EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAMXG00000018258 (Gene tree)
Gene ID: 103025872
Gene Symbol: polrmt
Alias: si:dkey-21e2.1|si:dkeyp-74c5.5|wu:fb73g10
Full Name: RNA polymerase mitochondrial
Gene Type: protein_coding
Species: Astyanax_mexicanus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 100710 bases
Position: chr5:14544204-14644913
Accession: 103025872
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAMXP00000037354	RNA_pol	PF00940.19	2.3e-166	1	1
ENSAMXP00000018815	RNA_pol	PF00940.19	2.7e-166	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAMXT00000018815	-	6200	XM_022669667	ENSAMXP00000018815	1284 (aa)	XP_022525388	W5LG53
ENSAMXT00000036255	-	5583	-	ENSAMXP00000037354	1204 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSAMXG00000018258's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSAMXG00000018258's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAMXG00000018258	polrmt	96	60.903	ENSG00000099821	POLRMT	93	60.903	Homo_sapiens
ENSAMXG00000018258	polrmt	100	68.612	ENSAPOG00000003942	polrmt	100	68.612	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAMXG00000018258	polrmt	99	58.780	ENSAMEG00000002745	POLRMT	96	58.780	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAMXG00000018258	polrmt	93	63.441	ENSACIG00000016078	polrmt	100	63.441	Amphilophus_citrinellus
ENSAMXG00000018258	polrmt	100	68.872	ENSAOCG00000020208	polrmt	100	68.872	Amphiprion_ocellaris
ENSAMXG00000018258	polrmt	100	69.001	ENSAPEG00000007949	polrmt	100	69.001	Amphiprion_percula
ENSAMXG00000018258	polrmt	100	78.744	ENSATEG00000024025	polrmt	94	78.744	Anabas_testudineus
ENSAMXG00000018258	polrmt	77	67.863	ENSAPLG00000003051	POLRMT	95	67.863	Anas_platyrhynchos
ENSAMXG00000018258	polrmt	96	60.748	ENSANAG00000032916	POLRMT	93	60.748	Aotus_nancymaae
ENSAMXG00000018258	polrmt	100	60.178	ENSACLG00000003766	polrmt	100	60.503	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000018258	polrmt	99	46.875	ENSBTAG00000015051	POLRMT	99	46.953	Bos_taurus
ENSAMXG00000018258	polrmt	50	42.969	WBGene00013680	rpom-1	55	41.955	Caenorhabditis_elegans
ENSAMXG00000018258	polrmt	98	60.062	ENSCJAG00000012913	POLRMT	94	60.062	Callithrix_jacchus
ENSAMXG00000018258	polrmt	96	59.701	ENSCAFG00000019711	POLRMT	95	59.701	Canis_familiaris
ENSAMXG00000018258	polrmt	96	59.701	ENSCAFG00020016843	POLRMT	96	59.701	Canis_lupus_dingo
ENSAMXG00000018258	polrmt	96	47.149	ENSCHIG00000013267	POLRMT	97	47.229	Capra_hircus
ENSAMXG00000018258	polrmt	77	56.502	ENSCAPG00000016900	POLRMT	88	55.810	Cavia_aperea
ENSAMXG00000018258	polrmt	96	58.254	ENSCPOG00000023061	POLRMT	93	58.254	Cavia_porcellus
ENSAMXG00000018258	polrmt	99	59.845	ENSCCAG00000025014	POLRMT	95	59.845	Cebus_capucinus
ENSAMXG00000018258	polrmt	99	60.062	ENSCATG00000040393	POLRMT	95	60.062	Cercocebus_atys
ENSAMXG00000018258	polrmt	77	61.218	ENSCLAG00000007473	POLRMT	66	61.218	Chinchilla_lanigera
ENSAMXG00000018258	polrmt	99	60.280	ENSCSAG00000012942	POLRMT	95	60.280	Chlorocebus_sabaeus
ENSAMXG00000018258	polrmt	96	69.673	ENSCPBG00000009869	POLRMT	97	69.673	Chrysemys_picta_bellii
ENSAMXG00000018258	polrmt	63	43.452	ENSCSAVG00000000440	-	99	43.452	Ciona_savignyi
