EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAMXG00000038905 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astyanax_mexicanus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 1008 bases
Position: chr3:14671567-14672574
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
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ENSAMXP00000046681	zf-C2H2	PF00096.26	8.9e-55	7	9
ENSAMXP00000046681	zf-C2H2	PF00096.26	8.9e-55	8	9
ENSAMXP00000046681	zf-C2H2	PF00096.26	8.9e-55	9	9
ENSAMXP00000046681	zf-met	PF12874.7	3.3e-08	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAMXT00000052240	-	867	-	ENSAMXP00000046681	288 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSAMXG00000038905	-	88	59.200	ENSAMXG00000039016	-	80	59.200
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Orthologs

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ENSAMXG00000038905	-	99	47.368	ENSPMAG00000007500	ZNF436	99	49.565	Petromyzon_marinus
ENSAMXG00000038905	-	87	53.571	ENSPNAG00000009164	-	84	53.571	Pygocentrus_nattereri
ENSAMXG00000038905	-	91	56.061	ENSPNAG00000017468	-	91	56.061	Pygocentrus_nattereri
ENSAMXG00000038905	-	99	52.941	ENSPNAG00000021075	-	97	52.941	Pygocentrus_nattereri