EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAMXG00000035868 (Gene tree)
Gene ID: 103038433
Gene Symbol: twistnb
Alias: -
Full Name: TWIST neighbor
Gene Type: protein_coding
Species: Astyanax_mexicanus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 5738 bases
Position: chrAPWO02000101.1:7295630-7301367
Accession: 103038433
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAMXP00000051982	SHS2_Rpb7-N	PF03876.17	1.9e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAMXT00000047507	-	4056	XM_007260690	ENSAMXP00000051982	330 (aa)	XP_007260752	-

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
amex03020	RNA polymerase	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAMXG00000035868	twistnb	69	49.174	ENSG00000105849	TWISTNB	65	52.055	Homo_sapiens
ENSAMXG00000035868	twistnb	77	53.435	ENSAPOG00000011796	twistnb	60	56.957	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAMXG00000035868	twistnb	57	56.633	ENSAMEG00000008558	TWISTNB	50	56.633	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAMXG00000035868	twistnb	76	52.800	ENSACIG00000020400	twistnb	54	56.716	Amphilophus_citrinellus
ENSAMXG00000035868	twistnb	72	56.485	ENSAOCG00000024200	twistnb	53	60.870	Amphiprion_ocellaris
ENSAMXG00000035868	twistnb	70	57.511	ENSAPEG00000016750	twistnb	53	60.870	Amphiprion_percula
ENSAMXG00000035868	twistnb	69	57.018	ENSATEG00000017956	twistnb	52	63.265	Anabas_testudineus
ENSAMXG00000035868	twistnb	53	56.354	ENSACAG00000011817	TWISTNB	91	56.667	Anolis_carolinensis
ENSAMXG00000035868	twistnb	60	56.061	ENSANAG00000026418	TWISTNB	50	60.714	Aotus_nancymaae
ENSAMXG00000035868	twistnb	65	55.814	ENSACLG00000022280	twistnb	51	55.814	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000035868	twistnb	61	54.412	ENSBTAG00000006721	TWISTNB	58	56.771	Bos_taurus
ENSAMXG00000035868	twistnb	60	55.224	ENSCJAG00000001148	TWISTNB	56	54.974	Callithrix_jacchus
ENSAMXG00000035868	twistnb	55	58.333	ENSCAFG00000002511	TWISTNB	59	53.922	Canis_familiaris
ENSAMXG00000035868	twistnb	55	58.333	ENSCAFG00020002140	TWISTNB	53	56.250	Canis_lupus_dingo
ENSAMXG00000035868	twistnb	61	53.695	ENSCHIG00000024078	TWISTNB	57	56.021	Capra_hircus
ENSAMXG00000035868	twistnb	72	48.837	ENSTSYG00000001471	TWISTNB	64	53.881	Carlito_syrichta
ENSAMXG00000035868	twistnb	57	56.633	ENSCPOG00000031651	TWISTNB	58	56.633	Cavia_porcellus
ENSAMXG00000035868	twistnb	51	60.714	ENSCCAG00000026416	TWISTNB	56	55.497	Cebus_capucinus
ENSAMXG00000035868	twistnb	63	51.869	ENSCATG00000035621	TWISTNB	57	55.497	Cercocebus_atys
ENSAMXG00000035868	twistnb	51	61.905	ENSCLAG00000012696	TWISTNB	57	56.545	Chinchilla_lanigera
ENSAMXG00000035868	twistnb	68	48.305	ENSCSAG00000013544	TWISTNB	65	51.142	Chlorocebus_sabaeus
ENSAMXG00000035868	twistnb	58	58.947	ENSCPBG00000000367	TWISTNB	59	58.947	Chrysemys_picta_bellii
ENSAMXG00000035868	twistnb	69	48.760	ENSCANG00000038759	TWISTNB	65	51.598	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAMXG00000035868	twistnb	61	54.412	ENSCGRG00001000499	Twistnb	88	43.299	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAMXG00000035868	twistnb	77	51.698	ENSCVAG00000014324	twistnb	60	56.579	Cyprinodon_variegatus
ENSAMXG00000035868	twistnb	82	58.088	ENSDARG00000024416	twistnb	62	58.871	Danio_rerio
ENSAMXG00000035868	twistnb	63	52.511	ENSDNOG00000006438	-	65	52.511	Dasypus_novemcinctus
ENSAMXG00000035868	twistnb	58	56.771	ENSDORG00000007795	Twistnb	66	53.738	Dipodomys_ordii
