EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAMXG00000032539 (Gene tree)
Gene ID: 103026047
Gene Symbol: xpo6
Alias: Ranbp20|fi24f12|wu:fi24f12
Full Name: exportin 6
Gene Type: protein_coding
Species: Astyanax_mexicanus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 39557 bases
Position: chrAPWO02000046.1:4734416-4773972
Accession: 103026047
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAMXP00000035115	Xpo1	PF08389.12	6.8e-23	1	1
ENSAMXP00000035115	IBN_N	PF03810.19	2e-08	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAMXT00000043188	-	8067	XM_022665110	ENSAMXP00000035115	1128 (aa)	XP_022520831	UPI000BBD5D48

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAMXG00000032539	xpo6	100	72.624	ENSG00000169180	XPO6	100	85.714	Homo_sapiens
ENSAMXG00000032539	xpo6	100	77.960	ENSAPOG00000012873	xpo6	100	77.960	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAMXG00000032539	xpo6	99	72.077	ENSAMEG00000011014	XPO6	100	72.077	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAMXG00000032539	xpo6	99	76.990	ENSACIG00000008055	xpo6	99	77.340	Amphilophus_citrinellus
ENSAMXG00000032539	xpo6	100	78.133	ENSAOCG00000001326	xpo6	100	78.133	Amphiprion_ocellaris
ENSAMXG00000032539	xpo6	100	78.047	ENSAPEG00000016304	xpo6	100	78.047	Amphiprion_percula
ENSAMXG00000032539	xpo6	100	77.615	ENSATEG00000002273	xpo6	100	77.615	Anabas_testudineus
ENSAMXG00000032539	xpo6	99	73.124	ENSAPLG00000007480	XPO6	99	73.188	Anas_platyrhynchos
ENSAMXG00000032539	xpo6	100	64.298	ENSACAG00000016883	XPO6	100	64.298	Anolis_carolinensis
ENSAMXG00000032539	xpo6	100	72.363	ENSANAG00000031761	XPO6	100	72.363	Aotus_nancymaae
ENSAMXG00000032539	xpo6	100	76.577	ENSACLG00000007048	xpo6	100	76.577	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000032539	xpo6	100	72.688	ENSBTAG00000010309	XPO6	100	72.688	Bos_taurus
ENSAMXG00000032539	xpo6	100	72.450	ENSCJAG00000006014	XPO6	100	72.450	Callithrix_jacchus
ENSAMXG00000032539	xpo6	99	72.576	ENSCAFG00000017356	XPO6	100	72.576	Canis_familiaris
ENSAMXG00000032539	xpo6	100	72.600	ENSCAFG00020011808	XPO6	100	72.600	Canis_lupus_dingo
ENSAMXG00000032539	xpo6	100	72.711	ENSCHIG00000022341	XPO6	100	72.711	Capra_hircus
ENSAMXG00000032539	xpo6	99	69.527	ENSTSYG00000012249	XPO6	100	69.527	Carlito_syrichta
ENSAMXG00000032539	xpo6	100	72.775	ENSCPOG00000012824	XPO6	100	72.775	Cavia_porcellus
ENSAMXG00000032539	xpo6	100	72.363	ENSCCAG00000036360	XPO6	100	72.363	Cebus_capucinus
ENSAMXG00000032539	xpo6	100	72.624	ENSCATG00000034030	XPO6	100	72.624	Cercocebus_atys
ENSAMXG00000032539	xpo6	99	72.664	ENSCLAG00000012270	XPO6	100	72.664	Chinchilla_lanigera
ENSAMXG00000032539	xpo6	91	71.563	ENSCHOG00000004369	XPO6	91	71.563	Choloepus_hoffmanni
