EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAOCG00000002832 (Gene tree)
Gene ID: 111587759
Gene Symbol: mtrf1
Alias: zgc:113104
Full Name: mitochondrial translation release factor 1
Gene Type: protein_coding
Species: Amphiprion_ocellaris
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 8654 bases
Position: chrNXFZ01005804.1:187079-195732
Accession: 111587759
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAOCP00000019435	RF-1	PF00472.20	4.9e-39	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAOCT00000015650	-	5869	XM_023297860	ENSAOCP00000019435	444 (aa)	XP_023153628	UPI000C3093DF

Gene Model

Click here to download ENSAOCG00000002832's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSAOCG00000002832's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSAOCG00000002832	mtrf1	85	44.211	ENSAOCG00000009709	mtrf1l	87	44.211

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAOCG00000002832	mtrf1	88	56.122	ENSG00000120662	MTRF1	87	56.122	Homo_sapiens
ENSAOCG00000002832	mtrf1	89	96.692	ENSAPOG00000010181	mtrf1	97	96.692	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAOCG00000002832	mtrf1	90	55.721	ENSAMEG00000008696	MTRF1	89	55.721	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAOCG00000002832	mtrf1	56	88.710	ENSACIG00000001495	mtrf1	100	88.710	Amphilophus_citrinellus
ENSAOCG00000002832	mtrf1	100	98.423	ENSAPEG00000014844	mtrf1	100	98.423	Amphiprion_percula
ENSAOCG00000002832	mtrf1	90	81.481	ENSATEG00000017403	mtrf1	97	81.481	Anabas_testudineus
ENSAOCG00000002832	mtrf1	88	53.470	ENSAPLG00000009317	MTRF1	89	53.985	Anas_platyrhynchos
ENSAOCG00000002832	mtrf1	98	51.826	ENSACAG00000000897	MTRF1	97	51.826	Anolis_carolinensis
ENSAOCG00000002832	mtrf1	77	57.849	ENSANAG00000025310	-	94	57.849	Aotus_nancymaae
ENSAOCG00000002832	mtrf1	88	53.435	ENSANAG00000023063	-	87	53.435	Aotus_nancymaae
ENSAOCG00000002832	mtrf1	100	83.556	ENSACLG00000023945	mtrf1	100	83.556	Astatotilapia_calliptera
ENSAOCG00000002832	mtrf1	53	77.350	ENSAMXG00000031859	mtrf1	97	77.350	Astyanax_mexicanus
ENSAOCG00000002832	mtrf1	88	56.378	ENSBTAG00000012260	MTRF1	85	58.726	Bos_taurus
ENSAOCG00000002832	mtrf1	88	56.378	ENSCJAG00000017739	MTRF1	98	63.743	Callithrix_jacchus
ENSAOCG00000002832	mtrf1	86	58.073	ENSCAFG00000004795	MTRF1	86	58.073	Canis_familiaris
ENSAOCG00000002832	mtrf1	86	58.073	ENSCAFG00020018178	MTRF1	86	58.073	Canis_lupus_dingo
ENSAOCG00000002832	mtrf1	89	56.743	ENSCHIG00000011810	MTRF1	87	56.743	Capra_hircus
ENSAOCG00000002832	mtrf1	87	57.216	ENSTSYG00000006976	MTRF1	86	57.216	Carlito_syrichta
ENSAOCG00000002832	mtrf1	88	56.566	ENSCAPG00000013163	MTRF1	90	56.566	Cavia_aperea
ENSAOCG00000002832	mtrf1	88	56.313	ENSCPOG00000005264	MTRF1	87	56.313	Cavia_porcellus
