99	65.898	Anas_platyrhynchos
ENSAMXG00000009975	srpra	100	66.049	ENSACAG00000000108	SRPRA	100	67.180	Anolis_carolinensis
ENSAMXG00000009975	srpra	100	64.907	ENSANAG00000020346	SRPRA	100	65.373	Aotus_nancymaae
ENSAMXG00000009975	srpra	100	73.611	ENSACLG00000000518	srpra	100	73.725	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000009975	srpra	100	64.130	ENSBTAG00000014105	SRPRA	100	66.047	Bos_taurus
ENSAMXG00000009975	srpra	99	47.114	WBGene00009521	F38A1.8	99	47.205	Caenorhabditis_elegans
ENSAMXG00000009975	srpra	100	65.008	ENSCJAG00000008752	SRPRA	100	65.474	Callithrix_jacchus
ENSAMXG00000009975	srpra	100	63.297	ENSCAFG00000010474	SRPRA	100	63.820	Canis_familiaris
ENSAMXG00000009975	srpra	100	64.852	ENSCAFG00020010608	SRPRA	100	65.373	Canis_lupus_dingo
ENSAMXG00000009975	srpra	100	65.891	ENSCHIG00000012423	SRPRA	100	65.891	Capra_hircus
ENSAMXG00000009975	srpra	100	64.055	ENSTSYG00000005187	SRPRA	100	64.055	Carlito_syrichta
ENSAMXG00000009975	srpra	94	61.818	ENSCAPG00000007098	SRPRA	91	87.970	Cavia_aperea
ENSAMXG00000009975	srpra	100	65.062	ENSCPOG00000014976	SRPRA	91	87.970	Cavia_porcellus
ENSAMXG00000009975	srpra	100	65.062	ENSCCAG00000025602	SRPRA	100	65.116	Cebus_capucinus
ENSAMXG00000009975	srpra	100	65.319	ENSCATG00000039354	SRPRA	100	65.839	Cercocebus_atys
ENSAMXG00000009975	srpra	100	65.008	ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	65.528	Chinchilla_lanigera
ENSAMXG00000009975	srpra	100	65.217	ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	65.683	Chlorocebus_sabaeus
ENSAMXG00000009975	srpra	57	85.714	ENSCHOG00000010015	-	72	85.714	Choloepus_hoffmanni
ENSAMXG00000009975	srpra	100	64.516	ENSCPBG00000011128	SRPRA	100	66.206	Chrysemys_picta_bellii
ENSAMXG00000009975	srpra	99	55.418	ENSCING00000008954	-	100	55.573	Ciona_intestinalis
ENSAMXG00000009975	srpra	99	59.360	ENSCSAVG00000005602	-	100	59.360	Ciona_savignyi
ENSAMXG00000009975	srpra	100	65.319	ENSCANG00000032337	SRPRA	100	65.480	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAMXG00000009975	srpra	100	65.000	ENSCGRG00001017670	Srpr	100	65.679	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAMXG00000009975	srpra	100	65.000	ENSCGRG00000009892	Srpr	90	88.889	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAMXG00000009975	srpra	100	71.865	ENSCSEG00000002374	srpra	100	72.186	Cynoglossus_semilaevis
ENSAMXG00000009975	srpra	54	92.063	ENSCVAG00000019881	srpra	100	70.833	Cyprinodon_variegatus
ENSAMXG00000009975	srpra	100	74.501	ENSDARG00000061124	srpra	100	74.501	Danio_rerio
ENSAMXG00000009975	srpra	100	65.438	ENSDNOG00000010821	SRPRA	100	65.438	Dasypus_novemcinctus
ENSAMXG00000009975	srpra	100	64.743	ENSDORG00000016719	Srpr	100	65.265	Dipodomys_ordii
ENSAMXG00000009975	srpra	99	50.791	FBgn0010391	Gtp-bp	100	51.659	Drosophila_melanogaster
ENSAMXG00000009975	srpra	100	63.608	ENSETEG00000013956	SRPRA	100	63.608	Echinops_telfairi
ENSAMXG00000009975	srpra	62	73.615	ENSEBUG00000002602	srpra	92	72.111	Eptatretus_burgeri
ENSAMXG00000009975	srpra	100	65.732	ENSEASG00005022980	SRPRA	100	65.732	Equus_asinus_asinus
ENSAMXG00000009975	srpra	100	65.576	ENSECAG00000014692	SRPRA	100	65.576	Equus_caballus
ENSAMXG00000009975	srpra	100	60.983	ENSEEUG00000007920	SRPRA	100	61.444	Erinaceus_europaeus
