EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSANAG00000032473 (Gene tree)
Gene ID: 105708608
Gene Symbol: SYF2
Alias: CBPIN|DKFZp564O2082|NTC31|fSAP29|p29
Full Name: SYF2 pre-mRNA splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Aotus_nancymaae
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 10335 bases
Position: chrKZ207330.1:11398112-11408446
Accession: 105708608
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSANAP00000029405	SYF2	PF08231.12	2.3e-54	1	1
ENSANAP00000029397	SYF2	PF08231.12	5.9e-54	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSANAT00000047426	SYF2-201	3236	XM_012440197	ENSANAP00000029397	243 (aa)	XP_012295620	A0A2K5E822
ENSANAT00000047433	SYF2-202	606	-	ENSANAP00000029405	201 (aa)	-	A0A2K5E840

Gene Model

Click here to download ENSANAG00000032473's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSANAG00000032473's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSANAG00000032473	SYF2	100	97.531	ENSG00000117614	SYF2	100	97.531	Homo_sapiens
ENSANAG00000032473	SYF2	91	84.545	ENSAPOG00000001174	syf2	91	85.185	Acanthochromis_polyacanthus
ENSANAG00000032473	SYF2	98	92.531	ENSAMEG00000010115	-	99	92.531	Ailuropoda_melanoleuca
ENSANAG00000032473	SYF2	80	96.923	ENSAMEG00000010134	-	100	96.923	Ailuropoda_melanoleuca
ENSANAG00000032473	SYF2	93	80.087	ENSACIG00000023688	syf2	86	82.791	Amphilophus_citrinellus
ENSANAG00000032473	SYF2	99	80.417	ENSAOCG00000022046	syf2	92	85.648	Amphiprion_ocellaris
ENSANAG00000032473	SYF2	84	83.744	ENSAOCG00000010912	syf2	62	84.422	Amphiprion_ocellaris
ENSANAG00000032473	SYF2	99	80.417	ENSAPEG00000018858	syf2	83	85.648	Amphiprion_percula
ENSANAG00000032473	SYF2	89	83.410	ENSATEG00000007745	syf2	91	83.796	Anabas_testudineus
ENSANAG00000032473	SYF2	82	89.000	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	89.000	Anas_platyrhynchos
ENSANAG00000032473	SYF2	84	85.784	ENSACAG00000013653	-	100	85.784	Anolis_carolinensis
ENSANAG00000032473	SYF2	79	75.625	ENSACAG00000026777	-	96	75.625	Anolis_carolinensis
ENSANAG00000032473	SYF2	90	81.735	ENSACLG00000019916	syf2	91	82.870	Astatotilapia_calliptera
ENSANAG00000032473	SYF2	99	77.917	ENSAMXG00000004051	syf2	100	77.500	Astyanax_mexicanus
ENSANAG00000032473	SYF2	100	92.653	ENSBTAG00000001651	SYF2	97	96.070	Bos_taurus
ENSANAG00000032473	SYF2	86	50.952	WBGene00019402	syf-2	90	50.711	Caenorhabditis_elegans
ENSANAG00000032473	SYF2	100	99.177	ENSCJAG00000046570	SYF2	100	99.177	Callithrix_jacchus
ENSANAG00000032473	SYF2	93	88.889	ENSCAFG00000030331	-	100	83.128	Canis_familiaris
ENSANAG00000032473	SYF2	99	94.262	ENSCAFG00000012895	-	99	94.262	Canis_familiaris
ENSANAG00000032473	SYF2	99	94.262	ENSCAFG00020021091	-	99	94.262	Canis_lupus_dingo
ENSANAG00000032473	SYF2	95	88.421	ENSCAFG00020021094	-	97	88.421	Canis_lupus_dingo
ENSANAG00000032473	SYF2	100	92.593	ENSCHIG00000020874	SYF2	99	93.724	Capra_hircus
ENSANAG00000032473	SYF2	100	93.416	ENSTSYG00000005114	SYF2	100	93.416	Carlito_syrichta
ENSANAG00000032473	SYF2	81	98.990	ENSCAPG00000010006	SYF2	100	98.990	Cavia_aperea