ENSAMXG00000018258	polrmt	99	60.218	ENSCANG00000038011	POLRMT	95	60.218	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAMXG00000018258	polrmt	92	60.952	ENSCGRG00001021311	Polrmt	100	60.952	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAMXG00000018258	polrmt	95	57.709	ENSCGRG00000011134	Polrmt	99	57.709	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAMXG00000018258	polrmt	100	73.344	ENSCSEG00000002734	polrmt	94	73.344	Cynoglossus_semilaevis
ENSAMXG00000018258	polrmt	100	61.573	ENSCVAG00000005949	polrmt	99	63.298	Cyprinodon_variegatus
ENSAMXG00000018258	polrmt	100	75.898	ENSDARG00000101220	polrmt	98	75.898	Danio_rerio
ENSAMXG00000018258	polrmt	93	61.426	ENSDORG00000014125	Polrmt	95	61.426	Dipodomys_ordii
ENSAMXG00000018258	polrmt	77	55.145	FBgn0261938	mtRNApol	70	55.145	Drosophila_melanogaster
ENSAMXG00000018258	polrmt	91	66.112	ENSETEG00000003476	POLRMT	91	66.112	Echinops_telfairi
ENSAMXG00000018258	polrmt	70	60.340	ENSEBUG00000013453	-	93	60.340	Eptatretus_burgeri
ENSAMXG00000018258	polrmt	96	59.762	ENSEASG00005021493	POLRMT	95	59.762	Equus_asinus_asinus
ENSAMXG00000018258	polrmt	96	59.762	ENSECAG00000032711	POLRMT	95	59.762	Equus_caballus
ENSAMXG00000018258	polrmt	100	59.643	ENSELUG00000019319	polrmt	100	68.564	Esox_lucius
ENSAMXG00000018258	polrmt	99	59.459	ENSFCAG00000018808	POLRMT	97	59.459	Felis_catus
ENSAMXG00000018258	polrmt	83	70.975	ENSFALG00000013910	POLRMT	93	70.975	Ficedula_albicollis
ENSAMXG00000018258	polrmt	96	61.661	ENSFDAG00000020312	POLRMT	93	60.061	Fukomys_damarensis
ENSAMXG00000018258	polrmt	99	59.481	ENSFHEG00000021239	polrmt	99	62.309	Fundulus_heteroclitus
ENSAMXG00000018258	polrmt	94	71.061	ENSGMOG00000011829	polrmt	94	71.061	Gadus_morhua
ENSAMXG00000018258	polrmt	97	67.500	ENSGALG00000001377	POLRMT	96	67.812	Gallus_gallus
ENSAMXG00000018258	polrmt	100	78.387	ENSGAFG00000003953	polrmt	94	78.387	Gambusia_affinis
ENSAMXG00000018258	polrmt	94	76.490	ENSGACG00000012957	polrmt	100	65.504	Gasterosteus_aculeatus
ENSAMXG00000018258	polrmt	94	69.545	ENSGAGG00000005522	POLRMT	99	69.545	Gopherus_agassizii
ENSAMXG00000018258	polrmt	81	67.081	ENSGGOG00000023264	-	95	67.081	Gorilla_gorilla
ENSAMXG00000018258	polrmt	93	70.088	ENSHBUG00000010005	polrmt	100	60.281	Haplochromis_burtoni
ENSAMXG00000018258	polrmt	77	59.876	ENSHGLG00000019286	POLRMT	93	59.876	Heterocephalus_glaber_female
ENSAMXG00000018258	polrmt	96	58.733	ENSHGLG00100005762	POLRMT	93	58.733	Heterocephalus_glaber_male
ENSAMXG00000018258	polrmt	100	66.452	ENSHCOG00000001565	polrmt	96	73.605	Hippocampus_comes
ENSAMXG00000018258	polrmt	100	81.988	ENSIPUG00000000789	polrmt	96	81.988	Ictalurus_punctatus
ENSAMXG00000018258	polrmt	90	63.993	ENSSTOG00000003431	POLRMT	97	64.164	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAMXG00000018258	polrmt	99	55.322	ENSJJAG00000012916	Polrmt	99	57.778	Jaculus_jaculus
ENSAMXG00000018258	polrmt	98	78.331	ENSKMAG00000004426	polrmt	92	78.331	Kryptolebias_marmoratus
ENSAMXG00000018258	polrmt	97	69.727	ENSLBEG00000016529	polrmt	100	69.161	Labrus_bergylta
ENSAMXG00000018258	polrmt	96	74.844	ENSLACG00000011518	POLRMT	96	74.844	Latimeria_chalumnae
ENSAMXG00000018258	polrmt	100	64.852	ENSLOCG00000005222	polrmt	98	64.852	Lepisosteus_oculatus
ENSAMXG00000018258	polrmt	96	59.688	ENSLAFG00000001860	POLRMT	92	59.844	Loxodonta_africana
