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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAOCG00000014859 (Gene tree)
Gene ID: 111565800
Gene Symbol: sbno1
Alias: -
Full Name: strawberry notch homolog 1
Gene Type: protein_coding
Species: Amphiprion_ocellaris
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 16347 bases
Position: chrNXFZ01001948.1:120267-136613
Accession: 111565800
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAOCP00000026520	ResIII	PF04851.15	2.5e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAOCT00000017668	-	4233	XM_023266044	ENSAOCP00000026520	1410 (aa)	XP_023121812	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSAOCG00000014859	sbno1	68	64.399	ENSAOCG00000016581	si:ch73-63e15.2	75	63.039

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAOCG00000014859	sbno1	99	75.193	ENSG00000139697	SBNO1	99	75.053	Homo_sapiens
ENSAOCG00000014859	sbno1	81	98.605	ENSAPOG00000003196	sbno1	98	98.605	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAOCG00000014859	sbno1	99	75.263	ENSAMEG00000015151	SBNO1	99	75.070	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAOCG00000014859	sbno1	99	89.212	ENSACIG00000008088	sbno1	100	88.857	Amphilophus_citrinellus
ENSAOCG00000014859	sbno1	100	99.929	ENSAPEG00000006069	sbno1	100	99.929	Amphiprion_percula
ENSAOCG00000014859	sbno1	99	93.523	ENSATEG00000006667	sbno1	100	93.096	Anabas_testudineus
ENSAOCG00000014859	sbno1	97	75.771	ENSAPLG00000015674	SBNO1	99	75.901	Anas_platyrhynchos
ENSAOCG00000014859	sbno1	97	75.036	ENSACAG00000015441	SBNO1	88	74.435	Anolis_carolinensis
ENSAOCG00000014859	sbno1	94	83.122	ENSANAG00000029958	-	99	75.000	Aotus_nancymaae
ENSAOCG00000014859	sbno1	99	88.273	ENSACLG00000024913	sbno1	100	87.986	Astatotilapia_calliptera
ENSAOCG00000014859	sbno1	99	81.734	ENSAMXG00000019473	sbno1	100	81.450	Astyanax_mexicanus
ENSAOCG00000014859	sbno1	99	75.439	ENSBTAG00000020505	SBNO1	99	75.386	Bos_taurus
ENSAOCG00000014859	sbno1	99	75.140	ENSCJAG00000016599	SBNO1	99	74.930	Callithrix_jacchus
ENSAOCG00000014859	sbno1	99	75.316	ENSCAFG00000007503	SBNO1	97	84.524	Canis_familiaris
ENSAOCG00000014859	sbno1	94	80.536	ENSCAFG00020015363	SBNO1	99	80.536	Canis_lupus_dingo
ENSAOCG00000014859	sbno1	94	82.531	ENSCHIG00000008382	SBNO1	99	82.531	Capra_hircus
ENSAOCG00000014859	sbno1	99	75.351	ENSTSYG00000012749	SBNO1	99	76.165	Carlito_syrichta
ENSAOCG00000014859	sbno1	89	82.679	ENSCAPG00000000384	SBNO1	99	82.679	Cavia_aperea
ENSAOCG00000014859	sbno1	94	82.679	ENSCPOG00000008109	SBNO1	99	82.679	Cavia_porcellus
ENSAOCG00000014859	sbno1	99	70.877	ENSCCAG00000035316	SBNO1	99	71.250	Cebus_capucinus
ENSAOCG00000014859	sbno1	98	74.435	ENSCATG00000008239	SBNO1	98	82.679	Cercocebus_atys
