EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAMXG00000042358 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: nanos2
Alias: -
Full Name: nanos homolog 1-like
Gene Type: protein_coding
Species: Astyanax_mexicanus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 1411 bases
Position: chr3:11081321-11082731
Accession: 107197924
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAMXP00000027552	zf-nanos	PF05741.13	2.2e-25	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAMXT00000035685	-	507	XM_022667597	ENSAMXP00000027552	168 (aa)	XP_022523318	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAMXG00000042358	nanos2	87	36.601	ENSG00000188425	NANOS2	96	36.601	Homo_sapiens
ENSAMXG00000042358	nanos2	76	38.168	ENSG00000187556	NANOS3	66	37.692	Homo_sapiens
ENSAMXG00000042358	nanos2	80	31.915	ENSAPOG00000009762	nanos3	88	30.851	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAMXG00000042358	nanos2	88	37.415	ENSAPOG00000020274	nanos2	88	38.462	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAMXG00000042358	nanos2	86	37.931	ENSACIG00000007105	nanos2	79	37.931	Amphilophus_citrinellus
ENSAMXG00000042358	nanos2	88	37.419	ENSAOCG00000009429	nanos2	90	37.342	Amphiprion_ocellaris
ENSAMXG00000042358	nanos2	88	36.424	ENSAPEG00000019139	nanos2	90	36.364	Amphiprion_percula
ENSAMXG00000042358	nanos2	82	37.226	ENSATEG00000009393	nanos2	81	38.129	Anabas_testudineus
ENSAMXG00000042358	nanos2	80	30.000	ENSATEG00000007052	-	83	30.000	Anabas_testudineus
ENSAMXG00000042358	nanos2	80	35.556	ENSACAG00000023519	-	82	35.556	Anolis_carolinensis
ENSAMXG00000042358	nanos2	80	31.852	ENSACAG00000026334	-	83	32.593	Anolis_carolinensis
ENSAMXG00000042358	nanos2	74	36.800	ENSACAG00000023813	-	77	36.800	Anolis_carolinensis
ENSAMXG00000042358	nanos2	80	32.593	ENSACAG00000027983	-	83	34.074	Anolis_carolinensis
ENSAMXG00000042358	nanos2	80	36.296	ENSACAG00000025556	-	84	36.296	Anolis_carolinensis
ENSAMXG00000042358	nanos2	80	32.593	ENSACAG00000024434	-	83	33.333	Anolis_carolinensis
ENSAMXG00000042358	nanos2	74	35.200	ENSACAG00000024432	-	76	35.200	Anolis_carolinensis
ENSAMXG00000042358	nanos2	80	34.074	ENSACAG00000022088	-	83	34.815	Anolis_carolinensis
ENSAMXG00000042358	nanos2	80	32.593	ENSACAG00000024995	-	82	33.333	Anolis_carolinensis
ENSAMXG00000042358	nanos2	80	33.333	ENSACAG00000023650	-	83	33.333	Anolis_carolinensis
ENSAMXG00000042358	nanos2	74	36.000	ENSACAG00000025505	-	77	36.000	Anolis_carolinensis
ENSAMXG00000042358	nanos2	74	36.000	ENSACAG00000022207	-	76	36.000	Anolis_carolinensis
ENSAMXG00000042358	nanos2	80	36.296	ENSACAG00000026819	-	82	36.296	Anolis_carolinensis
ENSAMXG00000042358	nanos2	80	32.593	ENSACAG00000025729	-	83	33.333	Anolis_carolinensis
ENSAMXG00000042358	nanos2	80	34.074	ENSACAG00000026716	-	83	34.815	Anolis_carolinensis
ENSAMXG00000042358	nanos2	84	32.624	ENSACLG00000027005	nanos2	78	32.624	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000042358	nanos2	89	36.913	ENSACLG00000014135	-	56	36.913	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000042358	nanos2	76	36.923	ENSBTAG00000047505	NANOS2	80	39.231	Bos_taurus
