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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAMXG00000011328 (Gene tree)
Gene ID: 103035887
Gene Symbol: zc3h12b
Alias: si:dkey-286f3.6
Full Name: zinc finger CCCH-type containing 12B
Gene Type: protein_coding
Species: Astyanax_mexicanus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 26242 bases
Position: chr3:35823655-35849896
Accession: 103035887
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAMXP00000011633	RNase_Zc3h12a	PF11977.8	1.4e-64	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAMXT00000011633	-	3039	XM_007256402	ENSAMXP00000011633	1012 (aa)	XP_007256464	W5KVM1

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	79	43.304	ENSAMXG00000038308	-	86	44.034
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	79	44.583	ENSAMXG00000005320	-	91	45.087

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	88	63.667	ENSG00000102053	ZC3H12B	91	66.667	Homo_sapiens
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	82	75.420	ENSAPOG00000001738	zc3h12b	93	75.663	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	65	68.627	ENSAMEG00000006955	ZC3H12B	99	67.927	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	81	75.240	ENSACIG00000009787	zc3h12b	93	75.090	Amphilophus_citrinellus
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	81	75.933	ENSAOCG00000010094	zc3h12b	93	76.024	Amphiprion_ocellaris
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	81	75.812	ENSAPEG00000007479	zc3h12b	93	75.904	Amphiprion_percula
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	81	76.053	ENSATEG00000011175	zc3h12b	93	75.904	Anabas_testudineus
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	81	69.455	ENSACAG00000013582	ZC3H12B	93	69.175	Anolis_carolinensis
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	88	63.667	ENSANAG00000010296	ZC3H12B	91	66.788	Aotus_nancymaae
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	81	75.120	ENSACLG00000007669	zc3h12b	93	74.970	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	86	64.531	ENSBTAG00000002206	ZC3H12B	92	66.788	Bos_taurus
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	88	63.333	ENSCJAG00000001427	ZC3H12B	91	66.545	Callithrix_jacchus
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	88	62.069	ENSCAFG00000031307	ZC3H12B	91	65.408	Canis_familiaris
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	88	62.069	ENSCAFG00020017995	ZC3H12B	91	65.408	Canis_lupus_dingo
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	60	66.937	ENSCHIG00000011723	ZC3H12B	98	66.504	Capra_hircus
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	88	63.333	ENSTSYG00000011302	ZC3H12B	91	66.504	Carlito_syrichta
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	63	61.728	ENSCAPG00000000650	ZC3H12B	100	61.215	Cavia_aperea
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	85	65.162	ENSCCAG00000030171	ZC3H12B	91	66.748	Cebus_capucinus
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	88	63.778	ENSCATG00000044845	ZC3H12B	91	66.788	Cercocebus_atys
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	85	64.943	ENSCLAG00000003600	ZC3H12B	92	66.586	Chinchilla_lanigera
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	88	65.929	ENSCPBG00000006983	ZC3H12B	93	69.602	Chrysemys_picta_bellii
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	88	63.556	ENSCANG00000006746	ZC3H12B	91	66.545	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	84	65.389	ENSCGRG00001018643	Zc3h12b	92	66.383	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	84	65.389	ENSCGRG00000015623	Zc3h12b	92	66.383	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	81	74.279	ENSCSEG00000013686	zc3h12b	94	73.494	Cynoglossus_semilaevis
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	81	75.211	ENSCVAG00000010473	zc3h12b	92	75.060	Cyprinodon_variegatus
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	82	86.265	ENSDARG00000062463	zc3h12b	97	86.232	Danio_rerio
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	86	59.272	ENSDNOG00000038439	ZC3H12B	88	75.238	Dasypus_novemcinctus
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	88	63.707	ENSDORG00000024832	Zc3h12b	92	66.667	Dipodomys_ordii
