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Description

Ensembl ID: ENSAMXG00000020299 (Gene tree)
Gene ID: 103034842
Gene Symbol: pelo
Alias: wu:fa12c12|wu:fb97f07|zgc:56550
Full Name: pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor
Gene Type: protein_coding
Species: Astyanax_mexicanus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 15912 bases
Position: chr4:24847975-24863886
Accession: 103034842
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAMXP00000052646	eRF1_2	PF03464.15	1.2e-32	1	1
ENSAMXP00000020905	eRF1_2	PF03464.15	1.2e-32	1	1
ENSAMXP00000052646	eRF1_3	PF03465.15	1e-24	1	1
ENSAMXP00000020905	eRF1_3	PF03465.15	3.1e-18	1	1
ENSAMXP00000052646	eRF1_1	PF03463.15	2.9e-52	1	1
ENSAMXP00000020905	eRF1_1	PF03463.15	2.9e-52	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAMXT00000039381	-	1492	XM_022669381	ENSAMXP00000052646	386 (aa)	XP_022525102	UPI000BBD7AA7
ENSAMXT00000020905	-	1155	-	ENSAMXP00000020905	384 (aa)	-	W5LM43

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
amex03015	mRNA surveillance pathway	KEGG

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAMXG00000020299	pelo	100	80.311	ENSG00000152684	PELO	97	81.233	Homo_sapiens
ENSAMXG00000020299	pelo	64	93.522	ENSAPOG00000023700	-	90	93.522	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAMXG00000020299	pelo	99	92.208	ENSAPOG00000023072	pelo	97	93.298	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAMXG00000020299	pelo	64	93.522	ENSAPOG00000000616	pelo	90	93.522	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAMXG00000020299	pelo	100	80.311	ENSAMEG00000007734	PELO	97	80.965	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAMXG00000020299	pelo	97	87.131	ENSACIG00000014386	pelo	97	92.899	Amphilophus_citrinellus
ENSAMXG00000020299	pelo	99	92.468	ENSAOCG00000023717	pelo	97	93.566	Amphiprion_ocellaris
ENSAMXG00000020299	pelo	99	92.468	ENSAPEG00000011235	pelo	97	93.566	Amphiprion_percula
ENSAMXG00000020299	pelo	100	92.487	ENSATEG00000019550	pelo	97	92.761	Anabas_testudineus
ENSAMXG00000020299	pelo	77	70.569	ENSAPLG00000013265	PELO	96	71.329	Anas_platyrhynchos
ENSAMXG00000020299	pelo	97	81.067	ENSACAG00000004352	PELO	97	81.233	Anolis_carolinensis
ENSAMXG00000020299	pelo	100	80.311	ENSANAG00000014096	PELO	97	80.965	Aotus_nancymaae
ENSAMXG00000020299	pelo	100	90.155	ENSACLG00000010305	pelo	97	90.885	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000020299	pelo	100	79.793	ENSBTAG00000003268	PELO	97	80.965	Bos_taurus
ENSAMXG00000020299	pelo	99	59.481	WBGene00011280	pelo-1	98	60.322	Caenorhabditis_elegans
ENSAMXG00000020299	pelo	100	80.052	ENSCJAG00000035190	PELO	97	80.697	Callithrix_jacchus
ENSAMXG00000020299	pelo	100	80.570	ENSCAFG00020023234	PELO	97	81.233	Canis_lupus_dingo
ENSAMXG00000020299	pelo	100	79.534	ENSCHIG00000016410	PELO	97	80.697	Capra_hircus