ENSAMXG00000009975	srpra	100	72.811	ENSELUG00000017643	srpra	100	73.733	Esox_lucius
ENSAMXG00000009975	srpra	78	59.574	ENSFCAG00000030894	-	99	59.574	Felis_catus
ENSAMXG00000009975	srpra	100	65.891	ENSFCAG00000011274	-	100	65.891	Felis_catus
ENSAMXG00000009975	srpra	99	60.092	ENSFALG00000005048	SRPRA	99	63.027	Ficedula_albicollis
ENSAMXG00000009975	srpra	100	64.697	ENSFDAG00000016229	SRPRA	92	83.916	Fukomys_damarensis
ENSAMXG00000009975	srpra	97	93.016	ENSFHEG00000016959	srpra	100	72.350	Fundulus_heteroclitus
ENSAMXG00000009975	srpra	100	75.323	ENSGMOG00000013244	srpra	100	75.806	Gadus_morhua
ENSAMXG00000009975	srpra	100	64.462	ENSGALG00000030759	SRPRA	100	66.615	Gallus_gallus
ENSAMXG00000009975	srpra	100	73.616	ENSGAFG00000000453	srpra	100	73.616	Gambusia_affinis
ENSAMXG00000009975	srpra	100	72.897	ENSGACG00000006550	srpra	100	74.143	Gasterosteus_aculeatus
ENSAMXG00000009975	srpra	100	64.154	ENSGAGG00000021157	SRPRA	100	65.899	Gopherus_agassizii
ENSAMXG00000009975	srpra	100	65.319	ENSGGOG00000012962	SRPRA	100	65.839	Gorilla_gorilla
ENSAMXG00000009975	srpra	100	73.457	ENSHBUG00000000119	srpra	100	73.570	Haplochromis_burtoni
ENSAMXG00000009975	srpra	100	64.541	ENSHGLG00000001597	SRPR	94	89.394	Heterocephalus_glaber_female
ENSAMXG00000009975	srpra	100	64.541	ENSHGLG00100006449	SRPR	94	89.394	Heterocephalus_glaber_male
ENSAMXG00000009975	srpra	100	70.626	ENSHCOG00000010749	srpra	100	71.626	Hippocampus_comes
ENSAMXG00000009975	srpra	93	74.178	ENSIPUG00000000867	srpra	99	74.342	Ictalurus_punctatus
ENSAMXG00000009975	srpra	100	65.008	ENSSTOG00000009897	SRPRA	100	65.528	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAMXG00000009975	srpra	100	64.587	ENSJJAG00000020272	Srpr	100	65.109	Jaculus_jaculus
ENSAMXG00000009975	srpra	95	92.698	ENSKMAG00000002280	srpra	100	71.429	Kryptolebias_marmoratus
ENSAMXG00000009975	srpra	100	72.811	ENSLBEG00000009608	srpra	100	73.118	Labrus_bergylta
ENSAMXG00000009975	srpra	100	66.044	ENSLACG00000017781	SRPRA	100	67.341	Latimeria_chalumnae
ENSAMXG00000009975	srpra	98	92.500	ENSLOCG00000002733	srpra	100	69.266	Lepisosteus_oculatus
ENSAMXG00000009975	srpra	100	64.130	ENSLAFG00000010252	SRPRA	100	65.736	Loxodonta_africana
ENSAMXG00000009975	srpra	100	65.373	ENSMFAG00000032606	SRPRA	100	65.839	Macaca_fascicularis
ENSAMXG00000009975	srpra	100	65.373	ENSMMUG00000007938	SRPRA	100	65.839	Macaca_mulatta
ENSAMXG00000009975	srpra	100	65.373	ENSMNEG00000030709	SRPRA	100	65.839	Macaca_nemestrina
ENSAMXG00000009975	srpra	100	65.319	ENSMLEG00000043404	SRPRA	100	65.839	Mandrillus_leucophaeus
ENSAMXG00000009975	srpra	100	72.573	ENSMAMG00000000473	srpra	100	72.573	Mastacembelus_armatus
ENSAMXG00000009975	srpra	100	73.611	ENSMZEG00005013432	srpra	100	73.725	Maylandia_zebra
ENSAMXG00000009975	srpra	93	63.725	ENSMGAG00000000732	SRPRA	100	65.686	Meleagris_gallopavo
ENSAMXG00000009975	srpra	100	65.000	ENSMAUG00000015648	Srpr	100	65.679	Mesocricetus_auratus
ENSAMXG00000009975	srpra	100	64.907	ENSMICG00000015981	SRPRA	100	65.373	Microcebus_murinus
ENSAMXG00000009975	srpra	100	64.688	ENSMOCG00000008311	Srpr	100	65.211	Microtus_ochrogaster
ENSAMXG00000009975	srpra	100	70.998	ENSMMOG00000005019	srpra	100	71.949	Mola_mola
