EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAMXG00000017008 (Gene tree)
Gene ID: 103037364
Gene Symbol: MTERF1
Alias: MTERF
Full Name: mitochondrial transcription termination factor 1
Gene Type: protein_coding
Species: Astyanax_mexicanus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 1065 bases
Position: chrAPWO02000636.1:63996-65060
Accession: 103037364
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAMXP00000017511	mTERF	PF02536.14	3.4e-49	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAMXT00000017511	MTERF1-201	1065	XM_007242230	ENSAMXP00000017511	354 (aa)	XP_007242292	W5LCE9

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAMXG00000017008	MTERF1	94	49.550	ENSG00000127989	MTERF1	87	49.550	Homo_sapiens
ENSAMXG00000017008	MTERF1	97	59.249	ENSAPOG00000022230	MTERF1	90	59.249	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAMXG00000017008	MTERF1	77	45.985	ENSAMEG00000007917	-	81	45.804	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAMXG00000017008	MTERF1	99	56.410	ENSACIG00000017700	MTERF1	90	56.410	Amphilophus_citrinellus
ENSAMXG00000017008	MTERF1	99	56.410	ENSAOCG00000004345	MTERF1	91	56.410	Amphiprion_ocellaris
ENSAMXG00000017008	MTERF1	99	56.410	ENSAPEG00000005877	MTERF1	91	56.410	Amphiprion_percula
ENSAMXG00000017008	MTERF1	99	50.986	ENSATEG00000011055	MTERF1	92	50.986	Anabas_testudineus
ENSAMXG00000017008	MTERF1	97	30.233	ENSAPLG00000001889	MTERF2	88	30.233	Anas_platyrhynchos
ENSAMXG00000017008	MTERF1	99	45.272	ENSACAG00000015777	MTERF1	87	45.272	Anolis_carolinensis
ENSAMXG00000017008	MTERF1	89	52.229	ENSANAG00000022640	MTERF1	84	51.840	Aotus_nancymaae
ENSAMXG00000017008	MTERF1	99	57.386	ENSACLG00000011571	MTERF1	91	57.386	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000017008	MTERF1	89	50.318	ENSBTAG00000045617	MTERF1	82	49.846	Bos_taurus
ENSAMXG00000017008	MTERF1	89	51.592	ENSCJAG00000014169	MTERF1	82	51.227	Callithrix_jacchus
ENSAMXG00000017008	MTERF1	89	48.089	ENSCAFG00000001908	MTERF1	83	47.853	Canis_familiaris
ENSAMXG00000017008	MTERF1	89	48.089	ENSCAFG00020015983	MTERF1	83	47.853	Canis_lupus_dingo
ENSAMXG00000017008	MTERF1	92	49.538	ENSCHIG00000013172	MTERF1	82	49.538	Capra_hircus
ENSAMXG00000017008	MTERF1	93	48.780	ENSTSYG00000012629	MTERF1	85	49.263	Carlito_syrichta
ENSAMXG00000017008	MTERF1	93	50.152	ENSCPOG00000003510	MTERF1	80	50.152	Cavia_porcellus
ENSAMXG00000017008	MTERF1	89	51.911	ENSCCAG00000026587	MTERF1	83	51.534	Cebus_capucinus
ENSAMXG00000017008	MTERF1	93	50.000	ENSCATG00000039620	MTERF1	83	50.000	Cercocebus_atys
ENSAMXG00000017008	MTERF1	93	50.000	ENSCSAG00000012508	MTERF1	83	50.000	Chlorocebus_sabaeus
ENSAMXG00000017008	MTERF1	92	51.070	ENSCPBG00000021801	MTERF1	81	51.070	Chrysemys_picta_bellii
ENSAMXG00000017008	MTERF1	93	30.000	ENSCPBG00000023194	MTERF2	83	30.000	Chrysemys_picta_bellii