ENSAOCG00000014859	sbno1	94	82.679	ENSCLAG00000008995	SBNO1	99	82.679	Chinchilla_lanigera
ENSAOCG00000014859	sbno1	82	81.314	ENSCSAG00000002064	SBNO1	99	81.143	Chlorocebus_sabaeus
ENSAOCG00000014859	sbno1	94	72.991	ENSCHOG00000008814	SBNO1	99	68.987	Choloepus_hoffmanni
ENSAOCG00000014859	sbno1	97	75.090	ENSCPBG00000025968	SBNO1	99	75.088	Chrysemys_picta_bellii
ENSAOCG00000014859	sbno1	99	71.719	ENSCANG00000042688	-	99	71.368	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAOCG00000014859	sbno1	99	74.596	ENSCGRG00001017470	Sbno1	99	81.283	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAOCG00000014859	sbno1	99	74.596	ENSCGRG00000004756	Sbno1	99	81.283	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAOCG00000014859	sbno1	99	90.014	ENSCSEG00000011919	sbno1	100	90.014	Cynoglossus_semilaevis
ENSAOCG00000014859	sbno1	99	90.476	ENSCVAG00000007038	sbno1	100	90.263	Cyprinodon_variegatus
ENSAOCG00000014859	sbno1	99	81.037	ENSDARG00000099080	sbno1	100	81.108	Danio_rerio
ENSAOCG00000014859	sbno1	99	77.524	ENSDNOG00000017147	SBNO1	96	77.524	Dasypus_novemcinctus
ENSAOCG00000014859	sbno1	99	69.361	ENSDORG00000015261	Sbno1	83	80.018	Dipodomys_ordii
ENSAOCG00000014859	sbno1	92	71.384	ENSETEG00000005620	SBNO1	93	71.384	Echinops_telfairi
ENSAOCG00000014859	sbno1	74	62.150	ENSEBUG00000013823	sbno1	93	60.784	Eptatretus_burgeri
ENSAOCG00000014859	sbno1	50	73.566	ENSEASG00005012595	-	92	73.913	Equus_asinus_asinus
ENSAOCG00000014859	sbno1	99	75.421	ENSECAG00000006127	SBNO1	99	75.815	Equus_caballus
ENSAOCG00000014859	sbno1	80	76.503	ENSEEUG00000003793	SBNO1	81	76.503	Erinaceus_europaeus
ENSAOCG00000014859	sbno1	99	83.109	ENSELUG00000002886	sbno1	99	82.896	Esox_lucius
ENSAOCG00000014859	sbno1	99	75.421	ENSFCAG00000015331	SBNO1	99	75.228	Felis_catus
ENSAOCG00000014859	sbno1	97	75.627	ENSFALG00000009273	SBNO1	99	75.830	Ficedula_albicollis
ENSAOCG00000014859	sbno1	94	80.616	ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	80.072	Fukomys_damarensis
ENSAOCG00000014859	sbno1	99	90.476	ENSFHEG00000007360	sbno1	100	90.263	Fundulus_heteroclitus
ENSAOCG00000014859	sbno1	94	85.221	ENSGMOG00000018229	sbno1	100	84.708	Gadus_morhua
ENSAOCG00000014859	sbno1	87	75.457	ENSGALG00000003392	SBNO1	99	75.958	Gallus_gallus
ENSAOCG00000014859	sbno1	99	90.896	ENSGAFG00000003960	sbno1	100	90.541	Gambusia_affinis
ENSAOCG00000014859	sbno1	93	89.827	ENSGACG00000015633	sbno1	99	89.375	Gasterosteus_aculeatus
ENSAOCG00000014859	sbno1	97	74.746	ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	82.716	Gopherus_agassizii
ENSAOCG00000014859	sbno1	99	75.123	ENSGGOG00000015000	SBNO1	99	82.500	Gorilla_gorilla
ENSAOCG00000014859	sbno1	99	81.838	ENSHBUG00000011910	sbno1	100	81.048	Haplochromis_burtoni
ENSAOCG00000014859	sbno1	94	83.666	ENSHGLG00000014165	-	99	83.273	Heterocephalus_glaber_female