ENSAMXG00000009975	srpra	100	63.339	ENSMODG00000004576	-	100	64.119	Monodelphis_domestica
ENSAMXG00000009975	srpra	100	72.462	ENSMALG00000011343	srpra	100	72.769	Monopterus_albus
ENSAMXG00000009975	srpra	100	64.688	MGP_CAROLIEiJ_G0031951	Srpr	86	88.636	Mus_caroli
ENSAMXG00000009975	srpra	100	65.055	ENSMUSG00000032042	Srpr	86	89.394	Mus_musculus
ENSAMXG00000009975	srpra	100	64.844	MGP_PahariEiJ_G0014816	Srpr	86	89.394	Mus_pahari
ENSAMXG00000009975	srpra	100	61.756	MGP_SPRETEiJ_G0033075	Srpr	100	62.110	Mus_spretus
ENSAMXG00000009975	srpra	100	65.062	ENSMPUG00000006626	SRPRA	100	65.528	Mustela_putorius_furo
ENSAMXG00000009975	srpra	100	64.890	ENSMLUG00000017334	SRPRA	100	65.571	Myotis_lucifugus
ENSAMXG00000009975	srpra	100	64.587	ENSNGAG00000015686	Srpr	100	65.109	Nannospalax_galili
ENSAMXG00000009975	srpra	100	73.457	ENSNBRG00000017311	srpra	100	73.570	Neolamprologus_brichardi
ENSAMXG00000009975	srpra	99	61.875	ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	64.763	Nomascus_leucogenys
ENSAMXG00000009975	srpra	93	62.521	ENSMEUG00000004956	SRPRA	100	63.350	Notamacropus_eugenii
ENSAMXG00000009975	srpra	100	63.183	ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	63.707	Ochotona_princeps
ENSAMXG00000009975	srpra	100	64.688	ENSODEG00000004730	SRPRA	100	65.319	Octodon_degus
ENSAMXG00000009975	srpra	100	73.261	ENSONIG00000005324	srpra	100	73.611	Oreochromis_niloticus
ENSAMXG00000009975	srpra	100	65.163	ENSOCUG00000017057	SRPRA	100	65.630	Oryctolagus_cuniculus
ENSAMXG00000009975	srpra	100	73.250	ENSORLG00000014676	srpra	100	72.784	Oryzias_latipes
ENSAMXG00000009975	srpra	100	73.250	ENSORLG00020009240	srpra	100	72.784	Oryzias_latipes_hni
ENSAMXG00000009975	srpra	100	74.801	ENSORLG00015015405	srpra	100	74.801	Oryzias_latipes_hsok
ENSAMXG00000009975	srpra	100	75.323	ENSOMEG00000005872	srpra	100	75.323	Oryzias_melastigma
ENSAMXG00000009975	srpra	100	65.683	ENSOGAG00000008926	SRPRA	100	65.683	Otolemur_garnettii
ENSAMXG00000009975	srpra	100	62.578	ENSOARG00000012397	SRPRA	100	63.721	Ovis_aries
ENSAMXG00000009975	srpra	100	65.319	ENSPPAG00000030813	SRPRA	100	65.839	Pan_paniscus
ENSAMXG00000009975	srpra	100	65.891	ENSPPRG00000001542	SRPRA	100	65.891	Panthera_pardus
ENSAMXG00000009975	srpra	100	65.736	ENSPTIG00000006989	SRPRA	100	65.736	Panthera_tigris_altaica
ENSAMXG00000009975	srpra	100	65.319	ENSPTRG00000028360	SRPRA	100	65.839	Pan_troglodytes
ENSAMXG00000009975	srpra	100	65.373	ENSPANG00000010858	SRPRA	100	65.839	Papio_anubis
ENSAMXG00000009975	srpra	100	70.755	ENSPKIG00000016106	srpra	100	71.474	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAMXG00000009975	srpra	93	65.789	ENSPSIG00000012009	SRPRA	100	66.338	Pelodiscus_sinensis
ENSAMXG00000009975	srpra	100	73.709	ENSPMGG00000001393	srpra	100	73.709	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSAMXG00000009975	srpra	100	64.844	ENSPEMG00000018279	Srpr	100	65.367	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAMXG00000009975	srpra	99	59.317	ENSPMAG00000009559	srpra	99	59.845	Petromyzon_marinus
ENSAMXG00000009975	srpra	100	63.426	ENSPCIG00000010207	SRPRA	100	64.615	Phascolarctos_cinereus
ENSAMXG00000009975	srpra	96	93.333	ENSPFOG00000003114	srpra	100	73.077	Poecilia_formosa