ENSAMXG00000018258	polrmt	99	60.374	ENSMFAG00000031466	POLRMT	95	60.374	Macaca_fascicularis
ENSAMXG00000018258	polrmt	99	60.218	ENSMNEG00000039129	POLRMT	95	60.218	Macaca_nemestrina
ENSAMXG00000018258	polrmt	87	64.789	ENSMLEG00000037404	POLRMT	99	64.789	Mandrillus_leucophaeus
ENSAMXG00000018258	polrmt	100	79.032	ENSMAMG00000019284	polrmt	95	79.032	Mastacembelus_armatus
ENSAMXG00000018258	polrmt	100	60.089	ENSMZEG00005009932	polrmt	100	60.415	Maylandia_zebra
ENSAMXG00000018258	polrmt	77	67.185	ENSMGAG00000003243	POLRMT	94	67.496	Meleagris_gallopavo
ENSAMXG00000018258	polrmt	96	60.828	ENSMAUG00000019392	Polrmt	100	60.828	Mesocricetus_auratus
ENSAMXG00000018258	polrmt	96	61.838	ENSMICG00000016701	POLRMT	92	61.838	Microcebus_murinus
ENSAMXG00000018258	polrmt	98	56.569	ENSMOCG00000008868	Polrmt	96	56.569	Microtus_ochrogaster
ENSAMXG00000018258	polrmt	89	74.688	ENSMMOG00000000705	polrmt	88	74.688	Mola_mola
ENSAMXG00000018258	polrmt	96	68.927	ENSMODG00000006478	POLRMT	96	68.927	Monodelphis_domestica
ENSAMXG00000018258	polrmt	100	77.868	ENSMALG00000021224	polrmt	94	77.868	Monopterus_albus
ENSAMXG00000018258	polrmt	95	61.905	MGP_CAROLIEiJ_G0015538	Polrmt	99	61.905	Mus_caroli
ENSAMXG00000018258	polrmt	91	61.587	ENSMUSG00000020329	Polrmt	99	61.587	Mus_musculus
ENSAMXG00000018258	polrmt	91	61.587	MGP_PahariEiJ_G0030951	Polrmt	99	61.587	Mus_pahari
ENSAMXG00000018258	polrmt	91	61.746	MGP_SPRETEiJ_G0016356	Polrmt	99	61.746	Mus_spretus
ENSAMXG00000018258	polrmt	96	58.544	ENSMPUG00000009910	POLRMT	95	58.544	Mustela_putorius_furo
ENSAMXG00000018258	polrmt	96	47.078	ENSMLUG00000009223	POLRMT	97	47.078	Myotis_lucifugus
ENSAMXG00000018258	polrmt	99	61.610	ENSNGAG00000005498	Polrmt	99	62.857	Nannospalax_galili
ENSAMXG00000018258	polrmt	95	70.129	ENSNBRG00000023530	polrmt	100	60.224	Neolamprologus_brichardi
ENSAMXG00000018258	polrmt	99	60.742	ENSNLEG00000000718	POLRMT	96	60.742	Nomascus_leucogenys
ENSAMXG00000018258	polrmt	59	61.735	ENSOPRG00000013579	POLRMT	63	62.264	Ochotona_princeps
ENSAMXG00000018258	polrmt	94	63.839	ENSONIG00000002405	polrmt	100	64.003	Oreochromis_niloticus
ENSAMXG00000018258	polrmt	100	67.143	ENSORLG00000004329	polrmt	97	67.143	Oryzias_latipes
ENSAMXG00000018258	polrmt	100	66.753	ENSORLG00020003896	polrmt	99	67.813	Oryzias_latipes_hni
ENSAMXG00000018258	polrmt	100	67.013	ENSORLG00015022238	polrmt	97	67.013	Oryzias_latipes_hsok
ENSAMXG00000018258	polrmt	100	74.845	ENSOMEG00000008292	polrmt	95	77.258	Oryzias_melastigma
ENSAMXG00000018258	polrmt	99	61.941	ENSOGAG00000007912	POLRMT	99	56.892	Otolemur_garnettii
ENSAMXG00000018258	polrmt	86	62.624	ENSOARG00000008898	POLRMT	91	62.624	Ovis_aries
ENSAMXG00000018258	polrmt	98	57.944	ENSPPAG00000043321	-	94	57.944	Pan_paniscus
ENSAMXG00000018258	polrmt	96	58.851	ENSPPAG00000030853	POLRMT	92	58.851	Pan_paniscus
ENSAMXG00000018258	polrmt	87	59.281	ENSPPRG00000001547	POLRMT	92	60.258	Panthera_pardus
ENSAMXG00000018258	polrmt	98	58.190	ENSPTRG00000039638	-	94	58.190	Pan_troglodytes
ENSAMXG00000018258	polrmt	96	59.657	ENSPTRG00000010157	POLRMT	89	59.657	Pan_troglodytes
ENSAMXG00000018258	polrmt	99	60.374	ENSPANG00000006649	POLRMT	95	60.374	Papio_anubis
