EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAMXG00000017335 (Gene tree)
Gene ID: 103034393
Gene Symbol: mars
Alias: id:ibd5106
Full Name: methionyl-tRNA synthetase
Gene Type: protein_coding
Species: Astyanax_mexicanus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 23170 bases
Position: chr13:28492778-28515947
Accession: 103034393
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAMXP00000040046	tRNA-synt_1g	PF09334.11	1.9e-152	1	1
ENSAMXP00000028952	tRNA-synt_1g	PF09334.11	2.4e-152	1	1
ENSAMXP00000017837	tRNA-synt_1g	PF09334.11	2.6e-152	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAMXT00000046818	-	2565	-	ENSAMXP00000040046	854 (aa)	-	-
ENSAMXT00000017837	-	3347	XM_022675634	ENSAMXP00000017837	978 (aa)	XP_022531355	W5LDC5
ENSAMXT00000057461	-	3488	-	ENSAMXP00000028952	938 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSAMXG00000017335's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
amex00450	Selenocompound metabolism	KEGG
amex00970	Aminoacyl-tRNA biosynthesis	KEGG
amex01100	Metabolic pathways	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSAMXG00000017335's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAMXG00000017335	mars	100	62.156	ENSG00000166986	MARS	91	73.585	Homo_sapiens
ENSAMXG00000017335	mars	100	69.762	ENSAPOG00000020238	mars	99	75.484	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAMXG00000017335	mars	100	61.936	ENSAMEG00000004962	MARS	99	63.499	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAMXG00000017335	mars	100	69.405	ENSACIG00000016271	mars	100	77.676	Amphilophus_citrinellus
ENSAMXG00000017335	mars	100	69.438	ENSAOCG00000011411	mars	99	75.081	Amphiprion_ocellaris
ENSAMXG00000017335	mars	100	69.438	ENSAPEG00000008610	mars	99	75.161	Amphiprion_percula
ENSAMXG00000017335	mars	100	69.968	ENSATEG00000025019	mars	100	75.647	Anabas_testudineus
ENSAMXG00000017335	mars	88	66.014	ENSAPLG00000014821	MARS	100	65.899	Anas_platyrhynchos
ENSAMXG00000017335	mars	99	57.941	ENSACAG00000006698	MARS	99	59.870	Anolis_carolinensis
ENSAMXG00000017335	mars	100	61.697	ENSANAG00000027589	MARS	100	62.513	Aotus_nancymaae
ENSAMXG00000017335	mars	94	75.647	ENSACLG00000018937	mars	100	75.725	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000017335	mars	100	62.004	ENSBTAG00000018405	MARS	99	62.999	Bos_taurus
ENSAMXG00000017335	mars	70	57.596	WBGene00003415	mars-1	87	58.615	Caenorhabditis_elegans
ENSAMXG00000017335	mars	100	62.144	ENSCJAG00000007249	MARS	99	62.728	Callithrix_jacchus
ENSAMXG00000017335	mars	100	62.335	ENSCAFG00000000229	MARS	99	63.215	Canis_familiaris
ENSAMXG00000017335	mars	100	62.335	ENSCAFG00020023661	MARS	99	63.215	Canis_lupus_dingo
ENSAMXG00000017335	mars	100	62.389	ENSCHIG00000027023	MARS	99	63.039	Capra_hircus
ENSAMXG00000017335	mars	100	62.418	ENSTSYG00000005193	MARS	99	63.480	Carlito_syrichta
