EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAMXG00000016416 (Gene tree)
Gene ID: 103040593
Gene Symbol: cse1l
Alias: bao|baobab|cas|cellular apoptosis susceptibility gene
Full Name: chromosome segregation 1 like
Gene Type: protein_coding
Species: Astyanax_mexicanus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 11979 bases
Position: chr22:29279675-29291653
Accession: 103040593
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAMXP00000051770	IBN_N	PF03810.19	5.3e-12	1	1
ENSAMXP00000016905	IBN_N	PF03810.19	5.5e-12	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAMXT00000039173	-	4242	XM_007256856	ENSAMXP00000051770	971 (aa)	XP_007256918	UPI000BBD86AA
ENSAMXT00000016905	-	2748	-	ENSAMXP00000016905	915 (aa)	-	W5LAP3

Gene Model

Click here to download ENSAMXG00000016416's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSAMXG00000016416's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	87.539	ENSG00000124207	CSE1L	100	87.539	Homo_sapiens
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	93.203	ENSAPOG00000015943	cse1l	100	93.203	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	87.436	ENSAMEG00000013717	CSE1L	100	87.436	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	91.257	ENSACIG00000020004	cse1l	100	91.257	Amphilophus_citrinellus
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	93.306	ENSAOCG00000004356	cse1l	100	93.306	Amphiprion_ocellaris
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	93.409	ENSAPEG00000016588	cse1l	100	93.409	Amphiprion_percula
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	93.203	ENSATEG00000005414	cse1l	100	93.203	Anabas_testudineus
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	88.157	ENSAPLG00000010368	CSE1L	100	88.157	Anas_platyrhynchos
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	87.333	ENSACAG00000015951	CSE1L	100	87.333	Anolis_carolinensis
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	85.479	ENSANAG00000023526	CSE1L	100	85.479	Aotus_nancymaae
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	89.392	ENSACLG00000023214	cse1l	99	89.598	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	87.333	ENSBTAG00000005957	CSE1L	100	87.333	Bos_taurus
ENSAMXG00000016416	cse1l	99	30.801	WBGene00002079	xpo-2	100	30.801	Caenorhabditis_elegans
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	87.539	ENSCJAG00000016296	CSE1L	100	87.539	Callithrix_jacchus
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	87.539	ENSCAFG00000011260	CSE1L	99	87.539	Canis_familiaris
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	86.818	ENSCAFG00020016114	CSE1L	100	86.448	Canis_lupus_dingo
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	87.230	ENSCHIG00000016579	CSE1L	100	87.230	Capra_hircus
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	87.539	ENSTSYG00000013400	CSE1L	100	87.539	Carlito_syrichta
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	70.164	ENSCAPG00000000237	-	100	70.164	Cavia_aperea
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	77.961	ENSCAPG00000004349	-	100	77.961	Cavia_aperea
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	87.333	ENSCPOG00000005554	-	100	87.333	Cavia_porcellus
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	77.755	ENSCPOG00000023180	-	100	77.755	Cavia_porcellus
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	87.539	ENSCCAG00000014373	CSE1L	100	87.539	Cebus_capucinus
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	87.539	ENSCATG00000039153	CSE1L	100	87.539	Cercocebus_atys
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	85.582	ENSCLAG00000006169	CSE1L	100	85.582	Chinchilla_lanigera
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	87.539	ENSCSAG00000014977	CSE1L	100	87.539	Chlorocebus_sabaeus
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	84.346	ENSCHOG00000004640	CSE1L	100	84.346	Choloepus_hoffmanni
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	88.465	ENSCPBG00000026743	CSE1L	100	88.465	Chrysemys_picta_bellii
ENSAMXG00000016416	cse1l	98	64.050	ENSCING00000002277	-	99	63.533	Ciona_intestinalis
ENSAMXG00000016416	cse1l	98	62.798	ENSCSAVG00000003299	-	98	62.798	Ciona_savignyi
