EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAMXG00000015964 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: ctif
Alias: zmp:0000001000
Full Name: cap binding complex dependent translation initiation factor
Gene Type: protein_coding
Species: Astyanax_mexicanus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 67213 bases
Position: chr14:37541598-37608810
Accession: 103047499
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAMXP00000016448	MIF4G	PF02854.19	4.7e-18	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAMXT00000016448	-	1980	XM_022676712	ENSAMXP00000016448	659 (aa)	XP_022532433	W5L9D6

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAMXG00000015964	ctif	100	52.699	ENSG00000134030	CTIF	100	58.051	Homo_sapiens
ENSAMXG00000015964	ctif	100	56.231	ENSAPOG00000020192	ctif	55	64.208	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAMXG00000015964	ctif	88	49.601	ENSAMEG00000006759	CTIF	57	57.724	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAMXG00000015964	ctif	100	65.661	ENSACIG00000017099	ctif	50	67.733	Amphilophus_citrinellus
ENSAMXG00000015964	ctif	100	63.394	ENSAPEG00000016975	ctif	54	63.934	Amphiprion_percula
ENSAMXG00000015964	ctif	100	64.326	ENSATEG00000016752	ctif	53	62.810	Anabas_testudineus
ENSAMXG00000015964	ctif	100	57.576	ENSACAG00000018006	CTIF	55	61.891	Anolis_carolinensis
ENSAMXG00000015964	ctif	100	52.908	ENSANAG00000024925	CTIF	63	58.763	Aotus_nancymaae
ENSAMXG00000015964	ctif	100	63.357	ENSACLG00000005956	ctif	54	62.842	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000015964	ctif	90	78.333	ENSBTAG00000018901	CTIF	76	78.333	Bos_taurus
ENSAMXG00000015964	ctif	100	52.617	ENSCJAG00000004729	CTIF	97	58.205	Callithrix_jacchus
ENSAMXG00000015964	ctif	98	52.029	ENSCAFG00000019076	CTIF	60	60.383	Canis_familiaris
ENSAMXG00000015964	ctif	98	52.174	ENSCAFG00020026482	CTIF	60	60.656	Canis_lupus_dingo
ENSAMXG00000015964	ctif	100	53.182	ENSCHIG00000014455	CTIF	63	58.718	Capra_hircus
ENSAMXG00000015964	ctif	81	50.943	ENSTSYG00000030461	CTIF	67	57.534	Carlito_syrichta
ENSAMXG00000015964	ctif	100	47.814	ENSCAPG00000011865	CTIF	77	74.286	Cavia_aperea
ENSAMXG00000015964	ctif	100	50.488	ENSCPOG00000001049	CTIF	94	57.937	Cavia_porcellus
ENSAMXG00000015964	ctif	100	52.617	ENSCCAG00000022758	CTIF	97	58.462	Cebus_capucinus
ENSAMXG00000015964	ctif	100	53.125	ENSCATG00000038134	CTIF	65	58.869	Cercocebus_atys
ENSAMXG00000015964	ctif	100	52.131	ENSCLAG00000008174	CTIF	60	60.714	Chinchilla_lanigera
ENSAMXG00000015964	ctif	100	51.667	ENSCSAG00000018021	CTIF	61	58.656	Chlorocebus_sabaeus
ENSAMXG00000015964	ctif	90	83.333	ENSCPBG00000025654	CTIF	72	83.333	Chrysemys_picta_bellii