ENSAMXG00000042358	nanos2	76	39.062	ENSBTAG00000000399	NANOS3	62	39.062	Bos_taurus
ENSAMXG00000042358	nanos2	76	35.385	ENSCJAG00000012141	NANOS2	94	36.601	Callithrix_jacchus
ENSAMXG00000042358	nanos2	76	39.231	ENSCAFG00000024541	NANOS2	80	39.231	Canis_familiaris
ENSAMXG00000042358	nanos2	76	39.231	ENSCAFG00020001772	NANOS2	80	39.231	Canis_lupus_dingo
ENSAMXG00000042358	nanos2	76	39.844	ENSCHIG00000007837	NANOS3	60	39.062	Capra_hircus
ENSAMXG00000042358	nanos2	76	36.923	ENSCHIG00000012637	NANOS2	80	39.231	Capra_hircus
ENSAMXG00000042358	nanos2	76	36.719	ENSTSYG00000026709	NANOS3	61	36.719	Carlito_syrichta
ENSAMXG00000042358	nanos2	80	34.783	ENSCAPG00000016771	NANOS2	83	34.783	Cavia_aperea
ENSAMXG00000042358	nanos2	76	36.641	ENSCPOG00000020727	NANOS3	62	36.641	Cavia_porcellus
ENSAMXG00000042358	nanos2	80	34.783	ENSCPOG00000014969	NANOS2	83	34.783	Cavia_porcellus
ENSAMXG00000042358	nanos2	76	35.385	ENSCATG00000018951	NANOS2	80	36.923	Cercocebus_atys
ENSAMXG00000042358	nanos2	76	35.115	ENSCLAG00000015139	NANOS3	60	35.115	Chinchilla_lanigera
ENSAMXG00000042358	nanos2	76	35.938	ENSCLAG00000001832	NANOS2	79	35.938	Chinchilla_lanigera
ENSAMXG00000042358	nanos2	76	36.154	ENSCSAG00000019629	NANOS2	80	39.231	Chlorocebus_sabaeus
ENSAMXG00000042358	nanos2	76	39.098	ENSCHOG00000001937	NANOS2	80	38.636	Choloepus_hoffmanni
ENSAMXG00000042358	nanos2	76	36.154	ENSCPBG00000023819	NANOS3	77	36.154	Chrysemys_picta_bellii
ENSAMXG00000042358	nanos2	80	36.957	ENSCPBG00000007141	NANOS2	76	36.957	Chrysemys_picta_bellii
ENSAMXG00000042358	nanos2	76	36.154	ENSCANG00000012014	NANOS2	80	37.692	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAMXG00000042358	nanos2	76	38.168	ENSCANG00000034930	NANOS3	66	37.692	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAMXG00000042358	nanos2	76	35.385	ENSCGRG00001023851	Nanos3	61	35.385	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAMXG00000042358	nanos2	87	36.486	ENSCGRG00001013726	Nanos2	89	36.486	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAMXG00000042358	nanos2	76	35.385	ENSCGRG00000017734	Nanos3	60	35.385	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAMXG00000042358	nanos2	87	36.486	ENSCGRG00000019170	Nanos2	89	36.486	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAMXG00000042358	nanos2	76	39.231	ENSCSEG00000017157	nanos2	77	38.931	Cynoglossus_semilaevis
ENSAMXG00000042358	nanos2	87	33.333	ENSDARG00000068255	nanos3	88	33.333	Danio_rerio
ENSAMXG00000042358	nanos2	88	40.541	ENSDARG00000116802	nanos2	95	42.568	Danio_rerio
ENSAMXG00000042358	nanos2	76	37.594	ENSDNOG00000044718	NANOS2	80	37.121	Dasypus_novemcinctus
ENSAMXG00000042358	nanos2	54	47.312	ENSEBUG00000002646	-	58	56.452	Eptatretus_burgeri
ENSAMXG00000042358	nanos2	76	34.848	ENSEASG00005014235	NANOS2	80	38.519	Equus_asinus_asinus
ENSAMXG00000042358	nanos2	76	38.462	ENSEASG00005015313	NANOS3	63	38.462	Equus_asinus_asinus