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	85.891	ENSCANG00000041300	CSE1L	100	85.891	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	87.539	ENSCGRG00001005670	Cse1l	100	87.539	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	87.539	ENSCGRG00000012164	Cse1l	100	87.539	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	91.349	ENSCSEG00000002471	cse1l	100	91.349	Cynoglossus_semilaevis
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	91.864	ENSCVAG00000004319	cse1l	100	91.864	Cyprinodon_variegatus
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	93.924	ENSDARG00000006963	cse1l	100	93.924	Danio_rerio
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	87.539	ENSDNOG00000014906	CSE1L	100	87.539	Dasypus_novemcinctus
ENSAMXG00000016416	cse1l	91	90.186	ENSDORG00000013960	Cse1l	100	90.186	Dipodomys_ordii
ENSAMXG00000016416	cse1l	99	52.085	FBgn0022213	Cse1	99	52.085	Drosophila_melanogaster
ENSAMXG00000016416	cse1l	73	80.808	ENSEBUG00000011135	cse1l	92	80.808	Eptatretus_burgeri
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	87.127	ENSEASG00005023345	CSE1L	100	86.448	Equus_asinus_asinus
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	87.333	ENSECAG00000015543	CSE1L	97	87.333	Equus_caballus
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	92.997	ENSELUG00000001309	cse1l	100	92.997	Esox_lucius
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	87.539	ENSFCAG00000001446	CSE1L	100	87.539	Felis_catus
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	87.951	ENSFALG00000012932	CSE1L	97	87.951	Ficedula_albicollis
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	87.436	ENSFDAG00000005180	CSE1L	100	87.436	Fukomys_damarensis
ENSAMXG00000016416	cse1l	85	92.503	ENSFHEG00000005939	cse1l	92	92.503	Fundulus_heteroclitus
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	89.907	ENSGMOG00000007944	cse1l	100	89.907	Gadus_morhua
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	88.260	ENSGALG00000004707	CSE1L	100	88.260	Gallus_gallus
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	91.555	ENSGAFG00000021631	cse1l	100	91.555	Gambusia_affinis
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	91.967	ENSGACG00000000963	cse1l	100	91.967	Gasterosteus_aculeatus
ENSAMXG00000016416	cse1l	97	88.335	ENSGAGG00000012815	CSE1L	99	88.335	Gopherus_agassizii
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	87.436	ENSGGOG00000010875	CSE1L	100	87.436	Gorilla_gorilla
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	93.100	ENSHBUG00000013599	cse1l	100	93.100	Haplochromis_burtoni
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	79.300	ENSHGLG00000014944	-	100	79.300	Heterocephalus_glaber_female
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	87.230	ENSHGLG00000009067	CSE1L	100	87.230	Heterocephalus_glaber_female
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	87.230	ENSHGLG00100001243	CSE1L	100	87.230	Heterocephalus_glaber_male
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	79.300	ENSHGLG00100014942	-	100	79.300	Heterocephalus_glaber_male
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	91.366	ENSHCOG00000005034	cse1l	100	91.366	Hippocampus_comes
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	95.881	ENSIPUG00000023752	cse1l	100	95.881	Ictalurus_punctatus
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	87.230	ENSSTOG00000003600	CSE1L	100	87.230	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	87.333	ENSJJAG00000016509	Cse1l	100	87.333	Jaculus_jaculus
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	92.276	ENSKMAG00000021099	cse1l	100	92.276	Kryptolebias_marmoratus
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	91.864	ENSLBEG00000012480	cse1l	100	91.475	Labrus_bergylta
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	90.113	ENSLACG00000015970	CSE1L	100	90.113	Latimeria_chalumnae
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	93.203	ENSLOCG00000003099	cse1l	100	93.203	Lepisosteus_oculatus
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	86.214	ENSLAFG00000006607	CSE1L	100	86.934	Loxodonta_africana
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	87.539	ENSMFAG00000034230	CSE1L	100	87.539	Macaca_fascicularis