ENSANAG00000032473	SYF2	100	93.033	ENSCPOG00000005326	SYF2	100	93.033	Cavia_porcellus
ENSANAG00000032473	SYF2	100	99.588	ENSCCAG00000022459	SYF2	100	99.588	Cebus_capucinus
ENSANAG00000032473	SYF2	100	96.708	ENSCATG00000026917	SYF2	100	96.708	Cercocebus_atys
ENSANAG00000032473	SYF2	100	94.262	ENSCLAG00000008474	SYF2	100	94.262	Chinchilla_lanigera
ENSANAG00000032473	SYF2	100	96.708	ENSCSAG00000000948	SYF2	100	96.708	Chlorocebus_sabaeus
ENSANAG00000032473	SYF2	74	77.348	ENSCHOG00000005273	-	100	75.000	Choloepus_hoffmanni
ENSANAG00000032473	SYF2	93	88.889	ENSCPBG00000025073	SYF2	94	87.124	Chrysemys_picta_bellii
ENSANAG00000032473	SYF2	87	53.521	ENSCING00000003017	-	89	53.052	Ciona_intestinalis
ENSANAG00000032473	SYF2	87	51.174	ENSCSAVG00000006627	-	97	51.174	Ciona_savignyi
ENSANAG00000032473	SYF2	100	83.539	ENSCANG00000037322	SYF2	100	83.539	Colobus_angolensis_palliatus
ENSANAG00000032473	SYF2	100	90.535	ENSCGRG00001020733	Syf2	100	90.535	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSANAG00000032473	SYF2	82	95.980	ENSCGRG00000005095	Syf2	96	95.980	Cricetulus_griseus_crigri
ENSANAG00000032473	SYF2	90	78.440	ENSCSEG00000000117	syf2	90	79.070	Cynoglossus_semilaevis
ENSANAG00000032473	SYF2	91	81.818	ENSCVAG00000019543	syf2	90	82.407	Cyprinodon_variegatus
ENSANAG00000032473	SYF2	99	78.333	ENSDARG00000004706	syf2	99	78.333	Danio_rerio
ENSANAG00000032473	SYF2	99	93.416	ENSDNOG00000047605	SYF2	99	93.004	Dasypus_novemcinctus
ENSANAG00000032473	SYF2	99	92.562	ENSDORG00000001274	Syf2	99	92.562	Dipodomys_ordii
ENSANAG00000032473	SYF2	90	57.273	FBgn0033556	CG12343	92	58.937	Drosophila_melanogaster
ENSANAG00000032473	SYF2	94	76.856	ENSETEG00000015729	SYF2	100	76.856	Echinops_telfairi
ENSANAG00000032473	SYF2	89	56.044	ENSEBUG00000015402	syf2	95	60.406	Eptatretus_burgeri
ENSANAG00000032473	SYF2	100	81.893	ENSEASG00005004232	-	100	81.893	Equus_asinus_asinus
ENSANAG00000032473	SYF2	100	92.653	ENSEASG00005004224	-	100	92.245	Equus_asinus_asinus
ENSANAG00000032473	SYF2	100	93.469	ENSECAG00000012023	-	100	93.061	Equus_caballus
ENSANAG00000032473	SYF2	99	92.562	ENSECAG00000010440	-	99	92.149	Equus_caballus
ENSANAG00000032473	SYF2	75	81.421	ENSEEUG00000015084	SYF2	100	81.421	Erinaceus_europaeus
ENSANAG00000032473	SYF2	96	81.092	ENSELUG00000003465	syf2	99	78.776	Esox_lucius
ENSANAG00000032473	SYF2	99	93.443	ENSFCAG00000043095	-	99	93.443	Felis_catus
ENSANAG00000032473	SYF2	100	94.286	ENSFCAG00000010324	-	85	94.286	Felis_catus
ENSANAG00000032473	SYF2	84	85.784	ENSFALG00000000460	SYF2	88	85.185	Ficedula_albicollis
ENSANAG00000032473	SYF2	100	93.416	ENSFDAG00000008310	SYF2	100	93.416	Fukomys_damarensis
ENSANAG00000032473	SYF2	90	67.727	ENSFHEG00000007238	syf2	96	67.742	Fundulus_heteroclitus
ENSANAG00000032473	SYF2	88	84.651	ENSGMOG00000019138	syf2	96	84.651	Gadus_morhua
ENSANAG00000032473	SYF2	93	87.665	ENSGALG00000013639	SYF2	99	82.800	Gallus_gallus
ENSANAG00000032473	SYF2	100	74.486	ENSGAFG00000019435	syf2	91	81.019	Gambusia_affinis
