EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAMXG00000018181 (Gene tree)
Gene ID: 103021534
Gene Symbol: polr1e
Alias: zgc:112501
Full Name: RNA polymerase I subunit E
Gene Type: protein_coding
Species: Astyanax_mexicanus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 5961 bases
Position: chr21:18065780-18071740
Accession: 103021534
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAMXP00000018734	RNA_pol_I_A49	PF06870.12	8.3e-105	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAMXT00000018734	-	1388	XM_007231240	ENSAMXP00000018734	413 (aa)	XP_007231302	W5LFX2

Gene Model

Click here to download ENSAMXG00000018181's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
amex03020	RNA polymerase	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSAMXG00000018181's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAMXG00000018181	polr1e	99	43.373	ENSG00000137054	POLR1E	94	45.000	Homo_sapiens
ENSAMXG00000018181	polr1e	99	57.246	ENSAPOG00000012452	polr1e	99	57.246	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAMXG00000018181	polr1e	95	40.268	ENSAMEG00000010193	POLR1E	91	40.268	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAMXG00000018181	polr1e	94	56.154	ENSACIG00000009884	polr1e	99	56.154	Amphilophus_citrinellus
ENSAMXG00000018181	polr1e	99	59.759	ENSAOCG00000005665	polr1e	99	59.759	Amphiprion_ocellaris
ENSAMXG00000018181	polr1e	99	60.000	ENSAPEG00000020581	polr1e	99	60.000	Amphiprion_percula
ENSAMXG00000018181	polr1e	99	58.072	ENSATEG00000020609	polr1e	99	58.072	Anabas_testudineus
ENSAMXG00000018181	polr1e	81	37.047	ENSAPLG00000010340	POLR1E	99	37.047	Anas_platyrhynchos
ENSAMXG00000018181	polr1e	98	43.689	ENSANAG00000038046	POLR1E	97	43.689	Aotus_nancymaae
ENSAMXG00000018181	polr1e	99	57.108	ENSACLG00000013685	polr1e	99	57.108	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000018181	polr1e	98	42.233	ENSBTAG00000012243	POLR1E	97	42.233	Bos_taurus
ENSAMXG00000018181	polr1e	95	41.058	ENSCJAG00000010512	POLR1E	92	44.324	Callithrix_jacchus
ENSAMXG00000018181	polr1e	98	43.029	ENSCAFG00000002377	POLR1E	97	43.029	Canis_familiaris
ENSAMXG00000018181	polr1e	98	43.269	ENSCAFG00020017851	POLR1E	97	43.269	Canis_lupus_dingo
ENSAMXG00000018181	polr1e	98	42.233	ENSCHIG00000019479	POLR1E	97	42.233	Capra_hircus
ENSAMXG00000018181	polr1e	98	43.133	ENSTSYG00000002075	POLR1E	97	43.133	Carlito_syrichta
ENSAMXG00000018181	polr1e	70	42.662	ENSCAPG00000015653	POLR1E	99	42.662	Cavia_aperea
ENSAMXG00000018181	polr1e	99	43.868	ENSCPOG00000009965	POLR1E	100	43.868	Cavia_porcellus
ENSAMXG00000018181	polr1e	98	40.633	ENSCCAG00000029460	POLR1E	97	40.633	Cebus_capucinus
ENSAMXG00000018181	polr1e	95	44.500	ENSCATG00000031732	POLR1E	92	49.505	Cercocebus_atys
