EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAMXG00000030100 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astyanax_mexicanus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 1104 bases
Position: chrAPWO02000075.1:779908-781011
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAMXP00000034629	RVT_1	PF00078.27	1.5e-42	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAMXT00000055038	-	1104	-	ENSAMXP00000034629	367 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSAMXG00000030100	-	61	43.805	ENSAMXG00000041932	-	57	43.515
ENSAMXG00000030100	-	73	46.667	ENSAMXG00000029786	-	68	46.667
ENSAMXG00000030100	-	75	51.020	ENSAMXG00000033367	-	65	51.864
ENSAMXG00000030100	-	57	60.748	ENSAMXG00000040899	-	51	60.748
ENSAMXG00000030100	-	88	43.385	ENSAMXG00000035505	-	67	43.385
ENSAMXG00000030100	-	93	48.538	ENSAMXG00000032588	-	51	48.538
ENSAMXG00000030100	-	84	45.455	ENSAMXG00000032598	-	89	45.455
ENSAMXG00000030100	-	75	43.403	ENSAMXG00000041299	-	69	43.403
ENSAMXG00000030100	-	99	95.879	ENSAMXG00000043139	-	69	95.879
ENSAMXG00000030100	-	99	58.177	ENSAMXG00000033666	-	64	58.177
ENSAMXG00000030100	-	86	45.741	ENSAMXG00000038571	-	73	45.110
ENSAMXG00000030100	-	57	62.150	ENSAMXG00000033268	-	51	62.150
ENSAMXG00000030100	-	75	36.861	ENSAMXG00000033695	-	59	36.861
ENSAMXG00000030100	-	93	42.609	ENSAMXG00000040733	-	77	42.609
ENSAMXG00000030100	-	89	43.293	ENSAMXG00000035634	-	69	43.293
ENSAMXG00000030100	-	80	50.685	ENSAMXG00000040370	-	70	50.685
ENSAMXG00000030100	-	99	94.780	ENSAMXG00000031937	-	92	94.780
ENSAMXG00000030100	-	74	57.143	ENSAMXG00000029882	-	57	61.134
ENSAMXG00000030100	-	99	95.879	ENSAMXG00000033549	-	59	95.879
ENSAMXG00000030100	-	99	57.909	ENSAMXG00000037500	-	67	57.909
ENSAMXG00000030100	-	99	96.703	ENSAMXG00000029030	-	64	96.703
ENSAMXG00000030100	-	93	46.802	ENSAMXG00000040860	-	59	46.802
ENSAMXG00000030100	-	93	94.737	ENSAMXG00000040990	-	100	94.737
ENSAMXG00000030100	-	93	48.555	ENSAMXG00000041791	-	50	48.555
ENSAMXG00000030100	-	80	53.770	ENSAMXG00000035603	-	50	53.770
ENSAMXG00000030100	-	90	43.243	ENSAMXG00000034041	-	77	43.243
ENSAMXG00000030100	-	71	51.331	ENSAMXG00000043740	-	53	51.331
ENSAMXG00000030100	-	83	50.000	ENSAMXG00000030994	-	60	50.000
ENSAMXG00000030100	-	84	52.443	ENSAMXG00000034412	-	62	52.443
ENSAMXG00000030100	-	99	39.560	ENSAMXG00000030246	-	50	39.560
ENSAMXG00000030100	-	74	52.747	ENSAMXG00000043461	-	55	52.747
ENSAMXG00000030100	-	91	40.774	ENSAMXG00000041363	-	60	38.843
ENSAMXG00000030100	-	87	49.533	ENSAMXG00000035521	-	88	49.533
ENSAMXG00000030100	-	99	98.077	ENSAMXG00000030235	-	58	98.077
ENSAMXG00000030100	-	91	43.155	ENSAMXG00000031910	-	79	43.027
ENSAMXG00000030100	-	99	98.077	ENSAMXG00000031289	-	64	98.077
ENSAMXG00000030100	-	99	93.681	ENSAMXG00000037727	-	63	93.681
ENSAMXG00000030100	-	89	44.037	ENSAMXG00000039086	-	76	45.819
ENSAMXG00000030100	-	87	35.312	ENSAMXG00000035582	-	60	35.556
ENSAMXG00000030100	-	99	41.047	ENSAMXG00000038422	-	96	41.047
ENSAMXG00000030100	-	54	44.221	ENSAMXG00000032194	-	51	44.221
ENSAMXG00000030100	-	63	30.342	ENSAMXG00000042384	-	52	30.342
ENSAMXG00000030100	-	92	43.027	ENSAMXG00000032548	-	69	43.027
