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Description

Ensembl ID: ENSAMXG00000042992 (Gene tree)
Gene ID: 103033562
Gene Symbol: apobec2a
Alias: apo2a|zgc:110762
Full Name: C->U-editing enzyme APOBEC-2-like
Gene Type: protein_coding
Species: Astyanax_mexicanus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 12547 bases
Position: chr22:17738518-17751064
Accession: 103033562
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAMXP00000042079	APOBEC_N	PF08210.11	2.4e-49	1	1
ENSAMXP00000042079	APOBEC_C	PF05240.14	5.8e-21	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAMXT00000046337	-	5137	XM_022682507	ENSAMXP00000042079	255 (aa)	XP_022538228	UPI000BBD5F32

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSAMXG00000042992	apobec2a	84	63.470	ENSAMXG00000015966	apobec2b	77	61.644
ENSAMXG00000042992	apobec2a	51	34.043	ENSAMXG00000037242	aicda	58	33.571

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAMXG00000042992	apobec2a	75	55.051	ENSG00000124701	APOBEC2	98	50.446	Homo_sapiens
ENSAMXG00000042992	apobec2a	83	58.685	ENSAPOG00000019390	apobec2b	77	57.746	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAMXG00000042992	apobec2a	84	48.624	ENSAMEG00000004467	APOBEC2	90	47.186	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAMXG00000042992	apobec2a	96	49.635	ENSACIG00000002472	APOBEC2	87	55.760	Amphilophus_citrinellus
ENSAMXG00000042992	apobec2a	70	65.922	ENSACIG00000016370	apobec2a	68	63.687	Amphilophus_citrinellus
ENSAMXG00000042992	apobec2a	96	62.097	ENSAOCG00000003291	apobec2a	84	63.380	Amphiprion_ocellaris
ENSAMXG00000042992	apobec2a	82	59.434	ENSAOCG00000023355	apobec2b	77	58.491	Amphiprion_ocellaris
ENSAMXG00000042992	apobec2a	96	61.694	ENSAPEG00000003630	apobec2a	84	62.911	Amphiprion_percula
ENSAMXG00000042992	apobec2a	96	50.929	ENSAPEG00000004591	apobec2b	77	58.216	Amphiprion_percula
ENSAMXG00000042992	apobec2a	83	58.216	ENSATEG00000023043	APOBEC2	99	48.905	Anabas_testudineus
ENSAMXG00000042992	apobec2a	100	56.031	ENSATEG00000000956	apobec2a	98	63.128	Anabas_testudineus
ENSAMXG00000042992	apobec2a	74	53.125	ENSAPLG00000002895	APOBEC2	93	47.926	Anas_platyrhynchos
ENSAMXG00000042992	apobec2a	78	49.754	ENSACAG00000016506	APOBEC2	95	50.549	Anolis_carolinensis
ENSAMXG00000042992	apobec2a	75	55.051	ENSANAG00000026993	APOBEC2	98	50.000	Aotus_nancymaae
ENSAMXG00000042992	apobec2a	70	61.798	ENSACLG00000026736	-	97	59.551	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000042992	apobec2a	96	50.000	ENSACLG00000007634	APOBEC2	77	56.338	Astatotilapia_calliptera
ENSAMXG00000042992	apobec2a	77	52.913	ENSBTAG00000005974	APOBEC2	69	49.550	Bos_taurus
ENSAMXG00000042992	apobec2a	77	54.106	ENSCJAG00000004063	APOBEC2	97	50.673	Callithrix_jacchus
ENSAMXG00000042992	apobec2a	75	54.040	ENSCAFG00000001575	APOBEC2	86	52.020	Canis_familiaris
