EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAMXG00000040053 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Astyanax_mexicanus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 4189 bases
Position: chr14:7765406-7769594
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAMXP00000028420	RVT_1	PF00078.27	1.2e-44	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAMXT00000043582	-	4189	-	ENSAMXP00000028420	959 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSAMXG00000040053	-	93	35.456	ENSAMXG00000040782	-	99	34.632
ENSAMXG00000040053	-	51	41.068	ENSAMXG00000043461	-	97	41.068
ENSAMXG00000040053	-	83	34.272	ENSAMXG00000033551	-	97	34.149
ENSAMXG00000040053	-	82	34.240	ENSAMXG00000043574	-	93	34.585
ENSAMXG00000040053	-	67	39.191	ENSAMXG00000043096	-	86	39.036
ENSAMXG00000040053	-	89	92.832	ENSAMXG00000036646	-	97	92.370
ENSAMXG00000040053	-	93	36.152	ENSAMXG00000040632	-	99	36.047
ENSAMXG00000040053	-	61	39.601	ENSAMXG00000030235	-	93	39.661
ENSAMXG00000040053	-	52	46.293	ENSAMXG00000030994	-	99	46.293
ENSAMXG00000040053	-	62	40.325	ENSAMXG00000033549	-	99	40.163
ENSAMXG00000040053	-	57	43.088	ENSAMXG00000033666	-	91	44.618
ENSAMXG00000040053	-	98	39.490	ENSAMXG00000037852	-	91	38.838
ENSAMXG00000040053	-	73	35.501	ENSAMXG00000034383	-	95	35.366
ENSAMXG00000040053	-	57	41.889	ENSAMXG00000031289	-	90	43.836
ENSAMXG00000040053	-	57	41.039	ENSAMXG00000037727	-	87	43.307
ENSAMXG00000040053	-	74	91.504	ENSAMXG00000033415	-	98	90.947
ENSAMXG00000040053	-	51	31.237	ENSAMXG00000035582	-	96	31.151
ENSAMXG00000040053	-	72	55.540	ENSAMXG00000030246	-	99	54.698
ENSAMXG00000040053	-	68	39.058	ENSAMXG00000033627	-	93	38.508
ENSAMXG00000040053	-	57	40.893	ENSAMXG00000029030	-	90	42.941
ENSAMXG00000040053	-	67	38.132	ENSAMXG00000032588	-	98	38.438
ENSAMXG00000040053	-	93	36.055	ENSAMXG00000029285	-	99	35.949
ENSAMXG00000040053	-	85	35.963	ENSAMXG00000036981	-	100	34.828
ENSAMXG00000040053	-	67	37.576	ENSAMXG00000041791	-	97	37.879
ENSAMXG00000040053	-	82	34.611	ENSAMXG00000039914	-	98	34.406
ENSAMXG00000040053	-	53	41.506	ENSAMXG00000043139	-	89	43.590
ENSAMXG00000040053	-	55	42.430	ENSAMXG00000037500	-	91	43.878
ENSAMXG00000040053	-	55	55.888	ENSAMXG00000041363	-	91	55.514
ENSAMXG00000040053	-	61	39.399	ENSAMXG00000035603	-	99	39.333

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAMXG00000040053	-	58	59.680	ENSATEG00000004798	-	99	59.649	Anabas_testudineus
ENSAMXG00000040053	-	99	54.508	ENSATEG00000012907	-	99	54.192	Anabas_testudineus
ENSAMXG00000040053	-	64	40.843	ENSATEG00000002739	-	99	40.554	Anabas_testudineus
ENSAMXG00000040053	-	84	53.856	ENSATEG00000005707	-	99	53.480	Anabas_testudineus
ENSAMXG00000040053	-	54	44.015	ENSATEG00000014607	-	98	44.118	Anabas_testudineus
ENSAMXG00000040053	-	52	44.554	ENSATEG00000015931	-	99	44.511	Anabas_testudineus
ENSAMXG00000040053	-	62	59.496	ENSATEG00000023197	-	92	59.593	Anabas_testudineus
ENSAMXG00000040053	-	64	40.681	ENSATEG00000015490	-	99	40.391	Anabas_testudineus
ENSAMXG00000040053	-	50	58.786	ENSATEG00000014055	-	80	59.032	Anabas_testudineus
ENSAMXG00000040053	-	89	37.415	ENSATEG00000019512	-	99	36.177	Anabas_testudineus
ENSAMXG00000040053	-	89	37.415	ENSATEG00000010674	-	99	36.177	Anabas_testudineus
ENSAMXG00000040053	-	67	39.171	ENSACLG00000013061	-	89	39.380	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000040053	-	96	35.535	ENSACLG00000027511	-	82	34.595	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000040053	-	54	44.275	ENSACLG00000013932	-	94	44.727	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000040053	-	67	39.324	ENSACLG00000017692	-	89	39.535	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000040053	-	78	33.419	ENSACLG00000015331	-	97	33.075	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000040053	-	66	39.225	ENSACLG00000008571	-	95	39.070	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000040053	-	85	34.726	ENSACLG00000008383	-	99	34.409	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000040053	-	92	35.339	ENSACLG00000025376	-	99	34.692	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000040053	-	84	35.851	ENSACLG00000009590	-	98	35.534	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000040053	-	51	35.421	ENSACLG00000008832	-	97	35.425	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000040053	-	65	38.535	ENSACLG00000014915	-	96	38.376	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000040053	-	58	41.145	ENSACLG00000021814	-	99	40.966	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000040053	-	65	38.193	ENSACLG00000022841	-	81	38.193	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000040053	-	92	35.230	ENSACLG00000022844	-	99	34.768	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000040053	-	62	40.000	ENSACLG00000014642	-	99	39.835	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000040053	-	66	38.994	ENSACLG00000023557	-	99	39.028	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000040053	-	58	41.145	ENSACLG00000000182	-	99	40.966	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000040053	-	66	39.535	ENSACLG00000020183	-	95	39.380	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000040053	-	94	35.097	ENSACLG00000017412	-	98	35.167	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000040053	