ENSAMXG00000017335	mars	88	62.831	ENSCAPG00000014448	MARS	99	63.075	Cavia_aperea
ENSAMXG00000017335	mars	100	61.936	ENSCPOG00000012866	MARS	99	62.891	Cavia_porcellus
ENSAMXG00000017335	mars	100	61.605	ENSCCAG00000032206	MARS	98	66.667	Cebus_capucinus
ENSAMXG00000017335	mars	100	62.266	ENSCATG00000038907	MARS	99	63.528	Cercocebus_atys
ENSAMXG00000017335	mars	97	63.730	ENSCLAG00000012164	MARS	99	64.088	Chinchilla_lanigera
ENSAMXG00000017335	mars	100	61.093	ENSCSAG00000004852	MARS	99	62.232	Chlorocebus_sabaeus
ENSAMXG00000017335	mars	50	77.174	ENSCHOG00000001035	-	54	77.174	Choloepus_hoffmanni
ENSAMXG00000017335	mars	100	59.487	ENSCPBG00000017136	MARS	99	61.099	Chrysemys_picta_bellii
ENSAMXG00000017335	mars	74	60.218	ENSCING00000018550	-	99	59.941	Ciona_intestinalis
ENSAMXG00000017335	mars	66	64.021	ENSCSAVG00000006145	-	98	63.874	Ciona_savignyi
ENSAMXG00000017335	mars	100	61.832	ENSCANG00000034583	MARS	99	62.943	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAMXG00000017335	mars	100	62.363	ENSCGRG00001019238	Mars	99	63.588	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAMXG00000017335	mars	100	62.363	ENSCGRG00000017321	Mars	99	63.588	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAMXG00000017335	mars	94	75.216	ENSCSEG00000010816	mars	99	79.167	Cynoglossus_semilaevis
ENSAMXG00000017335	mars	100	69.664	ENSCVAG00000009314	mars	99	75.054	Cyprinodon_variegatus
ENSAMXG00000017335	mars	94	77.081	ENSDARG00000034396	mars	97	77.081	Danio_rerio
ENSAMXG00000017335	mars	100	61.371	ENSDNOG00000017502	MARS	99	63.402	Dasypus_novemcinctus
ENSAMXG00000017335	mars	100	61.530	ENSDORG00000007127	Mars	99	62.594	Dipodomys_ordii
ENSAMXG00000017335	mars	98	46.711	FBgn0034401	MetRS	87	46.928	Drosophila_melanogaster
ENSAMXG00000017335	mars	60	69.074	ENSETEG00000007106	MARS	99	69.074	Echinops_telfairi
ENSAMXG00000017335	mars	73	54.864	ENSEBUG00000010439	mars	97	54.864	Eptatretus_burgeri
ENSAMXG00000017335	mars	100	62.239	ENSEASG00005007208	MARS	99	63.470	Equus_asinus_asinus
ENSAMXG00000017335	mars	100	62.239	ENSECAG00000015175	MARS	99	63.470	Equus_caballus
ENSAMXG00000017335	mars	88	59.040	ENSEEUG00000015503	MARS	89	60.969	Erinaceus_europaeus
ENSAMXG00000017335	mars	100	71.207	ENSELUG00000010453	mars	100	74.489	Esox_lucius
ENSAMXG00000017335	mars	100	62.527	ENSFCAG00000002083	MARS	99	63.538	Felis_catus
ENSAMXG00000017335	mars	100	61.184	ENSFDAG00000010217	MARS	99	62.084	Fukomys_damarensis
ENSAMXG00000017335	mars	100	69.081	ENSFHEG00000016374	mars	100	75.054	Fundulus_heteroclitus
ENSAMXG00000017335	mars	100	68.736	ENSGMOG00000007987	mars	100	73.276	Gadus_morhua
ENSAMXG00000017335	mars	94	62.440	ENSGALG00000039315	MARS	95	61.565	Gallus_gallus
ENSAMXG00000017335	mars	100	71.826	ENSGAFG00000013461	mars	100	73.333	Gambusia_affinis
ENSAMXG00000017335	mars	100	68.415	ENSGACG00000006474	mars	100	74.166	Gasterosteus_aculeatus