ENSAMXG00000020299	pelo	100	80.829	ENSTSYG00000005203	PELO	97	81.501	Carlito_syrichta
ENSAMXG00000020299	pelo	100	80.829	ENSCPOG00000027406	PELO	97	81.501	Cavia_porcellus
ENSAMXG00000020299	pelo	100	80.052	ENSCCAG00000035600	PELO	97	80.697	Cebus_capucinus
ENSAMXG00000020299	pelo	100	80.311	ENSCATG00000011829	PELO	97	80.965	Cercocebus_atys
ENSAMXG00000020299	pelo	100	80.311	ENSCLAG00000005043	PELO	97	80.965	Chinchilla_lanigera
ENSAMXG00000020299	pelo	100	80.311	ENSCSAG00000016692	PELO	97	80.965	Chlorocebus_sabaeus
ENSAMXG00000020299	pelo	100	80.570	ENSCHOG00000000523	PELO	97	81.233	Choloepus_hoffmanni
ENSAMXG00000020299	pelo	97	80.533	ENSCPBG00000007544	PELO	97	80.697	Chrysemys_picta_bellii
ENSAMXG00000020299	pelo	97	64.611	ENSCING00000001979	-	97	64.611	Ciona_intestinalis
ENSAMXG00000020299	pelo	100	65.285	ENSCSAVG00000006158	-	97	65.684	Ciona_savignyi
ENSAMXG00000020299	pelo	100	80.311	ENSCANG00000023382	PELO	97	80.965	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAMXG00000020299	pelo	97	81.233	ENSCGRG00001024665	Pelo	97	81.233	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAMXG00000020299	pelo	97	81.769	ENSCGRG00000004570	Pelo	97	81.769	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAMXG00000020299	pelo	100	91.710	ENSCSEG00000008807	pelo	97	92.493	Cynoglossus_semilaevis
ENSAMXG00000020299	pelo	99	91.429	ENSCVAG00000016082	pelo	97	92.761	Cyprinodon_variegatus
ENSAMXG00000020299	pelo	100	92.228	ENSDARG00000055477	pelo	97	93.029	Danio_rerio
ENSAMXG00000020299	pelo	100	77.261	ENSDNOG00000036721	PELO	97	77.807	Dasypus_novemcinctus
ENSAMXG00000020299	pelo	100	81.347	ENSDORG00000016689	Pelo	97	82.038	Dipodomys_ordii
ENSAMXG00000020299	pelo	96	67.027	FBgn0011207	pelo	94	66.756	Drosophila_melanogaster
ENSAMXG00000020299	pelo	74	74.731	ENSEBUG00000004955	pelo	95	74.731	Eptatretus_burgeri
ENSAMXG00000020299	pelo	100	80.570	ENSEASG00005013348	PELO	97	81.233	Equus_asinus_asinus
ENSAMXG00000020299	pelo	99	92.987	ENSELUG00000023229	pelo	98	93.521	Esox_lucius
ENSAMXG00000020299	pelo	100	81.088	ENSFCAG00000032341	PELO	97	81.769	Felis_catus
ENSAMXG00000020299	pelo	100	80.570	ENSFALG00000004559	PELO	97	81.501	Ficedula_albicollis
ENSAMXG00000020299	pelo	74	82.042	ENSFDAG00000002076	PELO	88	82.042	Fukomys_damarensis
ENSAMXG00000020299	pelo	99	89.870	ENSFHEG00000009769	pelo	97	91.421	Fundulus_heteroclitus
ENSAMXG00000020299	pelo	98	90.186	ENSGMOG00000005849	pelo	97	90.349	Gadus_morhua
ENSAMXG00000020299	pelo	99	90.130	ENSGAFG00000019350	pelo	97	91.689	Gambusia_affinis
ENSAMXG00000020299	pelo	100	91.192	ENSGACG00000007245	pelo	97	92.857	Gasterosteus_aculeatus
ENSAMXG00000020299	pelo	97	80.800	ENSGAGG00000004018	PELO	97	80.965	Gopherus_agassizii
ENSAMXG00000020299	pelo	100	80.311	ENSGGOG00000012635	PELO	97	80.965	Gorilla_gorilla
ENSAMXG00000020299	pelo	100	90.155	ENSHBUG00000005866	pelo	97	90.885	Haplochromis_burtoni