ENSAMXG00000032539	xpo6	82	79.412	ENSCPBG00000024660	XPO6	98	79.412	Chrysemys_picta_bellii
ENSAMXG00000032539	xpo6	100	43.900	ENSCING00000006884	-	100	43.213	Ciona_intestinalis
ENSAMXG00000032539	xpo6	99	42.882	ENSCSAVG00000000850	-	99	42.281	Ciona_savignyi
ENSAMXG00000032539	xpo6	100	72.537	ENSCANG00000041578	XPO6	100	72.537	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAMXG00000032539	xpo6	100	72.696	ENSCGRG00001013173	Xpo6	100	72.696	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAMXG00000032539	xpo6	100	76.145	ENSCSEG00000013622	xpo6	100	76.318	Cynoglossus_semilaevis
ENSAMXG00000032539	xpo6	100	76.950	ENSCVAG00000017399	xpo6	100	76.950	Cyprinodon_variegatus
ENSAMXG00000032539	xpo6	97	92.427	ENSDARG00000041217	xpo6	99	92.427	Danio_rerio
ENSAMXG00000032539	xpo6	100	72.363	ENSDNOG00000012449	XPO6	100	72.363	Dasypus_novemcinctus
ENSAMXG00000032539	xpo6	100	72.513	ENSDORG00000000919	Xpo6	100	72.513	Dipodomys_ordii
ENSAMXG00000032539	xpo6	83	74.517	ENSETEG00000018768	XPO6	85	74.517	Echinops_telfairi
ENSAMXG00000032539	xpo6	100	58.217	ENSEBUG00000015560	xpo6	100	58.217	Eptatretus_burgeri
ENSAMXG00000032539	xpo6	100	72.624	ENSEASG00005017296	XPO6	100	72.624	Equus_asinus_asinus
ENSAMXG00000032539	xpo6	100	72.450	ENSECAG00000008601	XPO6	100	72.450	Equus_caballus
ENSAMXG00000032539	xpo6	97	66.757	ENSEEUG00000014587	XPO6	100	66.757	Erinaceus_europaeus
ENSAMXG00000032539	xpo6	100	78.870	ENSELUG00000009159	xpo6	100	78.870	Esox_lucius
ENSAMXG00000032539	xpo6	100	72.711	ENSFCAG00000010309	XPO6	100	72.711	Felis_catus
ENSAMXG00000032539	xpo6	99	73.037	ENSFALG00000004441	XPO6	98	73.275	Ficedula_albicollis
ENSAMXG00000032539	xpo6	99	72.387	ENSFDAG00000012689	XPO6	100	72.387	Fukomys_damarensis
ENSAMXG00000032539	xpo6	100	76.430	ENSFHEG00000021190	xpo6	100	76.430	Fundulus_heteroclitus
ENSAMXG00000032539	xpo6	100	73.147	ENSGALG00000035360	XPO6	100	73.211	Gallus_gallus
ENSAMXG00000032539	xpo6	100	76.690	ENSGAFG00000004044	xpo6	100	76.690	Gambusia_affinis
ENSAMXG00000032539	xpo6	95	72.426	ENSGAGG00000022738	XPO6	100	72.518	Gopherus_agassizii
ENSAMXG00000032539	xpo6	100	72.624	ENSGGOG00000005609	XPO6	100	72.624	Gorilla_gorilla
ENSAMXG00000032539	xpo6	100	76.664	ENSHBUG00000019504	xpo6	100	76.664	Haplochromis_burtoni
ENSAMXG00000032539	xpo6	100	72.459	ENSHGLG00000009679	-	100	72.459	Heterocephalus_glaber_female
ENSAMXG00000032539	xpo6	94	58.347	ENSHGLG00000003865	-	99	58.347	Heterocephalus_glaber_female
ENSAMXG00000032539	xpo6	94	62.798	ENSHGLG00100001081	-	99	62.798	Heterocephalus_glaber_male
ENSAMXG00000032539	xpo6	100	72.372	ENSHGLG00100003673	-	99	72.372	Heterocephalus_glaber_male