ENSAMXG00000042358	nanos2	76	37.500	ENSECAG00000006033	NANOS2	80	38.519	Equus_caballus
ENSAMXG00000042358	nanos2	76	38.462	ENSECAG00000016293	NANOS3	60	38.462	Equus_caballus
ENSAMXG00000042358	nanos2	76	40.602	ENSEEUG00000009930	NANOS2	80	40.602	Erinaceus_europaeus
ENSAMXG00000042358	nanos2	76	35.821	ENSEEUG00000009900	NANOS3	73	35.821	Erinaceus_europaeus
ENSAMXG00000042358	nanos2	76	35.294	ENSELUG00000016082	nanos3	81	35.294	Esox_lucius
ENSAMXG00000042358	nanos2	76	35.294	ENSELUG00000016582	-	75	35.294	Esox_lucius
ENSAMXG00000042358	nanos2	80	40.580	ENSELUG00000019091	-	81	40.580	Esox_lucius
ENSAMXG00000042358	nanos2	76	37.692	ENSFCAG00000027661	NANOS2	80	42.308	Felis_catus
ENSAMXG00000042358	nanos2	76	38.760	ENSFDAG00000018459	NANOS3	60	38.760	Fukomys_damarensis
ENSAMXG00000042358	nanos2	80	35.461	ENSFDAG00000016342	NANOS2	83	35.461	Fukomys_damarensis
ENSAMXG00000042358	nanos2	85	38.028	ENSFHEG00000012835	NANOS2	96	39.437	Fundulus_heteroclitus
ENSAMXG00000042358	nanos2	80	31.293	ENSFHEG00000017084	-	80	33.333	Fundulus_heteroclitus
ENSAMXG00000042358	nanos2	76	39.062	ENSGMOG00000015980	-	94	39.062	Gadus_morhua
ENSAMXG00000042358	nanos2	81	37.143	ENSGACG00000019003	nanos3	83	37.143	Gasterosteus_aculeatus
ENSAMXG00000042358	nanos2	76	39.844	ENSGACG00000004930	-	94	39.844	Gasterosteus_aculeatus
ENSAMXG00000042358	nanos2	84	38.028	ENSGAGG00000009500	NANOS2	74	38.028	Gopherus_agassizii
ENSAMXG00000042358	nanos2	77	34.848	ENSGAGG00000005591	-	62	34.848	Gopherus_agassizii
ENSAMXG00000042358	nanos2	76	36.154	ENSGGOG00000013447	NANOS2	96	36.601	Gorilla_gorilla
ENSAMXG00000042358	nanos2	76	36.429	ENSGGOG00000000964	NANOS3	67	36.429	Gorilla_gorilla
ENSAMXG00000042358	nanos2	89	36.913	ENSHBUG00000010726	-	56	36.913	Haplochromis_burtoni
ENSAMXG00000042358	nanos2	84	32.394	ENSHBUG00000016772	nanos2	86	34.437	Haplochromis_burtoni
ENSAMXG00000042358	nanos2	76	36.090	ENSHGLG00000019378	NANOS3	59	36.090	Heterocephalus_glaber_female
ENSAMXG00000042358	nanos2	76	36.090	ENSHGLG00100012652	NANOS3	59	36.090	Heterocephalus_glaber_male
ENSAMXG00000042358	nanos2	74	38.583	ENSHCOG00000014790	nanos3	74	38.583	Hippocampus_comes
ENSAMXG00000042358	nanos2	74	36.242	ENSIPUG00000008857	nanos3	79	38.816	Ictalurus_punctatus
ENSAMXG00000042358	nanos2	76	40.602	ENSIPUG00000007200	-	74	40.602	Ictalurus_punctatus
ENSAMXG00000042358	nanos2	85	42.484	ENSIPUG00000024113	nanos2	87	42.484	Ictalurus_punctatus
ENSAMXG00000042358	nanos2	74	42.636	ENSIPUG00000012246	-	63	42.636	Ictalurus_punctatus
ENSAMXG00000042358	nanos2	83	36.879	ENSSTOG00000021724	NANOS2	88	36.879	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAMXG00000042358	nanos2	76	38.168	ENSJJAG00000000545	Nanos3	59	38.931	Jaculus_jaculus
ENSAMXG00000042358	nanos2	88	31.156	ENSKMAG00000018767	nanos3	90	32.836	Kryptolebias_marmoratus
ENSAMXG00000042358	nanos2	82	40.146	ENSLBEG00000018836	nanos2	87	40.146	Labrus_bergylta
ENSAMXG00000042358	nanos2	68	42.500	ENSLACG00000015195	NANOS1	54	42.500	Latimeria_chalumnae