ENSAMXG00000018181	polr1e	85	43.820	ENSCLAG00000012701	POLR1E	93	43.820	Chinchilla_lanigera
ENSAMXG00000018181	polr1e	95	44.500	ENSCSAG00000010782	POLR1E	94	44.500	Chlorocebus_sabaeus
ENSAMXG00000018181	polr1e	98	33.981	ENSCHOG00000013024	POLR1E	84	33.981	Choloepus_hoffmanni
ENSAMXG00000018181	polr1e	100	42.755	ENSCPBG00000006923	POLR1E	100	42.993	Chrysemys_picta_bellii
ENSAMXG00000018181	polr1e	99	43.133	ENSCANG00000036112	POLR1E	92	47.664	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAMXG00000018181	polr1e	98	41.889	ENSCGRG00001006197	Polr1e	94	41.889	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAMXG00000018181	polr1e	98	41.889	ENSCGRG00000006430	Polr1e	94	41.889	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAMXG00000018181	polr1e	100	54.964	ENSCSEG00000005121	polr1e	100	54.964	Cynoglossus_semilaevis
ENSAMXG00000018181	polr1e	99	56.039	ENSCVAG00000019759	polr1e	99	56.039	Cyprinodon_variegatus
ENSAMXG00000018181	polr1e	97	63.184	ENSDARG00000006434	polr1e	99	63.438	Danio_rerio
ENSAMXG00000018181	polr1e	98	37.797	ENSDNOG00000010257	POLR1E	98	36.695	Dasypus_novemcinctus
ENSAMXG00000018181	polr1e	86	41.504	ENSETEG00000018204	POLR1E	99	41.504	Echinops_telfairi
ENSAMXG00000018181	polr1e	98	42.718	ENSEASG00005000675	POLR1E	97	42.718	Equus_asinus_asinus
ENSAMXG00000018181	polr1e	98	42.476	ENSECAG00000014669	POLR1E	97	42.476	Equus_caballus
ENSAMXG00000018181	polr1e	95	39.698	ENSEEUG00000011928	POLR1E	84	39.698	Erinaceus_europaeus
ENSAMXG00000018181	polr1e	99	55.797	ENSELUG00000008150	polr1e	99	55.797	Esox_lucius
ENSAMXG00000018181	polr1e	98	44.712	ENSFCAG00000013081	POLR1E	97	44.712	Felis_catus
ENSAMXG00000018181	polr1e	95	41.750	ENSFALG00000012950	POLR1E	99	41.750	Ficedula_albicollis
ENSAMXG00000018181	polr1e	98	43.614	ENSFDAG00000016917	POLR1E	98	43.614	Fukomys_damarensis
ENSAMXG00000018181	polr1e	99	56.627	ENSFHEG00000009801	polr1e	99	56.627	Fundulus_heteroclitus
ENSAMXG00000018181	polr1e	99	45.455	ENSGMOG00000003336	POLR1E	99	45.455	Gadus_morhua
ENSAMXG00000018181	polr1e	96	41.832	ENSGALG00000005395	POLR1E	96	41.832	Gallus_gallus
ENSAMXG00000018181	polr1e	99	55.072	ENSGAFG00000004850	polr1e	99	55.072	Gambusia_affinis
ENSAMXG00000018181	polr1e	99	54.785	ENSGACG00000016087	polr1e	99	54.785	Gasterosteus_aculeatus
ENSAMXG00000018181	polr1e	96	39.109	ENSGAGG00000001659	POLR1E	98	39.651	Gopherus_agassizii
ENSAMXG00000018181	polr1e	99	43.373	ENSGGOG00000001882	POLR1E	92	49.505	Gorilla_gorilla
ENSAMXG00000018181	polr1e	99	57.108	ENSHBUG00000002559	polr1e	99	57.108	Haplochromis_burtoni
ENSAMXG00000018181	polr1e	98	43.614	ENSHGLG00000002036	POLR1E	98	43.614	Heterocephalus_glaber_female
ENSAMXG00000018181	polr1e	98	43.614	ENSHGLG00100012784	POLR1E	98	43.614	Heterocephalus_glaber_male