ENSAMXG00000035868	twistnb	63	53.425	ENSEASG00005021702	TWISTNB	62	53.425	Equus_asinus_asinus
ENSAMXG00000035868	twistnb	61	54.067	ENSECAG00000014563	TWISTNB	60	54.067	Equus_caballus
ENSAMXG00000035868	twistnb	67	56.306	ENSELUG00000000098	TWISTNB	53	61.458	Esox_lucius
ENSAMXG00000035868	twistnb	61	54.067	ENSFCAG00000025987	TWISTNB	63	54.067	Felis_catus
ENSAMXG00000035868	twistnb	58	53.886	ENSFALG00000009761	TWISTNB	56	58.480	Ficedula_albicollis
ENSAMXG00000035868	twistnb	57	56.122	ENSFDAG00000017368	TWISTNB	65	52.511	Fukomys_damarensis
ENSAMXG00000035868	twistnb	72	54.878	ENSFHEG00000013318	twistnb	63	57.080	Fundulus_heteroclitus
ENSAMXG00000035868	twistnb	74	52.529	ENSGAFG00000018309	twistnb	62	57.080	Gambusia_affinis
ENSAMXG00000035868	twistnb	76	50.199	ENSGACG00000006425	twistnb	73	59.162	Gasterosteus_aculeatus
ENSAMXG00000035868	twistnb	69	48.760	ENSGGOG00000026888	TWISTNB	65	51.598	Gorilla_gorilla
ENSAMXG00000035868	twistnb	65	55.814	ENSHBUG00000020155	twistnb	51	55.814	Haplochromis_burtoni
ENSAMXG00000035868	twistnb	57	57.143	ENSHGLG00000010976	TWISTNB	58	57.143	Heterocephalus_glaber_female
ENSAMXG00000035868	twistnb	57	57.143	ENSHGLG00100005410	TWISTNB	58	57.143	Heterocephalus_glaber_male
ENSAMXG00000035868	twistnb	92	57.237	ENSIPUG00000004117	twistnb	82	57.000	Ictalurus_punctatus
ENSAMXG00000035868	twistnb	57	56.122	ENSSTOG00000022702	TWISTNB	54	56.122	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAMXG00000035868	twistnb	75	44.565	ENSJJAG00000015887	Twistnb	61	55.102	Jaculus_jaculus
ENSAMXG00000035868	twistnb	56	60.326	ENSKMAG00000001591	twistnb	62	53.043	Kryptolebias_marmoratus
ENSAMXG00000035868	twistnb	67	55.217	ENSLBEG00000024225	twistnb	61	55.217	Labrus_bergylta
ENSAMXG00000035868	twistnb	53	62.069	ENSLACG00000010508	TWISTNB	50	62.069	Latimeria_chalumnae
ENSAMXG00000035868	twistnb	56	66.486	ENSLOCG00000011399	twistnb	56	66.486	Lepisosteus_oculatus
ENSAMXG00000035868	twistnb	57	56.122	ENSLAFG00000008755	TWISTNB	66	52.511	Loxodonta_africana
ENSAMXG00000035868	twistnb	63	51.869	ENSMFAG00000045328	TWISTNB	65	51.142	Macaca_fascicularis
ENSAMXG00000035868	twistnb	63	51.869	ENSMMUG00000009609	TWISTNB	64	51.142	Macaca_mulatta
ENSAMXG00000035868	twistnb	63	51.869	ENSMNEG00000041159	TWISTNB	57	55.497	Macaca_nemestrina
ENSAMXG00000035868	twistnb	63	51.869	ENSMLEG00000042783	TWISTNB	65	51.142	Mandrillus_leucophaeus
ENSAMXG00000035868	twistnb	65	55.814	ENSMZEG00005007561	twistnb	51	55.814	Maylandia_zebra
ENSAMXG00000035868	twistnb	80	47.292	ENSMICG00000036489	TWISTNB	66	53.425	Microcebus_murinus
ENSAMXG00000035868	twistnb	59	55.155	ENSMOCG00000003458	Twistnb	59	55.789	Microtus_ochrogaster
ENSAMXG00000035868	twistnb	82	41.034	ENSMODG00000001402	-	66	40.514	Monodelphis_domestica
ENSAMXG00000035868	twistnb	64	55.251	ENSMALG00000016407	twistnb	57	55.251	Monopterus_albus
ENSAMXG00000035868	twistnb	55	57.459	MGP_CAROLIEiJ_G0017692	Twistnb	56	56.452	Mus_caroli
ENSAMXG00000035868	twistnb	59	54.639	ENSMUSG00000020561	Twistnb	60	53.769	Mus_musculus
ENSAMXG00000035868	twistnb	63	51.628	MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	60	54.592	Mus_pahari
ENSAMXG00000035868	twistnb	55	56.906	MGP_SPRETEiJ_G0018534	Twistnb	56	55.914	Mus_spretus
ENSAMXG00000035868	twistnb	77	45.756	ENSMPUG00000013948	TWISTNB	68	49.587	Mustela_putorius_furo
ENSAMXG00000035868	twistnb	51	54.762	ENSMLUG00000008848	TWISTNB	54	54.762	Myotis_lucifugus
ENSAMXG00000035868	twistnb	55	58.564	ENSNGAG00000022455	Twistnb	90	58.564	Nannospalax_galili
