EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAMXG00000034266 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: ptrhd1
Alias: si:dkey-34f16.5
Full Name: peptidyl-tRNA hydrolase domain containing 1
Gene Type: protein_coding
Species: Astyanax_mexicanus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 1508 bases
Position: chrAPWO02000120.1:1279014-1280521
Accession: 111191367
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAMXP00000050969	PTH2	PF01981.16	4.3e-24	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAMXT00000036228	-	460	XM_022666174	ENSAMXP00000050969	144 (aa)	XP_022521895	-

Gene Model

Click here to download ENSAMXG00000034266's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSAMXG00000034266's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	96	55.396	ENSG00000184924	PTRHD1	89	58.871	Homo_sapiens
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	88	76.378	ENSAPOG00000024433	ptrhd1	100	76.378	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	96	53.957	ENSAMEG00000002651	PTRHD1	89	57.258	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	88	75.591	ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	75.591	Amphilophus_citrinellus
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	88	76.378	ENSAOCG00000007632	ptrhd1	100	76.378	Amphiprion_ocellaris
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	88	76.378	ENSAPEG00000011491	ptrhd1	100	76.378	Amphiprion_percula
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	88	77.165	ENSATEG00000019199	ptrhd1	100	77.165	Anabas_testudineus
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	96	55.396	ENSANAG00000019089	PTRHD1	89	58.871	Aotus_nancymaae
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	88	76.378	ENSACLG00000000814	ptrhd1	100	76.378	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	96	58.993	ENSBTAG00000015012	PTRHD1	89	62.097	Bos_taurus
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	78	46.903	WBGene00050885	Y94H6A.12	100	43.548	Caenorhabditis_elegans
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	96	54.676	ENSCJAG00000008012	PTRHD1	89	58.065	Callithrix_jacchus
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	96	54.676	ENSCAFG00000024865	PTRHD1	89	58.065	Canis_familiaris
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	96	58.993	ENSCHIG00000014757	PTRHD1	89	62.097	Capra_hircus
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	96	53.957	ENSTSYG00000009995	PTRHD1	87	58.197	Carlito_syrichta
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	94	56.934	ENSCPOG00000005561	PTRHD1	90	60.156	Cavia_porcellus
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	90	58.462	ENSCCAG00000033856	PTRHD1	89	58.871	Cebus_capucinus
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	96	55.797	ENSCATG00000033690	PTRHD1	88	59.350	Cercocebus_atys
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	90	59.231	ENSCLAG00000006505	PTRHD1	86	59.677	Chinchilla_lanigera
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	96	55.396	ENSCSAG00000008490	PTRHD1	89	58.871	Chlorocebus_sabaeus
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	85	49.180	ENSCHOG00000001920	PTRHD1	89	49.180	Choloepus_hoffmanni
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	95	53.957	ENSCPBG00000022276	PTRHD1	90	56.250	Chrysemys_picta_bellii
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	80	60.000	ENSCING00000019647	-	97	60.000	Ciona_intestinalis
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	98	55.634	ENSCANG00000034444	PTRHD1	89	58.871	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	85	58.871	ENSCGRG00001003289	Ptrhd1	59	58.871	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	85	58.871	ENSCGRG00000011834	Ptrhd1	89	58.871	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	88	77.344	ENSCSEG00000006943	ptrhd1	100	77.344	Cynoglossus_semilaevis
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	88	77.953	ENSCVAG00000016345	ptrhd1	100	77.953	Cyprinodon_variegatus
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	88	85.039	ENSDARG00000016122	ptrhd1	100	85.039	Danio_rerio
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	85	56.452	ENSDNOG00000043646	PTRHD1	82	56.452	Dasypus_novemcinctus
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	85	59.350	ENSDORG00000026776	Ptrhd1	89	58.871	Dipodomys_ordii
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	80	63.478	FBgn0038446	CG14903	97	63.478	Drosophila_melanogaster
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	57	49.398	ENSETEG00000001615	-	83	52.778	Echinops_telfairi
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	80	49.565	ENSETEG00000009379	-	85	49.565	Echinops_telfairi
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	80	58.261	ENSEBUG00000002249	ptrhd1	95	58.261	Eptatretus_burgeri
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	89	39.535	ENSEASG00005001302	-	88	40.323	Equus_asinus_asinus
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	90	58.015	ENSECAG00000017730	PTRHD1	89	58.871	Equus_caballus
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	85	40.323	ENSECAG00000005314	-	85	40.323	Equus_caballus
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	96	50.360	ENSEEUG00000004263	PTRHD1	88	52.419	Erinaceus_europaeus
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	88	77.953	ENSELUG00000003837	ptrhd1	100	77.953	Esox_lucius
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	90	55.725	ENSFCAG00000003648	PTRHD1	89	56.452	Felis_catus
