EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAMXG00000033969 (Gene tree)
Gene ID: 103028946
Gene Symbol: gemin2
Alias: sip1|wu:fc52a05|zgc:110274
Full Name: gem nuclear organelle associated protein 2
Gene Type: protein_coding
Species: Astyanax_mexicanus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 11623 bases
Position: chrAPWO02000028.1:145003-156625
Accession: 103028946
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAMXP00000028244	SIP1	PF04938.12	1e-75	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAMXT00000042432	-	2496	XM_022664775	ENSAMXP00000028244	260 (aa)	XP_022520496	UPI000BBD951C

Gene Model

Click here to download ENSAMXG00000033969's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
amex03013	RNA transport	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSAMXG00000033969's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	67.308	ENSG00000092208	GEMIN2	92	67.308	Homo_sapiens
ENSAMXG00000033969	gemin2	51	70.149	ENSAPOG00000012870	gemin2	82	70.149	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	66.667	ENSAMEG00000003856	GEMIN2	93	66.667	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAMXG00000033969	gemin2	98	67.969	ENSACIG00000014430	gemin2	94	67.969	Amphilophus_citrinellus
ENSAMXG00000033969	gemin2	100	70.229	ENSAOCG00000012349	gemin2	98	70.229	Amphiprion_ocellaris
ENSAMXG00000033969	gemin2	100	70.385	ENSAPEG00000002529	gemin2	98	70.385	Amphiprion_percula
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	68.966	ENSATEG00000009574	gemin2	98	68.966	Anabas_testudineus
ENSAMXG00000033969	gemin2	88	65.351	ENSAPLG00000012052	GEMIN2	99	65.351	Anas_platyrhynchos
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	62.977	ENSACAG00000015872	GEMIN2	97	62.977	Anolis_carolinensis
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	49.810	ENSANAG00000026213	GEMIN2	95	49.810	Aotus_nancymaae
ENSAMXG00000033969	gemin2	95	66.667	ENSACLG00000024473	gemin2	97	66.667	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	66.538	ENSBTAG00000020930	GEMIN2	92	66.538	Bos_taurus
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	66.154	ENSCJAG00000016248	GEMIN2	92	66.154	Callithrix_jacchus
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	66.923	ENSCAFG00000013859	GEMIN2	96	66.923	Canis_familiaris
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	66.923	ENSCAFG00020022243	GEMIN2	96	66.923	Canis_lupus_dingo
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	66.923	ENSCHIG00000009881	GEMIN2	96	66.923	Capra_hircus
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	66.154	ENSTSYG00000032612	-	98	66.154	Carlito_syrichta
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	67.692	ENSTSYG00000003528	-	92	67.692	Carlito_syrichta
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	61.776	ENSCPOG00000011338	GEMIN2	96	61.776	Cavia_porcellus
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	50.769	ENSCCAG00000030361	-	88	50.769	Cebus_capucinus
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	67.308	ENSCCAG00000035944	GEMIN2	93	67.331	Cebus_capucinus
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	48.077	ENSCATG00000031373	-	90	48.077	Cercocebus_atys
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	67.308	ENSCATG00000042473	GEMIN2	96	67.308	Cercocebus_atys
ENSAMXG00000033969	gemin2	95	66.667	ENSCLAG00000008967	GEMIN2	96	66.667	Chinchilla_lanigera
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	48.846	ENSCSAG00000016872	-	90	48.846	Chlorocebus_sabaeus
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	52.896	ENSCHOG00000011644	GEMIN2	92	52.896	Choloepus_hoffmanni
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	65.399	ENSCPBG00000026207	GEMIN2	98	65.399	Chrysemys_picta_bellii
ENSAMXG00000033969	gemin2	89	33.333	ENSCING00000012240	-	85	33.333	Ciona_intestinalis
ENSAMXG00000033969	gemin2	90	34.657	ENSCSAVG00000009875	-	85	34.657	Ciona_savignyi
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	67.308	ENSCANG00000035266	GEMIN2	92	67.308	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	49.035	ENSCANG00000033060	-	86	49.035	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	67.308	ENSCGRG00001017720	Gemin2	96	67.308	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	67.308	ENSCGRG00000007060	Gemin2	96	67.308	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	64.368	ENSCSEG00000016057	gemin2	98	64.368	Cynoglossus_semilaevis
