EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAMXG00000033551 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astyanax_mexicanus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 2502 bases
Position: chr18:18788596-18791097
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAMXP00000031303	RVT_1	PF00078.27	2.3e-44	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAMXT00000041016	-	2502	-	ENSAMXP00000031303	833 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSAMXG00000033551	-	69	46.141	ENSAMXG00000033627	-	83	46.141
ENSAMXG00000033551	-	69	36.519	ENSAMXG00000041363	-	99	37.162
ENSAMXG00000033551	-	52	50.893	ENSAMXG00000043139	-	87	50.108
ENSAMXG00000033551	-	98	39.760	ENSAMXG00000037852	-	77	39.760
ENSAMXG00000033551	-	52	38.964	ENSAMXG00000035505	-	92	38.964
ENSAMXG00000033551	-	96	42.439	ENSAMXG00000036981	-	97	42.439
ENSAMXG00000033551	-	52	51.116	ENSAMXG00000029030	-	79	51.116
ENSAMXG00000033551	-	96	41.565	ENSAMXG00000040782	-	88	41.565
ENSAMXG00000033551	-	97	34.554	ENSAMXG00000036646	-	91	35.165
ENSAMXG00000033551	-	57	45.621	ENSAMXG00000035603	-	81	45.935
ENSAMXG00000033551	-	84	49.929	ENSAMXG00000039914	-	86	49.929
ENSAMXG00000033551	-	96	42.387	ENSAMXG00000029285	-	88	42.387
ENSAMXG00000033551	-	77	98.594	ENSAMXG00000043096	-	85	98.594
ENSAMXG00000033551	-	81	31.930	ENSAMXG00000033415	-	92	32.656
ENSAMXG00000033551	-	53	38.839	ENSAMXG00000035634	-	94	38.839
ENSAMXG00000033551	-	64	48.327	ENSAMXG00000040860	-	96	48.327
ENSAMXG00000033551	-	59	48.031	ENSAMXG00000033549	-	81	48.031
ENSAMXG00000033551	-	83	49.432	ENSAMXG00000043574	-	85	49.432
ENSAMXG00000033551	-	66	51.163	ENSAMXG00000041791	-	83	51.163
ENSAMXG00000033551	-	52	50.224	ENSAMXG00000033666	-	79	50.224
ENSAMXG00000033551	-	52	49.776	ENSAMXG00000037500	-	83	49.776
ENSAMXG00000033551	-	55	38.675	ENSAMXG00000037974	-	92	37.323
ENSAMXG00000033551	-	68	47.766	ENSAMXG00000030235	-	92	47.766
ENSAMXG00000033551	-	96	42.022	ENSAMXG00000040632	-	88	42.022
ENSAMXG00000033551	-	52	50.893	ENSAMXG00000037727	-	77	50.893
ENSAMXG00000033551	-	52	52.679	ENSAMXG00000031289	-	79	52.679
ENSAMXG00000033551	-	97	34.149	ENSAMXG00000040053	-	83	34.272
ENSAMXG00000033551	-	85	42.521	ENSAMXG00000034383	-	94	42.521
ENSAMXG00000033551	-	65	52.995	ENSAMXG00000032588	-	83	52.995
ENSAMXG00000033551	-	72	37.785	ENSAMXG00000030246	-	84	37.763

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAMXG00000033551	-	60	46.414	ENSATEG00000015490	-	81	46.414	Anabas_testudineus
ENSAMXG00000033551	-	89	43.029	ENSATEG00000010674	-	86	43.029	Anabas_testudineus
ENSAMXG00000033551	-	99	33.694	ENSATEG00000012907	-	84	33.815	Anabas_testudineus
ENSAMXG00000033551	-	89	34.707	ENSATEG00000005707	-	91	34.840	Anabas_testudineus
ENSAMXG00000033551	-	69	38.128	ENSATEG00000023197	-	89	38.302	Anabas_testudineus
ENSAMXG00000033551	-	60	46.813	ENSATEG00000002739	-	81	46.813	Anabas_testudineus
ENSAMXG00000033551	-	89	43.029	ENSATEG00000019512	-	86	43.029	Anabas_testudineus
ENSAMXG00000033551	-	54	43.778	ENSATEG00000004798	-	79	43.640	Anabas_testudineus
ENSAMXG00000033551	-	54	46.102	ENSACLG00000012447	-	97	46.667	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000033551	-	66	49.009	ENSACLG00000005212	-	83	49.009	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000033551	-	73	45.514	ENSACLG00000012279	-	99	45.514	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000033551	-	72	43.709	ENSACLG00000013061	-	83	43.709	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000033551	-	98	41.241	ENSACLG00000003857	-	73	41.241	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000033551	-	56	43.469	ENSACLG00000008218	-	100	43.469	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000033551	-	98	40.537	ENSACLG00000009939	-	82	40.537	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000033551	-	98	40.245	ENSACLG00000017412	-	87	40.245	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000033551	