ENSAMXG00000042358	nanos2	80	35.294	ENSLACG00000014980	-	83	35.294	Latimeria_chalumnae
ENSAMXG00000042358	nanos2	89	34.667	ENSLACG00000013286	NANOS3	91	34.667	Latimeria_chalumnae
ENSAMXG00000042358	nanos2	76	37.037	ENSLAFG00000014090	NANOS2	80	37.037	Loxodonta_africana
ENSAMXG00000042358	nanos2	76	36.154	ENSMFAG00000017215	NANOS2	80	37.692	Macaca_fascicularis
ENSAMXG00000042358	nanos2	76	36.923	ENSMMUG00000008316	NANOS3	65	38.462	Macaca_mulatta
ENSAMXG00000042358	nanos2	76	36.154	ENSMMUG00000008103	NANOS2	80	37.692	Macaca_mulatta
ENSAMXG00000042358	nanos2	76	36.154	ENSMNEG00000004633	NANOS2	80	37.692	Macaca_nemestrina
ENSAMXG00000042358	nanos2	76	35.385	ENSMLEG00000001810	NANOS2	80	36.923	Mandrillus_leucophaeus
ENSAMXG00000042358	nanos2	77	35.766	ENSMAMG00000005577	NANOS2	76	35.766	Mastacembelus_armatus
ENSAMXG00000042358	nanos2	84	32.877	ENSMZEG00005021987	-	86	34.437	Maylandia_zebra
ENSAMXG00000042358	nanos2	84	31.690	ENSMZEG00005024641	-	86	33.775	Maylandia_zebra
ENSAMXG00000042358	nanos2	84	32.394	ENSMZEG00005003043	-	86	34.437	Maylandia_zebra
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ENSAMXG00000042358	nanos2	84	31.690	ENSMZEG00005028148	-	86	33.775	Maylandia_zebra
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ENSAMXG00000042358	nanos2	76	37.500	ENSMAUG00000008396	Nanos3	60	37.500	Mesocricetus_auratus
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ENSAMXG00000042358	nanos2	87	35.762	ENSMUSG00000051965	Nanos2	96	35.762	Mus_musculus
ENSAMXG00000042358	nanos2	76	36.154	ENSMUSG00000056155	Nanos3	61	36.154	Mus_musculus
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ENSAMXG00000042358	nanos2	76	36.154	MGP_PahariEiJ_G0022902	Nanos3	59	36.154	Mus_pahari
ENSAMXG00000042358	nanos2	87	36.424	MGP_SPRETEiJ_G0030347	Nanos2	96	36.424	Mus_spretus
ENSAMXG00000042358	nanos2	76	36.154	MGP_SPRETEiJ_G0032414	Nanos3	60	36.154	Mus_spretus
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ENSAMXG00000042358	nanos2	76	39.062	ENSMLUG00000012971	NANOS3	61	39.062	Myotis_lucifugus
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ENSAMXG00000042358	nanos2	76	36.923	ENSNGAG00000020486	Nanos3	59	36.923	Nannospalax_galili
ENSAMXG00000042358	nanos2	89	36.913	ENSNBRG00000024149	-	56	36.913	Neolamprologus_brichardi
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ENSAMXG00000042358	nanos2	79	35.795	ENSORLG00020004967	nanos3	85	35.795	Oryzias_latipes_hni
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ENSAMXG00000042358	nanos2	75	39.683	ENSOARG00000008043	NANOS3	58	38.889	Ovis_aries
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ENSAMXG00000042358	nanos2	76	37.692	ENSPTIG00000015372	NANOS2	79	42.308	Panthera_tigris_altaica
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ENSAMXG00000042358	nanos2	76	36.154	ENSPANG00000009327	NANOS2	80	37.692	Papio_anubis
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ENSAMXG00000042358	nanos2	87	32.984	ENSXCOG00000014426	nanos3	89	35.079	Xiphophorus_couchianus
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