ENSAMXG00000033969	gemin2	96	66.270	ENSCVAG00000003125	gemin2	98	66.270	Cyprinodon_variegatus
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	85.385	ENSDARG00000015638	gemin2	100	85.214	Danio_rerio
ENSAMXG00000033969	gemin2	74	63.212	ENSDNOG00000018278	GEMIN2	87	63.212	Dasypus_novemcinctus
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	66.923	ENSDORG00000003814	Gemin2	96	66.923	Dipodomys_ordii
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	65.385	ENSETEG00000006463	GEMIN2	92	65.385	Echinops_telfairi
ENSAMXG00000033969	gemin2	73	43.500	ENSEBUG00000002198	gemin2	68	45.070	Eptatretus_burgeri
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	67.692	ENSEASG00005007617	GEMIN2	92	67.692	Equus_asinus_asinus
ENSAMXG00000033969	gemin2	96	67.600	ENSECAG00000007554	GEMIN2	83	67.600	Equus_caballus
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	60.837	ENSEEUG00000008438	GEMIN2	93	60.837	Erinaceus_europaeus
ENSAMXG00000033969	gemin2	100	75.862	ENSELUG00000005266	gemin2	98	75.862	Esox_lucius
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	66.538	ENSFCAG00000029921	GEMIN2	92	66.538	Felis_catus
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	65.251	ENSFALG00000006169	GEMIN2	92	65.251	Ficedula_albicollis
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	66.154	ENSFDAG00000001562	GEMIN2	96	66.154	Fukomys_damarensis
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	67.557	ENSFHEG00000020705	gemin2	98	67.557	Fundulus_heteroclitus
ENSAMXG00000033969	gemin2	88	66.524	ENSGMOG00000009379	gemin2	98	66.524	Gadus_morhua
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	65.251	ENSGALG00000010154	GEMIN2	98	65.251	Gallus_gallus
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	62.121	ENSGAFG00000019641	gemin2	98	62.121	Gambusia_affinis
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	65.637	ENSGACG00000012444	gemin2	97	65.637	Gasterosteus_aculeatus
ENSAMXG00000033969	gemin2	88	65.385	ENSGAGG00000003982	GEMIN2	97	65.385	Gopherus_agassizii
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	57.692	ENSGGOG00000016691	GEMIN2	91	57.692	Gorilla_gorilla
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	48.462	ENSGGOG00000043428	-	76	48.462	Gorilla_gorilla
ENSAMXG00000033969	gemin2	100	70.611	ENSHBUG00000016285	gemin2	98	70.611	Haplochromis_burtoni
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	67.433	ENSHGLG00000004890	GEMIN2	96	67.433	Heterocephalus_glaber_female
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	67.433	ENSHGLG00100009949	GEMIN2	96	67.433	Heterocephalus_glaber_male
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	68.582	ENSHCOG00000012786	gemin2	98	68.582	Hippocampus_comes
ENSAMXG00000033969	gemin2	98	83.268	ENSIPUG00000012821	gemin2	100	83.268	Ictalurus_punctatus
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	68.077	ENSSTOG00000006357	GEMIN2	96	68.077	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	66.923	ENSJJAG00000022975	Gemin2	96	66.923	Jaculus_jaculus
ENSAMXG00000033969	gemin2	100	67.557	ENSKMAG00000007880	gemin2	98	67.557	Kryptolebias_marmoratus
ENSAMXG00000033969	gemin2	95	60.484	ENSLBEG00000022377	gemin2	98	60.484	Labrus_bergylta
ENSAMXG00000033969	gemin2	100	69.202	ENSLACG00000004723	GEMIN2	98	69.202	Latimeria_chalumnae
ENSAMXG00000033969	gemin2	100	68.061	ENSLOCG00000009221	gemin2	98	68.061	Lepisosteus_oculatus
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	67.692	ENSLAFG00000010321	GEMIN2	96	67.692	Loxodonta_africana
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	67.308	ENSMFAG00000014362	GEMIN2	92	67.308	Macaca_fascicularis
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	48.077	ENSMFAG00000003283	-	88	48.077	Macaca_fascicularis
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	49.231	ENSMMUG00000001073	-	86	49.231	Macaca_mulatta
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	67.308	ENSMMUG00000021028	GEMIN2	96	67.308	Macaca_mulatta
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	67.308	ENSMNEG00000033286	GEMIN2	96	67.308	Macaca_nemestrina
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	49.615	ENSMNEG00000033555	-	88	49.615	Macaca_nemestrina
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	47.308	ENSMLEG00000008946	-	88	47.308	Mandrillus_leucophaeus
