EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAOCG00000010912 (Gene tree)
Gene ID: 111574660
Gene Symbol: syf2 (1 of many)
Alias: hm:zeh0031|zeh0031|zgc:113871|zgc:92835
Full Name: microsomal glutathione S-transferase 3-like
Gene Type: protein_coding
Species: Amphiprion_ocellaris
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 16404 bases
Position: chrNXFZ01002996.1:283638-300041
Accession: 111574660
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAOCP00000007200	SYF2	PF08231.12	1.7e-46	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAOCT00000003260	-	1144	XM_023279362	ENSAOCP00000007197	140 (aa)	XP_023135130	UPI000C306BEC
ENSAOCT00000003247	-	1566	XM_023279355	ENSAOCP00000007200	321 (aa)	XP_023135123	-

Gene Model

Click here to download ENSAOCG00000010912's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSAOCG00000010912's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSAOCG00000010912	syf2	69	100.000	ENSAOCG00000022046	syf2	93	98.643

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAOCG00000010912	syf2	62	83.920	ENSG00000117614	SYF2	88	79.452	Homo_sapiens
ENSAOCG00000010912	syf2	69	99.095	ENSAPOG00000001174	syf2	93	99.095	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAOCG00000010912	syf2	64	82.039	ENSAMEG00000010115	-	83	82.673	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAOCG00000010912	syf2	55	83.708	ENSAMEG00000010134	-	91	83.708	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAOCG00000010912	syf2	68	90.367	ENSACIG00000023688	syf2	87	90.367	Amphilophus_citrinellus
ENSAOCG00000010912	syf2	69	100.000	ENSAPEG00000018858	syf2	85	100.000	Amphiprion_percula
ENSAOCG00000010912	syf2	69	93.213	ENSATEG00000007745	syf2	93	93.213	Anabas_testudineus
ENSAOCG00000010912	syf2	57	84.066	ENSAPLG00000016435	SYF2	91	84.066	Anas_platyrhynchos
ENSAOCG00000010912	syf2	58	83.422	ENSACAG00000013653	-	92	83.422	Anolis_carolinensis
ENSAOCG00000010912	syf2	62	84.422	ENSANAG00000032473	SYF2	84	83.744	Aotus_nancymaae
ENSAOCG00000010912	syf2	69	90.045	ENSACLG00000019916	syf2	93	90.045	Astatotilapia_calliptera
ENSAOCG00000010912	syf2	69	85.973	ENSAMXG00000004051	syf2	93	85.973	Astyanax_mexicanus
ENSAOCG00000010912	syf2	66	81.308	ENSBTAG00000001651	SYF2	91	81.308	Bos_taurus
ENSAOCG00000010912	syf2	60	51.295	WBGene00019402	syf-2	82	50.777	Caenorhabditis_elegans
ENSAOCG00000010912	syf2	62	84.422	ENSCJAG00000046570	SYF2	88	79.909	Callithrix_jacchus
ENSAOCG00000010912	syf2	63	77.114	ENSCAFG00000030331	-	86	77.114	Canis_familiaris
ENSAOCG00000010912	syf2	62	82.915	ENSCAFG00000012895	-	82	82.673	Canis_familiaris
ENSAOCG00000010912	syf2	62	82.915	ENSCAFG00020021091	-	82	82.673	Canis_lupus_dingo
ENSAOCG00000010912	syf2	51	74.545	ENSCAFG00020021094	-	86	74.545	Canis_lupus_dingo
ENSAOCG00000010912	syf2	69	78.475	ENSCHIG00000020874	SYF2	92	78.475	Capra_hircus
ENSAOCG00000010912	syf2	69	78.924	ENSTSYG00000005114	SYF2	92	78.924	Carlito_syrichta
