EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAMXG00000013274 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astyanax_mexicanus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 1071 bases
Position: chr19:1498448-1499518
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAMXP00000013663	zf-C2H2	PF00096.26	2.3e-66	1	10
ENSAMXP00000013663	zf-C2H2	PF00096.26	2.3e-66	2	10
ENSAMXP00000013663	zf-C2H2	PF00096.26	2.3e-66	3	10
ENSAMXP00000013663	zf-C2H2	PF00096.26	2.3e-66	4	10
ENSAMXP00000013663	zf-C2H2	PF00096.26	2.3e-66	5	10
ENSAMXP00000013663	zf-C2H2	PF00096.26	2.3e-66	6	10
ENSAMXP00000013663	zf-C2H2	PF00096.26	2.3e-66	7	10
ENSAMXP00000013663	zf-C2H2	PF00096.26	2.3e-66	8	10
ENSAMXP00000013663	zf-C2H2	PF00096.26	2.3e-66	9	10
ENSAMXP00000013663	zf-C2H2	PF00096.26	2.3e-66	10	10
ENSAMXP00000013663	zf-met	PF12874.7	3.2e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAMXT00000013662	-	1071	-	ENSAMXP00000013663	356 (aa)	-	W5L1F1

Gene Model

Click here to download ENSAMXG00000013274's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSAMXG00000013274's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSAMXG00000013274	-	92	61.702	ENSAMXG00000035683	-	95	60.622
ENSAMXG00000013274	-	94	55.738	ENSAMXG00000034857	-	65	55.738
ENSAMXG00000013274	-	90	60.759	ENSAMXG00000043291	-	71	60.759
ENSAMXG00000013274	-	97	60.515	ENSAMXG00000043978	-	90	58.447
ENSAMXG00000013274	-	94	59.164	ENSAMXG00000038536	-	94	59.164
ENSAMXG00000013274	-	96	60.535	ENSAMXG00000039977	-	98	63.333
ENSAMXG00000013274	-	91	61.300	ENSAMXG00000032619	-	96	61.562
ENSAMXG00000013274	-	93	57.143	ENSAMXG00000037143	-	95	59.722
ENSAMXG00000013274	-	91	64.217	ENSAMXG00000039004	-	88	64.217
ENSAMXG00000013274	-	97	55.200	ENSAMXG00000038905	-	95	53.237
ENSAMXG00000013274	-	91	60.066	ENSAMXG00000035875	-	99	60.066
ENSAMXG00000013274	-	97	56.140	ENSAMXG00000029960	-	94	59.615
ENSAMXG00000013274	-	92	41.379	ENSAMXG00000024907	znf319b	84	36.494
ENSAMXG00000013274	-	94	63.953	ENSAMXG00000042938	-	88	63.953
ENSAMXG00000013274	-	97	54.046	ENSAMXG00000026144	-	96	54.335
ENSAMXG00000013274	-	99	54.131	ENSAMXG00000038280	-	87	58.632
ENSAMXG00000013274	-	97	55.108	ENSAMXG00000038284	-	91	56.962
ENSAMXG00000013274	-	97	61.489	ENSAMXG00000010805	-	99	61.489
ENSAMXG00000013274	-	92	43.103	ENSAMXG00000042191	zbtb47a	70	43.005
ENSAMXG00000013274	-	97	58.382	ENSAMXG00000031307	-	73	58.382
ENSAMXG00000013274	-	90	61.889	ENSAMXG00000010930	-	81	61.270
ENSAMXG00000013274	-	98	65.801	ENSAMXG00000009558	-	93	65.939
ENSAMXG00000013274	-	92	56.456	ENSAMXG00000036915	-	94	57.944
ENSAMXG00000013274	-	98	62.145	ENSAMXG00000031496	-	94	62.145