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	94	56.204	ENSFDAG00000004017	PTRHD1	89	58.871	Fukomys_damarensis
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	88	77.165	ENSFHEG00000009135	ptrhd1	100	77.165	Fundulus_heteroclitus
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	80	55.652	ENSGALG00000016610	PTRHD1	93	53.846	Gallus_gallus
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	88	78.740	ENSGAFG00000005717	ptrhd1	100	78.740	Gambusia_affinis
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	88	74.803	ENSGACG00000006743	ptrhd1	100	74.803	Gasterosteus_aculeatus
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	88	58.594	ENSGAGG00000023951	PTRHD1	100	58.594	Gopherus_agassizii
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	85	58.065	ENSGGOG00000043870	PTRHD1	98	58.065	Gorilla_gorilla
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	88	76.378	ENSHBUG00000014289	ptrhd1	100	76.378	Haplochromis_burtoni
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	90	56.923	ENSHGLG00000008203	PTRHD1	89	56.452	Heterocephalus_glaber_female
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	90	57.692	ENSHGLG00100012553	PTRHD1	89	57.258	Heterocephalus_glaber_male
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	95	52.899	ENSHGLG00100004341	-	91	54.839	Heterocephalus_glaber_male
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	88	75.591	ENSHCOG00000013504	ptrhd1	100	75.591	Hippocampus_comes
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	80	81.739	ENSIPUG00000004885	ptrhd1	97	81.739	Ictalurus_punctatus
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	96	55.396	ENSSTOG00000006030	PTRHD1	89	59.677	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	90	58.462	ENSJJAG00000024180	Ptrhd1	91	59.375	Jaculus_jaculus
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	78	78.571	ENSKMAG00000016961	ptrhd1	99	78.571	Kryptolebias_marmoratus
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	88	77.953	ENSLBEG00000024406	ptrhd1	100	77.953	Labrus_bergylta
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	81	68.966	ENSLACG00000018052	PTRHD1	100	67.717	Latimeria_chalumnae
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	88	78.906	ENSLOCG00000015890	ptrhd1	100	78.906	Lepisosteus_oculatus
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	96	53.957	ENSLAFG00000014453	PTRHD1	89	56.452	Loxodonta_africana
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	96	54.676	ENSMFAG00000040267	PTRHD1	89	58.065	Macaca_fascicularis
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	96	54.676	ENSMMUG00000009598	PTRHD1	89	58.065	Macaca_mulatta
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	96	54.676	ENSMNEG00000035044	PTRHD1	89	58.065	Macaca_nemestrina
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	96	54.348	ENSMLEG00000030314	PTRHD1	88	57.724	Mandrillus_leucophaeus
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	88	74.803	ENSMAMG00000021201	ptrhd1	100	74.803	Mastacembelus_armatus
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	88	76.378	ENSMZEG00005021808	ptrhd1	100	76.378	Maylandia_zebra
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	85	60.484	ENSMAUG00000019251	Ptrhd1	89	60.484	Mesocricetus_auratus
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	90	57.692	ENSMICG00000001578	PTRHD1	89	58.065	Microcebus_murinus
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	85	58.065	ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	89	58.065	Microtus_ochrogaster
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	88	76.378	ENSMMOG00000015284	ptrhd1	100	76.378	Mola_mola
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	90	53.846	ENSMODG00000015895	PTRHD1	90	54.688	Monodelphis_domestica
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	88	75.591	ENSMALG00000003471	ptrhd1	100	75.591	Monopterus_albus
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	85	59.350	MGP_CAROLIEiJ_G0017582	Ptrhd1	88	59.350	Mus_caroli
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	85	59.350	ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	88	59.350	Mus_musculus
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	85	59.350	MGP_SPRETEiJ_G0018426	Ptrhd1	88	59.350	Mus_spretus
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	96	52.518	ENSMPUG00000014016	PTRHD1	89	56.452	Mustela_putorius_furo
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	90	55.725	ENSMLUG00000014127	PTRHD1	90	57.031	Myotis_lucifugus
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	98	56.338	ENSNGAG00000016335	Ptrhd1	89	58.871	Nannospalax_galili
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	88	76.378	ENSNBRG00000009690	ptrhd1	100	76.378	Neolamprologus_brichardi
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	96	55.396	ENSNLEG00000000990	PTRHD1	89	58.871	Nomascus_leucogenys
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	51	50.000	ENSMEUG00000010482	-	84	51.389	Notamacropus_eugenii
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	90	57.692	ENSOPRG00000008600	PTRHD1	89	58.065	Ochotona_princeps
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	94	55.474	ENSODEG00000007805	PTRHD1	86	58.065	Octodon_degus
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	91	74.809	ENSONIG00000015722	ptrhd1	93	76.378	Oreochromis_niloticus
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	85	56.452	ENSOCUG00000015432	PTRHD1	89	56.452	Oryctolagus_cuniculus