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	67.308	ENSMLEG00000035575	GEMIN2	93	67.308	Mandrillus_leucophaeus
ENSAMXG00000033969	gemin2	96	68.800	ENSMAMG00000012985	gemin2	98	68.800	Mastacembelus_armatus
ENSAMXG00000033969	gemin2	100	69.847	ENSMZEG00005007915	gemin2	98	69.847	Maylandia_zebra
ENSAMXG00000033969	gemin2	88	66.228	ENSMGAG00000012566	GEMIN2	99	66.228	Meleagris_gallopavo
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	67.308	ENSMAUG00000017447	Gemin2	96	67.308	Mesocricetus_auratus
ENSAMXG00000033969	gemin2	97	67.323	ENSMICG00000004811	-	89	67.323	Microcebus_murinus
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	53.462	ENSMICG00000043979	-	95	53.462	Microcebus_murinus
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	67.816	ENSMOCG00000023031	Gemin2	96	67.816	Microtus_ochrogaster
ENSAMXG00000033969	gemin2	95	66.265	ENSMMOG00000004604	gemin2	99	61.868	Mola_mola
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	65.385	ENSMODG00000011946	GEMIN2	98	65.385	Monodelphis_domestica
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	68.582	ENSMALG00000021507	gemin2	98	68.582	Monopterus_albus
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	67.308	MGP_CAROLIEiJ_G0017777	Gemin2	96	67.308	Mus_caroli
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	67.308	ENSMUSG00000060121	Gemin2	96	67.308	Mus_musculus
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	67.308	MGP_PahariEiJ_G0029533	Gemin2	96	67.308	Mus_pahari
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	66.923	MGP_SPRETEiJ_G0018622	Gemin2	96	66.923	Mus_spretus
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	66.923	ENSMPUG00000016240	GEMIN2	96	66.923	Mustela_putorius_furo
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	64.865	ENSMLUG00000002619	GEMIN2	97	64.865	Myotis_lucifugus
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	66.923	ENSNGAG00000001053	Gemin2	96	66.923	Nannospalax_galili
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	67.308	ENSNLEG00000004013	GEMIN2	95	67.308	Nomascus_leucogenys
ENSAMXG00000033969	gemin2	95	61.847	ENSMEUG00000011734	-	90	61.847	Notamacropus_eugenii
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	60.385	ENSOPRG00000007714	GEMIN2	92	60.385	Ochotona_princeps
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	66.923	ENSODEG00000000272	GEMIN2	96	66.923	Octodon_degus
ENSAMXG00000033969	gemin2	100	70.992	ENSONIG00000019495	gemin2	98	70.992	Oreochromis_niloticus
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	65.385	ENSOANG00000014013	-	94	65.385	Ornithorhynchus_anatinus
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	65.000	ENSOCUG00000000673	GEMIN2	92	65.000	Oryctolagus_cuniculus
ENSAMXG00000033969	gemin2	100	63.077	ENSORLG00000017666	gemin2	98	63.077	Oryzias_latipes
ENSAMXG00000033969	gemin2	100	65.649	ENSORLG00020016613	gemin2	98	65.649	Oryzias_latipes_hni
ENSAMXG00000033969	gemin2	100	66.031	ENSORLG00015013224	gemin2	98	66.031	Oryzias_latipes_hsok
ENSAMXG00000033969	gemin2	100	66.923	ENSOMEG00000011576	gemin2	98	66.923	Oryzias_melastigma
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	66.538	ENSOGAG00000007906	GEMIN2	92	66.538	Otolemur_garnettii
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	66.667	ENSOARG00000008466	GEMIN2	92	66.667	Ovis_aries
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	49.231	ENSPPAG00000033797	-	77	56.410	Pan_paniscus
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	61.594	ENSPPAG00000043467	GEMIN2	93	61.594	Pan_paniscus
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	66.538	ENSPPRG00000009485	GEMIN2	92	66.538	Panthera_pardus
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	66.538	ENSPTIG00000018115	GEMIN2	96	66.538	Panthera_tigris_altaica
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	49.231	ENSPTRG00000045455	-	76	49.231	Pan_troglodytes
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	67.308	ENSPTRG00000006291	GEMIN2	92	67.308	Pan_troglodytes
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	55.985	ENSPANG00000011343	-	94	55.985	Papio_anubis
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	48.077	ENSPANG00000034146	-	88	48.077	Papio_anubis
ENSAMXG00000033969	gemin2	100	70.115	ENSPKIG00000010339	gemin2	98	70.115	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	65.649	ENSPSIG00000013560	GEMIN2	86	65.649	Pelodiscus_sinensis
