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Description

Ensembl ID: ENSAMXG00000017178 (Gene tree)
Gene ID: 103023922
Gene Symbol: GZF1
Alias: ZBTB23|ZNF336|dJ322G13.2
Full Name: GDNF-inducible zinc finger protein 1
Gene Type: protein_coding
Species: Astyanax_mexicanus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 3887 bases
Position: chr3:45436102-45439988
Accession: 103023922
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAMXP00000017683	zf-C2H2	PF00096.26	2.2e-36	1	7
ENSAMXP00000017683	zf-C2H2	PF00096.26	2.2e-36	2	7
ENSAMXP00000017683	zf-C2H2	PF00096.26	2.2e-36	3	7
ENSAMXP00000017683	zf-C2H2	PF00096.26	2.2e-36	4	7
ENSAMXP00000017683	zf-C2H2	PF00096.26	2.2e-36	5	7
ENSAMXP00000017683	zf-C2H2	PF00096.26	2.2e-36	6	7
ENSAMXP00000017683	zf-C2H2	PF00096.26	2.2e-36	7	7
ENSAMXP00000017683	zf-met	PF12874.7	8.5e-09	1	2
ENSAMXP00000017683	zf-met	PF12874.7	8.5e-09	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAMXT00000017683	GZF1-201	2112	XM_007229703	ENSAMXP00000017683	703 (aa)	XP_007229765	W5LCX1

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSAMXG00000017178	GZF1	80	39.623	ENSAMXG00000034454	si:ch211-236k19.4	93	39.623
ENSAMXG00000017178	GZF1	53	44.700	ENSAMXG00000034096	-	90	44.700
ENSAMXG00000017178	GZF1	52	45.714	ENSAMXG00000032212	-	94	39.560
ENSAMXG00000017178	GZF1	55	35.714	ENSAMXG00000042174	-	93	41.791
ENSAMXG00000017178	GZF1	55	48.879	ENSAMXG00000038905	-	98	48.879
ENSAMXG00000017178	GZF1	54	41.532	ENSAMXG00000038284	-	93	41.532
ENSAMXG00000017178	GZF1	50	35.484	ENSAMXG00000009872	zbtb16b	58	35.484
ENSAMXG00000017178	GZF1	51	41.667	ENSAMXG00000034873	-	81	40.690
ENSAMXG00000017178	GZF1	51	40.299	ENSAMXG00000017609	-	90	40.299
ENSAMXG00000017178	GZF1	52	43.891	ENSAMXG00000035349	-	54	43.891
ENSAMXG00000017178	GZF1	52	38.286	ENSAMXG00000007441	-	93	37.766
ENSAMXG00000017178	GZF1	53	36.842	ENSAMXG00000012589	-	75	36.842
ENSAMXG00000017178	GZF1	50	36.842	ENSAMXG00000035127	-	99	44.848
ENSAMXG00000017178	GZF1	54	40.942	ENSAMXG00000036915	-	98	39.000
ENSAMXG00000017178	GZF1	53	43.023	ENSAMXG00000037143	-	96	44.635
ENSAMXG00000017178	GZF1	56	38.421	ENSAMXG00000005918	zbtb16a	55	38.421
ENSAMXG00000017178	GZF1	80	43.005	ENSAMXG00000043418	zbtb24	71	43.005
ENSAMXG00000017178	GZF1	50	36.087	ENSAMXG00000014745	-	82	42.781
ENSAMXG00000017178	GZF1	61	38.372	ENSAMXG00000035525	znf646	81	38.372
ENSAMXG00000017178	GZF1	53	42.857	ENSAMXG00000041975	-	91	42.857
ENSAMXG00000017178	GZF1	50	43.860	ENSAMXG00000032457	-	94	43.860
ENSAMXG00000017178	GZF1	51	46.961	ENSAMXG00000009776	-	98	46.961
ENSAMXG00000017178	GZF1	50	42.023	ENSAMXG00000038280	-	88	42.023
ENSAMXG00000017178	GZF1	58	48.052	ENSAMXG00000037382	-	94	48.052