ENSAOCG00000002832	mtrf1	88	57.143	ENSCCAG00000035116	MTRF1	87	57.143	Cebus_capucinus
ENSAOCG00000002832	mtrf1	88	56.122	ENSCATG00000009909	MTRF1	87	56.122	Cercocebus_atys
ENSAOCG00000002832	mtrf1	87	56.555	ENSCLAG00000000582	MTRF1	86	56.555	Chinchilla_lanigera
ENSAOCG00000002832	mtrf1	88	55.867	ENSCSAG00000017835	MTRF1	87	55.867	Chlorocebus_sabaeus
ENSAOCG00000002832	mtrf1	80	55.367	ENSCHOG00000011915	-	86	55.367	Choloepus_hoffmanni
ENSAOCG00000002832	mtrf1	97	52.403	ENSCPBG00000007969	MTRF1	96	52.403	Chrysemys_picta_bellii
ENSAOCG00000002832	mtrf1	88	55.612	ENSCANG00000040353	MTRF1	87	55.612	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAOCG00000002832	mtrf1	87	57.033	ENSCGRG00001003065	Mtrf1	87	57.033	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAOCG00000002832	mtrf1	87	57.033	ENSCGRG00000002570	Mtrf1	87	57.033	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAOCG00000002832	mtrf1	97	72.874	ENSCSEG00000005667	mtrf1	96	72.874	Cynoglossus_semilaevis
ENSAOCG00000002832	mtrf1	100	71.847	ENSCVAG00000021729	mtrf1	100	71.847	Cyprinodon_variegatus
ENSAOCG00000002832	mtrf1	53	66.667	ENSDARG00000033579	mtrf1	99	66.667	Danio_rerio
ENSAOCG00000002832	mtrf1	87	55.897	ENSDNOG00000034196	MTRF1	97	62.706	Dasypus_novemcinctus
ENSAOCG00000002832	mtrf1	87	57.545	ENSDORG00000016429	Mtrf1	86	57.545	Dipodomys_ordii
ENSAOCG00000002832	mtrf1	87	56.331	ENSETEG00000014811	MTRF1	86	56.331	Echinops_telfairi
ENSAOCG00000002832	mtrf1	52	54.310	ENSEBUG00000000778	mtrf1	95	54.310	Eptatretus_burgeri
ENSAOCG00000002832	mtrf1	87	56.848	ENSEASG00005015715	MTRF1	86	56.848	Equus_asinus_asinus
ENSAOCG00000002832	mtrf1	87	56.848	ENSECAG00000014389	MTRF1	84	56.848	Equus_caballus
ENSAOCG00000002832	mtrf1	87	43.959	ENSEEUG00000004450	-	86	43.959	Erinaceus_europaeus
ENSAOCG00000002832	mtrf1	97	68.372	ENSELUG00000006544	mtrf1	97	68.372	Esox_lucius
ENSAOCG00000002832	mtrf1	88	57.143	ENSFCAG00000031635	MTRF1	87	57.143	Felis_catus
ENSAOCG00000002832	mtrf1	88	54.499	ENSFALG00000008036	MTRF1	96	54.499	Ficedula_albicollis
ENSAOCG00000002832	mtrf1	87	56.701	ENSFDAG00000017881	MTRF1	86	56.701	Fukomys_damarensis
ENSAOCG00000002832	mtrf1	98	75.737	ENSFHEG00000019043	mtrf1	99	75.737	Fundulus_heteroclitus
ENSAOCG00000002832	mtrf1	85	67.282	ENSGMOG00000008608	mtrf1	99	67.282	Gadus_morhua
ENSAOCG00000002832	mtrf1	86	54.830	ENSGALG00000016951	MTRF1	84	55.352	Gallus_gallus
ENSAOCG00000002832	mtrf1	96	77.389	ENSGAFG00000007093	mtrf1	97	77.389	Gambusia_affinis
ENSAOCG00000002832	mtrf1	86	82.368	ENSGACG00000013728	mtrf1	99	82.368	Gasterosteus_aculeatus
ENSAOCG00000002832	mtrf1	71	58.675	ENSGAGG00000025696	MTRF1	99	58.991	Gopherus_agassizii
ENSAOCG00000002832	mtrf1	88	55.867	ENSGGOG00000002529	MTRF1	87	55.867	Gorilla_gorilla