ENSAMXG00000042992	apobec2a	75	54.040	ENSCAFG00020008306	APOBEC2	86	52.020	Canis_lupus_dingo
ENSAMXG00000042992	apobec2a	80	52.582	ENSCHIG00000026348	APOBEC2	96	49.774	Capra_hircus
ENSAMXG00000042992	apobec2a	75	54.822	ENSTSYG00000008206	APOBEC2	96	49.776	Carlito_syrichta
ENSAMXG00000042992	apobec2a	75	52.284	ENSCAPG00000015084	APOBEC2	93	48.148	Cavia_aperea
ENSAMXG00000042992	apobec2a	75	52.284	ENSCPOG00000036103	APOBEC2	93	48.148	Cavia_porcellus
ENSAMXG00000042992	apobec2a	75	55.051	ENSCCAG00000033987	APOBEC2	97	50.224	Cebus_capucinus
ENSAMXG00000042992	apobec2a	75	55.051	ENSCATG00000010691	APOBEC2	86	53.030	Cercocebus_atys
ENSAMXG00000042992	apobec2a	75	52.792	ENSCLAG00000013817	APOBEC2	93	48.611	Chinchilla_lanigera
ENSAMXG00000042992	apobec2a	75	55.051	ENSCSAG00000011177	APOBEC2	97	50.673	Chlorocebus_sabaeus
ENSAMXG00000042992	apobec2a	70	52.973	ENSCHOG00000008930	APOBEC2	100	50.811	Choloepus_hoffmanni
ENSAMXG00000042992	apobec2a	73	53.439	ENSCPBG00000017469	APOBEC2	87	51.020	Chrysemys_picta_bellii
ENSAMXG00000042992	apobec2a	75	55.556	ENSCANG00000035072	APOBEC2	96	51.351	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAMXG00000042992	apobec2a	77	55.122	ENSCGRG00001014983	Apobec2	94	52.315	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAMXG00000042992	apobec2a	77	55.122	ENSCGRG00000007835	Apobec2	94	52.315	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAMXG00000042992	apobec2a	100	58.333	ENSCSEG00000020201	apobec2a	80	64.251	Cynoglossus_semilaevis
ENSAMXG00000042992	apobec2a	75	56.250	ENSCSEG00000000690	-	83	51.327	Cynoglossus_semilaevis
ENSAMXG00000042992	apobec2a	93	55.508	ENSCVAG00000012342	apobec2b	78	56.075	Cyprinodon_variegatus
ENSAMXG00000042992	apobec2a	75	63.590	ENSDARG00000113992	apobec2b	70	61.538	Danio_rerio
ENSAMXG00000042992	apobec2a	99	63.780	ENSDARG00000018881	apobec2a	92	60.938	Danio_rerio
ENSAMXG00000042992	apobec2a	75	35.644	ENSDNOG00000033914	APOBEC2	100	33.906	Dasypus_novemcinctus
ENSAMXG00000042992	apobec2a	80	52.804	ENSDORG00000006447	Apobec2	91	50.935	Dipodomys_ordii
ENSAMXG00000042992	apobec2a	75	53.535	ENSETEG00000000624	APOBEC2	93	49.770	Echinops_telfairi
ENSAMXG00000042992	apobec2a	64	54.545	ENSEASG00005002937	APOBEC2	84	52.121	Equus_asinus_asinus
ENSAMXG00000042992	apobec2a	75	54.315	ENSECAG00000006576	APOBEC2	86	52.284	Equus_caballus
ENSAMXG00000042992	apobec2a	75	51.777	ENSEEUG00000006046	APOBEC2	86	49.239	Erinaceus_europaeus
ENSAMXG00000042992	apobec2a	98	51.590	ENSELUG00000003736	apobec2a	72	63.981	Esox_lucius
ENSAMXG00000042992	apobec2a	75	54.040	ENSFCAG00000004108	APOBEC2	98	50.000	Felis_catus
ENSAMXG00000042992	apobec2a	74	43.750	ENSFALG00000003910	APOBEC2	95	39.908	Ficedula_albicollis