ENSAMXG00000015964	ctif	100	52.550	ENSCANG00000030916	CTIF	75	58.398	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAMXG00000015964	ctif	100	52.340	ENSCGRG00001020158	Ctif	94	60.165	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAMXG00000015964	ctif	100	48.497	ENSCGRG00000000052	Ctif	94	53.409	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAMXG00000015964	ctif	100	60.942	ENSCSEG00000019857	ctif	53	62.881	Cynoglossus_semilaevis
ENSAMXG00000015964	ctif	100	61.453	ENSCVAG00000017158	ctif	99	62.676	Cyprinodon_variegatus
ENSAMXG00000015964	ctif	68	50.813	ENSDNOG00000037310	CTIF	87	57.623	Dasypus_novemcinctus
ENSAMXG00000015964	ctif	100	51.983	ENSDORG00000003221	Ctif	63	58.098	Dipodomys_ordii
ENSAMXG00000015964	ctif	80	80.000	ENSEASG00005016094	CTIF	57	80.000	Equus_asinus_asinus
ENSAMXG00000015964	ctif	100	52.841	ENSECAG00000020473	CTIF	60	60.714	Equus_caballus
ENSAMXG00000015964	ctif	77	52.364	ENSEEUG00000012451	CTIF	70	58.486	Erinaceus_europaeus
ENSAMXG00000015964	ctif	78	73.519	ENSELUG00000008733	ctif	96	70.886	Esox_lucius
ENSAMXG00000015964	ctif	90	78.333	ENSFCAG00000000664	CTIF	73	78.333	Felis_catus
ENSAMXG00000015964	ctif	100	50.909	ENSFDAG00000017379	CTIF	61	57.979	Fukomys_damarensis
ENSAMXG00000015964	ctif	100	61.964	ENSFHEG00000004334	ctif	51	62.634	Fundulus_heteroclitus
ENSAMXG00000015964	ctif	100	56.799	ENSGALG00000035912	-	73	83.333	Gallus_gallus
ENSAMXG00000015964	ctif	100	61.421	ENSGAFG00000011896	ctif	70	87.500	Gambusia_affinis
ENSAMXG00000015964	ctif	61	53.793	ENSGAGG00000020663	CTIF	94	55.051	Gopherus_agassizii
ENSAMXG00000015964	ctif	100	52.550	ENSGGOG00000015204	CTIF	65	58.098	Gorilla_gorilla
ENSAMXG00000015964	ctif	100	63.497	ENSHBUG00000018092	ctif	54	62.842	Haplochromis_burtoni
ENSAMXG00000015964	ctif	100	51.709	ENSHGLG00000005663	CTIF	60	60.055	Heterocephalus_glaber_female
ENSAMXG00000015964	ctif	100	51.567	ENSHGLG00100006976	CTIF	60	60.055	Heterocephalus_glaber_male
ENSAMXG00000015964	ctif	83	61.207	ENSHCOG00000011784	ctif	98	61.638	Hippocampus_comes
ENSAMXG00000015964	ctif	99	76.274	ENSIPUG00000014050	ctif	99	75.664	Ictalurus_punctatus
ENSAMXG00000015964	ctif	100	51.700	ENSSTOG00000001967	CTIF	88	60.109	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAMXG00000015964	ctif	100	50.621	ENSJJAG00000013706	Ctif	61	60.000	Jaculus_jaculus
ENSAMXG00000015964	ctif	100	61.326	ENSKMAG00000014651	ctif	53	62.431	Kryptolebias_marmoratus
ENSAMXG00000015964	ctif	83	62.363	ENSLBEG00000018277	ctif	71	91.667	Labrus_bergylta
ENSAMXG00000015964	ctif	100	67.775	ENSLOCG00000011697	ctif	100	67.341	Lepisosteus_oculatus
ENSAMXG00000015964	ctif	100	46.365	ENSLAFG00000016335	CTIF	99	71.852	Loxodonta_africana
ENSAMXG00000015964	ctif	100	53.125	ENSMFAG00000037903	CTIF	65	58.869	Macaca_fascicularis
ENSAMXG00000015964	ctif	100	53.125	ENSMMUG00000020898	CTIF	65	58.869	Macaca_mulatta
ENSAMXG00000015964	ctif	100	53.125	ENSMNEG00000039395	CTIF	65	58.869	Macaca_nemestrina