ENSAMXG00000013274	-	90	66.434	ENSAMXG00000029878	-	92	66.434
ENSAMXG00000013274	-	90	61.927	ENSAMXG00000033013	-	81	61.927
ENSAMXG00000013274	-	99	64.931	ENSAMXG00000017609	-	80	64.931
ENSAMXG00000013274	-	97	45.455	ENSAMXG00000037544	GFI1B	55	46.296
ENSAMXG00000013274	-	96	61.509	ENSAMXG00000031844	-	98	61.509
ENSAMXG00000013274	-	92	54.839	ENSAMXG00000013492	-	96	48.136
ENSAMXG00000013274	-	99	40.807	ENSAMXG00000035246	-	67	41.232
ENSAMXG00000013274	-	94	55.556	ENSAMXG00000036257	-	91	57.031
ENSAMXG00000013274	-	92	63.000	ENSAMXG00000042774	-	90	63.000
ENSAMXG00000013274	-	92	62.857	ENSAMXG00000038453	-	92	62.179
ENSAMXG00000013274	-	90	58.170	ENSAMXG00000043302	-	73	58.170
ENSAMXG00000013274	-	90	62.963	ENSAMXG00000004610	-	98	61.504
ENSAMXG00000013274	-	94	62.500	ENSAMXG00000019489	-	96	62.500
ENSAMXG00000013274	-	92	49.231	ENSAMXG00000007973	-	97	46.667
ENSAMXG00000013274	-	97	62.305	ENSAMXG00000029828	-	93	62.305
ENSAMXG00000013274	-	97	66.355	ENSAMXG00000032457	-	91	66.355
ENSAMXG00000013274	-	93	64.798	ENSAMXG00000031009	-	89	64.798
ENSAMXG00000013274	-	90	66.355	ENSAMXG00000025965	-	94	66.355
ENSAMXG00000013274	-	98	62.632	ENSAMXG00000029109	-	86	62.632
ENSAMXG00000013274	-	100	63.666	ENSAMXG00000041725	-	91	63.666
ENSAMXG00000013274	-	97	62.500	ENSAMXG00000036233	-	84	62.500
ENSAMXG00000013274	-	93	65.421	ENSAMXG00000043251	-	96	65.732
ENSAMXG00000013274	-	96	62.136	ENSAMXG00000037760	-	95	62.541
ENSAMXG00000013274	-	91	59.048	ENSAMXG00000039752	-	92	59.425
ENSAMXG00000013274	-	85	37.963	ENSAMXG00000039849	snai1b	55	39.604
ENSAMXG00000013274	-	80	33.582	ENSAMXG00000032845	-	52	33.582
ENSAMXG00000013274	-	100	58.654	ENSAMXG00000032841	-	84	58.654
ENSAMXG00000013274	-	98	65.639	ENSAMXG00000031646	-	94	64.317
ENSAMXG00000013274	-	90	62.540	ENSAMXG00000031489	-	94	62.540
ENSAMXG00000013274	-	91	57.602	ENSAMXG00000030530	-	97	58.521
ENSAMXG00000013274	-	96	40.196	ENSAMXG00000041864	prdm5	87	41.410
ENSAMXG00000013274	-	90	64.798	ENSAMXG00000041865	-	97	64.798
ENSAMXG00000013274	-	90	47.196	ENSAMXG00000041862	-	95	46.256
ENSAMXG00000013274	-	97	62.844	ENSAMXG00000041861	-	94	62.844
ENSAMXG00000013274	-	96	63.898	ENSAMXG00000009776	-	98	63.898
ENSAMXG00000013274	-	98	65.421	ENSAMXG00000036567	-	76	65.421
ENSAMXG00000013274	-	91	39.655	ENSAMXG00000033001	-	59	38.793
ENSAMXG00000013274	-	94	40.000	ENSAMXG00000042624	SCRT1	55	40.000
ENSAMXG00000013274	-	91	40.299	ENSAMXG00000029059	-	64	40.299
ENSAMXG00000013274	-	96	60.000	ENSAMXG00000026142	-	93	61.022
ENSAMXG00000013274	-	97	53.939	ENSAMXG00000026143	-	91	57.096
ENSAMXG00000013274	-	93	50.649	ENSAMXG00000034333	-	96	45.495
ENSAMXG00000013274	-	90	35.593	ENSAMXG00000002273	patz1	53	34.969