ENSAOCG00000014859	sbno1	90	93.294	ENSHCOG00000003246	sbno1	95	93.663	Hippocampus_comes
ENSAOCG00000014859	sbno1	99	81.999	ENSIPUG00000015830	Sbno1	98	82.276	Ictalurus_punctatus
ENSAOCG00000014859	sbno1	94	82.679	ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	82.679	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAOCG00000014859	sbno1	99	74.965	ENSJJAG00000001741	Sbno1	99	79.107	Jaculus_jaculus
ENSAOCG00000014859	sbno1	99	92.537	ENSKMAG00000009696	sbno1	100	92.537	Kryptolebias_marmoratus
ENSAOCG00000014859	sbno1	99	90.909	ENSLBEG00000007623	sbno1	100	90.554	Labrus_bergylta
ENSAOCG00000014859	sbno1	99	71.529	ENSLACG00000017227	SBNO1	99	74.561	Latimeria_chalumnae
ENSAOCG00000014859	sbno1	99	80.875	ENSLOCG00000005725	sbno1	97	80.381	Lepisosteus_oculatus
ENSAOCG00000014859	sbno1	99	74.579	ENSLAFG00000002135	SBNO1	99	74.877	Loxodonta_africana
ENSAOCG00000014859	sbno1	99	75.211	ENSMFAG00000031429	SBNO1	99	79.329	Macaca_fascicularis
ENSAOCG00000014859	sbno1	99	75.264	ENSMMUG00000011496	SBNO1	99	79.329	Macaca_mulatta
ENSAOCG00000014859	sbno1	94	82.500	ENSMLEG00000033260	SBNO1	99	82.500	Mandrillus_leucophaeus
ENSAOCG00000014859	sbno1	99	92.745	ENSMAMG00000005473	sbno1	100	92.390	Mastacembelus_armatus
ENSAOCG00000014859	sbno1	97	75.808	ENSMGAG00000003274	SBNO1	99	75.958	Meleagris_gallopavo
ENSAOCG00000014859	sbno1	94	80.399	ENSMICG00000006573	-	99	79.928	Microcebus_murinus
ENSAOCG00000014859	sbno1	99	72.939	ENSMOCG00000009390	Sbno1	99	81.996	Microtus_ochrogaster
ENSAOCG00000014859	sbno1	99	85.735	ENSMMOG00000008691	sbno1	99	86.377	Mola_mola
ENSAOCG00000014859	sbno1	99	75.035	ENSMODG00000012470	SBNO1	98	74.895	Monodelphis_domestica
ENSAOCG00000014859	sbno1	99	92.395	ENSMALG00000001056	sbno1	100	92.395	Monopterus_albus
ENSAOCG00000014859	sbno1	99	75.159	MGP_CAROLIEiJ_G0027749	Sbno1	95	90.789	Mus_caroli
ENSAOCG00000014859	sbno1	99	75.018	ENSMUSG00000038095	Sbno1	94	90.789	Mus_musculus
ENSAOCG00000014859	sbno1	99	75.229	MGP_PahariEiJ_G0024329	Sbno1	95	90.789	Mus_pahari
ENSAOCG00000014859	sbno1	99	75.265	MGP_SPRETEiJ_G0028747	Sbno1	95	90.789	Mus_spretus
ENSAOCG00000014859	sbno1	99	75.492	ENSMPUG00000001658	SBNO1	99	75.298	Mustela_putorius_furo
ENSAOCG00000014859	sbno1	99	74.965	ENSMLUG00000017159	SBNO1	99	74.789	Myotis_lucifugus
ENSAOCG00000014859	sbno1	91	83.689	ENSNGAG00000012620	Sbno1	98	83.689	Nannospalax_galili
ENSAOCG00000014859	sbno1	99	89.145	ENSNBRG00000019189	sbno1	100	88.066	Neolamprologus_brichardi
ENSAOCG00000014859	sbno1	99	72.382	ENSNLEG00000001502	SBNO1	99	74.643	Nomascus_leucogenys
ENSAOCG00000014859	sbno1	61	71.875	ENSMEUG00000008768	-	93	74.843	Notamacropus_eugenii
ENSAOCG00000014859	sbno1	99	74.666	ENSOPRG00000011054	SBNO1	99	74.912	Ochotona_princeps