ENSAOCG00000010912	syf2	57	82.967	ENSCAPG00000010006	SYF2	92	82.967	Cavia_aperea
ENSAOCG00000010912	syf2	69	78.733	ENSCPOG00000005326	SYF2	87	79.817	Cavia_porcellus
ENSAOCG00000010912	syf2	62	84.422	ENSCCAG00000022459	SYF2	83	84.158	Cebus_capucinus
ENSAOCG00000010912	syf2	68	78.995	ENSCATG00000026917	SYF2	88	78.995	Cercocebus_atys
ENSAOCG00000010912	syf2	68	81.193	ENSCLAG00000008474	SYF2	87	81.193	Chinchilla_lanigera
ENSAOCG00000010912	syf2	68	78.995	ENSCSAG00000000948	SYF2	88	78.995	Chlorocebus_sabaeus
ENSAOCG00000010912	syf2	53	66.092	ENSCHOG00000005273	-	96	66.092	Choloepus_hoffmanni
ENSAOCG00000010912	syf2	64	84.135	ENSCPBG00000025073	SYF2	87	81.364	Chrysemys_picta_bellii
ENSAOCG00000010912	syf2	60	52.041	ENSCING00000003017	-	82	52.041	Ciona_intestinalis
ENSAOCG00000010912	syf2	60	47.959	ENSCSAVG00000006627	-	89	47.959	Ciona_savignyi
ENSAOCG00000010912	syf2	68	68.493	ENSCANG00000037322	SYF2	86	68.493	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAOCG00000010912	syf2	69	79.556	ENSCGRG00001020733	Syf2	93	79.556	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAOCG00000010912	syf2	56	84.358	ENSCGRG00000005095	Syf2	87	84.530	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAOCG00000010912	syf2	63	88.060	ENSCSEG00000000117	syf2	92	84.615	Cynoglossus_semilaevis
ENSAOCG00000010912	syf2	69	89.189	ENSCVAG00000019543	syf2	93	89.640	Cyprinodon_variegatus
ENSAOCG00000010912	syf2	69	84.615	ENSDARG00000004706	syf2	93	84.615	Danio_rerio
ENSAOCG00000010912	syf2	66	80.930	ENSDNOG00000047605	SYF2	88	80.930	Dasypus_novemcinctus
ENSAOCG00000010912	syf2	69	79.295	ENSDORG00000001274	Syf2	93	79.295	Dipodomys_ordii
ENSAOCG00000010912	syf2	64	53.883	FBgn0033556	CG12343	91	53.883	Drosophila_melanogaster
ENSAOCG00000010912	syf2	64	70.098	ENSETEG00000015729	SYF2	99	65.929	Echinops_telfairi
ENSAOCG00000010912	syf2	58	55.376	ENSEBUG00000015402	syf2	89	55.376	Eptatretus_burgeri
ENSAOCG00000010912	syf2	69	69.507	ENSEASG00005004232	-	92	69.507	Equus_asinus_asinus
ENSAOCG00000010912	syf2	69	78.509	ENSEASG00005004224	-	93	78.509	Equus_asinus_asinus
ENSAOCG00000010912	syf2	66	81.776	ENSECAG00000010440	-	89	81.776	Equus_caballus
ENSAOCG00000010912	syf2	66	81.776	ENSECAG00000012023	-	87	81.776	Equus_caballus
ENSAOCG00000010912	syf2	52	71.930	ENSEEUG00000015084	SYF2	93	71.930	Erinaceus_europaeus
ENSAOCG00000010912	syf2	69	86.878	ENSELUG00000003465	syf2	92	86.878	Esox_lucius
ENSAOCG00000010912	syf2	63	83.663	ENSFCAG00000043095	-	82	83.663	Felis_catus
ENSAOCG00000010912	syf2	69	79.464	ENSFCAG00000010324	-	75	79.464	Felis_catus
ENSAOCG00000010912	syf2	58	80.214	ENSFALG00000000460	SYF2	85	77.619	Ficedula_albicollis
ENSAOCG00000010912	syf2	64	82.439	ENSFDAG00000008310	SYF2	84	82.439	Fukomys_damarensis
ENSAOCG00000010912	syf2	65	75.120	ENSFHEG00000007238	syf2	92	75.120	Fundulus_heteroclitus
ENSAOCG00000010912	syf2	62	91.414	ENSGMOG00000019138	syf2	88	91.414	Gadus_morhua
ENSAOCG00000010912	syf2	64	82.439	ENSGALG00000013639	SYF2	86	79.630	Gallus_gallus