ENSANAG00000032473	SYF2	88	83.721	ENSGACG00000007305	syf2	90	83.721	Gasterosteus_aculeatus
ENSANAG00000032473	SYF2	93	89.333	ENSGAGG00000010670	SYF2	94	87.554	Gopherus_agassizii
ENSANAG00000032473	SYF2	100	97.942	ENSGGOG00000012796	SYF2	100	97.942	Gorilla_gorilla
ENSANAG00000032473	SYF2	93	79.221	ENSHBUG00000020477	syf2	93	82.870	Haplochromis_burtoni
ENSANAG00000032473	SYF2	93	84.141	ENSHGLG00000004304	-	99	80.417	Heterocephalus_glaber_female
ENSANAG00000032473	SYF2	100	93.852	ENSHGLG00000014393	SYF2	100	93.852	Heterocephalus_glaber_female
ENSANAG00000032473	SYF2	100	93.852	ENSHGLG00100014722	SYF2	100	93.852	Heterocephalus_glaber_male
ENSANAG00000032473	SYF2	98	78.008	ENSHCOG00000012904	syf2	79	77.593	Hippocampus_comes
ENSANAG00000032473	SYF2	90	84.404	ENSIPUG00000019859	syf2	91	85.185	Ictalurus_punctatus
ENSANAG00000032473	SYF2	60	97.945	ENSSTOG00000023984	SYF2	100	97.945	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSANAG00000032473	SYF2	82	97.990	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	97.990	Jaculus_jaculus
ENSANAG00000032473	SYF2	99	76.667	ENSKMAG00000013856	syf2	91	82.870	Kryptolebias_marmoratus
ENSANAG00000032473	SYF2	90	83.562	ENSLBEG00000014425	syf2	91	84.259	Labrus_bergylta
ENSANAG00000032473	SYF2	90	86.239	ENSLACG00000012064	SYF2	91	86.574	Latimeria_chalumnae
ENSANAG00000032473	SYF2	97	81.277	ENSLOCG00000002728	syf2	92	81.277	Lepisosteus_oculatus
ENSANAG00000032473	SYF2	100	92.245	ENSLAFG00000023150	-	100	91.837	Loxodonta_africana
ENSANAG00000032473	SYF2	75	65.217	ENSLAFG00000030814	-	100	65.217	Loxodonta_africana
ENSANAG00000032473	SYF2	100	97.119	ENSMFAG00000041831	SYF2	100	97.119	Macaca_fascicularis
ENSANAG00000032473	SYF2	100	97.119	ENSMMUG00000002968	SYF2	100	97.119	Macaca_mulatta
ENSANAG00000032473	SYF2	100	97.119	ENSMNEG00000030180	SYF2	100	97.119	Macaca_nemestrina
ENSANAG00000032473	SYF2	100	96.708	ENSMLEG00000030248	SYF2	100	96.708	Mandrillus_leucophaeus
ENSANAG00000032473	SYF2	89	82.028	ENSMAMG00000010403	syf2	90	82.407	Mastacembelus_armatus
ENSANAG00000032473	SYF2	95	78.390	ENSMZEG00005006429	syf2	91	82.870	Maylandia_zebra
ENSANAG00000032473	SYF2	82	89.447	ENSMGAG00000002019	SYF2	100	89.447	Meleagris_gallopavo
ENSANAG00000032473	SYF2	100	90.947	ENSMAUG00000018974	Syf2	100	90.947	Mesocricetus_auratus
ENSANAG00000032473	SYF2	88	98.305	ENSMICG00000016191	SYF2	100	98.492	Microcebus_murinus
ENSANAG00000032473	SYF2	100	92.181	ENSMOCG00000022938	Syf2	100	92.181	Microtus_ochrogaster
ENSANAG00000032473	SYF2	90	80.365	ENSMMOG00000002396	syf2	90	80.556	Mola_mola
ENSANAG00000032473	SYF2	92	88.938	ENSMODG00000013951	-	95	89.908	Monodelphis_domestica
ENSANAG00000032473	SYF2	90	82.727	ENSMALG00000010706	syf2	90	83.410	Monopterus_albus
ENSANAG00000032473	SYF2	100	91.358	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	100	91.358	Mus_caroli
ENSANAG00000032473	SYF2	100	91.358	ENSMUSG00000028821	Syf2	100	91.358	Mus_musculus
ENSANAG00000032473	SYF2	100	91.358	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	100	91.358	Mus_pahari