ENSAMXG00000033969	gemin2	98	67.181	ENSPMGG00000008763	gemin2	98	67.181	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	67.308	ENSPEMG00000008079	Gemin2	96	67.308	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAMXG00000033969	gemin2	86	50.407	ENSPMAG00000009804	gemin2	91	51.037	Petromyzon_marinus
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	66.154	ENSPCIG00000025754	GEMIN2	78	66.154	Phascolarctos_cinereus
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	67.300	ENSPFOG00000014660	gemin2	98	67.300	Poecilia_formosa
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	67.557	ENSPLAG00000020265	gemin2	98	67.557	Poecilia_latipinna
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	67.176	ENSPMEG00000011134	gemin2	98	67.176	Poecilia_mexicana
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	63.118	ENSPREG00000007692	gemin2	98	63.118	Poecilia_reticulata
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	67.308	ENSPPYG00000005764	GEMIN2	92	67.308	Pongo_abelii
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	59.615	ENSPCAG00000005387	GEMIN2	92	59.615	Procavia_capensis
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	62.692	ENSPCOG00000016964	GEMIN2	92	62.692	Propithecus_coquereli
ENSAMXG00000033969	gemin2	95	66.265	ENSPVAG00000002586	GEMIN2	94	66.265	Pteropus_vampyrus
ENSAMXG00000033969	gemin2	100	70.229	ENSPNYG00000022626	gemin2	98	70.229	Pundamilia_nyererei
ENSAMXG00000033969	gemin2	100	86.641	ENSPNAG00000017346	gemin2	98	86.641	Pygocentrus_nattereri
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	67.692	ENSRNOG00000004360	Gemin2	96	67.692	Rattus_norvegicus
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	67.308	ENSRBIG00000034601	GEMIN2	96	67.308	Rhinopithecus_bieti
ENSAMXG00000033969	gemin2	95	45.783	ENSRBIG00000038026	-	71	59.829	Rhinopithecus_bieti
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	67.308	ENSRROG00000042627	GEMIN2	92	67.308	Rhinopithecus_roxellana
ENSAMXG00000033969	gemin2	96	67.331	ENSSBOG00000022280	GEMIN2	96	67.331	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSAMXG00000033969	gemin2	58	62.745	ENSSHAG00000000156	-	93	62.745	Sarcophilus_harrisii
ENSAMXG00000033969	gemin2	100	73.563	ENSSFOG00015012315	gemin2	98	73.563	Scleropages_formosus
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	68.966	ENSSMAG00000011151	gemin2	98	68.966	Scophthalmus_maximus
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	71.042	ENSSDUG00000017275	gemin2	98	71.042	Seriola_dumerili
ENSAMXG00000033969	gemin2	97	70.120	ENSSLDG00000023429	gemin2	97	70.120	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSAMXG00000033969	gemin2	95	66.667	ENSSARG00000010294	GEMIN2	92	66.667	Sorex_araneus
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	60.769	ENSSPUG00000017222	GEMIN2	98	60.769	Sphenodon_punctatus
ENSAMXG00000033969	gemin2	100	69.847	ENSSPAG00000001354	gemin2	98	69.847	Stegastes_partitus
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	67.424	ENSSSCG00000004985	GEMIN2	92	67.424	Sus_scrofa
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	64.865	ENSTGUG00000012039	GEMIN2	98	64.865	Taeniopygia_guttata
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	66.667	ENSTRUG00000021760	gemin2	96	66.667	Takifugu_rubripes
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	65.900	ENSTNIG00000016875	gemin2	98	65.900	Tetraodon_nigroviridis
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	68.077	ENSTBEG00000002654	GEMIN2	92	68.077	Tupaia_belangeri
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	57.308	ENSTTRG00000017126	GEMIN2	92	57.308	Tursiops_truncatus
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	66.154	ENSUAMG00000021811	GEMIN2	96	66.154	Ursus_americanus
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	66.538	ENSUMAG00000008366	GEMIN2	96	66.538	Ursus_maritimus
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	67.692	ENSVPAG00000006856	GEMIN2	92	67.692	Vicugna_pacos
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	66.923	ENSVVUG00000020954	GEMIN2	92	66.923	Vulpes_vulpes
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	66.795	ENSXETG00000000298	gemin2	94	66.795	Xenopus_tropicalis
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	63.878	ENSXCOG00000014021	gemin2	98	63.878	Xiphophorus_couchianus
ENSAMXG00000033969	gemin2	99	63.359	ENSXMAG00000009532	gemin2	98	63.359	Xiphophorus_maculatus