ENSAMXG00000017008	MTERF1	93	48.936	ENSCANG00000030925	MTERF1	82	48.936	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAMXG00000017008	MTERF1	92	50.154	ENSCGRG00001009716	-	86	50.154	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAMXG00000017008	MTERF1	92	50.154	ENSCGRG00000018838	-	86	50.154	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAMXG00000017008	MTERF1	93	61.702	ENSCVAG00000007837	MTERF1	86	61.702	Cyprinodon_variegatus
ENSAMXG00000017008	MTERF1	97	55.523	ENSDARG00000086107	MTERF1	93	55.523	Danio_rerio
ENSAMXG00000017008	MTERF1	97	38.192	ENSDNOG00000032229	MTERF1	74	38.192	Dasypus_novemcinctus
ENSAMXG00000017008	MTERF1	92	48.000	ENSDORG00000028877	-	86	48.000	Dipodomys_ordii
ENSAMXG00000017008	MTERF1	92	49.846	ENSEASG00005019646	MTERF1	83	49.846	Equus_asinus_asinus
ENSAMXG00000017008	MTERF1	94	48.802	ENSECAG00000018128	MTERF1	85	48.802	Equus_caballus
ENSAMXG00000017008	MTERF1	89	51.274	ENSEEUG00000013448	MTERF1	79	51.274	Erinaceus_europaeus
ENSAMXG00000017008	MTERF1	93	59.756	ENSELUG00000014952	MTERF1	82	59.756	Esox_lucius
ENSAMXG00000017008	MTERF1	92	31.307	ENSELUG00000020338	mterf2	83	31.307	Esox_lucius
ENSAMXG00000017008	MTERF1	89	50.000	ENSFCAG00000044797	MTERF1	82	49.695	Felis_catus
ENSAMXG00000017008	MTERF1	92	30.091	ENSFDAG00000004491	MTERF2	87	30.091	Fukomys_damarensis
ENSAMXG00000017008	MTERF1	96	59.767	ENSFHEG00000000224	MTERF1	89	59.767	Fundulus_heteroclitus
ENSAMXG00000017008	MTERF1	91	55.963	ENSGMOG00000007262	-	96	55.963	Gadus_morhua
ENSAMXG00000017008	MTERF1	92	30.699	ENSGALG00000012639	MTERF2	69	30.699	Gallus_gallus
ENSAMXG00000017008	MTERF1	99	56.734	ENSGAFG00000008852	MTERF1	91	56.734	Gambusia_affinis
ENSAMXG00000017008	MTERF1	93	30.000	ENSGAGG00000015709	MTERF2	83	30.000	Gopherus_agassizii
ENSAMXG00000017008	MTERF1	92	52.905	ENSGAGG00000025333	MTERF1	80	52.905	Gopherus_agassizii
ENSAMXG00000017008	MTERF1	94	49.850	ENSGGOG00000025995	MTERF1	85	49.850	Gorilla_gorilla
ENSAMXG00000017008	MTERF1	99	57.386	ENSHBUG00000022218	MTERF1	91	57.386	Haplochromis_burtoni
ENSAMXG00000017008	MTERF1	99	53.977	ENSHCOG00000016064	MTERF1	92	53.977	Hippocampus_comes
ENSAMXG00000017008	MTERF1	93	63.939	ENSIPUG00000004017	mterf1	86	63.939	Ictalurus_punctatus
ENSAMXG00000017008	MTERF1	98	30.252	ENSSTOG00000010181	MTERF2	92	30.252	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAMXG00000017008	MTERF1	93	50.305	ENSSTOG00000001846	MTERF1	84	50.305	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAMXG00000017008	MTERF1	98	45.480	ENSJJAG00000011811	-	95	45.480	Jaculus_jaculus
ENSAMXG00000017008	MTERF1	99	53.009	ENSKMAG00000009695	MTERF1	90	53.009	Kryptolebias_marmoratus
ENSAMXG00000017008	MTERF1	92	55.556	ENSLACG00000009880	MTERF1	82	55.556	Latimeria_chalumnae
ENSAMXG00000017008	MTERF1	92	61.846	ENSLOCG00000018348	MTERF1	84	61.846	Lepisosteus_oculatus
ENSAMXG00000017008	MTERF1	91	49.221	ENSLAFG00000000054	MTERF1	85	49.221	Loxodonta_africana