ENSANAG00000032473	SYF2	100	91.358	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	100	91.358	Mus_spretus
ENSANAG00000032473	SYF2	99	93.443	ENSMPUG00000015802	-	99	93.443	Mustela_putorius_furo
ENSANAG00000032473	SYF2	98	94.167	ENSMPUG00000015801	-	98	94.167	Mustela_putorius_furo
ENSANAG00000032473	SYF2	98	92.917	ENSMLUG00000001885	SYF2	98	92.500	Myotis_lucifugus
ENSANAG00000032473	SYF2	99	92.245	ENSNGAG00000007912	Syf2	99	92.245	Nannospalax_galili
ENSANAG00000032473	SYF2	97	72.083	ENSNBRG00000010720	syf2	100	70.000	Neolamprologus_brichardi
ENSANAG00000032473	SYF2	100	98.354	ENSNLEG00000035185	SYF2	100	98.354	Nomascus_leucogenys
ENSANAG00000032473	SYF2	100	91.358	ENSOPRG00000012870	SYF2	100	91.358	Ochotona_princeps
ENSANAG00000032473	SYF2	96	94.850	ENSODEG00000017664	-	98	94.850	Octodon_degus
ENSANAG00000032473	SYF2	96	84.549	ENSODEG00000014338	-	98	84.549	Octodon_degus
ENSANAG00000032473	SYF2	90	81.735	ENSONIG00000008213	syf2	91	82.407	Oreochromis_niloticus
ENSANAG00000032473	SYF2	83	91.089	ENSOANG00000009552	SYF2	100	91.089	Ornithorhynchus_anatinus
ENSANAG00000032473	SYF2	100	94.262	ENSOCUG00000013050	SYF2	100	94.262	Oryctolagus_cuniculus
ENSANAG00000032473	SYF2	93	80.617	ENSORLG00000028820	syf2	93	83.796	Oryzias_latipes
ENSANAG00000032473	SYF2	96	78.903	ENSORLG00020018333	syf2	91	83.796	Oryzias_latipes_hni
ENSANAG00000032473	SYF2	99	77.083	ENSORLG00015014665	syf2	91	83.796	Oryzias_latipes_hsok
ENSANAG00000032473	SYF2	96	78.992	ENSOMEG00000013911	syf2	91	84.259	Oryzias_melastigma
ENSANAG00000032473	SYF2	99	93.802	ENSOGAG00000009962	SYF2	99	93.802	Otolemur_garnettii
ENSANAG00000032473	SYF2	80	67.692	ENSOARG00000006269	-	100	67.692	Ovis_aries
ENSANAG00000032473	SYF2	100	92.713	ENSOARG00000006348	-	100	92.713	Ovis_aries
ENSANAG00000032473	SYF2	100	97.942	ENSPPAG00000036579	SYF2	100	97.942	Pan_paniscus
ENSANAG00000032473	SYF2	99	93.443	ENSPPRG00000001651	-	99	93.443	Panthera_pardus
ENSANAG00000032473	SYF2	100	93.902	ENSPPRG00000001638	-	100	93.902	Panthera_pardus
ENSANAG00000032473	SYF2	99	93.443	ENSPTIG00000007036	-	99	93.033	Panthera_tigris_altaica
ENSANAG00000032473	SYF2	93	97.345	ENSPTIG00000005711	-	82	97.345	Panthera_tigris_altaica
ENSANAG00000032473	SYF2	100	97.942	ENSPTRG00000000352	SYF2	100	97.942	Pan_troglodytes
ENSANAG00000032473	SYF2	100	97.119	ENSPANG00000008139	SYF2	100	97.119	Papio_anubis
ENSANAG00000032473	SYF2	99	79.583	ENSPKIG00000008130	syf2	99	79.583	Paramormyrops_kingsleyae
ENSANAG00000032473	SYF2	96	86.266	ENSPSIG00000011816	SYF2	91	86.266	Pelodiscus_sinensis
ENSANAG00000032473	SYF2	98	76.349	ENSPMGG00000008755	syf2	84	82.870	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSANAG00000032473	SYF2	100	91.358	ENSPEMG00000008283	Syf2	100	91.358	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSANAG00000032473	SYF2	92	94.196	ENSPCIG00000014235	SYF2	86	95.833	Phascolarctos_cinereus
ENSANAG00000032473	SYF2	90	80.734	ENSPFOG00000004116	syf2	89	81.019	Poecilia_formosa