ENSAMXG00000013274	-	100	60.317	ENSAMXG00000040677	-	90	60.317
ENSAMXG00000013274	-	97	58.962	ENSAMXG00000039700	-	96	58.222
ENSAMXG00000013274	-	94	58.521	ENSAMXG00000042746	-	94	58.521
ENSAMXG00000013274	-	97	39.085	ENSAMXG00000025761	-	92	39.085
ENSAMXG00000013274	-	96	62.928	ENSAMXG00000031794	-	95	62.928
ENSAMXG00000013274	-	91	66.032	ENSAMXG00000030911	-	68	66.032
ENSAMXG00000013274	-	95	49.186	ENSAMXG00000035127	-	92	50.000
ENSAMXG00000013274	-	93	48.896	ENSAMXG00000012589	-	83	48.896
ENSAMXG00000013274	-	89	41.481	ENSAMXG00000038235	snai2	52	44.000
ENSAMXG00000013274	-	95	57.592	ENSAMXG00000041650	-	93	57.592
ENSAMXG00000013274	-	96	61.364	ENSAMXG00000003002	-	98	61.364
ENSAMXG00000013274	-	95	42.282	ENSAMXG00000006669	GFI1	63	42.282
ENSAMXG00000013274	-	100	57.993	ENSAMXG00000042633	-	97	56.106
ENSAMXG00000013274	-	90	66.667	ENSAMXG00000008613	-	97	66.667
ENSAMXG00000013274	-	89	42.373	ENSAMXG00000007441	-	57	48.387
ENSAMXG00000013274	-	91	42.361	ENSAMXG00000034873	-	81	42.623
ENSAMXG00000013274	-	90	60.377	ENSAMXG00000030742	-	98	60.377
ENSAMXG00000013274	-	96	64.103	ENSAMXG00000040212	-	89	64.103
ENSAMXG00000013274	-	90	63.366	ENSAMXG00000010078	-	87	63.366
ENSAMXG00000013274	-	100	62.037	ENSAMXG00000034958	-	95	62.037
ENSAMXG00000013274	-	90	59.615	ENSAMXG00000044107	-	89	59.615
ENSAMXG00000013274	-	99	60.897	ENSAMXG00000042275	-	97	60.897
ENSAMXG00000013274	-	89	52.795	ENSAMXG00000014745	-	86	47.619
ENSAMXG00000013274	-	100	59.310	ENSAMXG00000042593	-	90	60.396
ENSAMXG00000013274	-	90	64.019	ENSAMXG00000035145	-	63	64.019
ENSAMXG00000013274	-	100	58.394	ENSAMXG00000039408	-	88	58.943
ENSAMXG00000013274	-	90	66.667	ENSAMXG00000018161	-	96	66.667
ENSAMXG00000013274	-	97	39.785	ENSAMXG00000044034	-	66	39.785
ENSAMXG00000013274	-	100	65.546	ENSAMXG00000042167	-	97	65.546
ENSAMXG00000013274	-	97	57.349	ENSAMXG00000001626	-	89	60.436
ENSAMXG00000013274	-	90	58.209	ENSAMXG00000029518	-	58	54.701
ENSAMXG00000013274	-	98	65.421	ENSAMXG00000036762	-	96	65.421
ENSAMXG00000013274	-	90	63.548	ENSAMXG00000034402	-	92	63.548
ENSAMXG00000013274	-	90	66.355	ENSAMXG00000037885	-	97	66.355
ENSAMXG00000013274	-	90	63.679	ENSAMXG00000035920	-	90	63.679
ENSAMXG00000013274	-	93	40.164	ENSAMXG00000035525	znf646	92	41.441
ENSAMXG00000013274	-	90	62.633	ENSAMXG00000039182	-	71	62.633
ENSAMXG00000013274	-	99	50.820	ENSAMXG00000037382	-	52	50.820
ENSAMXG00000013274	-	94	59.934	ENSAMXG00000044028	-	95	59.934
ENSAMXG00000013274	-	97	53.901	ENSAMXG00000035286	si:ch1073-224n8.1	87	49.074
ENSAMXG00000013274	-	98	53.826	ENSAMXG00000032212	-	81	58.879
ENSAMXG00000013274	-	99	47.452	ENSAMXG00000042784	-	94	54.701
