EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAMXG00000037878 (Gene tree)
Gene ID: 103025637
Gene Symbol: ipo4
Alias: si:ch211-196f5.1
Full Name: importin 4
Gene Type: protein_coding
Species: Astyanax_mexicanus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 19972 bases
Position: chrAPWO02000026.1:773299-793270
Accession: 103025637
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAMXP00000043365	IBN_N	PF03810.19	2.7e-14	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAMXT00000054403	-	3162	XM_022666910	ENSAMXP00000043365	1053 (aa)	XP_022522631	-

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAMXG00000037878	ipo4	99	44.641	ENSG00000196497	IPO4	99	45.028	Homo_sapiens
ENSAMXG00000037878	ipo4	100	71.429	ENSAPOG00000019018	ipo4	100	71.800	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAMXG00000037878	ipo4	99	43.386	ENSAMEG00000016271	IPO4	85	43.571	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAMXG00000037878	ipo4	100	70.312	ENSACIG00000004246	ipo4	100	70.230	Amphilophus_citrinellus
ENSAMXG00000037878	ipo4	100	72.385	ENSAOCG00000004773	ipo4	100	72.569	Amphiprion_ocellaris
ENSAMXG00000037878	ipo4	100	72.661	ENSAPEG00000002112	ipo4	100	72.844	Amphiprion_percula
ENSAMXG00000037878	ipo4	92	72.754	ENSATEG00000017082	ipo4	99	72.754	Anabas_testudineus
ENSAMXG00000037878	ipo4	84	46.154	ENSACAG00000003973	-	97	45.720	Anolis_carolinensis
ENSAMXG00000037878	ipo4	99	44.921	ENSANAG00000037973	IPO4	99	45.429	Aotus_nancymaae
ENSAMXG00000037878	ipo4	100	71.802	ENSACLG00000019742	ipo4	100	71.802	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000037878	ipo4	99	44.496	ENSBTAG00000002707	IPO4	99	44.773	Bos_taurus
ENSAMXG00000037878	ipo4	99	45.014	ENSCJAG00000006937	IPO4	99	45.522	Callithrix_jacchus
ENSAMXG00000037878	ipo4	98	45.565	ENSCAFG00000012049	IPO4	99	45.883	Canis_familiaris
ENSAMXG00000037878	ipo4	98	45.065	ENSCAFG00020002873	IPO4	99	44.693	Canis_lupus_dingo
ENSAMXG00000037878	ipo4	98	44.631	ENSCHIG00000009413	IPO4	96	44.958	Capra_hircus
ENSAMXG00000037878	ipo4	98	44.444	ENSTSYG00000002643	IPO4	99	44.773	Carlito_syrichta
ENSAMXG00000037878	ipo4	99	44.875	ENSCPOG00000014783	IPO4	99	45.421	Cavia_porcellus
ENSAMXG00000037878	ipo4	99	45.107	ENSCCAG00000037929	IPO4	99	45.614	Cebus_capucinus
ENSAMXG00000037878	ipo4	99	44.828	ENSCATG00000040395	IPO4	99	45.245	Cercocebus_atys
ENSAMXG00000037878	ipo4	99	45.143	ENSCLAG00000012817	IPO4	99	45.791	Chinchilla_lanigera
ENSAMXG00000037878	ipo4	91	44.852	ENSCPBG00000025757	IPO4	99	42.154	Chrysemys_picta_bellii
ENSAMXG00000037878	ipo4	93	35.777	ENSCING00000008639	-	99	35.812	Ciona_intestinalis
ENSAMXG00000037878	ipo4	94	36.293	ENSCSAVG00000011482	-	99	36.293	Ciona_savignyi
ENSAMXG00000037878	ipo4	99	44.548	ENSCANG00000029513	IPO4	99	44.968	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAMXG00000037878	ipo4	99	43.993	ENSCGRG00001001217	Ipo4	99	44.085	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAMXG00000037878	ipo4	99	43.993	ENSCGRG00000014404	Ipo4	99	44.085	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAMXG00000037878	ipo4	100	66.180	ENSCSEG00000009606	ipo4	100	66.085	Cynoglossus_semilaevis
ENSAMXG00000037878	ipo4	99	66.205	ENSCVAG00000002281	ipo4	100	66.089	Cyprinodon_variegatus
ENSAMXG00000037878	ipo4	100	78.637	ENSDARG00000041493	ipo4	100	78.637	Danio_rerio
ENSAMXG00000037878	ipo4	99	44.537	ENSDNOG00000000366	IPO4	99	45.051	Dasypus_novemcinctus