ENSAMXG00000030100	-	65	31.174	ENSAMXG00000039528	-	56	31.301
ENSAMXG00000030100	-	99	94.505	ENSAMXG00000033627	-	52	94.505
ENSAMXG00000030100	-	91	43.452	ENSAMXG00000037974	-	63	43.452
ENSAMXG00000030100	-	75	42.086	ENSAMXG00000031724	-	66	42.086

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAMXG00000030100	-	99	57.337	ENSAPEG00000007939	-	87	57.337	Amphiprion_percula
ENSAMXG00000030100	-	76	63.571	ENSAPEG00000000917	-	75	63.571	Amphiprion_percula
ENSAMXG00000030100	-	67	56.275	ENSAPEG00000006031	-	60	56.275	Amphiprion_percula
ENSAMXG00000030100	-	99	57.337	ENSAPEG00000006041	-	52	57.337	Amphiprion_percula
ENSAMXG00000030100	-	70	56.757	ENSAPEG00000019125	-	57	56.757	Amphiprion_percula
ENSAMXG00000030100	-	59	54.128	ENSAPEG00000024080	-	80	49.425	Amphiprion_percula
ENSAMXG00000030100	-	50	50.000	ENSAPEG00000001164	-	72	50.000	Amphiprion_percula
ENSAMXG00000030100	-	86	50.318	ENSAPEG00000014087	-	62	50.318	Amphiprion_percula
ENSAMXG00000030100	-	53	56.345	ENSAPEG00000011071	-	57	56.345	Amphiprion_percula
ENSAMXG00000030100	-	80	55.068	ENSAPEG00000010166	-	56	54.248	Amphiprion_percula
ENSAMXG00000030100	-	99	61.749	ENSATEG00000019303	-	58	61.749	Anabas_testudineus
ENSAMXG00000030100	-	75	62.681	ENSATEG00000010018	-	82	62.681	Anabas_testudineus
ENSAMXG00000030100	-	99	61.685	ENSATEG00000014522	-	78	61.685	Anabas_testudineus
ENSAMXG00000030100	-	88	60.494	ENSATEG00000022917	-	60	60.494	Anabas_testudineus
ENSAMXG00000030100	-	75	64.000	ENSATEG00000007276	-	56	64.000	Anabas_testudineus
ENSAMXG00000030100	-	71	68.321	ENSATEG00000007671	-	56	68.321	Anabas_testudineus
ENSAMXG00000030100	-	99	62.022	ENSATEG00000023306	-	64	62.022	Anabas_testudineus
ENSAMXG00000030100	-	99	60.822	ENSATEG00000002707	-	90	60.822	Anabas_testudineus
ENSAMXG00000030100	-	99	60.929	ENSATEG00000022498	-	64	60.929	Anabas_testudineus
ENSAMXG00000030100	-	99	60.929	ENSATEG00000009980	-	57	60.929	Anabas_testudineus
ENSAMXG00000030100	-	89	59.077	ENSATEG00000004853	-	99	59.077	Anabas_testudineus
ENSAMXG00000030100	-	95	59.195	ENSATEG00000021051	-	100	59.195	Anabas_testudineus
ENSAMXG00000030100	-	86	58.861	ENSATEG00000015488	-	100	58.861	Anabas_testudineus
ENSAMXG00000030100	-	99	57.143	ENSATEG00000016827	-	64	57.143	Anabas_testudineus
ENSAMXG00000030100	-	85	63.492	ENSATEG00000007647	-	58	63.492	Anabas_testudineus
ENSAMXG00000030100	-	68	65.060	ENSATEG00000018909	-	82	65.060	Anabas_testudineus
ENSAMXG00000030100	-	99	62.022	ENSATEG00000016515	-	57	62.022	Anabas_testudineus
ENSAMXG00000030100	-	60	64.840	ENSATEG00000009738	-	53	64.840	Anabas_testudineus
ENSAMXG00000030100	-	79	47.766	ENSACAG00000028621	-	55	47.766	Anolis_carolinensis
ENSAMXG00000030100	-	85	46.474	ENSACAG00000028543	-	57	46.474	Anolis_carolinensis
ENSAMXG00000030100	-	79	48.454	ENSACAG00000028434	-	95	48.454	Anolis_carolinensis
ENSAMXG00000030100	-	83	45.875	ENSACAG00000028321	-	56	45.875	Anolis_carolinensis
