EuRBPDB

  • Home
  • Cancer
  • Family
  • Species
  • RBPredictor
  • Search
  • Download
  • Submit
  • Help
  • Contact

  • Description
  • RBDs
  • Transcripts
  • Gene Model
  • PPI
  • Orthologs
Description
Ensembl ID
ENSAMXG00000038638 (Gene tree)
Gene ID
103027761
Gene Symbol
si:dkey-86e18.1
Alias
im:6912651
Full Name
uncharacterized LOC103027761
Gene Type
protein_coding
Species
Astyanax_mexicanus
Status
putative
Strand
Minus strand
Length
4782 bases
Position
chr3:65592635-65597416
Accession
103027761
RBP type
canonical RBP
Summary
-
RNA binding domains(RBDs)
Protein IDDomain Pfam IDE-value Domain number Total number
ENSAMXP00000034848Isy1PF06246.121.1e-0911
Transcripts
Transcript IDNameLengthRefSeq ID Protein IDLengthRefSeq IDUniportKB ID
ENSAMXT00000057430-940XM_007259479ENSAMXP00000034848260 (aa)XP_007259541UPI000BBE024D
ENSAMXT00000036959-1024-ENSAMXP00000038881288 (aa)--
Gene Model
Click here to download ENSAMXG00000038638's gene model file
Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSAMXG00000038638's network
Orthologs
Ensembl IDGene SymbolCoverageIdentiy OrthologGene SymbolCoverageIdentiy Species
ENSAMXG00000038638si:dkey-86e18.19947.022ENSAPOG00000002792si:dkey-86e18.19947.022Acanthochromis_polyacanthus
ENSAMXG00000038638si:dkey-86e18.19953.409ENSACIG00000007867si:dkey-86e18.19953.409Amphilophus_citrinellus
ENSAMXG00000038638si:dkey-86e18.19955.556ENSAOCG00000014440si:dkey-86e18.19955.556Amphiprion_ocellaris
ENSAMXG00000038638si:dkey-86e18.19948.852ENSAPEG00000011831si:dkey-86e18.19948.852Amphiprion_percula
ENSAMXG00000038638si:dkey-86e18.19950.000ENSATEG00000018061si:dkey-86e18.110050.000Anabas_testudineus
ENSAMXG00000038638si:dkey-86e18.19750.178ENSACLG00000012308si:dkey-86e18.19950.173Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000038638si:dkey-86e18.19948.288ENSCSEG00000007482-9948.288Cynoglossus_semilaevis
ENSAMXG00000038638si:dkey-86e18.19949.515ENSCVAG00000020099si:dkey-86e18.19949.515Cyprinodon_variegatus
ENSAMXG00000038638si:dkey-86e18.19957.955ENSDARG00000043536si:dkey-86e18.19957.955Danio_rerio
ENSAMXG00000038638si:dkey-86e18.19951.495ENSELUG00000007229si:dkey-86e18.19951.495Esox_lucius
ENSAMXG00000038638si:dkey-86e18.19946.835ENSFHEG00000023250si:dkey-86e18.19946.835Fundulus_heteroclitus
ENSAMXG00000038638si:dkey-86e18.18255.983ENSGAFG00000006609si:dkey-86e18.17855.983Gambusia_affinis
ENSAMXG00000038638si:dkey-86e18.19750.890ENSHBUG00000018237si:dkey-86e18.19950.865Haplochromis_burtoni
ENSAMXG00000038638si:dkey-86e18.19963.602ENSIPUG00000012213si:dkey-86e18.110063.602Ictalurus_punctatus
ENSAMXG00000038638si:dkey-86e18.19949.511ENSKMAG00000008387si:dkey-86e18.19949.511Kryptolebias_marmoratus
ENSAMXG00000038638si:dkey-86e18.19750.562ENSLBEG00000008055si:dkey-86e18.19851.095Labrus_bergylta
ENSAMXG00000038638si:dkey-86e18.19839.427ENSLACG00000003926si:dkey-86e18.19939.427Latimeria_chalumnae