ENSAMXG00000018258	polrmt	100	76.050	ENSPKIG00000024580	polrmt	97	76.050	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAMXG00000018258	polrmt	88	77.706	ENSPMGG00000014627	polrmt	94	77.706	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSAMXG00000018258	polrmt	98	60.494	ENSPEMG00000011671	Polrmt	99	61.587	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAMXG00000018258	polrmt	65	65.686	ENSPMAG00000005070	-	99	65.686	Petromyzon_marinus
ENSAMXG00000018258	polrmt	100	65.967	ENSPCIG00000006103	POLRMT	99	65.967	Phascolarctos_cinereus
ENSAMXG00000018258	polrmt	100	77.419	ENSPFOG00000003911	polrmt	94	80.590	Poecilia_formosa
ENSAMXG00000018258	polrmt	85	80.275	ENSPLAG00000005743	polrmt	93	80.275	Poecilia_latipinna
ENSAMXG00000018258	polrmt	68	76.471	ENSPMEG00000011484	polrmt	89	76.471	Poecilia_mexicana
ENSAMXG00000018258	polrmt	96	75.929	ENSPMEG00000008947	polrmt	94	75.929	Poecilia_mexicana
ENSAMXG00000018258	polrmt	100	75.235	ENSPREG00000007650	polrmt	97	75.235	Poecilia_reticulata
ENSAMXG00000018258	polrmt	93	60.924	ENSPPYG00000009282	POLRMT	99	60.924	Pongo_abelii
ENSAMXG00000018258	polrmt	74	60.326	ENSPCAG00000010816	POLRMT	93	50.467	Procavia_capensis
ENSAMXG00000018258	polrmt	99	57.919	ENSPCOG00000014539	POLRMT	95	58.281	Propithecus_coquereli
ENSAMXG00000018258	polrmt	96	60.124	ENSPVAG00000008403	POLRMT	93	60.124	Pteropus_vampyrus
ENSAMXG00000018258	polrmt	100	60.104	ENSPNYG00000020790	polrmt	100	60.429	Pundamilia_nyererei
ENSAMXG00000018258	polrmt	100	82.453	ENSPNAG00000019790	polrmt	96	83.278	Pygocentrus_nattereri
ENSAMXG00000018258	polrmt	98	57.226	ENSRNOG00000024879	Polrmt	99	57.226	Rattus_norvegicus
ENSAMXG00000018258	polrmt	99	59.969	ENSRBIG00000006728	POLRMT	95	59.969	Rhinopithecus_bieti
ENSAMXG00000018258	polrmt	99	59.813	ENSRROG00000040809	POLRMT	95	59.813	Rhinopithecus_roxellana
ENSAMXG00000018258	polrmt	99	59.225	ENSSBOG00000025388	POLRMT	96	59.225	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSAMXG00000018258	polrmt	60	64.715	ENSSHAG00000009387	-	96	64.715	Sarcophilus_harrisii
ENSAMXG00000018258	polrmt	96	75.195	ENSSFOG00015005074	polrmt	96	75.195	Scleropages_formosus
ENSAMXG00000018258	polrmt	100	78.871	ENSSMAG00000011851	polrmt	94	78.871	Scophthalmus_maximus
ENSAMXG00000018258	polrmt	100	78.352	ENSSDUG00000004410	polrmt	94	79.839	Seriola_dumerili
ENSAMXG00000018258	polrmt	100	78.352	ENSSLDG00000010643	polrmt	94	79.839	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSAMXG00000018258	polrmt	100	69.321	ENSSPAG00000018740	polrmt	100	69.321	Stegastes_partitus
ENSAMXG00000018258	polrmt	96	60.714	ENSSSCG00000035693	POLRMT	92	60.714	Sus_scrofa
ENSAMXG00000018258	polrmt	75	67.863	ENSTGUG00000000621	POLRMT	95	68.019	Taeniopygia_guttata
ENSAMXG00000018258	polrmt	96	77.706	ENSTRUG00000018040	polrmt	88	80.348	Takifugu_rubripes
ENSAMXG00000018258	polrmt	77	78.989	ENSTNIG00000010642	polrmt	93	78.989	Tetraodon_nigroviridis
ENSAMXG00000018258	polrmt	63	63.318	ENSTTRG00000011329	POLRMT	65	63.318	Tursiops_truncatus
ENSAMXG00000018258	polrmt	98	58.079	ENSUAMG00000019616	POLRMT	96	59.463	Ursus_americanus
ENSAMXG00000018258	polrmt	96	55.572	ENSVVUG00000022627	POLRMT	96	55.572	Vulpes_vulpes
ENSAMXG00000018258	polrmt	94	63.043	ENSXETG00000006545	polrmt	95	63.043	Xenopus_tropicalis
ENSAMXG00000018258	polrmt	100	78.710	ENSXMAG00000012464	polrmt	94	78.710	Xiphophorus_maculatus