ENSAMXG00000030100	-	94	60.290	ENSACLG00000005642	-	59	60.290	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000030100	-	75	60.650	ENSACLG00000003644	-	85	60.650	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000030100	-	99	57.692	ENSACLG00000021583	-	86	57.692	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000030100	-	75	63.899	ENSACLG00000009011	-	58	63.899	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000030100	-	91	58.806	ENSACLG00000011058	-	69	58.806	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000030100	-	58	54.673	ENSACLG00000004579	-	50	54.673	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000030100	-	70	55.642	ENSACLG00000014661	-	54	55.642	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000030100	-	70	55.642	ENSACLG00000018346	-	57	55.642	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000030100	-	99	57.459	ENSACLG00000002614	-	50	57.459	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000030100	-	99	57.967	ENSACLG00000017297	-	67	57.967	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000030100	-	75	63.177	ENSACLG00000012219	-	58	63.177	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000030100	-	75	61.733	ENSACLG00000021947	-	90	61.733	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000030100	-	99	58.242	ENSACLG00000027256	-	89	58.242	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000030100	-	80	51.027	ENSACLG00000021937	-	61	52.397	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000030100	-	99	58.242	ENSACLG00000008859	-	53	58.242	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000030100	-	99	57.735	ENSACLG00000012094	-	74	57.735	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000030100	-	99	57.967	ENSACLG00000003670	-	56	57.967	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000030100	-	99	58.242	ENSACLG00000015704	-	59	58.242	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000030100	-	74	62.963	ENSACLG00000026286	-	72	62.963	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000030100	-	84	60.261	ENSACLG00000025851	-	79	60.261	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000030100	-	99	57.418	ENSACLG00000005547	-	56	57.418	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000030100	-	99	57.143	ENSACLG00000014746	-	56	57.143	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000030100	-	75	61.372	ENSACLG00000006014	-	60	61.372	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000030100	-	50	59.239	ENSACLG00000011440	-	51	59.239	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000030100	-	75	61.733	ENSACLG00000021354	-	73	61.733	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000030100	-	99	58.516	ENSACLG00000000736	-	51	58.516	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000030100	-	58	50.704	ENSACLG00000024268	-	53	52.582	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000030100	-	99	56.831	ENSCSEG00000013241	-	55	56.831	Cynoglossus_semilaevis
ENSAMXG00000030100	-	75	65.091	ENSDARG00000116065	CR848040.3	90	65.091	Danio_rerio
ENSAMXG00000030100	-	80	61.092	ENSELUG00000018891	-	82	61.092	Esox_lucius
ENSAMXG00000030100	-	63	50.435	ENSELUG00000015080	-	52	50.435	Esox_lucius
ENSAMXG00000030100	-	58	50.467	ENSELUG00000019648	-	74	50.467	Esox_lucius
ENSAMXG00000030100	-	75	61.372	ENSFHEG00000004374	-	63	61.372	Fundulus_heteroclitus
ENSAMXG00000030100	-	50	58.696	ENSFHEG00000017568	-	61	58.696	Fundulus_heteroclitus