ENSAMXG00000017008	MTERF1	93	50.000	ENSMFAG00000038723	MTERF1	83	50.000	Macaca_fascicularis
ENSAMXG00000017008	MTERF1	93	50.303	ENSMMUG00000015516	MTERF1	87	50.303	Macaca_mulatta
ENSAMXG00000017008	MTERF1	93	50.303	ENSMNEG00000041445	MTERF1	83	50.303	Macaca_nemestrina
ENSAMXG00000017008	MTERF1	90	50.314	ENSMLEG00000008543	MTERF1	83	50.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSAMXG00000017008	MTERF1	97	56.936	ENSMAMG00000015682	MTERF1	88	56.936	Mastacembelus_armatus
ENSAMXG00000017008	MTERF1	99	57.386	ENSMZEG00005026659	MTERF1	91	57.386	Maylandia_zebra
ENSAMXG00000017008	MTERF1	99	30.312	ENSMGAG00000015962	MTERF2	89	30.312	Meleagris_gallopavo
ENSAMXG00000017008	MTERF1	92	50.154	ENSMAUG00000006025	-	86	50.154	Mesocricetus_auratus
ENSAMXG00000017008	MTERF1	92	51.692	ENSMICG00000046314	MTERF1	82	51.692	Microcebus_murinus
ENSAMXG00000017008	MTERF1	53	51.813	ENSMALG00000007587	MTERF1	78	51.813	Monopterus_albus
ENSAMXG00000017008	MTERF1	91	50.779	ENSMUSG00000040429	Mterf1a	85	50.779	Mus_musculus
ENSAMXG00000017008	MTERF1	91	50.779	ENSMUSG00000053178	Mterf1b	84	50.779	Mus_musculus
ENSAMXG00000017008	MTERF1	91	50.156	MGP_PahariEiJ_G0021712	-	84	50.156	Mus_pahari
ENSAMXG00000017008	MTERF1	91	50.156	MGP_PahariEiJ_G0021713	-	84	50.156	Mus_pahari
ENSAMXG00000017008	MTERF1	91	50.779	MGP_SPRETEiJ_G0027936	-	85	50.779	Mus_spretus
ENSAMXG00000017008	MTERF1	91	50.779	MGP_SPRETEiJ_G0027937	-	85	50.779	Mus_spretus
ENSAMXG00000017008	MTERF1	92	30.091	ENSMPUG00000020039	MTERF2	84	30.091	Mustela_putorius_furo
ENSAMXG00000017008	MTERF1	92	49.231	ENSMPUG00000008568	MTERF1	81	49.231	Mustela_putorius_furo
ENSAMXG00000017008	MTERF1	98	47.368	ENSMLUG00000011330	MTERF1	90	47.368	Myotis_lucifugus
ENSAMXG00000017008	MTERF1	94	46.847	ENSNGAG00000014383	-	86	46.847	Nannospalax_galili
ENSAMXG00000017008	MTERF1	58	54.762	ENSNBRG00000022238	-	68	54.762	Neolamprologus_brichardi
ENSAMXG00000017008	MTERF1	95	49.555	ENSNLEG00000015192	MTERF1	84	49.555	Nomascus_leucogenys
ENSAMXG00000017008	MTERF1	93	51.360	ENSODEG00000000904	-	82	51.360	Octodon_degus
ENSAMXG00000017008	MTERF1	93	51.360	ENSODEG00000014952	-	82	51.360	Octodon_degus
ENSAMXG00000017008	MTERF1	97	57.925	ENSONIG00000019792	MTERF1	91	57.925	Oreochromis_niloticus
ENSAMXG00000017008	MTERF1	86	43.279	ENSOANG00000004680	-	98	43.279	Ornithorhynchus_anatinus
ENSAMXG00000017008	MTERF1	93	50.610	ENSOCUG00000010902	MTERF1	82	50.610	Oryctolagus_cuniculus
ENSAMXG00000017008	MTERF1	95	55.331	ENSORLG00000027811	MTERF1	90	55.331	Oryzias_latipes
ENSAMXG00000017008	MTERF1	95	56.213	ENSOMEG00000023485	MTERF1	88	56.213	Oryzias_melastigma
ENSAMXG00000017008	MTERF1	93	50.303	ENSOGAG00000001378	MTERF1	83	50.303	Otolemur_garnettii
ENSAMXG00000017008	MTERF1	92	49.231	ENSOARG00000016682	MTERF1	82	49.231	Ovis_aries
ENSAMXG00000017008	MTERF1	94	49.850	ENSPPAG00000027361	MTERF1	85	49.850	Pan_paniscus
ENSAMXG00000017008	MTERF1	93	49.390	ENSPPRG00000002171	MTERF1	82	49.390	Panthera_pardus
