EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAMXG00000040653 (Gene tree)
Gene ID: 103021733
Gene Symbol: rpp30
Alias: fk66h08|rpp1|wu:fk66h08|zgc:110189
Full Name: ribonuclease P/MRP subunit p30
Gene Type: protein_coding
Species: Astyanax_mexicanus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 8766 bases
Position: chr4:96605-105370
Accession: 103021733
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAMXP00000033932	RNase_P_p30	PF01876.16	3e-65	1	1
ENSAMXP00000045914	RNase_P_p30	PF01876.16	2.6e-47	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAMXT00000053570	-	5366	XM_007251149	ENSAMXP00000033932	270 (aa)	XP_007251211	UPI000BBDA5C6
ENSAMXT00000055063	-	750	-	ENSAMXP00000045914	249 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSAMXG00000040653's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
amex03008	Ribosome biogenesis in eukaryotes	KEGG
amex03013	RNA transport	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSAMXG00000040653's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAMXG00000040653	rpp30	98	57.463	ENSG00000148688	RPP30	99	57.463	Homo_sapiens
ENSAMXG00000040653	rpp30	84	66.522	ENSAPOG00000023156	rpp30	94	57.895	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAMXG00000040653	rpp30	98	59.328	ENSAMEG00000016776	RPP30	99	59.328	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAMXG00000040653	rpp30	97	55.303	ENSACIG00000022810	rpp30	99	55.303	Amphilophus_citrinellus
ENSAMXG00000040653	rpp30	98	62.921	ENSAOCG00000016438	rpp30	90	62.921	Amphiprion_ocellaris
ENSAMXG00000040653	rpp30	98	63.296	ENSAPEG00000008697	rpp30	90	63.296	Amphiprion_percula
ENSAMXG00000040653	rpp30	96	63.197	ENSATEG00000015263	rpp30	98	63.197	Anabas_testudineus
ENSAMXG00000040653	rpp30	88	54.357	ENSAPLG00000009959	RPP30	99	54.357	Anas_platyrhynchos
ENSAMXG00000040653	rpp30	97	53.933	ENSACAG00000007996	RPP30	99	53.933	Anolis_carolinensis
ENSAMXG00000040653	rpp30	97	49.627	ENSANAG00000009439	RPP30	83	49.627	Aotus_nancymaae
ENSAMXG00000040653	rpp30	97	61.132	ENSACLG00000015389	-	99	61.132	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000040653	rpp30	98	58.209	ENSBTAG00000002973	RPP30	99	58.209	Bos_taurus
ENSAMXG00000040653	rpp30	98	57.463	ENSCJAG00000011045	RPP30	99	57.463	Callithrix_jacchus
ENSAMXG00000040653	rpp30	98	58.955	ENSCAFG00000031801	RPP30	99	58.955	Canis_familiaris
ENSAMXG00000040653	rpp30	98	58.955	ENSCAFG00020000258	RPP30	99	58.955	Canis_lupus_dingo
ENSAMXG00000040653	rpp30	98	55.597	ENSCHIG00000012901	RPP30	99	55.597	Capra_hircus
ENSAMXG00000040653	rpp30	98	57.090	ENSTSYG00000013903	RPP30	99	57.090	Carlito_syrichta
ENSAMXG00000040653	rpp30	86	48.402	ENSCAPG00000001326	RPP30	99	48.402	Cavia_aperea
ENSAMXG00000040653	rpp30	98	56.343	ENSCPOG00000033174	RPP30	99	56.343	Cavia_porcellus
ENSAMXG00000040653	rpp30	98	57.836	ENSCCAG00000029514	RPP30	99	57.836	Cebus_capucinus