ENSAMXG00000030100	-	73	53.160	ENSHBUG00000014670	-	83	53.160	Haplochromis_burtoni
ENSAMXG00000030100	-	61	49.327	ENSHBUG00000016641	-	52	51.121	Haplochromis_burtoni
ENSAMXG00000030100	-	56	68.116	ENSIPUG00000001254	-	81	68.116	Ictalurus_punctatus
ENSAMXG00000030100	-	56	69.082	ENSIPUG00000024115	-	51	69.082	Ictalurus_punctatus
ENSAMXG00000030100	-	56	67.150	ENSIPUG00000024904	-	51	67.150	Ictalurus_punctatus
ENSAMXG00000030100	-	52	64.583	ENSIPUG00000017481	-	97	64.583	Ictalurus_punctatus
ENSAMXG00000030100	-	56	69.565	ENSIPUG00000002810	-	51	69.565	Ictalurus_punctatus
ENSAMXG00000030100	-	50	71.038	ENSIPUG00000018566	-	88	71.038	Ictalurus_punctatus
ENSAMXG00000030100	-	58	66.355	ENSIPUG00000022510	-	51	66.355	Ictalurus_punctatus
ENSAMXG00000030100	-	97	63.260	ENSIPUG00000009893	-	100	63.260	Ictalurus_punctatus
ENSAMXG00000030100	-	56	68.116	ENSIPUG00000021996	-	51	68.116	Ictalurus_punctatus
ENSAMXG00000030100	-	56	64.623	ENSIPUG00000005377	-	57	64.623	Ictalurus_punctatus
ENSAMXG00000030100	-	61	66.964	ENSIPUG00000017503	-	57	66.964	Ictalurus_punctatus
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ENSAMXG00000030100	-	99	50.411	ENSPKIG00000024437	-	64	50.411	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAMXG00000030100	-	50	52.174	ENSPFOG00000024325	-	72	52.174	Poecilia_formosa
ENSAMXG00000030100	-	77	51.220	ENSPREG00000012441	-	64	51.220	Poecilia_reticulata
ENSAMXG00000030100	-	64	57.627	ENSPREG00000020670	-	52	57.627	Poecilia_reticulata
ENSAMXG00000030100	-	50	60.326	ENSPNYG00000001533	-	51	60.326	Pundamilia_nyererei
ENSAMXG00000030100	-	99	70.959	ENSPNAG00000002193	-	64	70.959	Pygocentrus_nattereri
ENSAMXG00000030100	-	57	49.519	ENSPNAG00000013359	-	56	49.519	Pygocentrus_nattereri
ENSAMXG00000030100	-	99	76.359	ENSPNAG00000014173	-	70	76.359	Pygocentrus_nattereri
ENSAMXG00000030100	-	84	71.290	ENSPNAG00000021351	-	83	68.389	Pygocentrus_nattereri
ENSAMXG00000030100	-	55	73.134	ENSPNAG00000000737	-	58	73.134	Pygocentrus_nattereri
ENSAMXG00000030100	-	99	76.630	ENSPNAG00000009566	-	69	76.630	Pygocentrus_nattereri
ENSAMXG00000030100	-	68	72.289	ENSPNAG00000003097	-	83	72.289	Pygocentrus_nattereri
ENSAMXG00000030100	-	99	76.902	ENSPNAG00000013546	-	89	76.902	Pygocentrus_nattereri
ENSAMXG00000030100	-	100	57.221	ENSSMAG00000016680	-	79	57.221	Scophthalmus_maximus
ENSAMXG00000030100	-	100	57.527	ENSSMAG00000014467	-	65	57.527	Scophthalmus_maximus
ENSAMXG00000030100	-	89	60.550	ENSSMAG00000017564	-	77	60.550	Scophthalmus_maximus
ENSAMXG00000030100	-	100	57.766	ENSSMAG00000020789	-	67	57.766	Scophthalmus_maximus
ENSAMXG00000030100	-	99	50.411	ENSSDUG00000012909	-	58	50.411	Seriola_dumerili
ENSAMXG00000030100	-	76	44.245	ENSSPUG00000004689	-	53	43.929	Sphenodon_punctatus
ENSAMXG00000030100	-	50	44.865	ENSSPAG00000005749	-	60	43.915	Stegastes_partitus
ENSAMXG00000030100	-	75	54.513	ENSTRUG00000022494	-	60	54.513	Takifugu_rubripes
ENSAMXG00000030100	-	100	55.313	ENSTRUG00000024564	-	82	55.313	Takifugu_rubripes
ENSAMXG00000030100	-	93	55.425	ENSTRUG00000024195	-	75	55.425	Takifugu_rubripes
ENSAMXG00000030100	-	99	51.099	ENSXMAG00000028039	-	51	50.824	Xiphophorus_maculatus