ENSAMXG00000042992	apobec2a	80	52.113	ENSFDAG00000006015	APOBEC2	100	48.035	Fukomys_damarensis
ENSAMXG00000042992	apobec2a	88	56.696	ENSFHEG00000005492	apobec2b	89	55.000	Fundulus_heteroclitus
ENSAMXG00000042992	apobec2a	75	56.771	ENSGMOG00000006819	apobec2b	85	52.804	Gadus_morhua
ENSAMXG00000042992	apobec2a	70	65.363	ENSGMOG00000007028	apobec2a	100	63.128	Gadus_morhua
ENSAMXG00000042992	apobec2a	74	52.850	ENSGALG00000003226	APOBEC2	96	47.706	Gallus_gallus
ENSAMXG00000042992	apobec2a	96	51.493	ENSGAFG00000007634	apobec2b	68	56.075	Gambusia_affinis
ENSAMXG00000042992	apobec2a	75	59.162	ENSGACG00000009663	apobec2b	92	54.245	Gasterosteus_aculeatus
ENSAMXG00000042992	apobec2a	75	68.229	ENSGACG00000011671	apobec2a	100	67.188	Gasterosteus_aculeatus
ENSAMXG00000042992	apobec2a	73	53.439	ENSGAGG00000010347	APOBEC2	87	51.020	Gopherus_agassizii
ENSAMXG00000042992	apobec2a	75	55.051	ENSGGOG00000001099	APOBEC2	94	50.673	Gorilla_gorilla
ENSAMXG00000042992	apobec2a	96	49.814	ENSHBUG00000005993	apobec2b	77	54.930	Haplochromis_burtoni
ENSAMXG00000042992	apobec2a	95	58.130	ENSHBUG00000015890	apobec2a	84	61.574	Haplochromis_burtoni
ENSAMXG00000042992	apobec2a	80	51.174	ENSHGLG00000017169	APOBEC2	99	47.619	Heterocephalus_glaber_female
ENSAMXG00000042992	apobec2a	80	51.174	ENSHGLG00100019442	APOBEC2	99	47.619	Heterocephalus_glaber_male
ENSAMXG00000042992	apobec2a	96	55.600	ENSHCOG00000020319	apobec2a	82	60.386	Hippocampus_comes
ENSAMXG00000042992	apobec2a	96	51.504	ENSHCOG00000002712	APOBEC2	79	58.216	Hippocampus_comes
ENSAMXG00000042992	apobec2a	100	62.452	ENSIPUG00000017355	apobec2a	61	66.063	Ictalurus_punctatus
ENSAMXG00000042992	apobec2a	97	54.851	ENSIPUG00000013784	Apobec2	78	60.930	Ictalurus_punctatus
ENSAMXG00000042992	apobec2a	77	54.369	ENSSTOG00000023643	APOBEC2	100	49.345	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAMXG00000042992	apobec2a	77	52.427	ENSJJAG00000009733	Apobec2	100	47.807	Jaculus_jaculus
ENSAMXG00000042992	apobec2a	96	50.549	ENSKMAG00000020631	apobec2b	98	50.752	Kryptolebias_marmoratus
ENSAMXG00000042992	apobec2a	100	56.420	ENSLBEG00000025214	apobec2a	85	59.434	Labrus_bergylta
ENSAMXG00000042992	apobec2a	86	54.260	ENSLBEG00000009422	-	77	52.252	Labrus_bergylta
ENSAMXG00000042992	apobec2a	89	50.000	ENSLACG00000015985	APOBEC2	88	51.691	Latimeria_chalumnae
ENSAMXG00000042992	apobec2a	79	61.386	ENSLOCG00000012415	apobec2b	76	56.542	Lepisosteus_oculatus
ENSAMXG00000042992	apobec2a	80	53.738	ENSLAFG00000016563	APOBEC2	100	50.218	Loxodonta_africana
ENSAMXG00000042992	apobec2a	75	55.051	ENSMFAG00000044645	APOBEC2	97	50.673	Macaca_fascicularis
ENSAMXG00000042992	apobec2a	75	55.051	ENSMMUG00000021171	APOBEC2	97	50.673	Macaca_mulatta
ENSAMXG00000042992	apobec2a	75	55.051	ENSMNEG00000045497	APOBEC2	97	50.673	Macaca_nemestrina