ENSAMXG00000037878	ipo4	98	44.351	ENSDORG00000009274	Ipo4	99	45.051	Dipodomys_ordii
ENSAMXG00000037878	ipo4	99	44.693	ENSETEG00000018381	IPO4	99	44.507	Echinops_telfairi
ENSAMXG00000037878	ipo4	91	46.694	ENSEASG00005011954	IPO4	96	46.999	Equus_asinus_asinus
ENSAMXG00000037878	ipo4	99	45.421	ENSECAG00000009909	IPO4	99	45.698	Equus_caballus
ENSAMXG00000037878	ipo4	100	75.688	ENSELUG00000020628	ipo4	100	75.963	Esox_lucius
ENSAMXG00000037878	ipo4	99	45.278	ENSFCAG00000005587	IPO4	99	45.278	Felis_catus
ENSAMXG00000037878	ipo4	94	42.466	ENSFDAG00000000725	IPO4	99	41.605	Fukomys_damarensis
ENSAMXG00000037878	ipo4	88	71.680	ENSFHEG00000009351	ipo4	97	70.738	Fundulus_heteroclitus
ENSAMXG00000037878	ipo4	100	74.472	ENSGMOG00000001801	ipo4	99	74.678	Gadus_morhua
ENSAMXG00000037878	ipo4	100	70.394	ENSGAFG00000005601	ipo4	100	70.394	Gambusia_affinis
ENSAMXG00000037878	ipo4	100	69.613	ENSGACG00000002276	ipo4	99	69.705	Gasterosteus_aculeatus
ENSAMXG00000037878	ipo4	99	44.641	ENSGGOG00000016062	IPO4	99	45.060	Gorilla_gorilla
ENSAMXG00000037878	ipo4	100	72.362	ENSHBUG00000023269	ipo4	100	72.362	Haplochromis_burtoni
ENSAMXG00000037878	ipo4	99	44.311	ENSHGLG00000002923	IPO4	99	44.866	Heterocephalus_glaber_female
ENSAMXG00000037878	ipo4	99	44.033	ENSHGLG00100003725	IPO4	99	44.588	Heterocephalus_glaber_male
ENSAMXG00000037878	ipo4	99	66.546	ENSHCOG00000016854	ipo4	99	66.636	Hippocampus_comes
ENSAMXG00000037878	ipo4	100	79.355	ENSIPUG00000001185	ipo4	100	79.078	Ictalurus_punctatus
ENSAMXG00000037878	ipo4	99	44.866	ENSSTOG00000002288	IPO4	99	45.421	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAMXG00000037878	ipo4	98	44.631	ENSJJAG00000019002	Ipo4	99	44.958	Jaculus_jaculus
ENSAMXG00000037878	ipo4	100	69.513	ENSKMAG00000004627	ipo4	100	69.605	Kryptolebias_marmoratus
ENSAMXG00000037878	ipo4	100	70.653	ENSLBEG00000024952	ipo4	100	70.653	Labrus_bergylta
ENSAMXG00000037878	ipo4	99	50.491	ENSLACG00000001428	IPO4	99	51.220	Latimeria_chalumnae
ENSAMXG00000037878	ipo4	77	68.638	ENSLOCG00000001149	ipo4	100	51.194	Lepisosteus_oculatus
ENSAMXG00000037878	ipo4	99	44.188	ENSLAFG00000015852	IPO4	99	44.270	Loxodonta_africana
ENSAMXG00000037878	ipo4	99	44.828	ENSMFAG00000000743	IPO4	99	45.245	Macaca_fascicularis
ENSAMXG00000037878	ipo4	99	44.921	ENSMMUG00000012481	IPO4	99	45.337	Macaca_mulatta
ENSAMXG00000037878	ipo4	99	44.828	ENSMNEG00000043531	IPO4	99	45.245	Macaca_nemestrina
ENSAMXG00000037878	ipo4	99	44.828	ENSMLEG00000042067	IPO4	99	45.245	Mandrillus_leucophaeus
ENSAMXG00000037878	ipo4	100	69.493	ENSMAMG00000021976	ipo4	100	69.862	Mastacembelus_armatus
ENSAMXG00000037878	ipo4	100	72.456	ENSMZEG00005017273	ipo4	100	72.456	Maylandia_zebra
ENSAMXG00000037878	ipo4	99	45.102	ENSMAUG00000017565	Ipo4	99	45.379	Mesocricetus_auratus
ENSAMXG00000037878	ipo4	98	44.818	ENSMICG00000001719	IPO4	99	45.328	Microcebus_murinus
ENSAMXG00000037878	ipo4	98	44.030	ENSMOCG00000020462	Ipo4	99	44.220	Microtus_ochrogaster
ENSAMXG00000037878	ipo4	100	70.092	ENSMMOG00000005264	ipo4	100	69.238	Mola_mola
ENSAMXG00000037878	ipo4	99	42.144	ENSMODG00000003337	IPO4	96	41.774	Monodelphis_domestica
ENSAMXG00000037878	ipo4	100	68.440	ENSMALG00000001587	ipo4	100	68.807	Monopterus_albus
ENSAMXG00000037878	ipo4	99	43.675	MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	99	45.432	Mus_caroli
ENSAMXG00000037878	ipo4	99	43.306	ENSMUSG00000002319	Ipo4	99	44.938	Mus_musculus
