EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAMXG00000011517 (Gene tree)
Gene ID: 103028968
Gene Symbol: skiv2l
Alias: fb70b07|wu:fb70b07
Full Name: Ski2 like RNA helicase
Gene Type: protein_coding
Species: Astyanax_mexicanus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 28437 bases
Position: chr23:15666876-15695312
Accession: 103028968
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAMXP00000011871	rRNA_proc-arch	PF13234.6	3.5e-28	1	1
ENSAMXP00000011871	DEAD	PF00270.29	6.3e-17	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAMXT00000011871	-	4062	XM_007228525	ENSAMXP00000011871	1249 (aa)	XP_007228587	W5KWA9

Gene Model

Click here to download ENSAMXG00000011517's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
amex03018	RNA degradation	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSAMXG00000011517's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSAMXG00000011517	skiv2l	72	35.691	ENSAMXG00000018751	mtrex	89	35.365

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	59.348	ENSG00000204351	SKIV2L	98	59.268	Homo_sapiens
ENSAMXG00000011517	skiv2l	100	81.514	ENSAPOG00000008257	skiv2l	100	81.419	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	59.327	ENSAMEG00000002078	SKIV2L	98	59.488	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	80.968	ENSACIG00000016719	skiv2l	99	80.810	Amphilophus_citrinellus
ENSAMXG00000011517	skiv2l	100	81.949	ENSAOCG00000017352	skiv2l	100	81.695	Amphiprion_ocellaris
ENSAMXG00000011517	skiv2l	100	81.789	ENSAPEG00000001055	skiv2l	100	81.535	Amphiprion_percula
ENSAMXG00000011517	skiv2l	100	81.934	ENSATEG00000007601	skiv2l	100	82.174	Anabas_testudineus
ENSAMXG00000011517	skiv2l	100	62.354	ENSACAG00000011746	SKIV2L	99	62.904	Anolis_carolinensis
ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	59.507	ENSANAG00000037992	SKIV2L	99	58.983	Aotus_nancymaae
ENSAMXG00000011517	skiv2l	100	82.626	ENSACLG00000006886	skiv2l	100	82.626	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	58.993	ENSBTAG00000005587	SKIV2L	98	59.167	Bos_taurus
ENSAMXG00000011517	skiv2l	92	40.568	WBGene00008502	skih-2	93	41.583	Caenorhabditis_elegans
ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	59.442	ENSCJAG00000002263	SKIV2L	98	59.552	Callithrix_jacchus
ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	59.392	ENSCAFG00000000679	SKIV2L	98	59.552	Canis_familiaris
ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	59.313	ENSCAFG00020000948	SKIV2L	98	59.472	Canis_lupus_dingo
ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	59.552	ENSCHIG00000012897	SKIV2L	98	59.568	Capra_hircus
ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	59.375	ENSTSYG00000012133	SKIV2L	98	59.313	Carlito_syrichta
ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	59.679	ENSCPOG00000001307	SKIV2L	98	59.839	Cavia_porcellus
ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	59.522	ENSCCAG00000026206	SKIV2L	99	58.838	Cebus_capucinus
ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	59.761	ENSCATG00000036901	SKIV2L	98	59.617	Cercocebus_atys
ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	59.298	ENSCLAG00000007678	SKIV2L	98	59.377	Chinchilla_lanigera
ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	59.681	ENSCSAG00000008988	SKIV2L	98	59.602	Chlorocebus_sabaeus
ENSAMXG00000011517	skiv2l	85	60.920	ENSCPBG00000000343	SKIV2L	94	60.920	Chrysemys_picta_bellii
ENSAMXG00000011517	skiv2l	93	50.728	ENSCING00000005576	-	98	50.861	Ciona_intestinalis
ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	60.048	ENSCANG00000039709	SKIV2L	99	59.280	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	59.681	ENSCGRG00001008385	Skiv2l	98	59.681	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	81.235	ENSCSEG00000011326	skiv2l	98	80.972	Cynoglossus_semilaevis
ENSAMXG00000011517	skiv2l	100	82.974	ENSCVAG00000003072	skiv2l	100	82.734	Cyprinodon_variegatus
ENSAMXG00000011517	skiv2l	100	85.452	ENSDARG00000062206	skiv2l	100	85.360	Danio_rerio
ENSAMXG00000011517	skiv2l	92	64.083	ENSDNOG00000037590	SKIV2L	91	64.083	Dasypus_novemcinctus
ENSAMXG00000011517	skiv2l	92	46.167	FBgn0039117	tst	95	46.285	Drosophila_melanogaster
ENSAMXG00000011517	skiv2l	68	69.231	ENSETEG00000009522	SKIV2L	68	73.611	Echinops_telfairi
ENSAMXG00000011517	skiv2l	90	56.435	ENSEBUG00000013680	-	97	55.700	Eptatretus_burgeri
ENSAMXG00000011517	skiv2l	92	60.632	ENSEASG00005015534	SKIV2L	98	61.212	Equus_asinus_asinus
ENSAMXG00000011517	skiv2l	93	59.306	ENSECAG00000021823	SKIV2L	94	59.510	Equus_caballus
ENSAMXG00000011517	skiv2l	50	74.308	ENSEEUG00000005049	SKIV2L	56	74.308	Erinaceus_europaeus
ENSAMXG00000011517	skiv2l	100	83.387	ENSELUG00000000181	skiv2l	99	83.482	Esox_lucius
ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	59.888	ENSFCAG00000004519	SKIV2L	98	59.808	Felis_catus
ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	58.280	ENSFDAG00000009438	SKIV2L	98	58.280	Fukomys_damarensis
ENSAMXG00000011517	skiv2l	100	83.133	ENSFHEG00000008853	skiv2l	100	82.894	Fundulus_heteroclitus
ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	78.669	ENSGMOG00000005926	skiv2l	98	78.879	Gadus_morhua
ENSAMXG00000011517	skiv2l	76	57.143	ENSGALG00000035499	SKIV2L	97	57.158	Gallus_gallus
ENSAMXG00000011517	skiv2l	100	82.734	ENSGAFG00000002382	skiv2l	100	82.574	Gambusia_affinis
ENSAMXG00000011517	skiv2l	100	80.812	ENSGACG00000002927	skiv2l	99	80.732	Gasterosteus_aculeatus
ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	59.522	ENSGGOG00000002270	SKIV2L	98	59.442	Gorilla_gorilla
ENSAMXG00000011517	skiv2l	100	82.546	ENSHBUG00000000726	skiv2l	100	82.546	Haplochromis_burtoni
ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	58.931	ENSHGLG00000016596	SKIV2L	98	59.091	Heterocephalus_glaber_female
ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	57.416	ENSHGLG00100014161	SKIV2L	98	57.576	Heterocephalus_glaber_male
ENSAMXG00000011517	skiv2l	98	74.776	ENSHCOG00000007191	skiv2l	100	74.614	Hippocampus_comes
ENSAMXG00000011517	skiv2l	100	88.231	ENSIPUG00000016263	skiv2l	100	88.527	Ictalurus_punctatus
ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	59.368	ENSSTOG00000014596	SKIV2L	98	59.696	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAMXG00000011517	skiv2l	56	62.245	ENSLACG00000002986	-	59	62.245	Latimeria_chalumnae
ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	59.375	ENSLAFG00000014231	SKIV2L	98	59.392	Loxodonta_africana
ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	59.920	ENSMFAG00000034235	SKIV2L	98	59.777	Macaca_fascicularis
ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	59.761	ENSMMUG00000000736	SKIV2L	98	59.777	Macaca_mulatta
ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	59.920	ENSMNEG00000044474	SKIV2L	98	59.777	Macaca_nemestrina
ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	59.681	ENSMLEG00000030512	SKIV2L	98	59.537	Mandrillus_leucophaeus
ENSAMXG00000011517	skiv2l	100	81.855	ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	82.105	Mastacembelus_armatus
ENSAMXG00000011517	skiv2l	100	82.546	ENSMZEG00005026415	skiv2l	100	82.546	Maylandia_zebra
ENSAMXG00000011517	skiv2l	68	51.106	ENSMGAG00000001320	SKIV2L	94	49.453	Meleagris_gallopavo
ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	59.395	ENSMAUG00000018613	Skiv2l	98	59.380	Mesocricetus_auratus
ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	59.442	ENSMICG00000046331	SKIV2L	98	59.380	Microcebus_murinus
ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	58.527	ENSMOCG00000014240	Skiv2l	98	58.466	Microtus_ochrogaster
ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	78.331	ENSMMOG00000014547	skiv2l	98	78.508	Mola_mola
ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	59.763	ENSMODG00000015052	SKIV2L	98	59.936	Monodelphis_domestica
ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	78.543	ENSMALG00000010535	skiv2l	98	78.381	Monopterus_albus
ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	59.631	MGP_CAROLIEiJ_G0021477	Skiv2l	98	59.711	Mus_caroli
ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	59.551	ENSMUSG00000040356	Skiv2l	98	59.648	Mus_musculus
ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	59.872	MGP_PahariEiJ_G0020472	Skiv2l	98	59.968	Mus_pahari
ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	59.310	MGP_SPRETEiJ_G0022382	Skiv2l	98	59.488	Mus_spretus
ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	59.440	ENSMPUG00000010567	SKIV2L	98	59.808	Mustela_putorius_furo
ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	59.280	ENSMLUG00000000628	SKIV2L	98	59.295	Myotis_lucifugus
ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	79.759	ENSNBRG00000018650	skiv2l	98	80.130	Neolamprologus_brichardi
ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	58.894	ENSNLEG00000006451	SKIV2L	99	58.781	Nomascus_leucogenys
ENSAMXG00000011517	skiv2l	78	60.177	ENSMEUG00000006072	SKIV2L	77	60.177	Notamacropus_eugenii
ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	59.185	ENSOPRG00000003972	SKIV2L	98	59.203	Ochotona_princeps
ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	59.283	ENSODEG00000017516	SKIV2L	98	59.442	Octodon_degus
ENSAMXG00000011517	skiv2l	100	82.827	ENSONIG00000013500	skiv2l	100	82.814	Oreochromis_niloticus
ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	59.535	ENSOCUG00000007019	SKIV2L	98	59.696	Oryctolagus_cuniculus
ENSAMXG00000011517	skiv2l	100	81.150	ENSORLG00000002021	skiv2l	100	80.735	Oryzias_latipes
ENSAMXG00000011517	skiv2l	100	80.990	ENSORLG00020009462	skiv2l	100	80.576	Oryzias_latipes_hni
ENSAMXG00000011517	skiv2l	100	81.070	ENSORLG00015016750	skiv2l	100	80.815	Oryzias_latipes_hsok
ENSAMXG00000011517	skiv2l	100	80.895	ENSOMEG00000008531	skiv2l	99	81.215	Oryzias_melastigma
ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	59.537	ENSOGAG00000009578	SKIV2L	98	59.554	Otolemur_garnettii
ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	56.094	ENSOARG00000002411	-	98	56.094	Ovis_aries
ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	58.861	ENSPPAG00000040211	SKIV2L	99	58.782	Pan_paniscus
ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	59.872	ENSPPRG00000005017	SKIV2L	98	59.792	Panthera_pardus
ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	59.472	ENSPTIG00000021656	SKIV2L	98	59.392	Panthera_tigris_altaica
ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	59.427	ENSPTRG00000017997	SKIV2L	98	59.348	Pan_troglodytes
ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	58.856	ENSPANG00000011501	SKIV2L	99	58.697	Papio_anubis
ENSAMXG00000011517	skiv2l	100	78.520	ENSPKIG00000011876	skiv2l	100	78.520	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	79.598	ENSPMGG00000019707	skiv2l	98	79.968	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	59.568	ENSPEMG00000019001	Skiv2l	98	59.665	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	59.652	ENSPCIG00000018792	SKIV2L	98	59.632	Phascolarctos_cinereus