ENSAMXG00000040653	rpp30	97	57.895	ENSCATG00000042072	RPP30	99	57.895	Cercocebus_atys
ENSAMXG00000040653	rpp30	98	58.209	ENSCLAG00000008595	RPP30	99	58.209	Chinchilla_lanigera
ENSAMXG00000040653	rpp30	98	57.836	ENSCSAG00000006694	RPP30	99	57.836	Chlorocebus_sabaeus
ENSAMXG00000040653	rpp30	66	76.923	ENSCHOG00000007023	-	75	76.923	Choloepus_hoffmanni
ENSAMXG00000040653	rpp30	97	56.180	ENSCPBG00000026518	RPP30	99	56.180	Chrysemys_picta_bellii
ENSAMXG00000040653	rpp30	86	34.568	ENSCING00000019714	-	90	36.214	Ciona_intestinalis
ENSAMXG00000040653	rpp30	98	33.696	ENSCSAVG00000011282	-	92	33.696	Ciona_savignyi
ENSAMXG00000040653	rpp30	98	57.836	ENSCANG00000041084	RPP30	99	57.836	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAMXG00000040653	rpp30	84	57.759	ENSCGRG00001017068	-	97	57.759	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAMXG00000040653	rpp30	98	50.000	ENSCGRG00001000834	-	99	50.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAMXG00000040653	rpp30	98	50.373	ENSCGRG00000006196	-	99	50.373	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAMXG00000040653	rpp30	98	57.090	ENSCGRG00000002508	-	99	57.090	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAMXG00000040653	rpp30	97	59.410	ENSCSEG00000001779	rpp30	93	59.410	Cynoglossus_semilaevis
ENSAMXG00000040653	rpp30	97	62.172	ENSCVAG00000003139	rpp30	99	62.172	Cyprinodon_variegatus
ENSAMXG00000040653	rpp30	98	72.348	ENSDARG00000027428	rpp30	99	72.348	Danio_rerio
ENSAMXG00000040653	rpp30	98	58.209	ENSDNOG00000010186	RPP30	92	58.209	Dasypus_novemcinctus
ENSAMXG00000040653	rpp30	98	57.463	ENSDORG00000015333	Rpp30	99	57.463	Dipodomys_ordii
ENSAMXG00000040653	rpp30	84	33.333	FBgn0283652	Rpp30	78	33.333	Drosophila_melanogaster
ENSAMXG00000040653	rpp30	98	56.343	ENSETEG00000018823	RPP30	99	56.343	Echinops_telfairi
ENSAMXG00000040653	rpp30	59	36.486	ENSEBUG00000003989	-	92	34.161	Eptatretus_burgeri
ENSAMXG00000040653	rpp30	98	57.993	ENSEASG00005011050	RPP30	100	57.993	Equus_asinus_asinus
ENSAMXG00000040653	rpp30	98	57.621	ENSECAG00000021917	RPP30	100	57.621	Equus_caballus
ENSAMXG00000040653	rpp30	96	40.304	ENSEEUG00000009986	-	100	40.304	Erinaceus_europaeus
ENSAMXG00000040653	rpp30	98	69.811	ENSELUG00000003731	rpp30	95	69.811	Esox_lucius
ENSAMXG00000040653	rpp30	98	58.582	ENSFCAG00000029073	RPP30	92	58.582	Felis_catus
ENSAMXG00000040653	rpp30	98	54.851	ENSFALG00000007711	RPP30	99	54.851	Ficedula_albicollis
ENSAMXG00000040653	rpp30	98	58.582	ENSFDAG00000019241	RPP30	99	58.582	Fukomys_damarensis
ENSAMXG00000040653	rpp30	91	63.008	ENSFHEG00000014739	rpp30	98	60.581	Fundulus_heteroclitus
ENSAMXG00000040653	rpp30	89	56.800	ENSGMOG00000005379	rpp30	100	56.800	Gadus_morhua
ENSAMXG00000040653	rpp30	98	53.358	ENSGALG00000006486	RPP30	98	58.871	Gallus_gallus
ENSAMXG00000040653	rpp30	91	63.563	ENSGAFG00000001445	rpp30	92	63.563	Gambusia_affinis