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	68	61.014	ENSETEG00000012095	ZC3H12B	86	60.668	Echinops_telfairi
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	86	60.609	ENSEASG00005006995	ZC3H12B	91	62.850	Equus_asinus_asinus
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	86	64.447	ENSECAG00000020993	ZC3H12B	91	66.910	Equus_caballus
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	100	70.283	ENSELUG00000010689	zc3h12b	100	69.922	Esox_lucius
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	86	63.387	ENSFCAG00000032299	ZC3H12B	92	65.291	Felis_catus
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	86	63.842	ENSFDAG00000014258	ZC3H12B	91	66.180	Fukomys_damarensis
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	52	68.406	ENSFHEG00000014717	-	74	72.100	Fundulus_heteroclitus
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	82	75.508	ENSFHEG00000002391	zc3h12b	92	75.150	Fundulus_heteroclitus
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	81	68.841	ENSGALG00000039391	ZC3H12B	93	68.478	Gallus_gallus
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	81	76.053	ENSGAFG00000006871	zc3h12b	92	75.904	Gambusia_affinis
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	74	74.828	ENSGACG00000020334	zc3h12b	94	75.000	Gasterosteus_aculeatus
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	81	69.795	ENSGAGG00000005569	ZC3H12B	93	69.240	Gopherus_agassizii
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	88	63.778	ENSGGOG00000024638	ZC3H12B	91	66.788	Gorilla_gorilla
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	81	74.880	ENSHBUG00000000645	zc3h12b	93	74.729	Haplochromis_burtoni
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	85	64.368	ENSHGLG00000003107	ZC3H12B	92	65.978	Heterocephalus_glaber_female
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	85	64.368	ENSHGLG00100010721	ZC3H12B	92	65.978	Heterocephalus_glaber_male
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	84	74.156	ENSHCOG00000008487	zc3h12b	94	75.301	Hippocampus_comes
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	100	77.820	ENSIPUG00000016745	zc3h12b	95	88.876	Ictalurus_punctatus
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	82	45.249	ENSIPUG00000014830	-	87	46.144	Ictalurus_punctatus
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	88	63.938	ENSSTOG00000020962	ZC3H12B	91	67.235	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	86	61.980	ENSJJAG00000015755	Zc3h12b	92	64.656	Jaculus_jaculus
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	82	74.670	ENSKMAG00000004921	zc3h12b	93	74.699	Kryptolebias_marmoratus
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	81	75.962	ENSLBEG00000006448	zc3h12b	93	75.933	Labrus_bergylta
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	99	64.902	ENSLACG00000014526	ZC3H12B	93	70.808	Latimeria_chalumnae
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	99	69.412	ENSLOCG00000014631	zc3h12b	99	68.597	Lepisosteus_oculatus
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	84	50.512	ENSLOCG00000010717	-	85	51.446	Lepisosteus_oculatus
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	86	63.823	ENSLAFG00000014891	ZC3H12B	91	65.614	Loxodonta_africana
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	85	65.162	ENSMFAG00000042237	ZC3H12B	91	66.626	Macaca_fascicularis
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	88	63.667	ENSMMUG00000012261	ZC3H12B	91	66.667	Macaca_mulatta
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	88	63.667	ENSMNEG00000043003	ZC3H12B	91	66.667	Macaca_nemestrina
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	88	63.778	ENSMLEG00000042630	ZC3H12B	91	66.788	Mandrillus_leucophaeus
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	88	71.667	ENSMAMG00000011770	zc3h12b	93	75.904	Mastacembelus_armatus
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	81	75.120	ENSMZEG00005007548	zc3h12b	93	74.970	Maylandia_zebra
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	89	65.165	ENSMGAG00000000759	ZC3H12B	92	69.249	Meleagris_gallopavo
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	85	64.800	ENSMAUG00000017800	Zc3h12b	91	66.383	Mesocricetus_auratus
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	88	63.778	ENSMICG00000010697	ZC3H12B	91	66.991	Microcebus_murinus