ENSAMXG00000017178	GZF1	57	48.241	ENSAMXG00000037981	-	94	48.241
ENSAMXG00000017178	GZF1	50	44.000	ENSAMXG00000011804	-	88	44.000

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAMXG00000017178	GZF1	84	47.717	ENSG00000125812	GZF1	86	48.031	Homo_sapiens
ENSAMXG00000017178	GZF1	87	46.948	ENSAPOG00000012930	GZF1	98	46.462	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAMXG00000017178	GZF1	84	42.368	ENSAMEG00000009853	GZF1	86	43.168	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAMXG00000017178	GZF1	83	49.259	ENSACIG00000004753	-	82	46.254	Amphilophus_citrinellus
ENSAMXG00000017178	GZF1	85	47.267	ENSAOCG00000024275	GZF1	98	47.428	Amphiprion_ocellaris
ENSAMXG00000017178	GZF1	94	46.705	ENSAPEG00000017195	GZF1	98	46.705	Amphiprion_percula
ENSAMXG00000017178	GZF1	83	42.568	ENSATEG00000018374	GZF1	99	68.182	Anabas_testudineus
ENSAMXG00000017178	GZF1	95	44.521	ENSANAG00000028240	GZF1	98	44.938	Aotus_nancymaae
ENSAMXG00000017178	GZF1	94	45.235	ENSACLG00000025866	GZF1	96	45.235	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000017178	GZF1	94	44.065	ENSCJAG00000000733	GZF1	98	44.938	Callithrix_jacchus
ENSAMXG00000017178	GZF1	81	47.411	ENSCAFG00000005142	GZF1	86	47.393	Canis_familiaris
ENSAMXG00000017178	GZF1	81	47.812	ENSTSYG00000028054	GZF1	85	47.419	Carlito_syrichta
ENSAMXG00000017178	GZF1	81	45.981	ENSCAPG00000002173	GZF1	85	45.981	Cavia_aperea
ENSAMXG00000017178	GZF1	81	45.981	ENSCPOG00000010790	GZF1	85	45.981	Cavia_porcellus
ENSAMXG00000017178	GZF1	81	49.114	ENSCCAG00000035601	GZF1	99	45.103	Cebus_capucinus
ENSAMXG00000017178	GZF1	94	44.199	ENSCATG00000039279	GZF1	99	44.751	Cercocebus_atys
ENSAMXG00000017178	GZF1	94	42.935	ENSCLAG00000014714	GZF1	99	42.935	Chinchilla_lanigera
ENSAMXG00000017178	GZF1	94	44.138	ENSCSAG00000011054	GZF1	99	44.690	Chlorocebus_sabaeus
ENSAMXG00000017178	GZF1	83	52.500	ENSCPBG00000023418	-	87	43.038	Chrysemys_picta_bellii
ENSAMXG00000017178	GZF1	81	47.993	ENSCPBG00000023415	GZF1	85	48.548	Chrysemys_picta_bellii
ENSAMXG00000017178	GZF1	94	44.276	ENSCANG00000041260	GZF1	99	44.828	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAMXG00000017178	GZF1	78	56.971	ENSCGRG00001003944	Gzf1	87	46.262	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAMXG00000017178	GZF1	78	56.971	ENSCGRG00000012721	Gzf1	87	46.262	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAMXG00000017178	GZF1	91	49.915	ENSCSEG00000002270	GZF1	77	49.915	Cynoglossus_semilaevis
ENSAMXG00000017178	GZF1	81	49.396	ENSCVAG00000013068	-	71	50.337	Cyprinodon_variegatus
ENSAMXG00000017178	GZF1	57	60.149	ENSDNOG00000014290	GZF1	68	60.494	Dasypus_novemcinctus
ENSAMXG00000017178	GZF1	84	47.188	ENSDORG00000011855	Gzf1	87	48.297	Dipodomys_ordii