ENSAMXG00000015964	ctif	100	52.691	ENSMLEG00000041132	CTIF	65	58.355	Mandrillus_leucophaeus
ENSAMXG00000015964	ctif	100	64.336	ENSMAMG00000014741	ctif	54	62.943	Mastacembelus_armatus
ENSAMXG00000015964	ctif	89	38.386	ENSMGAG00000001378	CTIF	75	77.273	Meleagris_gallopavo
ENSAMXG00000015964	ctif	100	52.051	ENSMAUG00000000656	Ctif	94	60.383	Mesocricetus_auratus
ENSAMXG00000015964	ctif	100	52.199	ENSMICG00000010167	CTIF	63	58.098	Microcebus_murinus
ENSAMXG00000015964	ctif	100	52.192	ENSMOCG00000020507	Ctif	94	60.383	Microtus_ochrogaster
ENSAMXG00000015964	ctif	100	65.116	ENSMMOG00000000831	ctif	51	65.988	Mola_mola
ENSAMXG00000015964	ctif	100	49.286	ENSMODG00000003464	CTIF	93	60.055	Monodelphis_domestica
ENSAMXG00000015964	ctif	60	73.333	ENSMALG00000020553	ctif	93	73.333	Monopterus_albus
ENSAMXG00000015964	ctif	100	50.687	MGP_CAROLIEiJ_G0022408	Ctif	62	56.848	Mus_caroli
ENSAMXG00000015964	ctif	100	50.685	ENSMUSG00000052928	Ctif	62	56.555	Mus_musculus
ENSAMXG00000015964	ctif	100	52.266	MGP_PahariEiJ_G0019137	Ctif	60	60.000	Mus_pahari
ENSAMXG00000015964	ctif	100	50.822	MGP_SPRETEiJ_G0023321	Ctif	91	76.667	Mus_spretus
ENSAMXG00000015964	ctif	100	52.550	ENSMPUG00000000844	CTIF	63	58.098	Mustela_putorius_furo
ENSAMXG00000015964	ctif	100	52.415	ENSMLUG00000003025	CTIF	63	58.398	Myotis_lucifugus
ENSAMXG00000015964	ctif	100	52.617	ENSNGAG00000011452	Ctif	60	60.383	Nannospalax_galili
ENSAMXG00000015964	ctif	100	52.550	ENSNLEG00000011503	CTIF	64	58.098	Nomascus_leucogenys
ENSAMXG00000015964	ctif	100	47.346	ENSMEUG00000000218	CTIF	87	81.667	Notamacropus_eugenii
ENSAMXG00000015964	ctif	100	52.000	ENSOPRG00000003558	CTIF	97	58.854	Ochotona_princeps
ENSAMXG00000015964	ctif	100	49.862	ENSODEG00000018390	CTIF	61	56.736	Octodon_degus
ENSAMXG00000015964	ctif	80	40.843	ENSOANG00000001337	CTIF	77	42.558	Ornithorhynchus_anatinus
ENSAMXG00000015964	ctif	100	52.000	ENSOCUG00000024842	CTIF	94	61.496	Oryctolagus_cuniculus
ENSAMXG00000015964	ctif	100	62.117	ENSORLG00000005786	ctif	60	58.649	Oryzias_latipes
ENSAMXG00000015964	ctif	100	61.463	ENSORLG00020005385	ctif	54	59.504	Oryzias_latipes_hni
ENSAMXG00000015964	ctif	100	60.585	ENSORLG00015011872	ctif	61	59.452	Oryzias_latipes_hsok
ENSAMXG00000015964	ctif	100	61.399	ENSOMEG00000007917	ctif	53	61.326	Oryzias_melastigma
ENSAMXG00000015964	ctif	100	51.920	ENSOGAG00000013927	CTIF	63	57.623	Otolemur_garnettii
ENSAMXG00000015964	ctif	100	53.399	ENSOARG00000003754	CTIF	63	58.869	Ovis_aries
ENSAMXG00000015964	ctif	100	52.550	ENSPPAG00000023554	CTIF	77	75.714	Pan_paniscus
ENSAMXG00000015964	ctif	100	52.408	ENSPPRG00000002265	CTIF	60	60.383	Panthera_pardus
ENSAMXG00000015964	ctif	100	52.266	ENSPTIG00000013761	CTIF	60	60.383	Panthera_tigris_altaica
ENSAMXG00000015964	ctif	100	52.550	ENSPTRG00000010009	CTIF	77	75.714	Pan_troglodytes
ENSAMXG00000015964	ctif	100	52.691	ENSPANG00000017087	CTIF	65	58.355	Papio_anubis