ENSAMXG00000009975	srpra	96	93.333	ENSPLAG00000007323	srpra	100	74.388	Poecilia_latipinna
ENSAMXG00000009975	srpra	96	93.333	ENSPMEG00000015658	srpra	100	75.286	Poecilia_mexicana
ENSAMXG00000009975	srpra	96	93.016	ENSPREG00000004937	srpra	100	73.573	Poecilia_reticulata
ENSAMXG00000009975	srpra	74	57.085	ENSPPYG00000004045	SRPRA	87	57.778	Pongo_abelii
ENSAMXG00000009975	srpra	63	90.698	ENSPCAG00000003801	-	62	90.698	Procavia_capensis
ENSAMXG00000009975	srpra	100	65.528	ENSPCOG00000025726	SRPRA	100	65.994	Propithecus_coquereli
ENSAMXG00000009975	srpra	100	65.204	ENSPVAG00000000993	SRPRA	100	65.728	Pteropus_vampyrus
ENSAMXG00000009975	srpra	100	73.611	ENSPNYG00000012371	srpra	100	73.725	Pundamilia_nyererei
ENSAMXG00000009975	srpra	54	97.468	ENSPNAG00000013476	srpra	100	80.710	Pygocentrus_nattereri
ENSAMXG00000009975	srpra	100	64.688	ENSRNOG00000010543	Srpra	100	65.211	Rattus_norvegicus
ENSAMXG00000009975	srpra	100	65.373	ENSRBIG00000008702	SRPRA	100	65.373	Rhinopithecus_bieti
ENSAMXG00000009975	srpra	100	65.116	ENSRROG00000029494	SRPRA	100	65.581	Rhinopithecus_roxellana
ENSAMXG00000009975	srpra	54	42.515	YDR292C	-	53	42.515	Saccharomyces_cerevisiae
ENSAMXG00000009975	srpra	100	65.217	ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	65.683	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSAMXG00000009975	srpra	93	63.054	ENSSHAG00000009168	SRPRA	99	64.695	Sarcophilus_harrisii
ENSAMXG00000009975	srpra	100	74.669	ENSSFOG00015008837	srpra	100	74.917	Scleropages_formosus
ENSAMXG00000009975	srpra	100	70.787	ENSSMAG00000002783	srpra	100	72.552	Scophthalmus_maximus
ENSAMXG00000009975	srpra	100	74.309	ENSSDUG00000013920	srpra	100	74.634	Seriola_dumerili
ENSAMXG00000009975	srpra	100	72.504	ENSSLDG00000008601	srpra	93	72.965	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSAMXG00000009975	srpra	83	82.927	ENSSARG00000012434	SRPRA	86	82.927	Sorex_araneus
ENSAMXG00000009975	srpra	100	64.142	ENSSPUG00000018221	SRPRA	100	65.385	Sphenodon_punctatus
ENSAMXG00000009975	srpra	100	72.853	ENSSPAG00000005103	srpra	87	86.423	Stegastes_partitus
ENSAMXG00000009975	srpra	100	65.373	ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	65.839	Sus_scrofa
ENSAMXG00000009975	srpra	93	61.818	ENSTGUG00000000815	SRPRA	100	63.471	Taeniopygia_guttata
ENSAMXG00000009975	srpra	100	71.073	ENSTRUG00000006856	srpra	100	72.473	Takifugu_rubripes
ENSAMXG00000009975	srpra	100	67.737	ENSTNIG00000010316	srpra	100	68.606	Tetraodon_nigroviridis
ENSAMXG00000009975	srpra	100	64.961	ENSTTRG00000001558	SRPRA	100	65.736	Tursiops_truncatus
ENSAMXG00000009975	srpra	100	64.961	ENSUAMG00000005510	SRPRA	100	65.426	Ursus_americanus
ENSAMXG00000009975	srpra	96	59.903	ENSUMAG00000002269	SRPRA	100	60.450	Ursus_maritimus
ENSAMXG00000009975	srpra	66	90.698	ENSVPAG00000001077	SRPRA	75	90.698	Vicugna_pacos
ENSAMXG00000009975	srpra	100	65.008	ENSVVUG00000020094	SRPRA	100	65.528	Vulpes_vulpes
ENSAMXG00000009975	srpra	100	55.335	ENSXETG00000003920	srpra	100	56.991	Xenopus_tropicalis
ENSAMXG00000009975	srpra	100	68.595	ENSXCOG00000001286	srpra	100	69.917	Xiphophorus_couchianus
ENSAMXG00000009975	srpra	100	72.334	ENSXMAG00000028401	srpra	100	72.881	Xiphophorus_maculatus