EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSANAG00000025320 (Gene tree)
Gene ID: 105711310
Gene Symbol: EFTUD2
Alias: SNRNP116|Snrp116|Snu114|U5-116KD
Full Name: elongation factor Tu GTP binding domain containing 2
Gene Type: protein_coding
Species: Aotus_nancymaae
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 60258 bases
Position: chrKZ201564.1:3358022-3418279
Accession: 105711310
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSANAP00000015082	GTP_EFTU	PF00009.27	4.5e-45	1	1
ENSANAP00000015087	GTP_EFTU	PF00009.27	5.5e-37	1	1
ENSANAP00000015094	GTP_EFTU	PF00009.27	1.2e-33	1	1
ENSANAP00000015094	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	1.7e-12	1	1
ENSANAP00000015087	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	1.7e-12	1	1
ENSANAP00000015082	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	1.7e-12	1	1
ENSANAP00000015087	EFG_IV	PF03764.18	3.4e-23	1	1
ENSANAP00000015094	EFG_IV	PF03764.18	3.4e-23	1	1
ENSANAP00000015082	EFG_IV	PF03764.18	3.5e-23	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSANAT00000032930	EFTUD2-203	2880	-	ENSANAP00000015094	959 (aa)	-	A0A2K5D2B1
ENSANAT00000032923	EFTUD2-202	2880	-	ENSANAP00000015087	959 (aa)	-	A0A2K5D2B2
ENSANAT00000032918	EFTUD2-201	2994	XM_021673697	ENSANAP00000015082	972 (aa)	XP_021529372	A0A2K5D2A7

Gene Model

Click here to download ENSANAG00000025320's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSANAG00000025320's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSANAG00000025320	EFTUD2	87	39.061	ENSANAG00000037323	EEF2	98	45.758
ENSANAG00000025320	EFTUD2	51	30.986	ENSANAG00000035983	GFM1	60	30.986

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	99.897	ENSG00000108883	EFTUD2	100	100.000	Homo_sapiens
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	92.284	ENSAPOG00000002433	eftud2	100	92.078	Acanthochromis_polyacanthus
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	99.794	ENSAMEG00000018390	EFTUD2	100	99.794	Ailuropoda_melanoleuca
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	89.512	ENSACIG00000009096	eftud2	100	89.304	Amphilophus_citrinellus
ENSANAG00000025320	EFTUD2	88	87.158	ENSAOCG00000023385	eftud2	100	88.118	Amphiprion_ocellaris
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	92.387	ENSAPEG00000003321	eftud2	100	92.181	Amphiprion_percula
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	92.695	ENSATEG00000000457	eftud2	100	92.490	Anabas_testudineus
ENSANAG00000025320	EFTUD2	99	94.336	ENSAPLG00000011036	EFTUD2	99	94.336	Anas_platyrhynchos
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	97.737	ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	97.737	Anolis_carolinensis
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	92.284	ENSACLG00000001296	eftud2	100	92.078	Astatotilapia_calliptera
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	91.709	ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.607	Astyanax_mexicanus
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	99.486	ENSBTAG00000013526	EFTUD2	100	99.486	Bos_taurus
ENSANAG00000025320	EFTUD2	99	70.145	WBGene00001166	eftu-2	99	69.938	Caenorhabditis_elegans
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	100.000	ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	100.000	Callithrix_jacchus
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	99.794	ENSCAFG00000014065	EFTUD2	100	99.794	Canis_familiaris
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	99.794	ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	99.794	Canis_lupus_dingo
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	99.486	ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	99.486	Capra_hircus
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	99.588	ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	99.588	Carlito_syrichta
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	98.971	ENSCAPG00000014639	EFTUD2	100	98.971	Cavia_aperea
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	98.971	ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	98.971	Cavia_porcellus
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	100.000	ENSCCAG00000035302	EFTUD2	100	100.000	Cebus_capucinus
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	100.000	ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	100.000	Cercocebus_atys
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	98.868	ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	98.868	Chinchilla_lanigera
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	100.000	ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	100.000	Chlorocebus_sabaeus
ENSANAG00000025320	EFTUD2	91	86.824	ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.824	Choloepus_hoffmanni
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	98.663	ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	98.663	Chrysemys_picta_bellii
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	77.538	ENSCING00000009372	-	100	77.538	Ciona_intestinalis
ENSANAG00000025320	EFTUD2	99	78.004	ENSCSAVG00000004985	-	99	79.717	Ciona_savignyi
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	100.000	ENSCANG00000026557	EFTUD2	100	100.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	99.486	ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	99.486	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	99.486	ENSCGRG00000003825	Eftud2	100	99.486	Cricetulus_griseus_crigri
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	91.872	ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.667	Cynoglossus_semilaevis
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	92.284	ENSCVAG00000012537	eftud2	100	92.078	Cyprinodon_variegatus
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	91.059	ENSDARG00000012261	eftud2	100	91.152	Danio_rerio
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	99.383	ENSDNOG00000008033	EFTUD2	100	99.383	Dasypus_novemcinctus
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	99.383	ENSDORG00000011566	Eftud2	100	99.383	Dipodomys_ordii
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	75.077	FBgn0039566	CG4849	100	75.077	Drosophila_melanogaster
ENSANAG00000025320	EFTUD2	92	99.457	ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	Echinops_telfairi
ENSANAG00000025320	EFTUD2	75	93.035	ENSEBUG00000004047	-	96	86.926	Eptatretus_burgeri