ENSAOCG00000010912	syf2	69	88.235	ENSGAFG00000019435	syf2	93	88.235	Gambusia_affinis
ENSAOCG00000010912	syf2	64	89.268	ENSGACG00000007305	syf2	93	87.838	Gasterosteus_aculeatus
ENSAOCG00000010912	syf2	64	84.615	ENSGAGG00000010670	SYF2	87	82.273	Gopherus_agassizii
ENSAOCG00000010912	syf2	62	83.920	ENSGGOG00000012796	SYF2	88	79.452	Gorilla_gorilla
ENSAOCG00000010912	syf2	69	89.593	ENSHBUG00000020477	syf2	93	89.593	Haplochromis_burtoni
ENSAOCG00000010912	syf2	64	70.588	ENSHGLG00000004304	-	85	70.732	Heterocephalus_glaber_female
ENSAOCG00000010912	syf2	64	82.927	ENSHGLG00000014393	SYF2	84	82.927	Heterocephalus_glaber_female
ENSAOCG00000010912	syf2	64	82.927	ENSHGLG00100014722	SYF2	89	78.899	Heterocephalus_glaber_male
ENSAOCG00000010912	syf2	69	87.783	ENSHCOG00000012904	syf2	72	87.783	Hippocampus_comes
ENSAOCG00000010912	syf2	69	85.586	ENSIPUG00000019859	syf2	93	85.586	Ictalurus_punctatus
ENSAOCG00000010912	syf2	57	84.066	ENSJJAG00000013301	Syf2	86	84.066	Jaculus_jaculus
ENSAOCG00000010912	syf2	69	90.498	ENSKMAG00000013856	syf2	93	90.498	Kryptolebias_marmoratus
ENSAOCG00000010912	syf2	69	92.308	ENSLBEG00000014425	syf2	93	92.308	Labrus_bergylta
ENSAOCG00000010912	syf2	67	78.505	ENSLACG00000012064	SYF2	90	78.505	Latimeria_chalumnae
ENSAOCG00000010912	syf2	69	84.615	ENSLOCG00000002728	syf2	88	84.615	Lepisosteus_oculatus
ENSAOCG00000010912	syf2	57	56.522	ENSLAFG00000030814	-	100	56.522	Loxodonta_africana
ENSAOCG00000010912	syf2	66	82.243	ENSLAFG00000023150	-	87	82.243	Loxodonta_africana
ENSAOCG00000010912	syf2	68	78.995	ENSMFAG00000041831	SYF2	88	78.995	Macaca_fascicularis
ENSAOCG00000010912	syf2	62	82.915	ENSMMUG00000002968	SYF2	88	78.539	Macaca_mulatta
ENSAOCG00000010912	syf2	68	78.995	ENSMNEG00000030180	SYF2	88	78.995	Macaca_nemestrina
ENSAOCG00000010912	syf2	68	78.995	ENSMLEG00000030248	SYF2	88	78.995	Mandrillus_leucophaeus
ENSAOCG00000010912	syf2	69	91.855	ENSMAMG00000010403	syf2	91	91.855	Mastacembelus_armatus
ENSAOCG00000010912	syf2	69	89.593	ENSMZEG00005006429	syf2	93	89.593	Maylandia_zebra
ENSAOCG00000010912	syf2	57	83.516	ENSMGAG00000002019	SYF2	91	83.516	Meleagris_gallopavo
ENSAOCG00000010912	syf2	69	79.556	ENSMAUG00000018974	Syf2	93	79.556	Mesocricetus_auratus
ENSAOCG00000010912	syf2	57	84.066	ENSMICG00000016191	SYF2	91	84.066	Microcebus_murinus
ENSAOCG00000010912	syf2	69	80.000	ENSMOCG00000022938	Syf2	93	80.000	Microtus_ochrogaster
ENSAOCG00000010912	syf2	67	88.785	ENSMMOG00000002396	syf2	90	88.785	Mola_mola
ENSAOCG00000010912	syf2	64	79.227	ENSMODG00000013951	-	90	79.227	Monodelphis_domestica
ENSAOCG00000010912	syf2	69	90.625	ENSMALG00000010706	syf2	93	91.071	Monopterus_albus
ENSAOCG00000010912	syf2	69	80.444	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	93	80.444	Mus_caroli
ENSAOCG00000010912	syf2	69	80.444	ENSMUSG00000028821	Syf2	93	80.444	Mus_musculus
ENSAOCG00000010912	syf2	69	80.444	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	93	80.444	Mus_pahari