ENSAMXG00000017008	MTERF1	89	50.000	ENSPTIG00000016254	MTERF1	82	49.695	Panthera_tigris_altaica
ENSAMXG00000017008	MTERF1	94	49.550	ENSPTRG00000019388	MTERF1	85	49.550	Pan_troglodytes
ENSAMXG00000017008	MTERF1	94	49.550	ENSPTRG00000052592	-	85	49.550	Pan_troglodytes
ENSAMXG00000017008	MTERF1	93	50.606	ENSPANG00000007445	MTERF1	83	50.606	Papio_anubis
ENSAMXG00000017008	MTERF1	92	57.231	ENSPKIG00000017556	MTERF1	88	57.231	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAMXG00000017008	MTERF1	92	57.231	ENSPKIG00000017849	MTERF1	88	57.231	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAMXG00000017008	MTERF1	92	50.459	ENSPSIG00000016905	MTERF1	82	50.459	Pelodiscus_sinensis
ENSAMXG00000017008	MTERF1	50	58.564	ENSPMGG00000021420	MTERF1	78	58.564	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSAMXG00000017008	MTERF1	93	50.456	ENSPEMG00000013884	-	86	50.456	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAMXG00000017008	MTERF1	91	45.031	ENSPMAG00000007898	MTERF1	96	45.031	Petromyzon_marinus
ENSAMXG00000017008	MTERF1	99	57.020	ENSPFOG00000006919	MTERF1	90	57.020	Poecilia_formosa
ENSAMXG00000017008	MTERF1	99	57.307	ENSPLAG00000011584	MTERF1	90	57.307	Poecilia_latipinna
ENSAMXG00000017008	MTERF1	99	57.307	ENSPREG00000012369	MTERF1	91	57.307	Poecilia_reticulata
ENSAMXG00000017008	MTERF1	90	49.371	ENSPPYG00000017826	MTERF1	77	49.371	Pongo_abelii
ENSAMXG00000017008	MTERF1	92	50.765	ENSPCOG00000013179	MTERF1	83	50.765	Propithecus_coquereli
ENSAMXG00000017008	MTERF1	73	49.231	ENSPVAG00000006613	MTERF1	66	49.231	Pteropus_vampyrus
ENSAMXG00000017008	MTERF1	99	57.102	ENSPNYG00000009120	MTERF1	91	57.102	Pundamilia_nyererei
ENSAMXG00000017008	MTERF1	97	72.965	ENSPNAG00000022366	MTERF1	90	72.965	Pygocentrus_nattereri
ENSAMXG00000017008	MTERF1	92	50.462	ENSRNOG00000007899	Mterf1	87	50.462	Rattus_norvegicus
ENSAMXG00000017008	MTERF1	93	49.394	ENSRBIG00000027323	MTERF1	83	49.394	Rhinopithecus_bieti
ENSAMXG00000017008	MTERF1	93	49.394	ENSRROG00000031256	MTERF1	83	49.394	Rhinopithecus_roxellana
ENSAMXG00000017008	MTERF1	89	51.911	ENSSBOG00000034146	MTERF1	95	48.739	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSAMXG00000017008	MTERF1	92	54.462	ENSSFOG00015008650	mterf1	85	54.462	Scleropages_formosus
ENSAMXG00000017008	MTERF1	99	53.258	ENSSMAG00000004934	MTERF1	76	53.258	Scophthalmus_maximus
ENSAMXG00000017008	MTERF1	97	56.034	ENSSDUG00000013580	MTERF1	90	56.034	Seriola_dumerili
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ENSAMXG00000017008	MTERF1	99	55.714	ENSSPAG00000018734	MTERF1	91	55.714	Stegastes_partitus
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ENSAMXG00000017008	MTERF1	93	30.211	ENSTGUG00000011016	-	93	30.211	Taeniopygia_guttata
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ENSAMXG00000017008	MTERF1	98	47.262	ENSXETG00000027398	mterf1	92	47.262	Xenopus_tropicalis