-	92	42.578	ENSACLG00000019519	-	93	42.578	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000033551	-	50	52.758	ENSACLG00000022853	-	78	52.758	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000033551	-	66	49.192	ENSACLG00000014915	-	85	49.192	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000033551	-	65	50.000	ENSACLG00000014911	-	83	50.000	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000033551	-	65	45.656	ENSACLG00000005570	-	84	45.656	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000033551	-	93	42.912	ENSACLG00000015331	-	98	42.912	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000033551	-	53	50.448	ENSACLG00000006327	-	86	50.448	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000033551	-	77	42.857	ENSACLG00000019194	-	85	42.857	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000033551	-	71	50.842	ENSACLG00000013805	-	71	50.842	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000033551	-	95	46.675	ENSACLG00000015650	-	88	46.675	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000033551	-	95	46.675	ENSACLG00000022844	-	88	46.675	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000033551	-	65	49.362	ENSACLG00000022841	-	70	49.362	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000033551	-	72	43.543	ENSACLG00000017692	-	83	43.543	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000033551	-	63	49.430	ENSACLG00000023557	-	82	49.430	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000033551	-	66	48.833	ENSACLG00000001758	-	83	48.833	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000033551	-	66	49.101	ENSACLG00000000536	-	83	49.101	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000033551	-	59	44.130	ENSACLG00000012352	-	99	44.130	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000033551	-	95	46.424	ENSACLG00000000393	-	88	46.424	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000033551	-	95	46.550	ENSACLG00000000395	-	91	46.550	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000033551	-	58	46.247	ENSACLG00000022169	-	82	46.247	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000033551	-	64	48.972	ENSACLG00000015507	-	98	48.972	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000033551	-	95	46.424	ENSACLG00000025119	-	88	46.424	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000033551	-	53	50.000	ENSACLG00000000182	-	80	50.000	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000033551	-	87	41.379	ENSACLG00000009590	-	86	41.379	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000033551	-	88	46.640	ENSACLG00000013844	-	96	46.640	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000033551	-	55	49.892	ENSACLG00000001556	-	98	49.892	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000033551	-	85	45.927	ENSACLG00000017448	-	86	45.927	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000033551	-	53	46.847	ENSACLG00000010082	-	79	46.847	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000033551	-	66	49.192	ENSACLG00000020183	-	83	49.192	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000033551	-	60	41.270	ENSACLG00000008832	-	100	41.502	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000033551	-	66	49.192	ENSACLG00000001405	-	83	49.192	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000033551	-	50	46.988	ENSACLG00000018107	-	75	46.988	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000033551	-	76	41.784	ENSACLG00000020248	-	85	41.784	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000033551	-	64	48.972	ENSACLG00000009903	-	94	48.972	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000033551	-	50	45.154	ENSACLG00000004754	-	99	46.190	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000033551	-	95	46.550	ENSACLG00000025376	-	88	46.550	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000033551	-	58	46.045	ENSACLG00000015659	-	82	46.045	