EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSAMXG00000025023 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: rpp38
Alias: fc10d08|wu:fc10d08|zgc:92924
Full Name: ribonuclease P/MRP 38 subunit
Gene Type: protein_coding
Species: Astyanax_mexicanus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 4500 bases
Position: chrAPWO02000037.1:4086352-4090851
Accession: ZDB-GENE-040718-258
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAMXP00000025729	Ribosomal_L7Ae	PF01248.26	1.2e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAMXT00000025749	-	753	-	ENSAMXP00000025729	250 (aa)	-	W5LS36

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAMXG00000025023	rpp38	98	44.765	ENSG00000152464	RPP38	90	48.344	Homo_sapiens
ENSAMXG00000025023	rpp38	93	43.066	ENSAPOG00000001240	rpp38	95	43.066	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAMXG00000025023	rpp38	98	41.818	ENSAMEG00000018832	RPP38	89	41.600	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAMXG00000025023	rpp38	93	43.866	ENSACIG00000011592	rpp38	97	44.610	Amphilophus_citrinellus
ENSAMXG00000025023	rpp38	93	41.844	ENSAOCG00000017293	rpp38	96	41.844	Amphiprion_ocellaris
ENSAMXG00000025023	rpp38	93	44.906	ENSAPEG00000002315	rpp38	95	44.906	Amphiprion_percula
ENSAMXG00000025023	rpp38	93	45.211	ENSATEG00000000731	rpp38	91	45.122	Anabas_testudineus
ENSAMXG00000025023	rpp38	88	43.254	ENSAPLG00000002054	RPP38	89	45.161	Anas_platyrhynchos
ENSAMXG00000025023	rpp38	93	44.531	ENSACLG00000016958	rpp38	96	45.312	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000025023	rpp38	93	44.922	ENSACLG00000016962	rpp38	96	45.703	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000025023	rpp38	98	44.043	ENSBTAG00000007702	RPP38	89	43.462	Bos_taurus
ENSAMXG00000025023	rpp38	96	44.649	ENSCAFG00000024373	RPP38	89	44.223	Canis_familiaris
ENSAMXG00000025023	rpp38	96	44.649	ENSCAFG00020008008	RPP38	89	44.223	Canis_lupus_dingo
ENSAMXG00000025023	rpp38	98	44.404	ENSCHIG00000012484	RPP38	89	43.243	Capra_hircus
ENSAMXG00000025023	rpp38	99	40.283	ENSCPOG00000003981	RPP38	89	40.392	Cavia_porcellus
ENSAMXG00000025023	rpp38	98	40.000	ENSCLAG00000010194	RPP38	89	39.608	Chinchilla_lanigera
ENSAMXG00000025023	rpp38	90	44.961	ENSCSAG00000019055	RPP38	89	46.215	Chlorocebus_sabaeus
ENSAMXG00000025023	rpp38	98	42.806	ENSCHOG00000004335	RPP38	89	42.688	Choloepus_hoffmanni
ENSAMXG00000025023	rpp38	94	40.377	ENSCGRG00001001395	Rpp38	89	39.271	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAMXG00000025023	rpp38	94	40.377	ENSCGRG00000017441	Rpp38	89	39.271	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAMXG00000025023	rpp38	93	44.402	ENSCSEG00000001721	rpp38	96	44.402	Cynoglossus_semilaevis
ENSAMXG00000025023	rpp38	93	43.223	ENSCVAG00000001676	rpp38	89	44.314	Cyprinodon_variegatus
ENSAMXG00000025023	rpp38	94	57.529	ENSDARG00000040350	rpp38	95	57.031	Danio_rerio
ENSAMXG00000025023	rpp38	98	43.116	ENSDNOG00000040314	RPP38	89	42.353	Dasypus_novemcinctus
ENSAMXG00000025023	rpp38	92	45.136	ENSDORG00000009783	Rpp38	89	44.490	Dipodomys_ordii
ENSAMXG00000025023	rpp38	94	43.233	ENSETEG00000002839	RPP38	89	42.972	Echinops_telfairi
ENSAMXG00000025023	rpp38	94	42.537	ENSEASG00005019783	RPP38	88	41.270	Equus_asinus_asinus
ENSAMXG00000025023	rpp38	98	41.155	ENSEEUG00000014677	RPP38	89	40.385	Erinaceus_europaeus
ENSAMXG00000025023	rpp38	93	42.268	ENSELUG00000010160	rpp38	97	42.268	Esox_lucius
ENSAMXG00000025023	rpp38	98	44.043	ENSFCAG00000022449	RPP38	89	43.651	Felis_catus