ENSAMXG00000018181	polr1e	99	55.556	ENSHCOG00000002774	polr1e	99	55.556	Hippocampus_comes
ENSAMXG00000018181	polr1e	100	65.375	ENSIPUG00000003019	polr1e	100	65.375	Ictalurus_punctatus
ENSAMXG00000018181	polr1e	98	44.010	ENSSTOG00000009810	POLR1E	97	44.010	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAMXG00000018181	polr1e	99	42.067	ENSJJAG00000020731	Polr1e	95	42.067	Jaculus_jaculus
ENSAMXG00000018181	polr1e	99	56.386	ENSKMAG00000000046	polr1e	99	56.386	Kryptolebias_marmoratus
ENSAMXG00000018181	polr1e	100	57.452	ENSLBEG00000003104	polr1e	99	57.452	Labrus_bergylta
ENSAMXG00000018181	polr1e	86	46.832	ENSLACG00000003416	POLR1E	99	46.832	Latimeria_chalumnae
ENSAMXG00000018181	polr1e	99	50.839	ENSLOCG00000012859	polr1e	99	50.839	Lepisosteus_oculatus
ENSAMXG00000018181	polr1e	98	43.204	ENSLAFG00000012831	POLR1E	97	43.204	Loxodonta_africana
ENSAMXG00000018181	polr1e	95	44.500	ENSMFAG00000045465	POLR1E	92	49.505	Macaca_fascicularis
ENSAMXG00000018181	polr1e	95	44.500	ENSMMUG00000017892	POLR1E	92	49.505	Macaca_mulatta
ENSAMXG00000018181	polr1e	95	41.707	ENSMNEG00000040283	POLR1E	94	41.707	Macaca_nemestrina
ENSAMXG00000018181	polr1e	95	44.500	ENSMLEG00000031135	POLR1E	92	49.505	Mandrillus_leucophaeus
ENSAMXG00000018181	polr1e	100	57.692	ENSMAMG00000001260	polr1e	99	57.692	Mastacembelus_armatus
ENSAMXG00000018181	polr1e	99	57.108	ENSMZEG00005021536	polr1e	99	57.108	Maylandia_zebra
ENSAMXG00000018181	polr1e	98	42.373	ENSMAUG00000021044	Polr1e	94	42.373	Mesocricetus_auratus
ENSAMXG00000018181	polr1e	98	43.932	ENSMICG00000003673	POLR1E	97	43.932	Microcebus_murinus
ENSAMXG00000018181	polr1e	98	41.262	ENSMOCG00000012920	Polr1e	94	41.262	Microtus_ochrogaster
ENSAMXG00000018181	polr1e	99	56.386	ENSMMOG00000007391	polr1e	99	56.386	Mola_mola
ENSAMXG00000018181	polr1e	96	44.913	ENSMODG00000002884	POLR1E	98	44.913	Monodelphis_domestica
ENSAMXG00000018181	polr1e	99	58.554	ENSMALG00000002665	polr1e	99	58.554	Monopterus_albus
ENSAMXG00000018181	polr1e	98	41.707	MGP_CAROLIEiJ_G0025967	Polr1e	97	42.065	Mus_caroli
ENSAMXG00000018181	polr1e	98	42.233	ENSMUSG00000028318	Polr1e	97	42.607	Mus_musculus
ENSAMXG00000018181	polr1e	98	42.615	MGP_PahariEiJ_G0024114	Polr1e	97	43.000	Mus_pahari
ENSAMXG00000018181	polr1e	98	42.233	MGP_SPRETEiJ_G0026930	Polr1e	97	42.607	Mus_spretus
ENSAMXG00000018181	polr1e	98	38.528	ENSMPUG00000006040	POLR1E	97	36.774	Mustela_putorius_furo
ENSAMXG00000018181	polr1e	98	44.660	ENSMLUG00000012688	POLR1E	94	44.660	Myotis_lucifugus
ENSAMXG00000018181	polr1e	98	43.584	ENSNGAG00000002520	Polr1e	94	43.584	Nannospalax_galili
ENSAMXG00000018181	polr1e	99	57.108	ENSNBRG00000016822	polr1e	99	57.108	Neolamprologus_brichardi