ENSAMXG00000015964	ctif	80	57.331	ENSPKIG00000011234	ctif	92	68.750	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAMXG00000015964	ctif	90	80.000	ENSPSIG00000006508	CTIF	72	80.000	Pelodiscus_sinensis
ENSAMXG00000015964	ctif	100	51.695	ENSPEMG00000022746	Ctif	60	59.563	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAMXG00000015964	ctif	72	51.262	ENSPCIG00000026247	CTIF	98	57.227	Phascolarctos_cinereus
ENSAMXG00000015964	ctif	100	62.136	ENSPFOG00000009243	ctif	60	62.602	Poecilia_formosa
ENSAMXG00000015964	ctif	100	62.136	ENSPLAG00000019171	ctif	89	62.873	Poecilia_latipinna
ENSAMXG00000015964	ctif	100	62.275	ENSPMEG00000020089	ctif	53	62.873	Poecilia_mexicana
ENSAMXG00000015964	ctif	100	61.259	ENSPREG00000017326	ctif	99	61.259	Poecilia_reticulata
ENSAMXG00000015964	ctif	80	54.035	ENSPPYG00000009147	CTIF	75	58.398	Pongo_abelii
ENSAMXG00000015964	ctif	100	49.929	ENSPCOG00000013391	CTIF	63	55.013	Propithecus_coquereli
ENSAMXG00000015964	ctif	100	53.249	ENSPVAG00000001965	CTIF	63	59.126	Pteropus_vampyrus
ENSAMXG00000015964	ctif	100	63.497	ENSPNYG00000007879	ctif	94	62.842	Pundamilia_nyererei
ENSAMXG00000015964	ctif	100	85.202	ENSPNAG00000029174	ctif	100	84.454	Pygocentrus_nattereri
ENSAMXG00000015964	ctif	100	52.199	ENSRNOG00000018342	Ctif	76	65.950	Rattus_norvegicus
ENSAMXG00000015964	ctif	100	52.833	ENSRBIG00000043937	CTIF	64	58.869	Rhinopithecus_bieti
ENSAMXG00000015964	ctif	100	52.408	ENSRROG00000006039	CTIF	64	58.355	Rhinopithecus_roxellana
ENSAMXG00000015964	ctif	100	52.624	ENSSBOG00000028468	CTIF	76	80.000	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSAMXG00000015964	ctif	100	49.713	ENSSHAG00000016321	CTIF	93	60.615	Sarcophilus_harrisii
ENSAMXG00000015964	ctif	100	70.968	ENSSFOG00015022594	ctif	53	70.088	Scleropages_formosus
ENSAMXG00000015964	ctif	99	64.853	ENSSMAG00000005707	ctif	91	62.912	Scophthalmus_maximus
ENSAMXG00000015964	ctif	100	66.381	ENSSDUG00000016033	ctif	99	66.141	Seriola_dumerili
ENSAMXG00000015964	ctif	100	52.975	ENSSPUG00000014734	CTIF	91	58.051	Sphenodon_punctatus
ENSAMXG00000015964	ctif	100	52.205	ENSSSCG00000004506	CTIF	94	60.440	Sus_scrofa
ENSAMXG00000015964	ctif	66	76.250	ENSTBEG00000002613	CTIF	72	77.143	Tupaia_belangeri
ENSAMXG00000015964	ctif	100	50.567	ENSTTRG00000004347	CTIF	60	56.011	Tursiops_truncatus
ENSAMXG00000015964	ctif	87	47.896	ENSUAMG00000007299	CTIF	50	50.831	Ursus_americanus
ENSAMXG00000015964	ctif	90	78.333	ENSUMAG00000002735	CTIF	76	78.333	Ursus_maritimus
ENSAMXG00000015964	ctif	88	77.273	ENSVVUG00000014347	CTIF	73	76.667	Vulpes_vulpes
ENSAMXG00000015964	ctif	70	66.154	ENSXETG00000026836	ctif	75	65.900	Xenopus_tropicalis
ENSAMXG00000015964	ctif	55	55.981	ENSXCOG00000002477	ctif	80	59.239	Xiphophorus_couchianus
ENSAMXG00000015964	ctif	100	62.151	ENSXMAG00000004236	ctif	90	72.963	Xiphophorus_maculatus