ENSAMXG00000040653	rpp30	97	62.545	ENSGACG00000010285	rpp30	99	62.545	Gasterosteus_aculeatus
ENSAMXG00000040653	rpp30	97	55.056	ENSGAGG00000000980	RPP30	69	55.056	Gopherus_agassizii
ENSAMXG00000040653	rpp30	98	58.209	ENSGGOG00000026917	RPP30	99	58.209	Gorilla_gorilla
ENSAMXG00000040653	rpp30	97	61.509	ENSHBUG00000019332	rpp30	99	61.509	Haplochromis_burtoni
ENSAMXG00000040653	rpp30	98	58.209	ENSHGLG00000013072	RPP30	99	58.209	Heterocephalus_glaber_female
ENSAMXG00000040653	rpp30	98	58.209	ENSHGLG00100017798	RPP30	99	58.209	Heterocephalus_glaber_male
ENSAMXG00000040653	rpp30	97	53.047	ENSHCOG00000004763	-	99	53.047	Hippocampus_comes
ENSAMXG00000040653	rpp30	98	76.779	ENSIPUG00000003863	rpp30	99	76.779	Ictalurus_punctatus
ENSAMXG00000040653	rpp30	98	58.209	ENSSTOG00000027002	RPP30	99	58.209	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAMXG00000040653	rpp30	98	58.955	ENSJJAG00000020041	Rpp30	99	58.955	Jaculus_jaculus
ENSAMXG00000040653	rpp30	97	63.396	ENSKMAG00000015355	rpp30	99	63.396	Kryptolebias_marmoratus
ENSAMXG00000040653	rpp30	97	62.687	ENSLBEG00000019989	rpp30	99	62.687	Labrus_bergylta
ENSAMXG00000040653	rpp30	73	47.642	ENSLACG00000002534	RPP30	96	47.945	Latimeria_chalumnae
ENSAMXG00000040653	rpp30	97	66.160	ENSLOCG00000000031	rpp30	99	66.160	Lepisosteus_oculatus
ENSAMXG00000040653	rpp30	98	55.970	ENSLAFG00000015931	RPP30	99	55.970	Loxodonta_africana
ENSAMXG00000040653	rpp30	98	57.836	ENSMFAG00000031109	RPP30	99	57.836	Macaca_fascicularis
ENSAMXG00000040653	rpp30	98	57.836	ENSMMUG00000006628	RPP30	99	57.836	Macaca_mulatta
ENSAMXG00000040653	rpp30	98	57.463	ENSMNEG00000033838	RPP30	98	63.710	Macaca_nemestrina
ENSAMXG00000040653	rpp30	98	57.836	ENSMLEG00000037578	RPP30	99	57.836	Mandrillus_leucophaeus
ENSAMXG00000040653	rpp30	97	63.569	ENSMAMG00000010934	rpp30	99	63.569	Mastacembelus_armatus
ENSAMXG00000040653	rpp30	97	61.509	ENSMZEG00005018508	-	99	61.509	Maylandia_zebra
ENSAMXG00000040653	rpp30	98	50.000	ENSMGAG00000008452	RPP30	99	50.373	Meleagris_gallopavo
ENSAMXG00000040653	rpp30	98	57.463	ENSMAUG00000008797	Rpp30	99	57.463	Mesocricetus_auratus
ENSAMXG00000040653	rpp30	98	57.463	ENSMICG00000012019	RPP30	99	57.463	Microcebus_murinus
ENSAMXG00000040653	rpp30	98	56.343	ENSMOCG00000016872	Rpp30	99	56.343	Microtus_ochrogaster
ENSAMXG00000040653	rpp30	90	62.295	ENSMMOG00000009266	rpp30	90	62.295	Mola_mola
ENSAMXG00000040653	rpp30	98	57.621	ENSMODG00000006863	-	100	57.621	Monodelphis_domestica
ENSAMXG00000040653	rpp30	98	50.558	ENSMODG00000009342	-	100	50.558	Monodelphis_domestica
ENSAMXG00000040653	rpp30	97	63.806	ENSMALG00000011718	rpp30	99	63.806	Monopterus_albus
ENSAMXG00000040653	rpp30	98	57.621	MGP_CAROLIEiJ_G0022902	Rpp30	100	57.621	Mus_caroli
ENSAMXG00000040653	rpp30	98	57.836	ENSMUSG00000024800	Rpp30	99	57.836	Mus_musculus
ENSAMXG00000040653	rpp30	98	57.463	MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	99	57.463	Mus_pahari