ENSAMXG00000017178	GZF1	81	68.872	ENSEBUG00000004858	GZF1	76	43.345	Eptatretus_burgeri
ENSAMXG00000017178	GZF1	51	82.243	ENSELUG00000013581	GZF1	99	82.243	Esox_lucius
ENSAMXG00000017178	GZF1	84	46.213	ENSFCAG00000006484	GZF1	86	46.677	Felis_catus
ENSAMXG00000017178	GZF1	81	46.474	ENSFDAG00000019468	GZF1	89	46.474	Fukomys_damarensis
ENSAMXG00000017178	GZF1	83	48.253	ENSFHEG00000020498	GZF1	74	48.922	Fundulus_heteroclitus
ENSAMXG00000017178	GZF1	81	49.834	ENSGMOG00000011017	GZF1	98	50.505	Gadus_morhua
ENSAMXG00000017178	GZF1	84	47.574	ENSGALG00000053640	GZF1	86	47.442	Gallus_gallus
ENSAMXG00000017178	GZF1	97	46.932	ENSGAFG00000008725	GZF1	88	47.913	Gambusia_affinis
ENSAMXG00000017178	GZF1	82	49.667	ENSGACG00000012415	GZF1	96	75.789	Gasterosteus_aculeatus
ENSAMXG00000017178	GZF1	84	48.031	ENSGGOG00000023248	GZF1	86	48.031	Gorilla_gorilla
ENSAMXG00000017178	GZF1	94	45.351	ENSHBUG00000016502	-	96	45.351	Haplochromis_burtoni
ENSAMXG00000017178	GZF1	81	47.200	ENSHGLG00000008891	GZF1	86	47.200	Heterocephalus_glaber_female
ENSAMXG00000017178	GZF1	81	47.200	ENSHGLG00100015117	GZF1	86	47.200	Heterocephalus_glaber_male
ENSAMXG00000017178	GZF1	82	46.220	ENSHCOG00000004326	GZF1	93	41.808	Hippocampus_comes
ENSAMXG00000017178	GZF1	84	48.281	ENSSTOG00000009820	GZF1	86	48.281	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAMXG00000017178	GZF1	94	43.776	ENSJJAG00000008172	Gzf1	99	44.186	Jaculus_jaculus
ENSAMXG00000017178	GZF1	81	71.429	ENSKMAG00000001453	-	99	72.165	Kryptolebias_marmoratus
ENSAMXG00000017178	GZF1	89	47.941	ENSLBEG00000025803	-	90	49.427	Labrus_bergylta
ENSAMXG00000017178	GZF1	84	46.479	ENSLAFG00000002458	GZF1	99	45.729	Loxodonta_africana
ENSAMXG00000017178	GZF1	94	44.199	ENSMFAG00000042408	GZF1	99	44.751	Macaca_fascicularis
ENSAMXG00000017178	GZF1	94	44.199	ENSMMUG00000022387	GZF1	99	44.751	Macaca_mulatta
ENSAMXG00000017178	GZF1	94	44.138	ENSMNEG00000033117	GZF1	99	44.690	Macaca_nemestrina
ENSAMXG00000017178	GZF1	94	44.138	ENSMLEG00000036831	GZF1	99	44.690	Mandrillus_leucophaeus
ENSAMXG00000017178	GZF1	99	58.696	ENSMAMG00000011931	-	92	44.879	Mastacembelus_armatus
ENSAMXG00000017178	GZF1	94	45.494	ENSMZEG00005010711	-	96	45.494	Maylandia_zebra
ENSAMXG00000017178	GZF1	87	45.564	ENSMAUG00000019656	Gzf1	99	48.208	Mesocricetus_auratus
ENSAMXG00000017178	GZF1	81	46.965	ENSMICG00000046070	GZF1	86	47.022	Microcebus_murinus
ENSAMXG00000017178	GZF1	86	46.463	ENSMOCG00000017816	Gzf1	87	46.372	Microtus_ochrogaster
ENSAMXG00000017178	GZF1	92	48.908	ENSMMOG00000004395	-	94	46.341	Mola_mola
ENSAMXG00000017178	GZF1	81	47.419	ENSMODG00000006238	GZF1	100	66.154	Monodelphis_domestica
ENSAMXG00000017178	GZF1	84	46.688	MGP_CAROLIEiJ_G0024409	Gzf1	87	47.634	Mus_caroli