-	66	39.596	ENSACLG00000000536	-	95	39.441	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000040053	-	67	39.324	ENSACLG00000005017	-	95	39.380	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000040053	-	92	35.230	ENSACLG00000010900	-	99	34.907	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000040053	-	84	35.783	ENSACLG00000017448	-	99	35.620	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000040053	-	54	41.667	ENSACLG00000005921	-	97	41.892	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000040053	-	54	42.802	ENSACLG00000022853	-	93	44.177	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000040053	-	95	37.207	ENSACLG00000007643	-	87	36.887	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000040053	-	53	37.718	ENSACLG00000015507	-	94	37.524	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000040053	-	51	41.309	ENSACLG00000006327	-	99	40.154	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000040053	-	89	36.023	ENSACLG00000000734	-	97	36.014	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000040053	-	74	35.278	ENSACLG00000013844	-	95	35.095	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000040053	-	92	35.449	ENSACLG00000025119	-	99	35.126	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000040053	-	60	39.483	ENSACLG00000022169	-	97	39.483	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000040053	-	65	37.660	ENSACLG00000019194	-	84	37.947	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000040053	-	84	36.936	ENSACLG00000021051	-	98	36.201	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000040053	-	54	38.889	ENSACLG00000025957	-	95	40.196	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000040053	-	82	36.634	ENSACLG00000019519	-	94	36.057	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000040053	-	66	39.690	ENSACLG00000001405	-	95	39.535	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000040053	-	61	39.562	ENSACLG00000015659	-	99	39.562	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000040053	-	92	35.339	ENSACLG00000015650	-	99	35.159	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000040053	-	95	35.213	ENSACLG00000003857	-	83	35.106	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000040053	-	87	34.994	ENSACLG00000009939	-	86	34.687	Astatotilapia_calliptera
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ENSAMXG00000040053	-	66	39.164	ENSACLG00000005570	-	99	38.760	Astatotilapia_calliptera
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ENSAMXG00000040053	-	57	40.255	ENSACLG00000010082	-	98	40.255	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000040053	-	92	35.449	ENSACLG00000012014	-	99	35.268	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000040053	-	71	39.650	ENSACLG00000012019	-	85	40.124	Astatotilapia_calliptera
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ENSAMXG00000040053	-	71	39.359	ENSACLG00000020248	-	85	39.813	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000040053	-	92	35.449	ENSACLG00000015667	-	99	35.346	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000040053	-	79	33.333	ENSACLG00000018252	-	98	32.564	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000040053	-	53	37.331	ENSACLG00000009903	-	91	37.137	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000040053	-	66	39.225	ENSACLG00000001758	-	95	39.070	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000040053	-	92	35.120	ENSACLG00000005662	-	99	34.471	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000040053	-	54	42.085	ENSACLG00000024400	-	95	43.287	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000040053	-	62	33.280	ENSACLG00000012279	-	89	33.573	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000040053	-	66	38.365	ENSACLG00000014911	-	97	38.365	Astatotilapia_calliptera
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ENSAMXG00000040053	-	66	38.880	ENSACLG00000005212	-	96	38.725	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000040053	-	54	41.267	ENSACLG00000018107	-	89	43.145	Astatotilapia_calliptera
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ENSAMXG00000040053	-	89	34.424	ENSACLG00000000395	-	99	33.864	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000040053	-	50	34.524	ENSFHEG00000008959	-	93	34.115	Fundulus_heteroclitus
ENSAMXG00000040053	-	59	36.317	ENSHBUG00000016298	-	98	35.204	Haplochromis_burtoni
ENSAMXG00000040053	-	50	52.830	ENSIPUG00000010974	-	94	52.830	Ictalurus_punctatus
ENSAMXG00000040053	-	53	56.693	ENSIPUG00000009483	-	95	56.693	Ictalurus_punctatus
ENSAMXG00000040053	-	78	52.833	ENSIPUG00000013060	-	90	52.701	Ictalurus_punctatus
ENSAMXG00000040053	-	55	60.076	ENSIPUG00000024068	-	94	60.274	Ictalurus_punctatus
ENSAMXG00000040053	-	52	45.600	ENSLBEG00000017814	-	98	45.600	Labrus_bergylta
ENSAMXG00000040053	-	66	37.710	ENSLBEG00000004554	-	91	36.991	Labrus_bergylta
ENSAMXG00000040053	-	52	45.600	ENSLBEG00000013530	-	98	45.600	Labrus_bergylta
ENSAMXG00000040053	-	70	33.759	ENSMAMG00000000974	-	92	33.092	Mastacembelus_armatus
ENSAMXG00000040053	-	66	40.124	ENSMAMG00000005648	-	92	39.658	Mastacembelus_armatus
ENSAMXG00000040053	-	55	38.983	ENSMAMG00000009292	-	91	38.964	Mastacembelus_armatus
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