ENSAMXG00000017335	mars	97	61.521	ENSGAGG00000011640	MARS	97	65.208	Gopherus_agassizii
ENSAMXG00000017335	mars	100	62.254	ENSGGOG00000001982	MARS	99	63.373	Gorilla_gorilla
ENSAMXG00000017335	mars	86	81.476	ENSHBUG00000009575	mars	96	81.476	Haplochromis_burtoni
ENSAMXG00000017335	mars	100	61.488	ENSHGLG00000013493	MARS	100	62.781	Heterocephalus_glaber_female
ENSAMXG00000017335	mars	96	54.142	ENSHGLG00000019739	-	93	54.791	Heterocephalus_glaber_female
ENSAMXG00000017335	mars	100	61.488	ENSHGLG00100006885	MARS	100	62.781	Heterocephalus_glaber_male
ENSAMXG00000017335	mars	96	53.092	ENSHGLG00100004906	-	93	53.777	Heterocephalus_glaber_male
ENSAMXG00000017335	mars	100	67.892	ENSHCOG00000001090	mars	100	73.305	Hippocampus_comes
ENSAMXG00000017335	mars	69	83.587	ENSIPUG00000024413	mars	99	84.679	Ictalurus_punctatus
ENSAMXG00000017335	mars	94	74.489	ENSIPUG00000024410	mars	99	79.323	Ictalurus_punctatus
ENSAMXG00000017335	mars	100	61.361	ENSSTOG00000001128	MARS	99	62.716	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAMXG00000017335	mars	100	62.020	ENSJJAG00000018827	Mars	99	63.039	Jaculus_jaculus
ENSAMXG00000017335	mars	100	69.687	ENSKMAG00000012408	mars	99	77.229	Kryptolebias_marmoratus
ENSAMXG00000017335	mars	94	74.542	ENSLBEG00000013609	mars	100	74.731	Labrus_bergylta
ENSAMXG00000017335	mars	100	62.077	ENSLACG00000018854	MARS	99	65.049	Latimeria_chalumnae
ENSAMXG00000017335	mars	100	62.198	ENSLAFG00000013525	MARS	99	63.578	Loxodonta_africana
ENSAMXG00000017335	mars	100	62.156	ENSMFAG00000010123	MARS	99	63.283	Macaca_fascicularis
ENSAMXG00000017335	mars	100	62.156	ENSMMUG00000011277	MARS	91	73.585	Macaca_mulatta
ENSAMXG00000017335	mars	100	60.965	ENSMNEG00000044464	MARS	99	62.419	Macaca_nemestrina
ENSAMXG00000017335	mars	91	68.313	ENSMLEG00000034638	MARS	99	68.313	Mandrillus_leucophaeus
ENSAMXG00000017335	mars	100	69.783	ENSMAMG00000010012	mars	97	74.082	Mastacembelus_armatus
ENSAMXG00000017335	mars	94	75.539	ENSMZEG00005007092	mars	100	75.618	Maylandia_zebra
ENSAMXG00000017335	mars	100	61.173	ENSMAUG00000011482	Mars	99	62.121	Mesocricetus_auratus
ENSAMXG00000017335	mars	100	62.691	ENSMICG00000032056	MARS	99	63.265	Microcebus_murinus
ENSAMXG00000017335	mars	100	61.816	ENSMOCG00000010941	Mars	99	63.050	Microtus_ochrogaster
ENSAMXG00000017335	mars	99	67.978	ENSMMOG00000007461	mars	99	72.953	Mola_mola
ENSAMXG00000017335	mars	100	69.886	ENSMALG00000010005	mars	99	75.513	Monopterus_albus
ENSAMXG00000017335	mars	100	61.800	MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	99	63.617	Mus_caroli
ENSAMXG00000017335	mars	100	61.800	ENSMUSG00000040354	Mars	99	63.617	Mus_musculus
ENSAMXG00000017335	mars	100	61.910	MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	99	63.402	Mus_pahari
ENSAMXG00000017335	mars	100	61.910	MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	99	63.724	Mus_spretus