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	86.885	ENSMMUG00000019636	CSE1L	100	86.885	Macaca_mulatta
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	87.539	ENSMNEG00000031340	CSE1L	100	87.539	Macaca_nemestrina
ENSAMXG00000016416	cse1l	92	86.994	ENSMLEG00000042388	CSE1L	100	84.371	Mandrillus_leucophaeus
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	92.173	ENSMAMG00000023931	cse1l	100	92.173	Mastacembelus_armatus
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	92.894	ENSMZEG00005010674	cse1l	100	92.894	Maylandia_zebra
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	87.642	ENSMAUG00000001362	Cse1l	100	87.642	Mesocricetus_auratus
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	87.230	ENSMICG00000001988	CSE1L	100	87.230	Microcebus_murinus
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	87.642	ENSMOCG00000013597	Cse1l	100	87.642	Microtus_ochrogaster
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	86.921	ENSMMOG00000021787	cse1l	100	86.921	Mola_mola
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	87.436	ENSMODG00000016269	CSE1L	100	87.436	Monodelphis_domestica
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	91.658	ENSMALG00000017385	cse1l	100	91.658	Monopterus_albus
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	87.436	MGP_CAROLIEiJ_G0024698	Cse1l	100	87.436	Mus_caroli
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	87.333	ENSMUSG00000002718	Cse1l	100	87.333	Mus_musculus
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	87.642	MGP_PahariEiJ_G0026140	Cse1l	100	87.642	Mus_pahari
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	87.333	MGP_SPRETEiJ_G0025618	Cse1l	100	87.333	Mus_spretus
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	87.333	ENSMPUG00000017586	CSE1L	99	87.333	Mustela_putorius_furo
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	85.685	ENSMLUG00000008368	CSE1L	100	85.685	Myotis_lucifugus
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	86.934	ENSNGAG00000001115	Cse1l	100	86.934	Nannospalax_galili
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	93.100	ENSNBRG00000005053	cse1l	100	93.100	Neolamprologus_brichardi
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	86.406	ENSNLEG00000006945	CSE1L	100	86.406	Nomascus_leucogenys
ENSAMXG00000016416	cse1l	75	78.667	ENSMEUG00000005658	-	73	78.667	Notamacropus_eugenii
ENSAMXG00000016416	cse1l	95	85.528	ENSOPRG00000014530	CSE1L	90	85.528	Ochotona_princeps
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	87.436	ENSODEG00000006918	-	100	87.436	Octodon_degus
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	93.409	ENSONIG00000018970	cse1l	100	93.409	Oreochromis_niloticus
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	87.848	ENSOANG00000006402	CSE1L	99	87.848	Ornithorhynchus_anatinus
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	86.934	ENSOCUG00000005459	CSE1L	100	86.934	Oryctolagus_cuniculus
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	91.658	ENSORLG00000000603	cse1l	100	91.658	Oryzias_latipes
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	88.962	ENSORLG00020007653	cse1l	100	88.962	Oryzias_latipes_hni
ENSAMXG00000016416	cse1l	56	91.160	ENSORLG00015003694	cse1l	97	91.160	Oryzias_latipes_hsok
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	91.555	ENSOMEG00000014357	cse1l	100	91.555	Oryzias_melastigma
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	85.421	ENSOGAG00000002126	CSE1L	100	85.421	Otolemur_garnettii
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	87.243	ENSOARG00000012031	CSE1L	100	87.243	Ovis_aries
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	87.539	ENSPPAG00000038391	CSE1L	100	87.539	Pan_paniscus
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	87.539	ENSPPRG00000022681	CSE1L	100	87.539	Panthera_pardus
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	87.539	ENSPTIG00000011919	CSE1L	100	86.885	Panthera_tigris_altaica
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	87.539	ENSPTRG00000013599	CSE1L	100	87.539	Pan_troglodytes
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	84.655	ENSPANG00000026147	CSE1L	100	84.655	Papio_anubis