ENSAMXG00000020299	pelo	100	80.570	ENSHGLG00000005932	PELO	97	81.233	Heterocephalus_glaber_female
ENSAMXG00000020299	pelo	100	78.497	ENSHGLG00100017627	PELO	97	79.088	Heterocephalus_glaber_male
ENSAMXG00000020299	pelo	99	88.831	ENSHCOG00000016782	pelo	97	89.812	Hippocampus_comes
ENSAMXG00000020299	pelo	100	93.523	ENSIPUG00000020627	pelo	97	94.370	Ictalurus_punctatus
ENSAMXG00000020299	pelo	100	80.570	ENSSTOG00000027378	PELO	97	81.233	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAMXG00000020299	pelo	100	78.497	ENSJJAG00000015032	Pelo	97	79.088	Jaculus_jaculus
ENSAMXG00000020299	pelo	99	90.649	ENSKMAG00000021305	pelo	97	91.957	Kryptolebias_marmoratus
ENSAMXG00000020299	pelo	100	91.192	ENSLBEG00000022399	pelo	97	91.957	Labrus_bergylta
ENSAMXG00000020299	pelo	100	80.829	ENSLAFG00000020551	PELO	97	81.501	Loxodonta_africana
ENSAMXG00000020299	pelo	100	80.311	ENSMFAG00000000651	PELO	97	80.965	Macaca_fascicularis
ENSAMXG00000020299	pelo	100	80.311	ENSMMUG00000039101	PELO	97	80.965	Macaca_mulatta
ENSAMXG00000020299	pelo	100	80.311	ENSMNEG00000035538	PELO	97	80.965	Macaca_nemestrina
ENSAMXG00000020299	pelo	100	80.311	ENSMLEG00000039113	PELO	97	80.965	Mandrillus_leucophaeus
ENSAMXG00000020299	pelo	97	93.298	ENSMAMG00000013260	pelo	97	93.298	Mastacembelus_armatus
ENSAMXG00000020299	pelo	100	90.155	ENSMZEG00005014258	pelo	97	90.885	Maylandia_zebra
ENSAMXG00000020299	pelo	100	80.570	ENSMAUG00000009770	Pelo	97	81.233	Mesocricetus_auratus
ENSAMXG00000020299	pelo	100	80.570	ENSMICG00000044040	PELO	97	81.233	Microcebus_murinus
ENSAMXG00000020299	pelo	100	80.311	ENSMOCG00000017554	Pelo	97	80.965	Microtus_ochrogaster
ENSAMXG00000020299	pelo	99	91.688	ENSMMOG00000001324	pelo	97	92.493	Mola_mola
ENSAMXG00000020299	pelo	100	91.710	ENSMALG00000008194	pelo	97	91.689	Monopterus_albus
ENSAMXG00000020299	pelo	100	80.052	MGP_CAROLIEiJ_G0018915	Pelo	97	80.697	Mus_caroli
ENSAMXG00000020299	pelo	100	80.052	ENSMUSG00000042275	Pelo	97	80.697	Mus_musculus
ENSAMXG00000020299	pelo	100	80.311	MGP_PahariEiJ_G0015985	Pelo	97	80.965	Mus_pahari
ENSAMXG00000020299	pelo	100	80.052	MGP_SPRETEiJ_G0019793	Pelo	97	80.697	Mus_spretus
ENSAMXG00000020299	pelo	100	80.052	ENSMLUG00000024132	PELO	97	80.965	Myotis_lucifugus
ENSAMXG00000020299	pelo	99	80.779	ENSNGAG00000019331	Pelo	97	81.769	Nannospalax_galili
ENSAMXG00000020299	pelo	100	90.155	ENSNBRG00000011799	pelo	97	90.885	Neolamprologus_brichardi
ENSAMXG00000020299	pelo	100	80.311	ENSNLEG00000035970	PELO	97	80.965	Nomascus_leucogenys
ENSAMXG00000020299	pelo	100	79.793	ENSMEUG00000005468	PELO	97	80.965	Notamacropus_eugenii
ENSAMXG00000020299	pelo	98	79.947	ENSOPRG00000018793	PELO	98	80.593	Ochotona_princeps
ENSAMXG00000020299	pelo	100	81.347	ENSODEG00000017579	PELO	97	82.038	Octodon_degus
ENSAMXG00000020299	pelo	96	90.836	ENSONIG00000011511	pelo	97	90.885	Oreochromis_niloticus