ENSAMXG00000035868	twistnb	60	58.883	ENSNBRG00000008652	twistnb	54	57.921	Neolamprologus_brichardi
ENSAMXG00000035868	twistnb	69	48.249	ENSNLEG00000035755	TWISTNB	57	56.021	Nomascus_leucogenys
ENSAMXG00000035868	twistnb	72	51.037	ENSOPRG00000016109	TWISTNB	70	51.915	Ochotona_princeps
ENSAMXG00000035868	twistnb	51	61.905	ENSODEG00000007222	TWISTNB	50	61.905	Octodon_degus
ENSAMXG00000035868	twistnb	61	61.386	ENSORLG00000004005	twistnb	65	51.408	Oryzias_latipes
ENSAMXG00000035868	twistnb	61	61.881	ENSORLG00020002579	twistnb	53	62.562	Oryzias_latipes_hni
ENSAMXG00000035868	twistnb	57	56.122	ENSOGAG00000009189	TWISTNB	71	49.590	Otolemur_garnettii
ENSAMXG00000035868	twistnb	61	53.695	ENSOARG00000009803	TWISTNB	60	53.695	Ovis_aries
ENSAMXG00000035868	twistnb	69	49.174	ENSPPAG00000034623	TWISTNB	65	52.055	Pan_paniscus
ENSAMXG00000035868	twistnb	61	54.067	ENSPPRG00000005877	TWISTNB	63	54.067	Panthera_pardus
ENSAMXG00000035868	twistnb	52	57.225	ENSPTIG00000021539	TWISTNB	58	57.225	Panthera_tigris_altaica
ENSAMXG00000035868	twistnb	69	49.174	ENSPTRG00000018962	TWISTNB	65	52.055	Pan_troglodytes
ENSAMXG00000035868	twistnb	63	51.869	ENSPANG00000015736	TWISTNB	57	55.497	Papio_anubis
ENSAMXG00000035868	twistnb	67	62.332	ENSPKIG00000025635	twistnb	60	63.426	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAMXG00000035868	twistnb	72	55.649	ENSPMGG00000019023	twistnb	60	55.365	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSAMXG00000035868	twistnb	89	43.854	ENSPCIG00000017456	TWISTNB	54	57.754	Phascolarctos_cinereus
ENSAMXG00000035868	twistnb	71	49.793	ENSPPYG00000017752	TWISTNB	70	50.211	Pongo_abelii
ENSAMXG00000035868	twistnb	57	55.612	ENSPCOG00000017601	TWISTNB	65	52.055	Propithecus_coquereli
ENSAMXG00000035868	twistnb	57	57.653	ENSPVAG00000015574	TWISTNB	57	57.653	Pteropus_vampyrus
ENSAMXG00000035868	twistnb	95	61.950	ENSPNAG00000011956	twistnb	80	62.626	Pygocentrus_nattereri
ENSAMXG00000035868	twistnb	55	58.011	ENSRNOG00000010750	Twistnb	88	44.326	Rattus_norvegicus
ENSAMXG00000035868	twistnb	69	50.202	ENSRBIG00000043007	TWISTNB	64	51.598	Rhinopithecus_bieti
ENSAMXG00000035868	twistnb	69	50.202	ENSRROG00000040155	TWISTNB	65	51.598	Rhinopithecus_roxellana
ENSAMXG00000035868	twistnb	60	55.224	ENSSBOG00000023188	TWISTNB	57	54.974	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSAMXG00000035868	twistnb	55	58.470	ENSSFOG00015012788	twistnb	55	60.000	Scleropages_formosus
ENSAMXG00000035868	twistnb	83	47.492	ENSSMAG00000012792	twistnb	74	48.571	Scophthalmus_maximus
ENSAMXG00000035868	twistnb	77	51.527	ENSSDUG00000007038	twistnb	51	61.340	Seriola_dumerili
ENSAMXG00000035868	twistnb	80	41.667	ENSSPUG00000007595	TWISTNB	59	54.444	Sphenodon_punctatus
ENSAMXG00000035868	twistnb	77	51.737	ENSSPAG00000005871	twistnb	62	55.702	Stegastes_partitus
ENSAMXG00000035868	twistnb	70	49.200	ENSSSCG00000025298	TWISTNB	59	56.122	Sus_scrofa
ENSAMXG00000035868	twistnb	67	53.540	ENSTNIG00000017778	twistnb	60	55.779	Tetraodon_nigroviridis
ENSAMXG00000035868	twistnb	57	56.633	ENSTBEG00000003554	TWISTNB	58	56.633	Tupaia_belangeri
ENSAMXG00000035868	twistnb	61	54.545	ENSUAMG00000017593	TWISTNB	62	54.545	Ursus_americanus
ENSAMXG00000035868	twistnb	61	54.067	ENSUMAG00000022203	TWISTNB	62	54.067	Ursus_maritimus
ENSAMXG00000035868	twistnb	55	58.333	ENSVVUG00000008386	TWISTNB	61	53.922	Vulpes_vulpes
ENSAMXG00000035868	twistnb	74	56.800	ENSXCOG00000020199	twistnb	63	59.292	Xiphophorus_couchianus