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000033551	-	87	40.110	ENSACLG00000021051	-	86	40.110	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000033551	-	88	46.972	ENSACLG00000009850	-	84	46.972	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000033551	-	59	44.064	ENSACLG00000014642	-	82	44.064	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000033551	-	67	45.230	ENSACLG00000005017	-	82	45.230	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000033551	-	95	46.550	ENSACLG00000010900	-	88	46.550	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000033551	-	73	41.368	ENSACLG00000009807	-	84	42.062	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000033551	-	67	44.386	ENSACLG00000018945	-	96	44.386	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000033551	-	66	48.833	ENSACLG00000008571	-	83	48.833	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000033551	-	95	46.599	ENSACLG00000005662	-	88	46.599	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000033551	-	95	46.675	ENSACLG00000012014	-	88	46.675	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000033551	-	77	41.975	ENSACLG00000012019	-	85	41.975	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000033551	-	53	50.000	ENSACLG00000021814	-	80	50.000	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000033551	-	95	46.550	ENSACLG00000015667	-	88	46.550	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000033551	-	52	38.161	ENSACLG00000007654	-	94	38.161	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000033551	-	93	41.003	ENSACLG00000000734	-	88	41.003	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000033551	-	99	47.045	ENSACLG00000008383	-	99	47.045	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000033551	-	92	46.373	ENSACLG00000018252	-	98	46.373	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000033551	-	98	40.268	ENSACLG00000027511	-	72	40.268	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000033551	-	99	41.496	ENSACLG00000007643	-	77	41.496	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000033551	-	67	45.230	ENSACLG00000014413	-	82	45.230	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000033551	-	59	46.200	ENSFHEG00000008959	-	100	46.200	Fundulus_heteroclitus
ENSAMXG00000033551	-	56	43.777	ENSHBUG00000015916	-	99	43.777	Haplochromis_burtoni
ENSAMXG00000033551	-	69	40.995	ENSHBUG00000016298	-	98	40.995	Haplochromis_burtoni
ENSAMXG00000033551	-	50	44.952	ENSIPUG00000024068	-	76	44.952	Ictalurus_punctatus
ENSAMXG00000033551	-	64	37.009	ENSIPUG00000009483	-	99	37.803	Ictalurus_punctatus
ENSAMXG00000033551	-	78	36.571	ENSIPUG00000013060	-	78	37.216	Ictalurus_punctatus
ENSAMXG00000033551	-	57	41.004	ENSKMAG00000009759	-	97	41.004	Kryptolebias_marmoratus
ENSAMXG00000033551	-	56	48.305	ENSLBEG00000008169	-	93	48.305	Labrus_bergylta
ENSAMXG00000033551	-	82	42.587	ENSLBEG00000004554	-	99	42.587	Labrus_bergylta
ENSAMXG00000033551	-	82	45.138	ENSMAMG00000000974	-	92	45.138	Mastacembelus_armatus
ENSAMXG00000033551	-	65	50.364	ENSMAMG00000005648	-	79	50.364	Mastacembelus_armatus
ENSAMXG00000033551	-	66	48.313	ENSMAMG00000009292	-	98	48.468	Mastacembelus_armatus
ENSAMXG00000033551	-	55	49.675	ENSMZEG00005017545	-	98	49.675	Maylandia_zebra
ENSAMXG00000033551	-	66	49.192	ENSMZEG00005006441	-	83	49.192	Maylandia_zebra
ENSAMXG00000033551	-	53	46.532	ENSMZEG00005006571	-	74	46.532	Maylandia_zebra
ENSAMXG00000033551	-	66	49.013	ENSMZEG00005007942	-	83	49.013	Maylandia_zebra
ENSAMXG00000033551	-	53	50.448	ENSMZEG00005005149	-	80	50.448	Maylandia_zebra
ENSAMXG00000033551	-	52	49.541	ENSMZEG00005006125	-	99	49.541	Maylandia_zebra
ENSAMXG00000033551	-	53	50.224	ENSMZEG00005020016	-	80	50.224	Maylandia_zebra
ENSAMXG00000033551	-	92	41.623	ENSMALG00000019721	-	87	41.623	Monopterus_albus
ENSAMXG00000033551	-	53	37.668	ENSMALG00000016841	-	98	37.668	Monopterus_albus
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