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	99.794	ENSEASG00005010321	EFTUD2	100	99.794	Equus_asinus_asinus
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	99.691	ENSECAG00000019363	EFTUD2	93	99.691	Equus_caballus
ENSANAG00000025320	EFTUD2	83	100.000	ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	90.947	ENSELUG00000017169	eftud2	100	90.947	Esox_lucius
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	99.691	ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	99.691	Felis_catus
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	97.942	ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	97.942	Ficedula_albicollis
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	99.177	ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	99.177	Fukomys_damarensis
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	92.387	ENSFHEG00000013479	eftud2	100	92.181	Fundulus_heteroclitus
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	91.255	ENSGMOG00000014277	eftud2	100	91.667	Gadus_morhua
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	98.045	ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.599	Gallus_gallus
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	92.078	ENSGAFG00000002263	eftud2	100	91.975	Gambusia_affinis
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	91.770	ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.564	Gasterosteus_aculeatus
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	100.000	ENSGGOG00000012999	EFTUD2	100	100.000	Gorilla_gorilla
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	92.181	ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.975	Haplochromis_burtoni
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	98.765	ENSHGLG00000014497	EFTUD2	100	98.765	Heterocephalus_glaber_female
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	98.765	ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	98.765	Heterocephalus_glaber_male
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	91.049	ENSHCOG00000017689	eftud2	100	91.049	Hippocampus_comes
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	91.358	ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	91.975	Ictalurus_punctatus
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	93.519	ENSSTOG00000012188	EFTUD2	99	94.645	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSANAG00000025320	EFTUD2	96	99.466	ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	99.466	Jaculus_jaculus
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	91.770	ENSKMAG00000021027	eftud2	100	91.564	Kryptolebias_marmoratus
ENSANAG00000025320	EFTUD2	95	91.802	ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.706	Labrus_bergylta
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	94.342	ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.861	Latimeria_chalumnae
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	92.181	ENSLOCG00000011460	eftud2	100	92.181	Lepisosteus_oculatus
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	99.280	ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	99.280	Loxodonta_africana
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	100.000	ENSMFAG00000042655	EFTUD2	100	100.000	Macaca_fascicularis
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	100.000	ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	Macaca_mulatta
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	100.000	ENSMNEG00000037895	EFTUD2	100	100.000	Macaca_nemestrina
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	100.000	ENSMLEG00000032960	EFTUD2	100	100.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	92.695	ENSMAMG00000022190	eftud2	100	92.490	Mastacembelus_armatus
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	92.284	ENSMZEG00005022885	eftud2	100	92.078	Maylandia_zebra
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	98.049	ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	98.049	Meleagris_gallopavo
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	99.486	ENSMAUG00000021178	Eftud2	100	99.486	Mesocricetus_auratus
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	100.000	ENSMICG00000016592	EFTUD2	100	100.000	Microcebus_murinus
ENSANAG00000025320	EFTUD2	91	83.010	ENSMOCG00000017653	-	90	83.010	Microtus_ochrogaster
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	99.588	ENSMOCG00000009039	-	100	99.588	Microtus_ochrogaster
ENSANAG00000025320	EFTUD2	88	92.985	ENSMMOG00000020811	eftud2	100	93.882	Mola_mola
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	99.588	ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	99.588	Monodelphis_domestica
ENSANAG00000025320	EFTUD2	88	91.320	ENSMALG00000014501	eftud2	100	92.118	Monopterus_albus
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	99.280	MGP_CAROLIEiJ_G0017263	Eftud2	100	99.280	Mus_caroli
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	99.280	ENSMUSG00000020929	Eftud2	100	99.280	Mus_musculus
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	99.280	MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	99.280	Mus_pahari
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	99.280	MGP_SPRETEiJ_G0018106	Eftud2	100	99.280	Mus_spretus
ENSANAG00000025320	EFTUD2	97	99.576	ENSMPUG00000009136	EFTUD2	90	99.576	Mustela_putorius_furo
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	99.794	ENSMLUG00000012164	EFTUD2	99	99.794	Myotis_lucifugus
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	99.486	ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	99.486	Nannospalax_galili
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	92.181	ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.975	Neolamprologus_brichardi
ENSANAG00000025320	EFTUD2	97	98.193	ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	98.193	Nomascus_leucogenys
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	95.988	ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	95.988	Notamacropus_eugenii
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	91.461	ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	91.461	Ochotona_princeps
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	98.560	ENSODEG00000018041	-	100	98.560	Octodon_degus
ENSANAG00000025320	EFTUD2	93	79.741	ENSODEG00000003385	-	100	79.741	Octodon_degus