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	80	73.276	ENSORLG00000028768	ptrhd1	98	73.276	Oryzias_latipes
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	80	73.276	ENSORLG00020002857	ptrhd1	98	73.276	Oryzias_latipes_hni
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	80	73.276	ENSORLG00015018271	ptrhd1	99	73.276	Oryzias_latipes_hsok
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	88	67.717	ENSOMEG00000017594	ptrhd1	100	67.717	Oryzias_melastigma
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	96	51.799	ENSOGAG00000000756	PTRHD1	89	54.839	Otolemur_garnettii
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	96	58.993	ENSOARG00000018052	PTRHD1	89	62.097	Ovis_aries
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	96	55.396	ENSPPAG00000035395	PTRHD1	89	58.871	Pan_paniscus
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	90	55.725	ENSPPRG00000022961	PTRHD1	89	56.452	Panthera_pardus
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	90	55.725	ENSPTIG00000012136	PTRHD1	89	56.452	Panthera_tigris_altaica
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	96	55.396	ENSPTRG00000011716	PTRHD1	89	58.871	Pan_troglodytes
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	96	54.676	ENSPANG00000006781	PTRHD1	89	58.065	Papio_anubis
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	89	76.562	ENSPKIG00000015207	ptrhd1	86	76.378	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	80	80.870	ENSPMGG00000020297	ptrhd1	100	78.740	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	72	65.385	ENSPMAG00000007352	ptrhd1	94	63.559	Petromyzon_marinus
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	80	54.310	ENSPCIG00000025242	PTRHD1	92	54.310	Phascolarctos_cinereus
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	95	74.453	ENSPFOG00000004468	ptrhd1	89	78.740	Poecilia_formosa
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	88	78.740	ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	78.740	Poecilia_latipinna
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	88	78.740	ENSPMEG00000001321	ptrhd1	100	78.740	Poecilia_mexicana
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	88	78.740	ENSPREG00000017624	ptrhd1	100	78.740	Poecilia_reticulata
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	90	57.692	ENSPPYG00000012597	PTRHD1	89	58.065	Pongo_abelii
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	96	51.799	ENSPCAG00000007535	PTRHD1	89	54.839	Procavia_capensis
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	90	56.923	ENSPCOG00000003110	PTRHD1	89	57.258	Propithecus_coquereli
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	96	53.957	ENSPVAG00000017514	PTRHD1	90	57.812	Pteropus_vampyrus
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	88	76.378	ENSPNYG00000016755	ptrhd1	100	76.378	Pundamilia_nyererei
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	88	89.764	ENSPNAG00000028214	ptrhd1	100	89.764	Pygocentrus_nattereri
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	85	58.871	ENSRNOG00000004059	Ptrhd1	89	58.871	Rattus_norvegicus
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	90	58.462	ENSRBIG00000032190	PTRHD1	89	58.871	Rhinopithecus_bieti
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	90	58.462	ENSRROG00000029627	PTRHD1	89	58.871	Rhinopithecus_roxellana
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	96	55.396	ENSSBOG00000031751	PTRHD1	89	58.871	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	96	49.640	ENSSHAG00000005774	PTRHD1	75	54.310	Sarcophilus_harrisii
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	82	74.576	ENSSFOG00015000526	ptrhd1	98	73.950	Scleropages_formosus
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	80	78.261	ENSSMAG00000004450	ptrhd1	100	74.803	Scophthalmus_maximus
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	89	78.125	ENSSDUG00000004610	ptrhd1	85	78.740	Seriola_dumerili
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	88	78.740	ENSSLDG00000006231	ptrhd1	100	78.740	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	81	58.974	ENSSPUG00000002905	PTRHD1	95	58.730	Sphenodon_punctatus
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	88	77.165	ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	77.165	Stegastes_partitus
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	81	45.299	ENSSSCG00000040441	-	88	45.299	Sus_scrofa
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	84	55.738	ENSTGUG00000015169	-	89	55.738	Taeniopygia_guttata
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	88	74.803	ENSTRUG00000007201	ptrhd1	100	74.803	Takifugu_rubripes
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	88	76.378	ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	76.378	Tetraodon_nigroviridis
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	90	53.846	ENSTTRG00000015128	PTRHD1	88	54.032	Tursiops_truncatus
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	96	53.957	ENSUAMG00000007305	PTRHD1	89	58.065	Ursus_americanus
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	90	55.725	ENSVPAG00000005556	PTRHD1	89	56.452	Vicugna_pacos
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	79	63.158	ENSXETG00000021176	ptrhd1	89	62.903	Xenopus_tropicalis
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	88	78.740	ENSXCOG00000019083	ptrhd1	100	78.740	Xiphophorus_couchianus
ENSAMXG00000034266	ptrhd1	88	78.740	ENSXMAG00000024458	ptrhd1	100	78.740	Xiphophorus_maculatus