ENSAOCG00000002832	mtrf1	87	55.412	ENSHGLG00000003210	MTRF1	86	55.412	Heterocephalus_glaber_female
ENSAOCG00000002832	mtrf1	87	55.412	ENSHGLG00100011843	MTRF1	86	55.412	Heterocephalus_glaber_male
ENSAOCG00000002832	mtrf1	96	72.286	ENSHCOG00000009449	mtrf1	97	72.286	Hippocampus_comes
ENSAOCG00000002832	mtrf1	88	56.633	ENSSTOG00000021682	MTRF1	88	56.633	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAOCG00000002832	mtrf1	89	55.443	ENSJJAG00000017590	Mtrf1	87	55.443	Jaculus_jaculus
ENSAOCG00000002832	mtrf1	99	76.562	ENSKMAG00000003231	mtrf1	99	76.562	Kryptolebias_marmoratus
ENSAOCG00000002832	mtrf1	52	91.416	ENSLBEG00000027169	-	94	91.416	Labrus_bergylta
ENSAOCG00000002832	mtrf1	52	91.416	ENSLBEG00000023151	mtrf1	94	91.416	Labrus_bergylta
ENSAOCG00000002832	mtrf1	87	60.363	ENSLACG00000010582	MTRF1	86	60.363	Latimeria_chalumnae
ENSAOCG00000002832	mtrf1	89	60.152	ENSLOCG00000005937	MTRF1	88	60.152	Lepisosteus_oculatus
ENSAOCG00000002832	mtrf1	87	43.734	ENSLAFG00000030499	-	85	43.734	Loxodonta_africana
ENSAOCG00000002832	mtrf1	88	56.667	ENSLAFG00000022177	-	87	56.667	Loxodonta_africana
ENSAOCG00000002832	mtrf1	88	56.122	ENSMFAG00000037972	MTRF1	87	56.122	Macaca_fascicularis
ENSAOCG00000002832	mtrf1	88	56.122	ENSMNEG00000035487	MTRF1	87	56.122	Macaca_nemestrina
ENSAOCG00000002832	mtrf1	88	56.122	ENSMLEG00000033582	MTRF1	87	56.122	Mandrillus_leucophaeus
ENSAOCG00000002832	mtrf1	100	78.971	ENSMAMG00000022048	mtrf1	100	78.971	Mastacembelus_armatus
ENSAOCG00000002832	mtrf1	100	83.556	ENSMZEG00005017922	mtrf1	100	83.556	Maylandia_zebra
ENSAOCG00000002832	mtrf1	86	54.830	ENSMGAG00000014971	MTRF1	91	55.614	Meleagris_gallopavo
ENSAOCG00000002832	mtrf1	95	54.632	ENSMAUG00000011661	Mtrf1	94	54.632	Mesocricetus_auratus
ENSAOCG00000002832	mtrf1	89	55.808	ENSMICG00000033131	MTRF1	88	55.808	Microcebus_murinus
ENSAOCG00000002832	mtrf1	87	57.474	ENSMOCG00000011945	Mtrf1	86	57.474	Microtus_ochrogaster
ENSAOCG00000002832	mtrf1	56	70.445	ENSMMOG00000013394	mtrf1	100	70.445	Mola_mola
ENSAOCG00000002832	mtrf1	92	52.206	ENSMODG00000014772	MTRF1	90	52.206	Monodelphis_domestica
ENSAOCG00000002832	mtrf1	98	81.406	ENSMALG00000013274	mtrf1	100	81.406	Monopterus_albus
ENSAOCG00000002832	mtrf1	84	58.667	MGP_CAROLIEiJ_G0019539	Mtrf1	83	58.667	Mus_caroli
ENSAOCG00000002832	mtrf1	89	57.761	ENSMUSG00000022022	Mtrf1	87	57.761	Mus_musculus
ENSAOCG00000002832	mtrf1	89	57.252	MGP_PahariEiJ_G0030557	Mtrf1	87	57.252	Mus_pahari
ENSAOCG00000002832	mtrf1	89	57.252	MGP_SPRETEiJ_G0020435	Mtrf1	87	57.252	Mus_spretus
ENSAOCG00000002832	mtrf1	89	57.360	ENSMPUG00000001874	MTRF1	88	57.360	Mustela_putorius_furo
ENSAOCG00000002832	mtrf1	88	56.888	ENSMLUG00000017237	MTRF1	87	56.888	Myotis_lucifugus