ENSAMXG00000025023	rpp38	88	42.520	ENSFALG00000014804	RPP38	86	42.800	Ficedula_albicollis
ENSAMXG00000025023	rpp38	98	39.209	ENSFDAG00000018669	RPP38	89	38.735	Fukomys_damarensis
ENSAMXG00000025023	rpp38	93	41.727	ENSFHEG00000013741	rpp38	90	41.445	Fundulus_heteroclitus
ENSAMXG00000025023	rpp38	92	42.007	ENSGALG00000008794	RPP38	85	42.745	Gallus_gallus
ENSAMXG00000025023	rpp38	62	47.879	ENSGACG00000009258	rpp38	99	47.879	Gasterosteus_aculeatus
ENSAMXG00000025023	rpp38	93	44.922	ENSHBUG00000010937	rpp38	96	45.703	Haplochromis_burtoni
ENSAMXG00000025023	rpp38	98	37.801	ENSHGLG00000012144	RPP38	89	37.218	Heterocephalus_glaber_female
ENSAMXG00000025023	rpp38	93	56.432	ENSIPUG00000022879	rpp38	95	57.851	Ictalurus_punctatus
ENSAMXG00000025023	rpp38	94	43.704	ENSSTOG00000025699	RPP38	87	41.434	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAMXG00000025023	rpp38	94	41.481	ENSJJAG00000007523	Rpp38	89	41.016	Jaculus_jaculus
ENSAMXG00000025023	rpp38	88	42.248	ENSKMAG00000003986	rpp38	89	41.961	Kryptolebias_marmoratus
ENSAMXG00000025023	rpp38	96	46.350	ENSLBEG00000006853	rpp38	97	46.269	Labrus_bergylta
ENSAMXG00000025023	rpp38	93	42.599	ENSLACG00000006502	RPP38	90	43.295	Latimeria_chalumnae
ENSAMXG00000025023	rpp38	96	44.928	ENSLOCG00000018347	rpp38	89	44.314	Lepisosteus_oculatus
ENSAMXG00000025023	rpp38	94	41.264	ENSLAFG00000000509	RPP38	89	40.476	Loxodonta_africana
ENSAMXG00000025023	rpp38	90	44.961	ENSMMUG00000007679	RPP38	89	46.215	Macaca_mulatta
ENSAMXG00000025023	rpp38	95	45.769	ENSMAMG00000012774	rpp38	95	45.490	Mastacembelus_armatus
ENSAMXG00000025023	rpp38	93	45.312	ENSMZEG00005003189	rpp38	96	46.094	Maylandia_zebra
ENSAMXG00000025023	rpp38	93	44.531	ENSMZEG00005003200	rpp38	96	45.312	Maylandia_zebra
ENSAMXG00000025023	rpp38	92	43.494	ENSMGAG00000008217	RPP38	85	44.314	Meleagris_gallopavo
ENSAMXG00000025023	rpp38	94	40.000	ENSMAUG00000003644	Rpp38	89	39.676	Mesocricetus_auratus
ENSAMXG00000025023	rpp38	94	40.824	ENSMOCG00000007020	Rpp38	89	38.521	Microtus_ochrogaster
ENSAMXG00000025023	rpp38	95	45.113	ENSMMOG00000003446	rpp38	96	45.038	Mola_mola
ENSAMXG00000025023	rpp38	89	42.520	ENSMODG00000024091	RPP38	89	42.742	Monodelphis_domestica
ENSAMXG00000025023	rpp38	92	45.736	ENSMALG00000002356	rpp38	91	45.749	Monopterus_albus
ENSAMXG00000025023	rpp38	94	43.233	MGP_CAROLIEiJ_G0023133	Rpp38	89	42.169	Mus_caroli
ENSAMXG00000025023	rpp38	94	42.857	ENSMUSG00000049950	Rpp38	89	41.667	Mus_musculus
ENSAMXG00000025023	rpp38	94	43.657	MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	89	41.732	Mus_pahari
ENSAMXG00000025023	rpp38	94	42.481	MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	89	41.270	Mus_spretus
ENSAMXG00000025023	rpp38	97	40.876	ENSMPUG00000018523	RPP38	89	40.800	Mustela_putorius_furo
ENSAMXG00000025023	rpp38	90	39.922	ENSMLUG00000002153	RPP38	89	41.036	Myotis_lucifugus
ENSAMXG00000025023	rpp38	94	41.328	ENSNGAG00000011066	Rpp38	89	40.551	Nannospalax_galili
ENSAMXG00000025023	rpp38	93	45.136	ENSNBRG00000006994	rpp38	97	45.914	Neolamprologus_brichardi
ENSAMXG00000025023	rpp38	93	45.914	ENSONIG00000020467	rpp38	95	45.914	Oreochromis_niloticus
ENSAMXG00000025023	rpp38	87	43.902	ENSOCUG00000022768	-	89	44.130	Oryctolagus_cuniculus
ENSAMXG00000025023	rpp38	87	42.683	ENSOCUG00000024367	-	89	42.915	Oryctolagus_cuniculus
ENSAMXG00000025023	rpp38	93	45.926	ENSORLG00000009219	rpp38	91	46.275	Oryzias_latipes
ENSAMXG00000025023	rpp38	93	46.125	ENSORLG00020011503	rpp38	86	45.490	Oryzias_latipes_hni