ENSAMXG00000013274	-	98	67.524	ENSAMXG00000000353	-	93	67.524
ENSAMXG00000013274	-	97	60.377	ENSAMXG00000037923	-	99	60.606
ENSAMXG00000013274	-	97	62.667	ENSAMXG00000041721	-	79	62.667
ENSAMXG00000013274	-	90	66.667	ENSAMXG00000025455	-	99	66.667
ENSAMXG00000013274	-	95	62.305	ENSAMXG00000025452	-	99	62.305
ENSAMXG00000013274	-	93	56.646	ENSAMXG00000009563	-	97	56.646
ENSAMXG00000013274	-	100	57.244	ENSAMXG00000043541	-	90	57.244
ENSAMXG00000013274	-	98	58.675	ENSAMXG00000033201	-	97	58.861
ENSAMXG00000013274	-	95	62.745	ENSAMXG00000037717	-	94	62.745
ENSAMXG00000013274	-	90	66.355	ENSAMXG00000039744	-	99	66.355
ENSAMXG00000013274	-	91	46.875	ENSAMXG00000044096	-	80	46.875
ENSAMXG00000013274	-	96	60.000	ENSAMXG00000017959	-	99	60.436
ENSAMXG00000013274	-	99	61.442	ENSAMXG00000036849	-	86	61.830
ENSAMXG00000013274	-	94	64.780	ENSAMXG00000040630	-	97	64.780
ENSAMXG00000013274	-	91	56.347	ENSAMXG00000039770	-	85	56.698
ENSAMXG00000013274	-	97	61.056	ENSAMXG00000043423	-	80	61.056
ENSAMXG00000013274	-	98	64.314	ENSAMXG00000035949	-	74	64.777
ENSAMXG00000013274	-	96	57.732	ENSAMXG00000034096	-	87	57.732
ENSAMXG00000013274	-	95	59.732	ENSAMXG00000044110	-	93	61.006
ENSAMXG00000013274	-	90	67.138	ENSAMXG00000011804	-	86	67.138
ENSAMXG00000013274	-	96	63.240	ENSAMXG00000039432	-	92	63.240
ENSAMXG00000013274	-	99	47.799	ENSAMXG00000033252	-	91	53.448
ENSAMXG00000013274	-	93	66.044	ENSAMXG00000029178	-	97	66.044
ENSAMXG00000013274	-	94	59.322	ENSAMXG00000037981	-	74	59.072
ENSAMXG00000013274	-	94	58.204	ENSAMXG00000042174	-	92	58.567
ENSAMXG00000013274	-	98	56.989	ENSAMXG00000037326	-	97	57.857
ENSAMXG00000013274	-	99	65.732	ENSAMXG00000039879	-	97	65.732
ENSAMXG00000013274	-	90	65.732	ENSAMXG00000041404	-	93	65.732
ENSAMXG00000013274	-	92	66.355	ENSAMXG00000041128	-	88	66.355
ENSAMXG00000013274	-	89	53.750	ENSAMXG00000038122	-	94	53.750
ENSAMXG00000013274	-	94	59.067	ENSAMXG00000043019	-	91	59.067
ENSAMXG00000013274	-	93	55.738	ENSAMXG00000030659	-	76	55.906
ENSAMXG00000013274	-	90	65.273	ENSAMXG00000035809	-	99	65.273
ENSAMXG00000013274	-	97	62.264	ENSAMXG00000039016	-	80	62.264
ENSAMXG00000013274	-	90	64.630	ENSAMXG00000038636	-	98	64.630
ENSAMXG00000013274	-	97	57.724	ENSAMXG00000040806	-	94	57.724
ENSAMXG00000013274	-	99	64.311	ENSAMXG00000041975	-	81	64.311
ENSAMXG00000013274	-	92	46.040	ENSAMXG00000017199	-	50	37.714
ENSAMXG00000013274	-	100	65.145	ENSAMXG00000035690	-	75	65.145
ENSAMXG00000013274	-	97	62.658	ENSAMXG00000034847	-	90	62.658
ENSAMXG00000013274	-	99	57.692	ENSAMXG00000012873	-	94	56.757
ENSAMXG00000013274	-	92	41.304	ENSAMXG00000039622	zbtb41	51	41.304