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	92.284	ENSONIG00000000912	eftud2	100	92.078	Oreochromis_niloticus
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	99.794	ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	99.794	Oryctolagus_cuniculus
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	91.872	ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.872	Oryzias_latipes
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	91.770	ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.770	Oryzias_latipes_hni
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	91.770	ENSORLG00015002611	eftud2	100	93.573	Oryzias_latipes_hsok
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	97.737	ENSOGAG00000012918	EFTUD2	100	97.737	Otolemur_garnettii
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	99.486	ENSOARG00000009078	EFTUD2	97	99.486	Ovis_aries
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	99.897	ENSPPAG00000029450	EFTUD2	100	99.897	Pan_paniscus
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	99.794	ENSPPRG00000010981	EFTUD2	100	99.794	Panthera_pardus
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	99.794	ENSPTIG00000007703	EFTUD2	100	99.794	Panthera_tigris_altaica
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	99.897	ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	99.897	Pan_troglodytes
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	100.000	ENSPANG00000021284	EFTUD2	100	100.000	Papio_anubis
ENSANAG00000025320	EFTUD2	93	97.133	ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	97.133	Pelodiscus_sinensis
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	84.568	ENSPMGG00000007281	eftud2	100	84.465	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	99.486	ENSPEMG00000005129	Eftud2	100	99.486	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	99.691	ENSPCIG00000015027	EFTUD2	100	99.691	Phascolarctos_cinereus
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	92.078	ENSPFOG00000008515	eftud2	100	91.975	Poecilia_formosa
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	92.078	ENSPLAG00000010393	eftud2	100	91.975	Poecilia_latipinna
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	92.078	ENSPMEG00000005087	eftud2	100	91.975	Poecilia_mexicana
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	98.853	ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	98.853	Pongo_abelii
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	95.679	ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	95.679	Procavia_capensis
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	99.897	ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	99.897	Propithecus_coquereli
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	94.856	ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	94.856	Pteropus_vampyrus
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	92.181	ENSPNYG00000012448	eftud2	100	91.975	Pundamilia_nyererei
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	91.975	ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.490	Pygocentrus_nattereri
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	99.280	ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	99.280	Rattus_norvegicus
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	99.897	ENSRBIG00000043255	EFTUD2	100	99.897	Rhinopithecus_bieti
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	99.897	ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	99.897	Rhinopithecus_roxellana
ENSANAG00000025320	EFTUD2	97	34.091	YKL173W	SNU114	97	33.893	Saccharomyces_cerevisiae
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	100.000	ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	100.000	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSANAG00000025320	EFTUD2	97	99.680	ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	99.680	Sarcophilus_harrisii
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	91.667	ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.667	Scleropages_formosus
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	92.078	ENSSMAG00000010174	eftud2	100	91.872	Scophthalmus_maximus
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	92.387	ENSSDUG00000022675	eftud2	100	92.181	Seriola_dumerili
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	92.490	ENSSLDG00000001595	eftud2	100	92.284	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	91.152	ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	91.152	Sorex_araneus
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	97.634	ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	97.634	Sphenodon_punctatus
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	92.490	ENSSPAG00000016235	eftud2	99	92.284	Stegastes_partitus
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	99.588	ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	99.588	Sus_scrofa
ENSANAG00000025320	EFTUD2	84	97.324	ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	97.324	Taeniopygia_guttata
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	91.461	ENSTRUG00000016422	eftud2	100	91.255	Takifugu_rubripes
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	87.474	ENSTNIG00000005346	eftud2	99	87.267	Tetraodon_nigroviridis
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	94.342	ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	94.342	Tupaia_belangeri
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	90.947	ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	90.947	Tursiops_truncatus
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	98.665	ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	98.665	Ursus_americanus
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	99.794	ENSUMAG00000014323	EFTUD2	100	99.794	Ursus_maritimus
ENSANAG00000025320	EFTUD2	88	100.000	ENSVPAG00000002748	EFTUD2	88	100.000	Vicugna_pacos
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	99.794	ENSVVUG00000018113	EFTUD2	100	99.794	Vulpes_vulpes
ENSANAG00000025320	EFTUD2	97	94.883	ENSXETG00000003394	eftud2	98	95.865	Xenopus_tropicalis
ENSANAG00000025320	EFTUD2	81	93.495	ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.495	Xiphophorus_couchianus
ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	92.078	ENSXMAG00000008494	eftud2	100	91.975	Xiphophorus_maculatus