ENSAOCG00000010912	syf2	69	80.444	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	93	80.444	Mus_spretus
ENSAOCG00000010912	syf2	62	82.915	ENSMPUG00000015802	-	82	82.673	Mustela_putorius_furo
ENSAOCG00000010912	syf2	63	83.663	ENSMPUG00000015801	-	82	83.663	Mustela_putorius_furo
ENSAOCG00000010912	syf2	65	80.660	ENSMLUG00000001885	SYF2	87	80.660	Myotis_lucifugus
ENSAOCG00000010912	syf2	69	76.856	ENSNGAG00000007912	Syf2	93	76.856	Nannospalax_galili
ENSAOCG00000010912	syf2	69	80.000	ENSNBRG00000010720	syf2	92	80.000	Neolamprologus_brichardi
ENSAOCG00000010912	syf2	62	83.920	ENSNLEG00000035185	SYF2	88	79.452	Nomascus_leucogenys
ENSAOCG00000010912	syf2	69	77.876	ENSOPRG00000012870	SYF2	93	77.876	Ochotona_princeps
ENSAOCG00000010912	syf2	68	70.642	ENSODEG00000014338	-	84	73.171	Octodon_degus
ENSAOCG00000010912	syf2	64	81.951	ENSODEG00000017664	-	86	81.951	Octodon_degus
ENSAOCG00000010912	syf2	69	90.498	ENSONIG00000008213	syf2	93	90.498	Oreochromis_niloticus
ENSAOCG00000010912	syf2	58	83.784	ENSOANG00000009552	SYF2	92	83.784	Ornithorhynchus_anatinus
ENSAOCG00000010912	syf2	62	84.422	ENSOCUG00000013050	SYF2	88	80.365	Oryctolagus_cuniculus
ENSAOCG00000010912	syf2	67	88.426	ENSORLG00000028820	syf2	93	88.426	Oryzias_latipes
ENSAOCG00000010912	syf2	69	87.783	ENSORLG00020018333	syf2	93	87.783	Oryzias_latipes_hni
ENSAOCG00000010912	syf2	69	87.783	ENSORLG00015014665	syf2	93	87.783	Oryzias_latipes_hsok
ENSAOCG00000010912	syf2	69	89.593	ENSOMEG00000013911	syf2	93	89.593	Oryzias_melastigma
ENSAOCG00000010912	syf2	68	81.279	ENSOGAG00000009962	SYF2	88	81.279	Otolemur_garnettii
ENSAOCG00000010912	syf2	55	56.742	ENSOARG00000006269	-	92	56.742	Ovis_aries
ENSAOCG00000010912	syf2	66	80.093	ENSOARG00000006348	-	87	80.093	Ovis_aries
ENSAOCG00000010912	syf2	62	83.920	ENSPPAG00000036579	SYF2	88	79.452	Pan_paniscus
ENSAOCG00000010912	syf2	63	83.663	ENSPPRG00000001651	-	82	83.663	Panthera_pardus
ENSAOCG00000010912	syf2	68	79.730	ENSPPRG00000001638	-	88	79.730	Panthera_pardus
ENSAOCG00000010912	syf2	62	84.925	ENSPTIG00000005711	-	73	84.577	Panthera_tigris_altaica
ENSAOCG00000010912	syf2	63	83.663	ENSPTIG00000007036	-	82	83.663	Panthera_tigris_altaica
ENSAOCG00000010912	syf2	62	83.920	ENSPTRG00000000352	SYF2	88	79.452	Pan_troglodytes
ENSAOCG00000010912	syf2	68	78.995	ENSPANG00000008139	SYF2	88	78.995	Papio_anubis
ENSAOCG00000010912	syf2	69	85.068	ENSPKIG00000008130	syf2	93	85.068	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAOCG00000010912	syf2	67	79.817	ENSPSIG00000011816	SYF2	85	79.817	Pelodiscus_sinensis
ENSAOCG00000010912	syf2	66	88.626	ENSPMGG00000008755	syf2	82	88.626	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSAOCG00000010912	syf2	69	79.556	ENSPEMG00000008283	Syf2	93	79.556	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAOCG00000010912	syf2	64	82.927	ENSPCIG00000014235	SYF2	82	82.927	Phascolarctos_cinereus
ENSAOCG00000010912	syf2	69	86.937	ENSPFOG00000004116	syf2	92	86.937	Poecilia_formosa