ENSAOCG00000002832	mtrf1	92	55.012	ENSNGAG00000014460	Mtrf1	91	55.012	Nannospalax_galili
ENSAOCG00000002832	mtrf1	53	89.873	ENSNBRG00000004634	mtrf1	100	89.873	Neolamprologus_brichardi
ENSAOCG00000002832	mtrf1	88	56.122	ENSNLEG00000001236	MTRF1	87	56.122	Nomascus_leucogenys
ENSAOCG00000002832	mtrf1	87	52.972	ENSMEUG00000001846	MTRF1	86	52.972	Notamacropus_eugenii
ENSAOCG00000002832	mtrf1	62	36.727	ENSOPRG00000006450	-	83	36.727	Ochotona_princeps
ENSAOCG00000002832	mtrf1	88	55.499	ENSODEG00000005782	MTRF1	87	55.499	Octodon_degus
ENSAOCG00000002832	mtrf1	88	89.460	ENSONIG00000012476	mtrf1	100	89.460	Oreochromis_niloticus
ENSAOCG00000002832	mtrf1	67	58.940	ENSOANG00000003383	-	96	58.940	Ornithorhynchus_anatinus
ENSAOCG00000002832	mtrf1	87	56.186	ENSOCUG00000025207	MTRF1	86	56.186	Oryctolagus_cuniculus
ENSAOCG00000002832	mtrf1	99	74.886	ENSORLG00000003225	mtrf1	99	74.886	Oryzias_latipes
ENSAOCG00000002832	mtrf1	99	75.171	ENSORLG00020021048	mtrf1	99	75.171	Oryzias_latipes_hni
ENSAOCG00000002832	mtrf1	99	74.886	ENSORLG00015020957	mtrf1	99	74.886	Oryzias_latipes_hsok
ENSAOCG00000002832	mtrf1	99	72.686	ENSOMEG00000002022	mtrf1	99	72.686	Oryzias_melastigma
ENSAOCG00000002832	mtrf1	74	49.544	ENSOGAG00000026411	-	100	49.544	Otolemur_garnettii
ENSAOCG00000002832	mtrf1	80	59.104	ENSOGAG00000009719	-	79	59.104	Otolemur_garnettii
ENSAOCG00000002832	mtrf1	89	56.743	ENSOARG00000006994	MTRF1	87	56.743	Ovis_aries
ENSAOCG00000002832	mtrf1	88	56.122	ENSPPAG00000000050	MTRF1	87	56.122	Pan_paniscus
ENSAOCG00000002832	mtrf1	88	57.653	ENSPPRG00000009511	MTRF1	87	57.653	Panthera_pardus
ENSAOCG00000002832	mtrf1	87	58.290	ENSPTIG00000006673	MTRF1	86	58.290	Panthera_tigris_altaica
ENSAOCG00000002832	mtrf1	88	56.122	ENSPTRG00000005815	MTRF1	87	56.122	Pan_troglodytes
ENSAOCG00000002832	mtrf1	88	56.122	ENSPANG00000010809	MTRF1	87	56.122	Papio_anubis
ENSAOCG00000002832	mtrf1	96	57.243	ENSPKIG00000015711	mtrf1	99	57.243	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAOCG00000002832	mtrf1	86	55.469	ENSPSIG00000004773	MTRF1	85	55.352	Pelodiscus_sinensis
ENSAOCG00000002832	mtrf1	53	85.169	ENSPMGG00000006724	mtrf1	96	85.169	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSAOCG00000002832	mtrf1	97	54.233	ENSPEMG00000020982	Mtrf1	96	54.233	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAOCG00000002832	mtrf1	77	51.003	ENSPMAG00000009849	mtrf1	99	51.289	Petromyzon_marinus
ENSAOCG00000002832	mtrf1	87	55.412	ENSPCIG00000012940	MTRF1	87	55.412	Phascolarctos_cinereus
ENSAOCG00000002832	mtrf1	97	75.459	ENSPFOG00000000254	mtrf1	99	75.459	Poecilia_formosa
ENSAOCG00000002832	mtrf1	96	76.279	ENSPLAG00000014280	mtrf1	97	76.279	Poecilia_latipinna