ENSAMXG00000038638si:dkey-86e18.19954.545ENSLOCG00000008902si:dkey-86e18.19955.849Lepisosteus_oculatus
ENSAMXG00000038638si:dkey-86e18.110047.826ENSMAMG00000016989si:dkey-86e18.19947.826Mastacembelus_armatus
ENSAMXG00000038638si:dkey-86e18.19750.178ENSMZEG00005019446si:dkey-86e18.19950.173Maylandia_zebra
ENSAMXG00000038638si:dkey-86e18.19955.385ENSMMOG00000002257si:dkey-86e18.19955.385Mola_mola
ENSAMXG00000038638si:dkey-86e18.19953.612ENSMALG00000004349si:dkey-86e18.19953.612Monopterus_albus
ENSAMXG00000038638si:dkey-86e18.19750.958ENSNBRG00000023611si:dkey-86e18.19950.929Neolamprologus_brichardi
ENSAMXG00000038638si:dkey-86e18.19755.000ENSONIG00000002738si:dkey-86e18.110054.851Oreochromis_niloticus
ENSAMXG00000038638si:dkey-86e18.19948.525ENSORLG00000028970si:dkey-86e18.19949.020Oryzias_latipes
ENSAMXG00000038638si:dkey-86e18.19949.495ENSORLG00020021835si:dkey-86e18.19950.168Oryzias_latipes_hni
ENSAMXG00000038638si:dkey-86e18.19948.397ENSORLG00015018600si:dkey-86e18.19948.397Oryzias_latipes_hsok
ENSAMXG00000038638si:dkey-86e18.19946.557ENSOMEG00000001778si:dkey-86e18.110047.386Oryzias_melastigma
ENSAMXG00000038638si:dkey-86e18.19950.193ENSPKIG00000009550si:dkey-86e18.19950.193Paramormyrops_kingsleyae
ENSAMXG00000038638si:dkey-86e18.19951.894ENSPMGG00000008481si:dkey-86e18.19951.894Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSAMXG00000038638si:dkey-86e18.19952.045ENSPFOG00000014484si:dkey-86e18.110052.045Poecilia_formosa
ENSAMXG00000038638si:dkey-86e18.19947.697ENSPLAG00000009910si:dkey-86e18.19947.697Poecilia_latipinna
ENSAMXG00000038638si:dkey-86e18.19947.039ENSPMEG00000003114si:dkey-86e18.19947.039Poecilia_mexicana
ENSAMXG00000038638si:dkey-86e18.19955.682ENSPREG00000002081si:dkey-86e18.19955.682Poecilia_reticulata
ENSAMXG00000038638si:dkey-86e18.19750.534ENSPNYG00000007473si:dkey-86e18.19950.519Pundamilia_nyererei
ENSAMXG00000038638si:dkey-86e18.19977.043ENSPNAG00000008048si:dkey-86e18.19977.043Pygocentrus_nattereri
ENSAMXG00000038638si:dkey-86e18.19949.658ENSSFOG00015002284si:dkey-86e18.19949.658Scleropages_formosus
ENSAMXG00000038638si:dkey-86e18.19547.667ENSSMAG00000017672si:dkey-86e18.19948.232Scophthalmus_maximus
ENSAMXG00000038638si:dkey-86e18.19946.082ENSSDUG00000000818si:dkey-86e18.19946.082Seriola_dumerili
ENSAMXG00000038638si:dkey-86e18.19945.283ENSSLDG00000000289si:dkey-86e18.19945.283Seriola_lalandi_dorsalis
ENSAMXG00000038638si:dkey-86e18.19948.701ENSSPAG00000014712si:dkey-86e18.19948.701Stegastes_partitus
ENSAMXG00000038638si:dkey-86e18.19850.000ENSTRUG00000024468si:dkey-86e18.19950.355Takifugu_rubripes
ENSAMXG00000038638si:dkey-86e18.19953.257ENSXCOG00000008851si:dkey-86e18.19953.257Xiphophorus_couchianus
ENSAMXG00000038638si:dkey-86e18.19947.573ENSXMAG00000011403si:dkey-86e18.19947.573Xiphophorus_maculatus

Copyright © , Bioinformatics Center, Sun Yat-sen Memorial Hospital, Sun Yat-sen University, China. All Rights Reserved.

Any comment and suggestion, please contact us