ENSAMXG00000020299	pelo	100	80.570	ENSOCUG00000023902	PELO	97	81.501	Oryctolagus_cuniculus
ENSAMXG00000020299	pelo	100	90.415	ENSORLG00000005827	pelo	97	90.885	Oryzias_latipes
ENSAMXG00000020299	pelo	100	90.674	ENSORLG00020016456	pelo	97	91.153	Oryzias_latipes_hni
ENSAMXG00000020299	pelo	100	90.674	ENSORLG00015014447	pelo	97	91.153	Oryzias_latipes_hsok
ENSAMXG00000020299	pelo	100	92.228	ENSOMEG00000021567	pelo	97	93.029	Oryzias_melastigma
ENSAMXG00000020299	pelo	100	80.311	ENSOGAG00000027940	PELO	97	80.965	Otolemur_garnettii
ENSAMXG00000020299	pelo	100	79.793	ENSOARG00000008324	PELO	97	80.965	Ovis_aries
ENSAMXG00000020299	pelo	100	80.311	ENSPPAG00000038951	PELO	97	80.965	Pan_paniscus
ENSAMXG00000020299	pelo	100	81.088	ENSPPRG00000018800	PELO	97	81.769	Panthera_pardus
ENSAMXG00000020299	pelo	100	81.088	ENSPTIG00000019988	PELO	97	81.769	Panthera_tigris_altaica
ENSAMXG00000020299	pelo	100	80.052	ENSPTRG00000034409	PELO	97	80.965	Pan_troglodytes
ENSAMXG00000020299	pelo	100	80.311	ENSPANG00000010902	PELO	97	80.965	Papio_anubis
ENSAMXG00000020299	pelo	100	93.264	ENSPKIG00000015190	pelo	97	93.566	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAMXG00000020299	pelo	97	80.800	ENSPSIG00000004971	PELO	97	80.965	Pelodiscus_sinensis
ENSAMXG00000020299	pelo	66	92.126	ENSPMGG00000014561	pelo	94	92.126	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSAMXG00000020299	pelo	100	80.829	ENSPEMG00000015584	Pelo	97	81.501	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAMXG00000020299	pelo	99	81.152	ENSPCIG00000004880	PELO	97	82.038	Phascolarctos_cinereus
ENSAMXG00000020299	pelo	99	90.909	ENSPFOG00000007277	pelo	97	92.225	Poecilia_formosa
ENSAMXG00000020299	pelo	99	91.169	ENSPLAG00000020787	pelo	97	92.493	Poecilia_latipinna
ENSAMXG00000020299	pelo	99	90.909	ENSPMEG00000016964	pelo	97	92.225	Poecilia_mexicana
ENSAMXG00000020299	pelo	99	91.169	ENSPREG00000023071	pelo	97	92.493	Poecilia_reticulata
ENSAMXG00000020299	pelo	97	80.965	ENSPPYG00000015451	PELO	93	80.965	Pongo_abelii
ENSAMXG00000020299	pelo	100	80.570	ENSPCOG00000021178	PELO	97	81.233	Propithecus_coquereli
ENSAMXG00000020299	pelo	100	90.155	ENSPNYG00000017325	pelo	97	90.885	Pundamilia_nyererei
ENSAMXG00000020299	pelo	100	96.114	ENSPNAG00000012458	pelo	100	96.114	Pygocentrus_nattereri
ENSAMXG00000020299	pelo	100	80.570	ENSRNOG00000061128	Pelo	97	81.233	Rattus_norvegicus
ENSAMXG00000020299	pelo	100	80.311	ENSRBIG00000007299	PELO	97	80.965	Rhinopithecus_bieti
ENSAMXG00000020299	pelo	100	80.311	ENSRROG00000035507	PELO	97	80.965	Rhinopithecus_roxellana
ENSAMXG00000020299	pelo	96	33.158	YNL001W	-	97	33.069	Saccharomyces_cerevisiae
ENSAMXG00000020299	pelo	100	80.311	ENSSBOG00000036140	PELO	97	80.965	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSAMXG00000020299	pelo	63	75.918	ENSSHAG00000010770	PELO	95	77.586	Sarcophilus_harrisii
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