ENSAMXG00000025023	rpp38	91	45.833	ENSORLG00015017702	rpp38	86	45.490	Oryzias_latipes_hsok
ENSAMXG00000025023	rpp38	87	44.269	ENSOMEG00000005414	rpp38	90	45.455	Oryzias_melastigma
ENSAMXG00000025023	rpp38	98	43.525	ENSOGAG00000008059	RPP38	89	43.478	Otolemur_garnettii
ENSAMXG00000025023	rpp38	98	44.203	ENSOARG00000004534	RPP38	89	43.629	Ovis_aries
ENSAMXG00000025023	rpp38	98	44.765	ENSPPAG00000041577	RPP38	81	44.841	Pan_paniscus
ENSAMXG00000025023	rpp38	98	43.682	ENSPPRG00000015329	RPP38	89	43.651	Panthera_pardus
ENSAMXG00000025023	rpp38	98	43.682	ENSPTIG00000007188	RPP38	89	43.651	Panthera_tigris_altaica
ENSAMXG00000025023	rpp38	98	44.765	ENSPTRG00000002318	RPP38	81	44.841	Pan_troglodytes
ENSAMXG00000025023	rpp38	92	44.061	ENSPKIG00000025652	rpp38	88	43.373	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAMXG00000025023	rpp38	99	43.416	ENSPSIG00000001527	RPP38	89	42.857	Pelodiscus_sinensis
ENSAMXG00000025023	rpp38	94	42.105	ENSPEMG00000008375	Rpp38	89	40.625	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAMXG00000025023	rpp38	94	44.030	ENSPCIG00000009096	RPP38	84	43.548	Phascolarctos_cinereus
ENSAMXG00000025023	rpp38	61	49.708	ENSPFOG00000016823	rpp38	80	49.383	Poecilia_formosa
ENSAMXG00000025023	rpp38	97	40.283	ENSPLAG00000007626	rpp38	96	40.146	Poecilia_latipinna
ENSAMXG00000025023	rpp38	93	39.098	ENSPMEG00000020392	rpp38	96	39.098	Poecilia_mexicana
ENSAMXG00000025023	rpp38	94	40.860	ENSPREG00000017744	rpp38	92	40.613	Poecilia_reticulata
ENSAMXG00000025023	rpp38	98	45.848	ENSPPYG00000002113	RPP38	89	46.032	Pongo_abelii
ENSAMXG00000025023	rpp38	90	39.474	ENSPVAG00000007155	RPP38	89	40.076	Pteropus_vampyrus
ENSAMXG00000025023	rpp38	93	44.922	ENSPNYG00000004293	rpp38	96	45.703	Pundamilia_nyererei
ENSAMXG00000025023	rpp38	87	63.677	ENSPNAG00000010633	rpp38	94	63.025	Pygocentrus_nattereri
ENSAMXG00000025023	rpp38	92	44.444	ENSRNOG00000038025	Rpp38	89	43.373	Rattus_norvegicus
ENSAMXG00000025023	rpp38	94	45.756	ENSSHAG00000015529	RPP38	89	45.418	Sarcophilus_harrisii
ENSAMXG00000025023	rpp38	92	45.136	ENSSMAG00000018276	rpp38	90	44.898	Scophthalmus_maximus
ENSAMXG00000025023	rpp38	93	46.899	ENSSDUG00000001651	rpp38	96	47.287	Seriola_dumerili
ENSAMXG00000025023	rpp38	93	46.923	ENSSLDG00000014355	rpp38	96	47.692	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSAMXG00000025023	rpp38	94	39.535	ENSSARG00000012099	RPP38	87	38.174	Sorex_araneus
ENSAMXG00000025023	rpp38	98	41.577	ENSSPUG00000005237	-	88	41.270	Sphenodon_punctatus
ENSAMXG00000025023	rpp38	94	40.741	ENSSPUG00000008560	-	90	39.286	Sphenodon_punctatus
ENSAMXG00000025023	rpp38	98	41.219	ENSSPUG00000018363	-	89	40.873	Sphenodon_punctatus
ENSAMXG00000025023	rpp38	93	43.629	ENSSPAG00000020387	rpp38	95	42.857	Stegastes_partitus
ENSAMXG00000025023	rpp38	98	40.070	ENSSSCG00000027110	RPP38	89	39.313	Sus_scrofa
ENSAMXG00000025023	rpp38	88	40.157	ENSTGUG00000001366	RPP38	89	40.400	Taeniopygia_guttata
ENSAMXG00000025023	rpp38	96	45.594	ENSTNIG00000001334	rpp38	96	46.215	Tetraodon_nigroviridis
ENSAMXG00000025023	rpp38	98	45.357	ENSTTRG00000004420	RPP38	89	45.098	Tursiops_truncatus
ENSAMXG00000025023	rpp38	98	41.455	ENSUAMG00000002618	RPP38	89	41.200	Ursus_americanus
ENSAMXG00000025023	rpp38	98	41.516	ENSUMAG00000012382	RPP38	89	41.270	Ursus_maritimus
ENSAMXG00000025023	rpp38	96	43.542	ENSVVUG00000005272	RPP38	89	43.028	Vulpes_vulpes
ENSAMXG00000025023	rpp38	90	41.699	ENSXETG00000003419	rpp38	91	41.406	Xenopus_tropicalis