ENSAMXG00000032539	xpo6	100	76.256	ENSHCOG00000004987	xpo6	100	76.343	Hippocampus_comes
ENSAMXG00000032539	xpo6	100	94.331	ENSIPUG00000006516	xpo6	100	94.331	Ictalurus_punctatus
ENSAMXG00000032539	xpo6	100	72.513	ENSSTOG00000012161	XPO6	100	72.513	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAMXG00000032539	xpo6	100	72.251	ENSJJAG00000019392	Xpo6	100	72.251	Jaculus_jaculus
ENSAMXG00000032539	xpo6	100	77.210	ENSKMAG00000010403	xpo6	100	77.210	Kryptolebias_marmoratus
ENSAMXG00000032539	xpo6	100	77.355	ENSLBEG00000023039	xpo6	100	77.355	Labrus_bergylta
ENSAMXG00000032539	xpo6	100	72.140	ENSLACG00000017930	XPO6	100	72.140	Latimeria_chalumnae
ENSAMXG00000032539	xpo6	94	76.809	ENSLOCG00000003304	xpo6	100	76.809	Lepisosteus_oculatus
ENSAMXG00000032539	xpo6	99	71.728	ENSLAFG00000011960	XPO6	100	71.728	Loxodonta_africana
ENSAMXG00000032539	xpo6	100	72.624	ENSMFAG00000045067	XPO6	100	72.624	Macaca_fascicularis
ENSAMXG00000032539	xpo6	100	72.624	ENSMMUG00000018623	XPO6	100	72.624	Macaca_mulatta
ENSAMXG00000032539	xpo6	100	72.624	ENSMNEG00000028587	XPO6	100	72.624	Macaca_nemestrina
ENSAMXG00000032539	xpo6	100	72.624	ENSMLEG00000029685	XPO6	100	72.624	Mandrillus_leucophaeus
ENSAMXG00000032539	xpo6	100	76.750	ENSMAMG00000001351	xpo6	100	77.010	Mastacembelus_armatus
ENSAMXG00000032539	xpo6	100	76.664	ENSMZEG00005010620	xpo6	100	76.664	Maylandia_zebra
ENSAMXG00000032539	xpo6	97	72.118	ENSMGAG00000009566	XPO6	100	72.182	Meleagris_gallopavo
ENSAMXG00000032539	xpo6	99	65.256	ENSMAUG00000012539	Xpo6	100	64.462	Mesocricetus_auratus
ENSAMXG00000032539	xpo6	100	72.624	ENSMICG00000001923	XPO6	100	72.624	Microcebus_murinus
ENSAMXG00000032539	xpo6	100	72.435	ENSMOCG00000008015	Xpo6	100	72.435	Microtus_ochrogaster
ENSAMXG00000032539	xpo6	100	77.459	ENSMMOG00000011992	xpo6	100	77.459	Mola_mola
ENSAMXG00000032539	xpo6	100	73.037	ENSMODG00000015516	XPO6	100	73.037	Monodelphis_domestica
ENSAMXG00000032539	xpo6	99	68.848	ENSMALG00000020612	xpo6	99	69.895	Monopterus_albus
ENSAMXG00000032539	xpo6	100	72.324	MGP_CAROLIEiJ_G0030439	Xpo6	100	72.324	Mus_caroli
ENSAMXG00000032539	xpo6	100	72.324	ENSMUSG00000000131	Xpo6	100	72.324	Mus_musculus
ENSAMXG00000032539	xpo6	100	72.324	MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	100	72.324	Mus_pahari
ENSAMXG00000032539	xpo6	100	72.498	MGP_SPRETEiJ_G0031553	Xpo6	100	72.498	Mus_spretus
ENSAMXG00000032539	xpo6	99	72.339	ENSMPUG00000012920	XPO6	98	72.339	Mustela_putorius_furo
ENSAMXG00000032539	xpo6	99	72.038	ENSMLUG00000012970	XPO6	100	72.038	Myotis_lucifugus
ENSAMXG00000032539	xpo6	99	72.561	ENSNGAG00000012740	Xpo6	99	72.561	Nannospalax_galili
ENSAMXG00000032539	xpo6	100	76.837	ENSNBRG00000007275	xpo6	100	76.837	Neolamprologus_brichardi