ENSAMXG00000011517	skiv2l	100	82.494	ENSPFOG00000002424	skiv2l	100	82.334	Poecilia_formosa
ENSAMXG00000011517	skiv2l	100	82.654	ENSPLAG00000018304	skiv2l	100	82.414	Poecilia_latipinna
ENSAMXG00000011517	skiv2l	100	82.494	ENSPMEG00000006997	skiv2l	100	82.334	Poecilia_mexicana
ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	77.047	ENSPREG00000002277	skiv2l	98	76.642	Poecilia_reticulata
ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	59.189	ENSPPYG00000016472	SKIV2L	98	59.109	Pongo_abelii
ENSAMXG00000011517	skiv2l	77	59.821	ENSPCAG00000004178	SKIV2L	74	76.712	Procavia_capensis
ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	59.522	ENSPCOG00000010308	SKIV2L	98	59.586	Propithecus_coquereli
ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	59.761	ENSPVAG00000005136	SKIV2L	98	59.777	Pteropus_vampyrus
ENSAMXG00000011517	skiv2l	95	83.316	ENSPNYG00000017853	skiv2l	98	78.120	Pundamilia_nyererei
ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	92.464	ENSPNAG00000011823	skiv2l	100	92.160	Pygocentrus_nattereri
ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	60.193	ENSRNOG00000000421	Skiv2l	98	59.984	Rattus_norvegicus
ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	58.954	ENSRBIG00000035485	SKIV2L	99	58.796	Rhinopithecus_bieti
ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	60.016	ENSRROG00000036429	SKIV2L	98	59.856	Rhinopithecus_roxellana
ENSAMXG00000011517	skiv2l	90	39.539	YLR398C	-	90	39.242	Saccharomyces_cerevisiae
ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	59.808	ENSSBOG00000027920	SKIV2L	98	59.632	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	59.447	ENSSHAG00000008963	SKIV2L	98	58.574	Sarcophilus_harrisii
ENSAMXG00000011517	skiv2l	100	81.245	ENSSFOG00015016930	skiv2l	100	80.926	Scleropages_formosus
ENSAMXG00000011517	skiv2l	100	81.775	ENSSMAG00000020185	skiv2l	100	81.695	Scophthalmus_maximus
ENSAMXG00000011517	skiv2l	100	83.120	ENSSDUG00000019977	skiv2l	100	82.960	Seriola_dumerili
ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	77.671	ENSSLDG00000024382	skiv2l	98	77.778	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	57.704	ENSSPUG00000012945	SKIV2L	99	58.158	Sphenodon_punctatus
ENSAMXG00000011517	skiv2l	95	81.113	ENSSPAG00000012904	skiv2l	98	81.352	Stegastes_partitus
ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	59.543	ENSSSCG00000001424	SKIV2L	98	59.585	Sus_scrofa
ENSAMXG00000011517	skiv2l	69	83.422	ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	65.794	Takifugu_rubripes
ENSAMXG00000011517	skiv2l	100	77.689	ENSTNIG00000004382	skiv2l	99	77.769	Tetraodon_nigroviridis
ENSAMXG00000011517	skiv2l	93	61.472	ENSTBEG00000003462	SKIV2L	93	61.472	Tupaia_belangeri
ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	55.396	ENSTTRG00000005931	SKIV2L	98	55.404	Tursiops_truncatus
ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	59.792	ENSUAMG00000024336	SKIV2L	98	59.808	Ursus_americanus
ENSAMXG00000011517	skiv2l	92	60.922	ENSUMAG00000012666	SKIV2L	98	61.299	Ursus_maritimus
ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	59.313	ENSVVUG00000022807	SKIV2L	98	59.472	Vulpes_vulpes
ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	58.090	ENSXETG00000010932	skiv2l	98	58.147	Xenopus_tropicalis
ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	81.476	ENSXCOG00000019517	skiv2l	96	81.457	Xiphophorus_couchianus
ENSAMXG00000011517	skiv2l	100	82.160	ENSXMAG00000014079	skiv2l	100	81.920	Xiphophorus_maculatus