ENSAMXG00000018181	polr1e	99	43.269	ENSNLEG00000003616	POLR1E	92	49.505	Nomascus_leucogenys
ENSAMXG00000018181	polr1e	74	48.000	ENSMEUG00000015372	-	80	48.000	Notamacropus_eugenii
ENSAMXG00000018181	polr1e	86	38.674	ENSOPRG00000014206	POLR1E	99	38.674	Ochotona_princeps
ENSAMXG00000018181	polr1e	98	44.096	ENSODEG00000014565	POLR1E	95	44.096	Octodon_degus
ENSAMXG00000018181	polr1e	99	57.108	ENSONIG00000008921	polr1e	99	57.108	Oreochromis_niloticus
ENSAMXG00000018181	polr1e	99	41.928	ENSOCUG00000024773	POLR1E	98	42.169	Oryctolagus_cuniculus
ENSAMXG00000018181	polr1e	99	55.181	ENSORLG00000005143	polr1e	99	55.181	Oryzias_latipes
ENSAMXG00000018181	polr1e	95	52.685	ENSORLG00020007271	polr1e	99	53.906	Oryzias_latipes_hni
ENSAMXG00000018181	polr1e	99	54.699	ENSORLG00015000137	polr1e	99	54.699	Oryzias_latipes_hsok
ENSAMXG00000018181	polr1e	99	54.458	ENSOMEG00000013264	polr1e	98	54.458	Oryzias_melastigma
ENSAMXG00000018181	polr1e	98	43.204	ENSOGAG00000012981	POLR1E	95	43.204	Otolemur_garnettii
ENSAMXG00000018181	polr1e	98	41.990	ENSOARG00000011465	POLR1E	94	41.990	Ovis_aries
ENSAMXG00000018181	polr1e	99	43.373	ENSPPAG00000034566	POLR1E	92	49.505	Pan_paniscus
ENSAMXG00000018181	polr1e	98	44.096	ENSPPRG00000005649	POLR1E	97	44.096	Panthera_pardus
ENSAMXG00000018181	polr1e	98	44.471	ENSPTIG00000009774	POLR1E	97	44.471	Panthera_tigris_altaica
ENSAMXG00000018181	polr1e	99	43.373	ENSPTRG00000020944	POLR1E	92	49.505	Pan_troglodytes
ENSAMXG00000018181	polr1e	95	44.500	ENSPANG00000025563	POLR1E	92	49.505	Papio_anubis
ENSAMXG00000018181	polr1e	99	53.810	ENSPKIG00000003562	polr1e	99	53.810	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAMXG00000018181	polr1e	96	44.776	ENSPSIG00000003274	POLR1E	92	44.776	Pelodiscus_sinensis
ENSAMXG00000018181	polr1e	96	55.303	ENSPMGG00000024169	polr1e	96	55.303	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSAMXG00000018181	polr1e	98	41.505	ENSPEMG00000019151	-	94	41.505	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAMXG00000018181	polr1e	98	34.699	ENSPEMG00000022300	-	93	34.699	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAMXG00000018181	polr1e	98	44.878	ENSPCIG00000014798	POLR1E	99	44.878	Phascolarctos_cinereus
ENSAMXG00000018181	polr1e	99	52.500	ENSPFOG00000019627	polr1e	99	52.500	Poecilia_formosa
ENSAMXG00000018181	polr1e	99	55.797	ENSPLAG00000022679	polr1e	99	55.797	Poecilia_latipinna
ENSAMXG00000018181	polr1e	86	56.145	ENSPMEG00000022123	polr1e	93	56.145	Poecilia_mexicana
ENSAMXG00000018181	polr1e	99	54.589	ENSPREG00000009470	polr1e	99	54.589	Poecilia_reticulata
ENSAMXG00000018181	polr1e	95	44.750	ENSPPYG00000019061	POLR1E	94	44.750	Pongo_abelii
ENSAMXG00000018181	polr1e	50	38.942	ENSPCAG00000004891	POLR1E	68	38.942	Procavia_capensis