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	93.512	ENSPKIG00000024520	cse1l	100	93.512	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	88.568	ENSPSIG00000010864	CSE1L	99	88.568	Pelodiscus_sinensis
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	87.539	ENSPEMG00000000944	Cse1l	100	87.539	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	87.539	ENSPCIG00000023472	CSE1L	100	87.539	Phascolarctos_cinereus
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	92.173	ENSPFOG00000001989	cse1l	100	92.173	Poecilia_formosa
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	92.276	ENSPLAG00000015012	cse1l	100	92.276	Poecilia_latipinna
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	92.173	ENSPMEG00000022671	cse1l	100	92.173	Poecilia_mexicana
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	92.379	ENSPREG00000009081	cse1l	100	92.379	Poecilia_reticulata
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	87.539	ENSPPYG00000011110	CSE1L	100	87.539	Pongo_abelii
ENSAMXG00000016416	cse1l	75	87.706	ENSPCAG00000007508	CSE1L	80	87.706	Procavia_capensis
ENSAMXG00000016416	cse1l	93	84.935	ENSPCOG00000026411	CSE1L	100	84.935	Propithecus_coquereli
ENSAMXG00000016416	cse1l	99	83.612	ENSPVAG00000015014	CSE1L	100	83.612	Pteropus_vampyrus
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	93.203	ENSPNYG00000007058	cse1l	100	93.203	Pundamilia_nyererei
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	97.013	ENSPNAG00000012903	cse1l	100	97.013	Pygocentrus_nattereri
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	86.818	ENSRNOG00000007665	Cse1l	100	86.818	Rattus_norvegicus
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	87.539	ENSRBIG00000029361	CSE1L	100	87.539	Rhinopithecus_bieti
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	87.539	ENSRROG00000021686	CSE1L	100	87.539	Rhinopithecus_roxellana
ENSAMXG00000016416	cse1l	96	35.624	YGL238W	CSE1	97	35.518	Saccharomyces_cerevisiae
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	87.539	ENSSBOG00000021396	CSE1L	100	87.539	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	91.246	ENSSFOG00015021428	cse1l	100	91.246	Scleropages_formosus
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	92.173	ENSSMAG00000000580	cse1l	96	92.173	Scophthalmus_maximus
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	93.512	ENSSDUG00000012110	cse1l	100	93.512	Seriola_dumerili
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	93.512	ENSSLDG00000022083	cse1l	100	93.512	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	88.774	ENSSPUG00000017941	CSE1L	100	88.774	Sphenodon_punctatus
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	92.894	ENSSPAG00000008182	cse1l	100	92.894	Stegastes_partitus
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	87.539	ENSSSCG00000025534	CSE1L	99	87.539	Sus_scrofa
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	87.848	ENSTGUG00000008823	CSE1L	100	87.848	Taeniopygia_guttata
ENSAMXG00000016416	cse1l	95	90.543	ENSTRUG00000005496	cse1l	95	90.543	Takifugu_rubripes
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	90.319	ENSTNIG00000014631	cse1l	100	90.319	Tetraodon_nigroviridis
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	79.197	ENSTBEG00000008338	CSE1L	100	79.197	Tupaia_belangeri
ENSAMXG00000016416	cse1l	91	85.526	ENSTTRG00000004279	CSE1L	91	85.526	Tursiops_truncatus
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	87.230	ENSUAMG00000025448	CSE1L	99	87.230	Ursus_americanus
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	87.230	ENSUMAG00000024476	CSE1L	99	87.230	Ursus_maritimus
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	84.037	ENSVPAG00000001312	CSE1L	100	84.037	Vicugna_pacos
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	87.539	ENSVVUG00000022322	CSE1L	99	87.539	Vulpes_vulpes
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	85.479	ENSXETG00000001784	cse1l	100	85.479	Xenopus_tropicalis
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	92.240	ENSXCOG00000000805	cse1l	100	92.240	Xiphophorus_couchianus
ENSAMXG00000016416	cse1l	100	92.585	ENSXMAG00000001306	cse1l	100	92.585	Xiphophorus_maculatus