ENSAMXG00000042992	apobec2a	75	55.051	ENSMLEG00000028328	APOBEC2	97	50.673	Mandrillus_leucophaeus
ENSAMXG00000042992	apobec2a	96	58.635	ENSMAMG00000023685	apobec2a	96	56.452	Mastacembelus_armatus
ENSAMXG00000042992	apobec2a	95	52.263	ENSMAMG00000007926	APOBEC2	76	56.132	Mastacembelus_armatus
ENSAMXG00000042992	apobec2a	96	50.186	ENSMZEG00005027159	APOBEC2	77	55.399	Maylandia_zebra
ENSAMXG00000042992	apobec2a	93	60.169	ENSMZEG00005005240	-	88	64.368	Maylandia_zebra
ENSAMXG00000042992	apobec2a	92	47.059	ENSMGAG00000010173	APOBEC2	94	49.727	Meleagris_gallopavo
ENSAMXG00000042992	apobec2a	90	48.954	ENSMAUG00000011016	Apobec2	96	50.909	Mesocricetus_auratus
ENSAMXG00000042992	apobec2a	89	50.000	ENSMICG00000043339	APOBEC2	98	49.554	Microcebus_murinus
ENSAMXG00000042992	apobec2a	77	54.369	ENSMOCG00000001904	Apobec2	90	52.427	Microtus_ochrogaster
ENSAMXG00000042992	apobec2a	94	51.667	ENSMMOG00000008681	apobec2b	79	55.399	Mola_mola
ENSAMXG00000042992	apobec2a	81	50.230	ENSMODG00000013090	APOBEC2	96	48.848	Monodelphis_domestica
ENSAMXG00000042992	apobec2a	96	58.871	ENSMALG00000020523	apobec2a	87	60.829	Monopterus_albus
ENSAMXG00000042992	apobec2a	96	53.435	ENSMALG00000013779	APOBEC2	98	50.958	Monopterus_albus
ENSAMXG00000042992	apobec2a	77	54.369	MGP_CAROLIEiJ_G0021727	Apobec2	90	52.427	Mus_caroli
ENSAMXG00000042992	apobec2a	77	54.369	ENSMUSG00000040694	Apobec2	90	52.913	Mus_musculus
ENSAMXG00000042992	apobec2a	77	54.369	MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	90	52.427	Mus_pahari
ENSAMXG00000042992	apobec2a	75	53.807	ENSMPUG00000013691	APOBEC2	83	51.777	Mustela_putorius_furo
ENSAMXG00000042992	apobec2a	75	51.269	ENSMLUG00000011327	APOBEC2	84	50.761	Myotis_lucifugus
ENSAMXG00000042992	apobec2a	77	54.369	ENSNGAG00000013717	Apobec2	97	50.679	Nannospalax_galili
ENSAMXG00000042992	apobec2a	96	50.370	ENSNBRG00000018806	apobec2b	69	55.869	Neolamprologus_brichardi
ENSAMXG00000042992	apobec2a	75	69.110	ENSNBRG00000021776	apobec2a	87	62.273	Neolamprologus_brichardi
ENSAMXG00000042992	apobec2a	75	55.051	ENSNLEG00000005057	APOBEC2	96	50.901	Nomascus_leucogenys
ENSAMXG00000042992	apobec2a	81	52.074	ENSMEUG00000011623	APOBEC2	96	50.691	Notamacropus_eugenii
ENSAMXG00000042992	apobec2a	80	53.023	ENSOPRG00000014808	APOBEC2	96	50.224	Ochotona_princeps
ENSAMXG00000042992	apobec2a	75	53.807	ENSODEG00000016183	APOBEC2	95	48.869	Octodon_degus
ENSAMXG00000042992	apobec2a	95	58.537	ENSONIG00000004644	-	84	62.037	Oreochromis_niloticus
ENSAMXG00000042992	apobec2a	96	50.558	ENSONIG00000012289	apobec2b	79	54.795	Oreochromis_niloticus
ENSAMXG00000042992	apobec2a	66	51.744	ENSOANG00000000824	APOBEC2	98	48.370	Ornithorhynchus_anatinus
ENSAMXG00000042992	apobec2a	80	52.558	ENSOCUG00000028008	APOBEC2	100	48.918	Oryctolagus_cuniculus
ENSAMXG00000042992	apobec2a	100	50.530	ENSORLG00000022372	APOBEC2	78	55.869	Oryzias_latipes