ENSAMXG00000018181	polr1e	98	42.892	ENSPCOG00000027448	POLR1E	97	42.892	Propithecus_coquereli
ENSAMXG00000018181	polr1e	95	44.500	ENSPVAG00000007940	POLR1E	83	44.665	Pteropus_vampyrus
ENSAMXG00000018181	polr1e	99	57.349	ENSPNYG00000001032	polr1e	99	57.349	Pundamilia_nyererei
ENSAMXG00000018181	polr1e	99	72.464	ENSPNAG00000006987	polr1e	99	72.464	Pygocentrus_nattereri
ENSAMXG00000018181	polr1e	98	41.019	ENSRNOG00000012664	Polr1e	94	41.019	Rattus_norvegicus
ENSAMXG00000018181	polr1e	99	42.892	ENSRBIG00000034214	POLR1E	95	45.135	Rhinopithecus_bieti
ENSAMXG00000018181	polr1e	95	44.250	ENSRROG00000031986	POLR1E	92	49.505	Rhinopithecus_roxellana
ENSAMXG00000018181	polr1e	98	42.961	ENSSBOG00000021415	POLR1E	97	42.961	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSAMXG00000018181	polr1e	86	44.475	ENSSHAG00000016084	POLR1E	99	44.475	Sarcophilus_harrisii
ENSAMXG00000018181	polr1e	100	53.349	ENSSFOG00015002293	polr1e	100	53.349	Scleropages_formosus
ENSAMXG00000018181	polr1e	99	56.763	ENSSMAG00000011672	polr1e	93	56.763	Scophthalmus_maximus
ENSAMXG00000018181	polr1e	99	57.349	ENSSDUG00000022279	polr1e	99	57.349	Seriola_dumerili
ENSAMXG00000018181	polr1e	99	57.590	ENSSLDG00000024918	polr1e	99	57.590	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSAMXG00000018181	polr1e	56	38.627	ENSSARG00000009810	-	58	39.485	Sorex_araneus
ENSAMXG00000018181	polr1e	99	42.619	ENSSPUG00000009499	POLR1E	99	42.619	Sphenodon_punctatus
ENSAMXG00000018181	polr1e	99	60.386	ENSSPAG00000021240	polr1e	99	60.386	Stegastes_partitus
ENSAMXG00000018181	polr1e	98	42.651	ENSSSCG00000005347	POLR1E	97	42.651	Sus_scrofa
ENSAMXG00000018181	polr1e	95	35.506	ENSTGUG00000007169	POLR1E	99	35.506	Taeniopygia_guttata
ENSAMXG00000018181	polr1e	100	53.207	ENSTRUG00000020779	polr1e	100	53.525	Takifugu_rubripes
ENSAMXG00000018181	polr1e	100	54.916	ENSTNIG00000017812	polr1e	100	54.916	Tetraodon_nigroviridis
ENSAMXG00000018181	polr1e	99	43.720	ENSTBEG00000013786	POLR1E	87	43.720	Tupaia_belangeri
ENSAMXG00000018181	polr1e	92	43.669	ENSTTRG00000008294	POLR1E	85	42.537	Tursiops_truncatus
ENSAMXG00000018181	polr1e	95	45.000	ENSUAMG00000012474	POLR1E	97	44.598	Ursus_americanus
ENSAMXG00000018181	polr1e	95	45.000	ENSUMAG00000011496	POLR1E	94	45.000	Ursus_maritimus
ENSAMXG00000018181	polr1e	86	37.673	ENSVPAG00000009048	POLR1E	83	37.673	Vicugna_pacos
ENSAMXG00000018181	polr1e	98	43.269	ENSVVUG00000019954	POLR1E	97	43.269	Vulpes_vulpes
ENSAMXG00000018181	polr1e	99	38.810	ENSXETG00000006533	polr1e	99	38.810	Xenopus_tropicalis
ENSAMXG00000018181	polr1e	99	53.140	ENSXCOG00000013706	polr1e	99	53.140	Xiphophorus_couchianus
ENSAMXG00000018181	polr1e	99	56.280	ENSXMAG00000012484	polr1e	99	56.280	Xiphophorus_maculatus