ENSANAG00000032473	SYF2	98	74.180	ENSPLAG00000006691	syf2	92	81.395	Poecilia_latipinna
ENSANAG00000032473	SYF2	100	72.428	ENSPMEG00000011684	syf2	97	73.932	Poecilia_mexicana
ENSANAG00000032473	SYF2	89	81.481	ENSPREG00000003009	syf2	91	81.481	Poecilia_reticulata
ENSANAG00000032473	SYF2	100	97.942	ENSPPYG00000001713	SYF2	100	97.942	Pongo_abelii
ENSANAG00000032473	SYF2	100	76.617	ENSPCOG00000027011	SYF2	100	76.617	Propithecus_coquereli
ENSANAG00000032473	SYF2	99	81.481	ENSPVAG00000005841	SYF2	99	81.481	Pteropus_vampyrus
ENSANAG00000032473	SYF2	90	81.735	ENSPNYG00000004979	syf2	91	82.870	Pundamilia_nyererei
ENSANAG00000032473	SYF2	100	79.835	ENSPNAG00000015570	syf2	100	79.424	Pygocentrus_nattereri
ENSANAG00000032473	SYF2	100	91.358	ENSRNOG00000060597	Syf2	100	91.358	Rattus_norvegicus
ENSANAG00000032473	SYF2	100	94.650	ENSRBIG00000042970	SYF2	100	94.650	Rhinopithecus_bieti
ENSANAG00000032473	SYF2	100	97.119	ENSRROG00000001347	SYF2	100	97.119	Rhinopithecus_roxellana
ENSANAG00000032473	SYF2	100	98.354	ENSSBOG00000020184	SYF2	100	98.354	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSANAG00000032473	SYF2	84	94.175	ENSSHAG00000007152	-	100	94.175	Sarcophilus_harrisii
ENSANAG00000032473	SYF2	92	92.411	ENSSHAG00000015630	-	87	93.519	Sarcophilus_harrisii
ENSANAG00000032473	SYF2	90	84.862	ENSSFOG00015023647	syf2	91	85.185	Scleropages_formosus
ENSANAG00000032473	SYF2	90	82.110	ENSSMAG00000009867	syf2	91	82.407	Scophthalmus_maximus
ENSANAG00000032473	SYF2	90	83.486	ENSSDUG00000013072	syf2	91	83.796	Seriola_dumerili
ENSANAG00000032473	SYF2	90	83.486	ENSSLDG00000012677	syf2	91	83.796	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSANAG00000032473	SYF2	100	74.590	ENSSARG00000012889	SYF2	100	74.590	Sorex_araneus
ENSANAG00000032473	SYF2	95	86.147	ENSSPUG00000005251	SYF2	85	88.889	Sphenodon_punctatus
ENSANAG00000032473	SYF2	90	83.562	ENSSPAG00000009626	syf2	91	83.796	Stegastes_partitus
ENSANAG00000032473	SYF2	98	91.393	ENSSSCG00000037481	SYF2	99	91.393	Sus_scrofa
ENSANAG00000032473	SYF2	58	73.504	ENSTGUG00000001126	SYF2	96	55.440	Taeniopygia_guttata
ENSANAG00000032473	SYF2	100	75.720	ENSTRUG00000001499	syf2	86	82.326	Takifugu_rubripes
ENSANAG00000032473	SYF2	90	80.734	ENSTNIG00000016912	syf2	97	81.019	Tetraodon_nigroviridis
ENSANAG00000032473	SYF2	100	70.370	ENSTBEG00000017370	SYF2	99	69.959	Tupaia_belangeri
ENSANAG00000032473	SYF2	100	92.623	ENSTTRG00000003550	SYF2	100	93.443	Tursiops_truncatus
ENSANAG00000032473	SYF2	99	92.213	ENSUAMG00000002897	SYF2	99	92.213	Ursus_americanus
ENSANAG00000032473	SYF2	99	92.623	ENSUMAG00000013108	SYF2	99	92.623	Ursus_maritimus
ENSANAG00000032473	SYF2	100	93.033	ENSVPAG00000005705	SYF2	100	92.623	Vicugna_pacos
ENSANAG00000032473	SYF2	99	94.262	ENSVVUG00000027175	-	99	94.262	Vulpes_vulpes
ENSANAG00000032473	SYF2	84	97.561	ENSVVUG00000027181	-	100	90.323	Vulpes_vulpes
ENSANAG00000032473	SYF2	96	83.691	ENSXETG00000022797	syf2	94	83.691	Xenopus_tropicalis
ENSANAG00000032473	SYF2	88	81.395	ENSXMAG00000022698	syf2	91	81.019	Xiphophorus_maculatus