ENSAMXG00000042992	apobec2a	93	63.333	ENSORLG00000010752	apobec2a	88	64.815	Oryzias_latipes
ENSAMXG00000042992	apobec2a	100	50.883	ENSORLG00020006164	APOBEC2	78	56.338	Oryzias_latipes_hni
ENSAMXG00000042992	apobec2a	93	63.333	ENSORLG00020004153	apobec2a	88	64.815	Oryzias_latipes_hni
ENSAMXG00000042992	apobec2a	95	55.187	ENSORLG00015022089	-	78	56.338	Oryzias_latipes_hsok
ENSAMXG00000042992	apobec2a	93	63.333	ENSORLG00015021781	apobec2a	88	64.815	Oryzias_latipes_hsok
ENSAMXG00000042992	apobec2a	93	62.500	ENSOMEG00000001311	apobec2a	88	64.352	Oryzias_melastigma
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ENSAMXG00000042992	apobec2a	96	60.976	ENSPMGG00000004044	apobec2a	97	58.367	Periophthalmus_magnuspinnatus
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ENSAMXG00000042992	apobec2a	75	56.122	ENSPCOG00000026935	APOBEC2	100	49.561	Propithecus_coquereli
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ENSAMXG00000042992	apobec2a	96	50.186	ENSPNYG00000016747	apobec2b	77	55.399	Pundamilia_nyererei
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ENSAMXG00000042992	apobec2a	100	74.627	ENSPNAG00000010382	apobec2a	100	72.388	Pygocentrus_nattereri
ENSAMXG00000042992	apobec2a	77	54.369	ENSRNOG00000012303	Apobec2	90	52.427	Rattus_norvegicus
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ENSAMXG00000042992	apobec2a	75	55.556	ENSRROG00000030082	APOBEC2	96	50.901	Rhinopithecus_roxellana
ENSAMXG00000042992	apobec2a	75	55.051	ENSSBOG00000028496	APOBEC2	97	50.224	Saimiri_boliviensis_boliviensis
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ENSAMXG00000042992	apobec2a	100	58.238	ENSSMAG00000001011	apobec2a	65	60.360	Scophthalmus_maximus
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ENSAMXG00000042992	apobec2a	76	47.761	ENSSPUG00000010839	APOBEC2	87	47.826	Sphenodon_punctatus
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ENSAMXG00000042992	apobec2a	77	53.398	ENSSSCG00000036018	APOBEC2	100	48.684	Sus_scrofa
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ENSAMXG00000042992	apobec2a	94	50.612	ENSTRUG00000012839	apobec2b	81	52.273	Takifugu_rubripes
ENSAMXG00000042992	apobec2a	87	54.299	ENSTNIG00000015038	apobec2b	81	53.636	Tetraodon_nigroviridis
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ENSAMXG00000042992	apobec2a	75	55.330	ENSUAMG00000027667	APOBEC2	98	50.655	Ursus_americanus
ENSAMXG00000042992	apobec2a	75	54.040	ENSVVUG00000026617	APOBEC2	99	47.368	Vulpes_vulpes
ENSAMXG00000042992	apobec2a	91	42.915	ENSXETG00000008007	apobec2	88	45.540	Xenopus_tropicalis
ENSAMXG00000042992	apobec2a	96	53.516	ENSXCOG00000007398	apobec2b	84	54.839	Xiphophorus_couchianus
ENSAMXG00000042992	apobec2a	96	50.554	ENSXMAG00000008134	apobec2b	78	54.839	Xiphophorus_maculatus