EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAOCG00000008661 (Gene tree)
Gene ID: 111568303
Gene Symbol: si:dkey-98f17.5
Alias: -
Full Name: uncharacterized LOC111568303
Gene Type: protein_coding
Species: Amphiprion_ocellaris
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 16608 bases
Position: chrNXFZ01002165.1:421828-438435
Accession: 111568303
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAOCP00000005164	MMR_HSR1	PF01926.23	9.3e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAOCT00000006784	-	3057	XM_023269892	ENSAOCP00000005164	448 (aa)	XP_023125660	UPI000C309032

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	100	60.222	ENSAOCG00000014284	si:ch211-11k18.4	99	60.222

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	100	60.000	ENSAPOG00000018833	si:ch211-11k18.4	99	60.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	100	98.438	ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	100	98.438	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	100	58.758	ENSACIG00000006696	si:ch211-11k18.4	99	58.758	Amphilophus_citrinellus
ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	100	94.420	ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	100	94.420	Amphilophus_citrinellus
ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	100	60.000	ENSAPEG00000014910	si:ch211-11k18.4	99	60.000	Amphiprion_percula
ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	100	99.554	ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	99.554	Amphiprion_percula
ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	100	91.741	ENSATEG00000007188	si:dkey-98f17.5	100	91.741	Anabas_testudineus
ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	100	60.667	ENSATEG00000004775	si:ch211-11k18.4	99	60.667	Anabas_testudineus
ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	99	58.036	ENSACAG00000028632	-	99	58.259	Anolis_carolinensis
ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	100	92.857	ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	100	92.857	Astatotilapia_calliptera
ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	100	59.513	ENSACLG00000007907	si:ch211-11k18.4	99	59.513	Astatotilapia_calliptera
ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	100	60.573	ENSAMXG00000017817	si:ch211-11k18.4	99	60.573	Astyanax_mexicanus
ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	100	82.628	ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	100	82.628	Astyanax_mexicanus
ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	77	62.609	ENSCING00000020807	-	91	62.609	Ciona_intestinalis
ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	98	55.909	ENSCSAVG00000009987	-	98	56.364	Ciona_savignyi
ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	100	60.000	ENSCSEG00000017661	si:ch211-11k18.4	99	60.000	Cynoglossus_semilaevis
ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	100	89.732	ENSCSEG00000017512	si:dkey-98f17.5	98	87.264	Cynoglossus_semilaevis
ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	100	91.071	ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	100	91.071	Cyprinodon_variegatus
ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	100	60.444	ENSCVAG00000015346	si:ch211-11k18.4	99	60.444	Cyprinodon_variegatus
ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	98	84.091	ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	84.091	Danio_rerio
ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	100	61.111	ENSDARG00000087869	si:ch211-11k18.4	100	74.490	Danio_rerio
ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	79	56.497	ENSEBUG00000007620	si:dkey-98f17.5	95	56.497	Eptatretus_burgeri
ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	99	81.390	ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	99	81.390	Esox_lucius
ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	100	59.645	ENSFHEG00000019820	si:ch211-11k18.4	99	59.645	Fundulus_heteroclitus
ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	100	91.071	ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	100	91.071	Fundulus_heteroclitus
ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	89	55.362	ENSGMOG00000003492	si:ch211-11k18.4	99	55.362	Gadus_morhua
ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	100	60.889	ENSGAFG00000005677	si:ch211-11k18.4	99	60.889	Gambusia_affinis
ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	100	91.295	ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	91.295	Gambusia_affinis
ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	58	95.349	ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	95.349	Gasterosteus_aculeatus
ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	80	67.500	ENSGACG00000013134	si:ch211-11k18.4	99	61.692	Gasterosteus_aculeatus
ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	100	93.080	ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	100	93.080	Haplochromis_burtoni
ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	100	59.735	ENSHBUG00000020638	si:ch211-11k18.4	99	59.735	Haplochromis_burtoni
ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	99	86.937	ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	97	86.937	Hippocampus_comes
ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	100	59.111	ENSHCOG00000014773	si:ch211-11k18.4	99	58.889	Hippocampus_comes
ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	96	60.277	ENSIPUG00000016678	si:ch211-11k18.4	99	60.277	Ictalurus_punctatus
ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	81	59.452	ENSIPUG00000016694	si:ch211-11k18.4	81	59.452	Ictalurus_punctatus
ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	100	78.619	ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	99	78.619	Ictalurus_punctatus
ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	100	59.778	ENSKMAG00000009327	si:ch211-11k18.4	99	60.000	Kryptolebias_marmoratus
ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	100	92.411	ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	100	92.411	Kryptolebias_marmoratus
ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	100	91.964	ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	100	91.964	Labrus_bergylta
ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	99	69.595	ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	69.595	Latimeria_chalumnae
ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	100	62.806	ENSLACG00000004899	-	99	62.806	Latimeria_chalumnae
ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	99	62.472	ENSLACG00000006280	si:ch211-11k18.4	98	62.921	Latimeria_chalumnae
ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	99	75.391	ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	75.391	Lepisosteus_oculatus
ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	100	92.857	ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	100	92.857	Mastacembelus_armatus
ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	96	60.739	ENSMAMG00000002536	si:ch211-11k18.4	99	60.739	Mastacembelus_armatus
ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	100	59.292	ENSMZEG00005008941	si:ch211-11k18.4	99	59.292	Maylandia_zebra
ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	100	93.080	ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	100	93.080	Maylandia_zebra
ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	100	58.315	ENSMMOG00000012485	si:ch211-11k18.4	99	58.315	Mola_mola
ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	100	60.444	ENSMALG00000019735	si:ch211-11k18.4	99	60.444	Monopterus_albus
ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	98	91.116	ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	91.116	Monopterus_albus
ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	96	60.277	ENSNBRG00000002220	si:ch211-11k18.4	98	60.277	Neolamprologus_brichardi
ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	100	92.634	ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	92.634	Neolamprologus_brichardi
ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	100	59.513	ENSONIG00000019412	si:ch211-11k18.4	99	59.513	Oreochromis_niloticus
ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	100	94.196	ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	100	94.196	Oreochromis_niloticus
ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	100	61.111	ENSORLG00000012015	si:ch211-11k18.4	99	61.111	Oryzias_latipes
ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	100	87.946	ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	100	87.946	Oryzias_latipes
ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	100	90.848	ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	100	90.848	Oryzias_latipes_hni
ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	100	60.889	ENSORLG00020012386	si:ch211-11k18.4	99	60.889	Oryzias_latipes_hni
ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	100	61.111	ENSORLG00015022862	si:ch211-11k18.4	99	61.111	Oryzias_latipes_hsok
ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	100	91.071	ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	100	91.071	Oryzias_latipes_hsok
ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	100	92.188	ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	92.188	Oryzias_melastigma
ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	100	61.333	ENSOMEG00000018686	si:ch211-11k18.4	99	61.333	Oryzias_melastigma
ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	100	59.041	ENSPKIG00000018807	si:ch211-11k18.4	99	60.526	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	100	77.283	ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	77.283	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	100	58.352	ENSPKIG00000023918	-	98	58.352	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	100	86.830	ENSPMGG00000019065	si:dkey-98f17.5	100	86.830	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	100	59.956	ENSPMGG00000016507	si:ch211-11k18.4	99	59.956	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	100	62.000	ENSPFOG00000007976	si:ch211-11k18.4	99	62.000	Poecilia_formosa
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