ENSAMXG00000013274	-	99	58.000	ENSAMXG00000038324	-	83	61.967
ENSAMXG00000013274	-	95	62.927	ENSAMXG00000041609	-	99	62.927
ENSAMXG00000013274	-	100	59.677	ENSAMXG00000033124	-	56	63.810
ENSAMXG00000013274	-	99	44.025	ENSAMXG00000034934	-	79	44.025
ENSAMXG00000013274	-	90	30.682	ENSAMXG00000016921	znf341	53	30.392
ENSAMXG00000013274	-	90	65.541	ENSAMXG00000007092	-	98	65.541
ENSAMXG00000013274	-	98	54.891	ENSAMXG00000043178	-	66	54.891
ENSAMXG00000013274	-	98	65.732	ENSAMXG00000024978	-	92	65.732
ENSAMXG00000013274	-	97	56.944	ENSAMXG00000036633	-	66	56.997
ENSAMXG00000013274	-	98	52.901	ENSAMXG00000038325	-	92	54.516
ENSAMXG00000013274	-	91	62.346	ENSAMXG00000029161	-	81	62.733
ENSAMXG00000013274	-	99	58.704	ENSAMXG00000034344	-	73	58.704
ENSAMXG00000013274	-	97	60.714	ENSAMXG00000037709	-	90	60.714
ENSAMXG00000013274	-	90	65.678	ENSAMXG00000037703	-	87	65.678
ENSAMXG00000013274	-	91	54.233	ENSAMXG00000012604	-	96	56.832
ENSAMXG00000013274	-	91	44.615	ENSAMXG00000033299	-	70	45.745
ENSAMXG00000013274	-	99	59.701	ENSAMXG00000029783	-	87	59.701
ENSAMXG00000013274	-	90	60.811	ENSAMXG00000033500	-	94	63.423
ENSAMXG00000013274	-	94	64.062	ENSAMXG00000031900	-	94	64.062
ENSAMXG00000013274	-	90	60.976	ENSAMXG00000030963	-	80	60.976
ENSAMXG00000013274	-	98	66.044	ENSAMXG00000031501	-	85	66.044
ENSAMXG00000013274	-	98	62.092	ENSAMXG00000039162	-	90	62.928
ENSAMXG00000013274	-	97	58.567	ENSAMXG00000032237	-	97	58.567
ENSAMXG00000013274	-	91	59.609	ENSAMXG00000036241	-	89	56.598
ENSAMXG00000013274	-	100	59.190	ENSAMXG00000035437	-	99	59.744

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAMXG00000013274	-	97	47.059	ENSATEG00000010859	-	95	49.206	Anabas_testudineus
ENSAMXG00000013274	-	92	52.239	ENSCPBG00000009849	-	85	53.901	Chrysemys_picta_bellii
ENSAMXG00000013274	-	92	55.833	ENSELUG00000009575	-	99	53.333	Esox_lucius
ENSAMXG00000013274	-	97	58.805	ENSIPUG00000015121	-	70	61.806	Ictalurus_punctatus
ENSAMXG00000013274	-	92	45.017	ENSKMAG00000000543	-	100	45.017	Kryptolebias_marmoratus
ENSAMXG00000013274	-	100	42.925	ENSMAMG00000016519	-	87	42.925	Mastacembelus_armatus
ENSAMXG00000013274	-	92	46.789	ENSMZEG00005020574	-	84	47.950	Maylandia_zebra
ENSAMXG00000013274	-	95	44.776	ENSONIG00000007088	-	100	46.528	Oreochromis_niloticus
ENSAMXG00000013274	-	90	53.333	ENSPSIG00000000075	-	71	53.333	Pelodiscus_sinensis
ENSAMXG00000013274	-	98	56.839	ENSPNAG00000008480	-	89	59.502	Pygocentrus_nattereri
ENSAMXG00000013274	-	97	58.491	ENSPNAG00000012215	-	91	58.491	Pygocentrus_nattereri
ENSAMXG00000013274	-	93	43.533	ENSSMAG00000007396	-	81	43.533	Scophthalmus_maximus
ENSAMXG00000013274	-	95	56.923	ENSTBEG00000012287	-	99	56.923	Tupaia_belangeri