ENSAMXG00000017335	mars	100	62.088	ENSMPUG00000001831	MARS	99	63.430	Mustela_putorius_furo
ENSAMXG00000017335	mars	100	62.804	ENSMLUG00000001037	MARS	99	63.715	Myotis_lucifugus
ENSAMXG00000017335	mars	100	61.209	ENSNGAG00000018824	Mars	99	62.567	Nannospalax_galili
ENSAMXG00000017335	mars	94	68.094	ENSNBRG00000004105	mars	100	68.522	Neolamprologus_brichardi
ENSAMXG00000017335	mars	100	61.926	ENSNLEG00000017297	MARS	99	63.158	Nomascus_leucogenys
ENSAMXG00000017335	mars	90	62.871	ENSMEUG00000007195	MARS	99	63.227	Notamacropus_eugenii
ENSAMXG00000017335	mars	100	59.560	ENSOPRG00000006518	MARS	99	60.734	Ochotona_princeps
ENSAMXG00000017335	mars	100	62.473	ENSODEG00000001752	MARS	99	63.704	Octodon_degus
ENSAMXG00000017335	mars	94	76.078	ENSONIG00000005090	mars	100	76.262	Oreochromis_niloticus
ENSAMXG00000017335	mars	75	60.843	ENSOANG00000013318	MARS	100	63.198	Ornithorhynchus_anatinus
ENSAMXG00000017335	mars	100	61.926	ENSOCUG00000007373	MARS	99	63.158	Oryctolagus_cuniculus
ENSAMXG00000017335	mars	100	68.906	ENSORLG00000005405	mars	100	74.002	Oryzias_latipes
ENSAMXG00000017335	mars	100	69.339	ENSORLG00020017397	mars	100	74.434	Oryzias_latipes_hni
ENSAMXG00000017335	mars	100	69.122	ENSORLG00015012976	mars	100	74.326	Oryzias_latipes_hsok
ENSAMXG00000017335	mars	100	71.739	ENSOMEG00000018411	mars	100	74.973	Oryzias_melastigma
ENSAMXG00000017335	mars	100	61.630	ENSOGAG00000005226	MARS	100	62.741	Otolemur_garnettii
ENSAMXG00000017335	mars	100	62.500	ENSOARG00000006477	MARS	99	63.147	Ovis_aries
ENSAMXG00000017335	mars	100	61.530	ENSPPAG00000025147	MARS	99	62.703	Pan_paniscus
ENSAMXG00000017335	mars	100	62.418	ENSPPRG00000023243	MARS	99	63.323	Panthera_pardus
ENSAMXG00000017335	mars	100	62.527	ENSPTIG00000006721	MARS	99	63.430	Panthera_tigris_altaica
ENSAMXG00000017335	mars	100	62.156	ENSPTRG00000005135	MARS	99	63.499	Pan_troglodytes
ENSAMXG00000017335	mars	100	61.842	ENSPANG00000009140	MARS	99	63.283	Papio_anubis
ENSAMXG00000017335	mars	100	69.466	ENSPKIG00000002833	mars	100	74.757	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAMXG00000017335	mars	78	46.032	ENSPSIG00000013607	MARS	99	42.007	Pelodiscus_sinensis
ENSAMXG00000017335	mars	99	70.790	ENSPMGG00000014847	mars	99	74.127	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSAMXG00000017335	mars	100	62.857	ENSPEMG00000000046	Mars	99	64.009	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAMXG00000017335	mars	100	61.513	ENSPCIG00000023765	MARS	99	62.768	Phascolarctos_cinereus
ENSAMXG00000017335	mars	100	69.598	ENSPFOG00000006998	mars	100	75.162	Poecilia_formosa
ENSAMXG00000017335	mars	100	69.598	ENSPLAG00000017870	mars	100	74.730	Poecilia_latipinna
ENSAMXG00000017335	mars	100	69.490	ENSPMEG00000008197	mars	100	74.622	Poecilia_mexicana