ENSAOCG00000002832	mtrf1	99	74.208	ENSPMEG00000023245	mtrf1	100	74.208	Poecilia_mexicana
ENSAOCG00000002832	mtrf1	53	76.695	ENSPREG00000018619	mtrf1	97	76.695	Poecilia_reticulata
ENSAOCG00000002832	mtrf1	88	55.102	ENSPPYG00000005313	MTRF1	87	55.102	Pongo_abelii
ENSAOCG00000002832	mtrf1	87	56.443	ENSPCOG00000018133	MTRF1	86	56.443	Propithecus_coquereli
ENSAOCG00000002832	mtrf1	88	55.641	ENSPVAG00000008573	MTRF1	87	55.641	Pteropus_vampyrus
ENSAOCG00000002832	mtrf1	56	88.664	ENSPNYG00000004357	mtrf1	100	88.664	Pundamilia_nyererei
ENSAOCG00000002832	mtrf1	87	64.935	ENSPNAG00000010682	mtrf1	88	64.935	Pygocentrus_nattereri
ENSAOCG00000002832	mtrf1	85	58.466	ENSRNOG00000047106	Mtrf1	94	70.435	Rattus_norvegicus
ENSAOCG00000002832	mtrf1	88	55.612	ENSRBIG00000007069	MTRF1	87	55.612	Rhinopithecus_bieti
ENSAOCG00000002832	mtrf1	88	55.612	ENSRROG00000035345	MTRF1	87	55.612	Rhinopithecus_roxellana
ENSAOCG00000002832	mtrf1	85	57.825	ENSSBOG00000004572	MTRF1	99	57.825	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSAOCG00000002832	mtrf1	80	58.427	ENSSHAG00000018109	MTRF1	87	58.263	Sarcophilus_harrisii
ENSAOCG00000002832	mtrf1	88	62.341	ENSSFOG00015006191	mtrf1	88	62.341	Scleropages_formosus
ENSAOCG00000002832	mtrf1	98	77.477	ENSSMAG00000015740	mtrf1	99	77.477	Scophthalmus_maximus
ENSAOCG00000002832	mtrf1	100	82.927	ENSSDUG00000022608	mtrf1	88	82.927	Seriola_dumerili
ENSAOCG00000002832	mtrf1	100	83.149	ENSSLDG00000013584	mtrf1	88	83.149	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSAOCG00000002832	mtrf1	87	55.670	ENSSARG00000002306	MTRF1	87	55.670	Sorex_araneus
ENSAOCG00000002832	mtrf1	55	64.876	ENSSPUG00000007354	MTRF1	100	64.876	Sphenodon_punctatus
ENSAOCG00000002832	mtrf1	100	88.514	ENSSPAG00000000881	mtrf1	100	88.514	Stegastes_partitus
ENSAOCG00000002832	mtrf1	87	57.216	ENSSSCG00000009436	MTRF1	86	57.216	Sus_scrofa
ENSAOCG00000002832	mtrf1	86	54.569	ENSTGUG00000012422	MTRF1	92	55.091	Taeniopygia_guttata
ENSAOCG00000002832	mtrf1	100	74.501	ENSTRUG00000000396	mtrf1	99	74.501	Takifugu_rubripes
ENSAOCG00000002832	mtrf1	84	76.075	ENSTNIG00000017149	-	99	75.584	Tetraodon_nigroviridis
ENSAOCG00000002832	mtrf1	54	56.485	ENSTBEG00000004696	-	100	56.485	Tupaia_belangeri
ENSAOCG00000002832	mtrf1	88	56.888	ENSTTRG00000010370	MTRF1	87	56.888	Tursiops_truncatus
ENSAOCG00000002832	mtrf1	90	55.721	ENSUMAG00000014772	MTRF1	89	55.721	Ursus_maritimus
ENSAOCG00000002832	mtrf1	87	56.555	ENSVPAG00000002565	MTRF1	86	56.555	Vicugna_pacos
ENSAOCG00000002832	mtrf1	89	56.599	ENSVVUG00000028755	MTRF1	87	56.599	Vulpes_vulpes
ENSAOCG00000002832	mtrf1	84	57.219	ENSXETG00000018904	mtrf1	96	57.219	Xenopus_tropicalis
ENSAOCG00000002832	mtrf1	95	75.644	ENSXMAG00000009853	mtrf1	96	75.644	Xiphophorus_maculatus