ENSAOCG00000010912	syf2	67	88.426	ENSPLAG00000006691	syf2	93	88.426	Poecilia_latipinna
ENSAOCG00000010912	syf2	69	85.520	ENSPMEG00000011684	syf2	93	85.520	Poecilia_mexicana
ENSAOCG00000010912	syf2	69	88.235	ENSPREG00000003009	syf2	93	88.235	Poecilia_reticulata
ENSAOCG00000010912	syf2	68	79.452	ENSPPYG00000001713	SYF2	88	79.452	Pongo_abelii
ENSAOCG00000010912	syf2	69	52.655	ENSPCOG00000027011	SYF2	90	52.655	Propithecus_coquereli
ENSAOCG00000010912	syf2	69	67.257	ENSPVAG00000005841	SYF2	92	67.257	Pteropus_vampyrus
ENSAOCG00000010912	syf2	69	89.593	ENSPNYG00000004979	syf2	93	89.593	Pundamilia_nyererei
ENSAOCG00000010912	syf2	69	85.973	ENSPNAG00000015570	syf2	93	85.973	Pygocentrus_nattereri
ENSAOCG00000010912	syf2	69	80.444	ENSRNOG00000060597	Syf2	93	80.444	Rattus_norvegicus
ENSAOCG00000010912	syf2	68	76.712	ENSRBIG00000042970	SYF2	88	76.712	Rhinopithecus_bieti
ENSAOCG00000010912	syf2	68	78.995	ENSRROG00000001347	SYF2	88	78.995	Rhinopithecus_roxellana
ENSAOCG00000010912	syf2	62	83.920	ENSSBOG00000020184	SYF2	89	79.186	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSAOCG00000010912	syf2	59	83.598	ENSSHAG00000007152	-	92	83.598	Sarcophilus_harrisii
ENSAOCG00000010912	syf2	64	82.439	ENSSHAG00000015630	-	82	82.439	Sarcophilus_harrisii
ENSAOCG00000010912	syf2	69	83.258	ENSSFOG00015023647	syf2	93	83.258	Scleropages_formosus
ENSAOCG00000010912	syf2	69	89.140	ENSSMAG00000009867	syf2	93	89.140	Scophthalmus_maximus
ENSAOCG00000010912	syf2	69	91.403	ENSSDUG00000013072	syf2	93	91.403	Seriola_dumerili
ENSAOCG00000010912	syf2	69	91.403	ENSSLDG00000012677	syf2	93	91.403	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSAOCG00000010912	syf2	69	59.821	ENSSARG00000012889	SYF2	92	59.821	Sorex_araneus
ENSAOCG00000010912	syf2	68	79.111	ENSSPUG00000005251	SYF2	85	80.455	Sphenodon_punctatus
ENSAOCG00000010912	syf2	69	94.570	ENSSPAG00000009626	syf2	93	94.570	Stegastes_partitus
ENSAOCG00000010912	syf2	66	80.841	ENSSSCG00000037481	SYF2	87	80.841	Sus_scrofa
ENSAOCG00000010912	syf2	69	84.753	ENSTRUG00000001499	syf2	88	84.091	Takifugu_rubripes
ENSAOCG00000010912	syf2	64	87.317	ENSTNIG00000016912	syf2	92	87.317	Tetraodon_nigroviridis
ENSAOCG00000010912	syf2	69	57.522	ENSTBEG00000017370	SYF2	91	57.522	Tupaia_belangeri
ENSAOCG00000010912	syf2	69	77.232	ENSTTRG00000003550	SYF2	92	78.125	Tursiops_truncatus
ENSAOCG00000010912	syf2	64	82.039	ENSUAMG00000002897	SYF2	83	82.039	Ursus_americanus
ENSAOCG00000010912	syf2	62	82.412	ENSUMAG00000013108	SYF2	83	81.553	Ursus_maritimus
ENSAOCG00000010912	syf2	69	78.125	ENSVPAG00000005705	SYF2	92	78.125	Vicugna_pacos
ENSAOCG00000010912	syf2	62	82.915	ENSVVUG00000027175	-	82	82.673	Vulpes_vulpes
ENSAOCG00000010912	syf2	59	82.979	ENSVVUG00000027181	-	93	76.190	Vulpes_vulpes
ENSAOCG00000010912	syf2	66	77.315	ENSXETG00000022797	syf2	87	77.315	Xenopus_tropicalis
ENSAOCG00000010912	syf2	69	87.783	ENSXMAG00000022698	syf2	93	87.783	Xiphophorus_maculatus