ENSAMXG00000040653	rpp30	98	57.463	MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	99	57.463	Mus_spretus
ENSAMXG00000040653	rpp30	97	59.774	ENSMPUG00000017258	RPP30	93	59.774	Mustela_putorius_furo
ENSAMXG00000040653	rpp30	98	58.736	ENSMLUG00000017169	RPP30	100	58.736	Myotis_lucifugus
ENSAMXG00000040653	rpp30	98	57.463	ENSNGAG00000012018	-	99	57.463	Nannospalax_galili
ENSAMXG00000040653	rpp30	78	55.349	ENSNGAG00000014392	-	91	55.349	Nannospalax_galili
ENSAMXG00000040653	rpp30	91	56.098	ENSNBRG00000024170	-	92	56.098	Neolamprologus_brichardi
ENSAMXG00000040653	rpp30	98	58.209	ENSNLEG00000012383	RPP30	99	58.209	Nomascus_leucogenys
ENSAMXG00000040653	rpp30	97	51.838	ENSMEUG00000015587	-	100	51.838	Notamacropus_eugenii
ENSAMXG00000040653	rpp30	51	60.432	ENSOPRG00000007367	-	98	60.432	Ochotona_princeps
ENSAMXG00000040653	rpp30	96	57.197	ENSODEG00000004530	-	100	57.197	Octodon_degus
ENSAMXG00000040653	rpp30	98	44.403	ENSODEG00000004560	-	99	44.403	Octodon_degus
ENSAMXG00000040653	rpp30	75	63.235	ENSONIG00000019140	rpp30	100	61.353	Oreochromis_niloticus
ENSAMXG00000040653	rpp30	98	55.390	ENSOANG00000003415	RPP30	100	55.390	Ornithorhynchus_anatinus
ENSAMXG00000040653	rpp30	98	54.851	ENSOCUG00000006896	RPP30	92	54.851	Oryctolagus_cuniculus
ENSAMXG00000040653	rpp30	93	61.024	ENSORLG00000020420	rpp30	88	61.024	Oryzias_latipes
ENSAMXG00000040653	rpp30	97	61.278	ENSORLG00020009037	-	99	61.278	Oryzias_latipes_hni
ENSAMXG00000040653	rpp30	97	61.278	ENSORLG00015008300	rpp30	93	61.278	Oryzias_latipes_hsok
ENSAMXG00000040653	rpp30	72	62.088	ENSOMEG00000012640	-	99	62.088	Oryzias_melastigma
ENSAMXG00000040653	rpp30	98	57.090	ENSOGAG00000013963	RPP30	99	57.090	Otolemur_garnettii
ENSAMXG00000040653	rpp30	97	54.135	ENSOARG00000015789	RPP30	99	54.135	Ovis_aries
ENSAMXG00000040653	rpp30	98	57.463	ENSPPAG00000043779	RPP30	99	57.463	Pan_paniscus
ENSAMXG00000040653	rpp30	98	58.209	ENSPPRG00000000115	RPP30	99	58.209	Panthera_pardus
ENSAMXG00000040653	rpp30	98	58.209	ENSPTIG00000014949	RPP30	99	58.209	Panthera_tigris_altaica
ENSAMXG00000040653	rpp30	97	57.895	ENSPTRG00000002742	RPP30	99	55.224	Pan_troglodytes
ENSAMXG00000040653	rpp30	98	57.836	ENSPANG00000021710	RPP30	99	57.836	Papio_anubis
ENSAMXG00000040653	rpp30	56	51.724	ENSPKIG00000024858	rpp30	78	51.724	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAMXG00000040653	rpp30	88	54.508	ENSPSIG00000013213	RPP30	99	54.508	Pelodiscus_sinensis
ENSAMXG00000040653	rpp30	83	52.294	ENSPMGG00000014872	rpp30	93	52.294	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSAMXG00000040653	rpp30	98	46.642	ENSPEMG00000001948	Rpp30	99	46.642	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAMXG00000040653	rpp30	55	40.373	ENSPMAG00000001855	-	99	40.373	Petromyzon_marinus
ENSAMXG00000040653	rpp30	98	57.621	ENSPCIG00000015730	RPP30	100	57.621	Phascolarctos_cinereus