ENSAMXG00000017178	GZF1	81	47.326	ENSMUSG00000027439	Gzf1	87	47.161	Mus_musculus
ENSAMXG00000017178	GZF1	84	46.772	MGP_PahariEiJ_G0025852	Gzf1	87	47.087	Mus_pahari
ENSAMXG00000017178	GZF1	81	47.326	MGP_SPRETEiJ_G0025327	Gzf1	87	47.161	Mus_spretus
ENSAMXG00000017178	GZF1	81	48.622	ENSMPUG00000001160	GZF1	88	44.321	Mustela_putorius_furo
ENSAMXG00000017178	GZF1	74	33.544	ENSMLUG00000002194	GZF1	88	45.016	Myotis_lucifugus
ENSAMXG00000017178	GZF1	81	47.164	ENSNGAG00000024012	Gzf1	86	47.634	Nannospalax_galili
ENSAMXG00000017178	GZF1	81	43.485	ENSNBRG00000019987	GZF1	97	46.678	Neolamprologus_brichardi
ENSAMXG00000017178	GZF1	94	44.337	ENSNLEG00000011565	GZF1	99	44.751	Nomascus_leucogenys
ENSAMXG00000017178	GZF1	81	47.078	ENSOPRG00000004697	GZF1	85	47.735	Ochotona_princeps
ENSAMXG00000017178	GZF1	84	42.429	ENSODEG00000013020	GZF1	83	44.032	Octodon_degus
ENSAMXG00000017178	GZF1	83	48.270	ENSONIG00000000989	GZF1	99	48.929	Oreochromis_niloticus
ENSAMXG00000017178	GZF1	81	47.428	ENSOCUG00000025214	GZF1	84	47.749	Oryctolagus_cuniculus
ENSAMXG00000017178	GZF1	91	49.383	ENSORLG00000010006	-	92	49.327	Oryzias_latipes
ENSAMXG00000017178	GZF1	54	65.938	ENSORLG00020001395	-	92	49.324	Oryzias_latipes_hni
ENSAMXG00000017178	GZF1	53	68.543	ENSORLG00015015364	GZF1	92	49.408	Oryzias_latipes_hsok
ENSAMXG00000017178	GZF1	84	47.319	ENSOGAG00000028389	GZF1	86	47.319	Otolemur_garnettii
ENSAMXG00000017178	GZF1	84	48.031	ENSPPAG00000028487	GZF1	86	48.346	Pan_paniscus
ENSAMXG00000017178	GZF1	84	46.334	ENSPPRG00000010040	GZF1	86	46.677	Panthera_pardus
ENSAMXG00000017178	GZF1	84	45.763	ENSPTIG00000019328	GZF1	86	46.677	Panthera_tigris_altaica
ENSAMXG00000017178	GZF1	84	48.504	ENSPTRG00000013320	GZF1	86	48.189	Pan_troglodytes
ENSAMXG00000017178	GZF1	94	44.276	ENSPANG00000017419	GZF1	99	44.828	Papio_anubis
ENSAMXG00000017178	GZF1	92	55.041	ENSPKIG00000003781	GZF1	95	55.041	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAMXG00000017178	GZF1	81	48.089	ENSPSIG00000014455	GZF1	85	49.433	Pelodiscus_sinensis
ENSAMXG00000017178	GZF1	60	52.857	ENSPSIG00000014208	-	69	47.183	Pelodiscus_sinensis
ENSAMXG00000017178	GZF1	51	52.439	ENSPMGG00000003778	-	90	40.265	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSAMXG00000017178	GZF1	74	37.143	ENSPEMG00000011285	Gzf1	87	45.950	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAMXG00000017178	GZF1	81	48.232	ENSPCIG00000013803	GZF1	84	48.232	Phascolarctos_cinereus
ENSAMXG00000017178	GZF1	99	47.833	ENSPFOG00000002393	GZF1	99	48.167	Poecilia_formosa
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ENSAMXG00000017178	GZF1	81	46.365	ENSXETG00000004510	gzf1	85	46.365	Xenopus_tropicalis
ENSAMXG00000017178	GZF1	95	48.649	ENSXMAG00000023249	GZF1	96	49.155	Xiphophorus_maculatus