ENSAMXG00000037878	ipo4	99	43.346	MGP_PahariEiJ_G0030322	Ipo4	98	45.149	Mus_pahari
ENSAMXG00000037878	ipo4	99	43.675	MGP_SPRETEiJ_G0020194	Ipo4	99	45.185	Mus_spretus
ENSAMXG00000037878	ipo4	99	45.606	ENSMPUG00000005916	IPO4	99	46.161	Mustela_putorius_furo
ENSAMXG00000037878	ipo4	99	44.496	ENSMLUG00000025277	IPO4	86	44.958	Myotis_lucifugus
ENSAMXG00000037878	ipo4	99	43.848	ENSNGAG00000019340	Ipo4	99	44.311	Nannospalax_galili
ENSAMXG00000037878	ipo4	100	72.970	ENSNBRG00000005870	ipo4	100	72.970	Neolamprologus_brichardi
ENSAMXG00000037878	ipo4	99	44.691	ENSOPRG00000016615	IPO4	99	45.245	Ochotona_princeps
ENSAMXG00000037878	ipo4	99	44.866	ENSODEG00000002609	IPO4	99	45.328	Octodon_degus
ENSAMXG00000037878	ipo4	100	72.192	ENSONIG00000014574	ipo4	100	71.915	Oreochromis_niloticus
ENSAMXG00000037878	ipo4	99	44.834	ENSOCUG00000002881	IPO4	99	45.111	Oryctolagus_cuniculus
ENSAMXG00000037878	ipo4	100	66.944	ENSORLG00000006457	ipo4	99	68.744	Oryzias_latipes
ENSAMXG00000037878	ipo4	100	68.537	ENSORLG00020004286	ipo4	100	67.801	Oryzias_latipes_hni
ENSAMXG00000037878	ipo4	100	68.537	ENSORLG00015021856	ipo4	100	67.801	Oryzias_latipes_hsok
ENSAMXG00000037878	ipo4	99	67.007	ENSOMEG00000016203	ipo4	100	66.332	Oryzias_melastigma
ENSAMXG00000037878	ipo4	98	44.093	ENSOGAG00000010642	IPO4	99	44.126	Otolemur_garnettii
ENSAMXG00000037878	ipo4	98	43.861	ENSOARG00000019188	IPO4	99	44.142	Ovis_aries
ENSAMXG00000037878	ipo4	99	44.869	ENSPPAG00000035476	IPO4	99	44.968	Pan_paniscus
ENSAMXG00000037878	ipo4	99	45.463	ENSPPRG00000023607	IPO4	99	45.463	Panthera_pardus
ENSAMXG00000037878	ipo4	99	45.370	ENSPTIG00000008720	IPO4	99	45.370	Panthera_tigris_altaica
ENSAMXG00000037878	ipo4	99	44.641	ENSPTRG00000006200	IPO4	99	45.060	Pan_troglodytes
ENSAMXG00000037878	ipo4	99	44.921	ENSPANG00000026278	IPO4	99	45.337	Papio_anubis
ENSAMXG00000037878	ipo4	99	68.953	ENSPKIG00000007683	-	99	68.953	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAMXG00000037878	ipo4	100	68.044	ENSPKIG00000007830	ipo4	100	68.411	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAMXG00000037878	ipo4	99	66.883	ENSPMGG00000020871	ipo4	99	65.865	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSAMXG00000037878	ipo4	99	43.825	ENSPEMG00000016160	Ipo4	99	44.671	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAMXG00000037878	ipo4	94	45.874	ENSPCIG00000010718	IPO4	96	45.285	Phascolarctos_cinereus
ENSAMXG00000037878	ipo4	100	69.908	ENSPFOG00000009255	ipo4	100	70.000	Poecilia_formosa
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ENSAMXG00000037878	ipo4	100	69.908	ENSPMEG00000013102	ipo4	100	70.000	Poecilia_mexicana
ENSAMXG00000037878	ipo4	100	70.092	ENSPREG00000017605	ipo4	100	69.817	Poecilia_reticulata
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ENSAMXG00000037878	ipo4	99	45.023	ENSPCAG00000015669	IPO4	99	45.161	Procavia_capensis
ENSAMXG00000037878	ipo4	98	44.725	ENSPCOG00000015319	IPO4	99	44.866	Propithecus_coquereli
ENSAMXG00000037878	ipo4	98	44.444	ENSPVAG00000010755	IPO4	99	45.194	Pteropus_vampyrus
ENSAMXG00000037878	ipo4	100	72.981	ENSPNYG00000021414	ipo4	100	72.795	Pundamilia_nyererei
ENSAMXG00000037878	ipo4	100	81.810	ENSPNAG00000027964	ipo4	100	81.994	Pygocentrus_nattereri
ENSAMXG00000037878	ipo4	99	44.270	ENSRNOG00000019553	Ipo4	99	44.732	Rattus_norvegicus
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