ENSAMXG00000040653	rpp30	97	62.406	ENSPFOG00000000610	rpp30	99	62.406	Poecilia_formosa
ENSAMXG00000040653	rpp30	84	65.502	ENSPLAG00000003728	rpp30	80	65.502	Poecilia_latipinna
ENSAMXG00000040653	rpp30	97	60.902	ENSPMEG00000015692	rpp30	99	60.902	Poecilia_mexicana
ENSAMXG00000040653	rpp30	97	61.132	ENSPREG00000001536	rpp30	99	61.132	Poecilia_reticulata
ENSAMXG00000040653	rpp30	98	57.836	ENSPPYG00000002473	RPP30	99	57.836	Pongo_abelii
ENSAMXG00000040653	rpp30	56	60.265	ENSPCAG00000016930	RPP30	52	60.265	Procavia_capensis
ENSAMXG00000040653	rpp30	98	57.836	ENSPCOG00000017865	RPP30	99	57.836	Propithecus_coquereli
ENSAMXG00000040653	rpp30	99	53.559	ENSPVAG00000010524	RPP30	96	53.559	Pteropus_vampyrus
ENSAMXG00000040653	rpp30	97	50.951	ENSPNYG00000016930	-	89	50.951	Pundamilia_nyererei
ENSAMXG00000040653	rpp30	98	85.227	ENSPNAG00000014804	rpp30	99	85.227	Pygocentrus_nattereri
ENSAMXG00000040653	rpp30	97	57.519	ENSRNOG00000018718	Rpp30	99	57.519	Rattus_norvegicus
ENSAMXG00000040653	rpp30	97	54.887	ENSRBIG00000036948	RPP30	85	54.887	Rhinopithecus_bieti
ENSAMXG00000040653	rpp30	99	46.350	ENSSBOG00000025405	RPP30	91	46.350	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSAMXG00000040653	rpp30	98	56.458	ENSSHAG00000007452	RPP30	100	56.458	Sarcophilus_harrisii
ENSAMXG00000040653	rpp30	98	67.045	ENSSFOG00015012510	rpp30	99	67.045	Scleropages_formosus
ENSAMXG00000040653	rpp30	97	61.798	ENSSMAG00000013854	rpp30	98	61.798	Scophthalmus_maximus
ENSAMXG00000040653	rpp30	97	62.963	ENSSDUG00000015086	rpp30	98	62.963	Seriola_dumerili
ENSAMXG00000040653	rpp30	89	57.438	ENSSLDG00000021234	rpp30	96	57.438	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSAMXG00000040653	rpp30	98	57.090	ENSSARG00000007110	RPP30	99	57.090	Sorex_araneus
ENSAMXG00000040653	rpp30	75	52.709	ENSSPUG00000000595	RPP30	95	55.932	Sphenodon_punctatus
ENSAMXG00000040653	rpp30	98	58.736	ENSSSCG00000010460	RPP30	100	58.736	Sus_scrofa
ENSAMXG00000040653	rpp30	91	52.800	ENSTGUG00000008399	RPP30	99	52.800	Taeniopygia_guttata
ENSAMXG00000040653	rpp30	56	46.809	ENSTRUG00000020711	-	57	46.809	Takifugu_rubripes
ENSAMXG00000040653	rpp30	97	57.914	ENSTNIG00000018540	rpp30	98	57.914	Tetraodon_nigroviridis
ENSAMXG00000040653	rpp30	80	57.014	ENSTBEG00000010734	RPP30	99	57.014	Tupaia_belangeri
ENSAMXG00000040653	rpp30	90	52.033	ENSTTRG00000014708	RPP30	92	52.033	Tursiops_truncatus
ENSAMXG00000040653	rpp30	72	55.435	ENSUAMG00000001045	RPP30	90	55.435	Ursus_americanus
ENSAMXG00000040653	rpp30	98	59.328	ENSUMAG00000000971	RPP30	99	59.328	Ursus_maritimus
ENSAMXG00000040653	rpp30	97	48.958	ENSVPAG00000002077	RPP30	100	48.958	Vicugna_pacos
ENSAMXG00000040653	rpp30	98	53.731	ENSVVUG00000021784	RPP30	99	53.731	Vulpes_vulpes
ENSAMXG00000040653	rpp30	87	57.741	ENSXETG00000021785	rpp30	88	57.741	Xenopus_tropicalis
ENSAMXG00000040653	rpp30	91	62.348	ENSXCOG00000017864	rpp30	92	62.348	Xiphophorus_couchianus