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	85	63.272	ENSMOCG00000000094	Zc3h12b	91	65.049	Microtus_ochrogaster
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	81	74.190	ENSMMOG00000008734	zc3h12b	93	74.159	Mola_mola
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	86	64.229	ENSMODG00000005206	ZC3H12B	93	66.182	Monodelphis_domestica
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	88	67.363	ENSMALG00000021153	zc3h12b	95	71.497	Monopterus_albus
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	56	66.942	ENSMALG00000016807	-	81	62.238	Monopterus_albus
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	85	64.147	ENSMUSG00000035045	Zc3h12b	66	97.143	Mus_musculus
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	85	63.918	MGP_PahariEiJ_G0031787	Zc3h12b	91	65.655	Mus_pahari
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	85	64.147	MGP_SPRETEiJ_G0034413	Zc3h12b	91	65.777	Mus_spretus
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	88	61.402	ENSMPUG00000001162	ZC3H12B	91	65.000	Mustela_putorius_furo
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	86	63.791	ENSMLUG00000013635	ZC3H12B	94	66.261	Myotis_lucifugus
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	81	75.120	ENSNBRG00000014889	zc3h12b	93	74.970	Neolamprologus_brichardi
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	88	63.667	ENSNLEG00000000383	ZC3H12B	91	66.788	Nomascus_leucogenys
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	68	68.163	ENSMEUG00000014075	ZC3H12B	88	68.046	Notamacropus_eugenii
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	81	75.000	ENSONIG00000012867	zc3h12b	94	74.850	Oreochromis_niloticus
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	88	64.412	ENSOCUG00000006130	ZC3H12B	91	67.315	Oryctolagus_cuniculus
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	82	74.432	ENSORLG00000009556	zc3h12b	93	75.060	Oryzias_latipes
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	53	69.118	ENSORLG00000009188	-	63	69.118	Oryzias_latipes
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	82	74.313	ENSORLG00020021793	zc3h12b	93	74.940	Oryzias_latipes_hni
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	82	74.552	ENSORLG00015004818	zc3h12b	93	75.181	Oryzias_latipes_hsok
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	53	69.048	ENSORLG00015020619	-	87	70.085	Oryzias_latipes_hsok
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	88	71.397	ENSOMEG00000005768	zc3h12b	93	75.301	Oryzias_melastigma
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	53	70.326	ENSOMEG00000018642	-	61	69.164	Oryzias_melastigma
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	88	62.901	ENSOGAG00000029439	ZC3H12B	91	65.901	Otolemur_garnettii
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	86	64.564	ENSOARG00000004959	ZC3H12B	91	66.829	Ovis_aries
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	88	63.667	ENSPPAG00000039530	ZC3H12B	91	66.667	Pan_paniscus
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	65	67.665	ENSPPRG00000004966	-	95	66.916	Panthera_pardus
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	65	68.127	ENSPTIG00000005571	ZC3H12B	99	67.372	Panthera_tigris_altaica
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	88	63.667	ENSPTRG00000021969	ZC3H12B	91	66.667	Pan_troglodytes
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	88	63.778	ENSPANG00000007944	ZC3H12B	91	66.788	Papio_anubis
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	81	69.880	ENSPKIG00000012946	zc3h12b	94	69.855	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	81	73.866	ENSPKIG00000019893	ZC3H12B	94	73.022	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	88	66.337	ENSPSIG00000016853	ZC3H12B	93	69.891	Pelodiscus_sinensis
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	81	74.096	ENSPMGG00000006009	zc3h12b	93	74.065	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	86	63.470	ENSPCIG00000020264	ZC3H12B	92	65.735	Phascolarctos_cinereus
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	88	71.444	ENSPFOG00000019365	zc3h12b	93	75.783	Poecilia_formosa
ENSAMXG00000011328	zc3h12b	88	68.798	ENSPLAG00000011981	zc3h12b	92	72.892	Poecilia_latipinna
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