ENSAMXG00000017335	mars	97	73.040	ENSPREG00000008123	mars	100	74.273	Poecilia_reticulata
ENSAMXG00000017335	mars	100	61.936	ENSPPYG00000004691	MARS	99	63.175	Pongo_abelii
ENSAMXG00000017335	mars	85	66.797	ENSPCAG00000016037	MARS	88	66.797	Procavia_capensis
ENSAMXG00000017335	mars	100	62.308	ENSPCOG00000017598	MARS	99	62.891	Propithecus_coquereli
ENSAMXG00000017335	mars	80	62.745	ENSPVAG00000012112	MARS	81	61.433	Pteropus_vampyrus
ENSAMXG00000017335	mars	94	75.539	ENSPNYG00000013809	mars	100	75.618	Pundamilia_nyererei
ENSAMXG00000017335	mars	94	87.379	ENSPNAG00000017290	mars	100	87.379	Pygocentrus_nattereri
ENSAMXG00000017335	mars	100	62.308	ENSRNOG00000025459	Mars	99	63.646	Rattus_norvegicus
ENSAMXG00000017335	mars	97	63.230	ENSRBIG00000044782	MARS	99	63.020	Rhinopithecus_bieti
ENSAMXG00000017335	mars	100	62.020	ENSRROG00000042331	MARS	99	63.203	Rhinopithecus_roxellana
ENSAMXG00000017335	mars	67	51.130	YGR264C	MES1	75	51.736	Saccharomyces_cerevisiae
ENSAMXG00000017335	mars	100	59.231	ENSSBOG00000022875	MARS	99	60.086	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSAMXG00000017335	mars	100	62.171	ENSSHAG00000007182	MARS	99	62.983	Sarcophilus_harrisii
ENSAMXG00000017335	mars	100	70.288	ENSSFOG00015011038	mars	99	73.974	Scleropages_formosus
ENSAMXG00000017335	mars	100	70.486	ENSSMAG00000012409	mars	100	76.288	Scophthalmus_maximus
ENSAMXG00000017335	mars	100	70.366	ENSSDUG00000019070	mars	100	76.052	Seriola_dumerili
ENSAMXG00000017335	mars	94	73.261	ENSSLDG00000005561	mars	99	75.666	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSAMXG00000017335	mars	91	70.190	ENSSARG00000002477	MARS	92	70.190	Sorex_araneus
ENSAMXG00000017335	mars	85	63.562	ENSSPUG00000007756	MARS	99	68.000	Sphenodon_punctatus
ENSAMXG00000017335	mars	94	75.888	ENSSPAG00000022691	mars	100	75.914	Stegastes_partitus
ENSAMXG00000017335	mars	100	62.198	ENSSSCG00000023318	MARS	98	62.019	Sus_scrofa
ENSAMXG00000017335	mars	100	67.279	ENSTRUG00000014774	mars	100	73.485	Takifugu_rubripes
ENSAMXG00000017335	mars	100	65.983	ENSTNIG00000007060	mars	100	70.950	Tetraodon_nigroviridis
ENSAMXG00000017335	mars	74	64.129	ENSTBEG00000000303	MARS	86	64.129	Tupaia_belangeri
ENSAMXG00000017335	mars	76	69.839	ENSTTRG00000013088	MARS	75	69.839	Tursiops_truncatus
ENSAMXG00000017335	mars	55	53.252	ENSUAMG00000019284	-	99	56.442	Ursus_americanus
ENSAMXG00000017335	mars	100	61.936	ENSUMAG00000019826	MARS	99	63.538	Ursus_maritimus
ENSAMXG00000017335	mars	64	74.510	ENSVPAG00000008665	MARS	66	74.510	Vicugna_pacos
ENSAMXG00000017335	mars	100	61.894	ENSVVUG00000017940	MARS	99	62.783	Vulpes_vulpes
ENSAMXG00000017335	mars	68	71.637	ENSXETG00000025174	mars	99	72.152	Xenopus_tropicalis
ENSAMXG00000017335	mars	100	69.298	ENSXCOG00000013878	mars	100	73.564	Xiphophorus_couchianus
ENSAMXG00000017335	mars	100	69.707	ENSXMAG00000017920	mars	100	75.270	Xiphophorus_maculatus