ENSAMXG00000032539	xpo6	100	72.624	ENSNLEG00000011518	XPO6	100	72.624	Nomascus_leucogenys
ENSAMXG00000032539	xpo6	82	74.658	ENSOPRG00000009278	XPO6	82	74.658	Ochotona_princeps
ENSAMXG00000032539	xpo6	100	72.474	ENSODEG00000012917	XPO6	100	72.474	Octodon_degus
ENSAMXG00000032539	xpo6	100	76.664	ENSONIG00000019366	xpo6	100	76.664	Oreochromis_niloticus
ENSAMXG00000032539	xpo6	99	72.561	ENSOCUG00000002727	XPO6	100	72.561	Oryctolagus_cuniculus
ENSAMXG00000032539	xpo6	100	75.931	ENSORLG00000011231	xpo6	100	75.931	Oryzias_latipes
ENSAMXG00000032539	xpo6	100	76.104	ENSORLG00020000386	xpo6	100	76.104	Oryzias_latipes_hni
ENSAMXG00000032539	xpo6	100	76.190	ENSORLG00015003636	xpo6	100	76.190	Oryzias_latipes_hsok
ENSAMXG00000032539	xpo6	100	76.190	ENSOMEG00000016505	xpo6	100	76.190	Oryzias_melastigma
ENSAMXG00000032539	xpo6	99	72.751	ENSOGAG00000012844	XPO6	100	72.751	Otolemur_garnettii
ENSAMXG00000032539	xpo6	99	72.600	ENSOARG00000000960	XPO6	100	72.600	Ovis_aries
ENSAMXG00000032539	xpo6	100	72.537	ENSPPAG00000033668	XPO6	100	72.537	Pan_paniscus
ENSAMXG00000032539	xpo6	99	72.198	ENSPPRG00000001454	XPO6	100	72.198	Panthera_pardus
ENSAMXG00000032539	xpo6	97	71.841	ENSPTIG00000016663	XPO6	99	71.841	Panthera_tigris_altaica
ENSAMXG00000032539	xpo6	100	72.537	ENSPTRG00000007919	XPO6	100	72.537	Pan_troglodytes
ENSAMXG00000032539	xpo6	100	72.624	ENSPANG00000017103	XPO6	100	72.624	Papio_anubis
ENSAMXG00000032539	xpo6	100	76.228	ENSPKIG00000022550	xpo6	100	76.108	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAMXG00000032539	xpo6	99	71.429	ENSPSIG00000018225	XPO6	100	71.429	Pelodiscus_sinensis
ENSAMXG00000032539	xpo6	99	75.616	ENSPMGG00000014436	xpo6	100	75.616	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSAMXG00000032539	xpo6	100	72.609	ENSPEMG00000012100	Xpo6	100	72.609	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAMXG00000032539	xpo6	99	66.696	ENSPMAG00000003127	xpo6	99	66.696	Petromyzon_marinus
ENSAMXG00000032539	xpo6	97	72.597	ENSPCIG00000003863	XPO6	100	72.284	Phascolarctos_cinereus
ENSAMXG00000032539	xpo6	100	77.524	ENSPFOG00000008763	xpo6	100	77.524	Poecilia_formosa
ENSAMXG00000032539	xpo6	100	76.690	ENSPLAG00000014054	xpo6	100	76.690	Poecilia_latipinna
ENSAMXG00000032539	xpo6	100	76.690	ENSPMEG00000018994	xpo6	100	76.690	Poecilia_mexicana
ENSAMXG00000032539	xpo6	97	76.313	ENSPREG00000016421	xpo6	96	76.313	Poecilia_reticulata
ENSAMXG00000032539	xpo6	100	72.624	ENSPPYG00000007218	XPO6	100	72.624	Pongo_abelii
ENSAMXG00000032539	xpo6	90	74.419	ENSPCAG00000008918	XPO6	90	74.419	Procavia_capensis
ENSAMXG00000032539	xpo6	100	72.775	ENSPCOG00000017886	XPO6	100	72.775	Propithecus_coquereli
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