ENSAOCG00000014859	sbno1	94	82.857	ENSODEG00000009997	SBNO1	99	82.857	Octodon_degus
ENSAOCG00000014859	sbno1	99	92.264	ENSONIG00000015348	sbno1	100	91.554	Oreochromis_niloticus
ENSAOCG00000014859	sbno1	97	74.465	ENSOCUG00000002441	SBNO1	95	74.660	Oryctolagus_cuniculus
ENSAOCG00000014859	sbno1	99	89.986	ENSORLG00000001593	sbno1	100	89.773	Oryzias_latipes
ENSAOCG00000014859	sbno1	99	89.979	ENSORLG00020015216	sbno1	100	89.837	Oryzias_latipes_hni
ENSAOCG00000014859	sbno1	99	90.192	ENSORLG00015002726	sbno1	100	90.050	Oryzias_latipes_hsok
ENSAOCG00000014859	sbno1	98	90.157	ENSOMEG00000019313	sbno1	99	90.086	Oryzias_melastigma
ENSAOCG00000014859	sbno1	99	75.105	ENSOARG00000004404	SBNO1	99	75.263	Ovis_aries
ENSAOCG00000014859	sbno1	99	75.070	ENSPPAG00000024635	SBNO1	99	82.500	Pan_paniscus
ENSAOCG00000014859	sbno1	99	75.421	ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	75.228	Panthera_pardus
ENSAOCG00000014859	sbno1	99	75.369	ENSPTIG00000017803	SBNO1	99	75.176	Panthera_tigris_altaica
ENSAOCG00000014859	sbno1	99	75.070	ENSPTRG00000005597	SBNO1	99	82.500	Pan_troglodytes
ENSAOCG00000014859	sbno1	94	82.500	ENSPANG00000011640	SBNO1	99	82.500	Papio_anubis
ENSAOCG00000014859	sbno1	99	80.679	ENSPKIG00000001441	sbno1	100	80.396	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAOCG00000014859	sbno1	91	72.015	ENSPSIG00000009256	-	99	72.107	Pelodiscus_sinensis
ENSAOCG00000014859	sbno1	97	74.982	ENSPSIG00000009572	-	99	74.679	Pelodiscus_sinensis
ENSAOCG00000014859	sbno1	94	81.818	ENSPEMG00000016087	Sbno1	99	81.818	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAOCG00000014859	sbno1	99	75.000	ENSPCIG00000010985	SBNO1	99	74.912	Phascolarctos_cinereus
ENSAOCG00000014859	sbno1	99	91.607	ENSPFOG00000005069	sbno1	100	91.607	Poecilia_formosa
ENSAOCG00000014859	sbno1	99	91.465	ENSPLAG00000015015	sbno1	100	91.465	Poecilia_latipinna
ENSAOCG00000014859	sbno1	99	91.613	ENSPMEG00000021212	sbno1	100	91.613	Poecilia_mexicana
ENSAOCG00000014859	sbno1	99	90.689	ENSPREG00000017746	sbno1	99	92.839	Poecilia_reticulata
ENSAOCG00000014859	sbno1	99	75.035	ENSPPYG00000005084	SBNO1	99	75.316	Pongo_abelii
ENSAOCG00000014859	sbno1	87	69.385	ENSPCAG00000008634	SBNO1	88	68.901	Procavia_capensis
ENSAOCG00000014859	sbno1	99	75.123	ENSPCOG00000024277	SBNO1	99	82.734	Propithecus_coquereli
ENSAOCG00000014859	sbno1	86	83.499	ENSPVAG00000015304	SBNO1	87	83.499	Pteropus_vampyrus
ENSAOCG00000014859	sbno1	99	91.767	ENSPNYG00000004291	sbno1	100	91.116	Pundamilia_nyererei
ENSAOCG00000014859	sbno1	99	81.831	ENSPNAG00000015622	sbno1	100	81.050	Pygocentrus_nattereri
ENSAOCG00000014859	sbno1	94	81.996	ENSRNOG00000001064	Sbno1	99	82.143	Rattus_norvegicus
ENSAOCG00000014859	sbno1	94	82.500	ENSRROG00000034230	SBNO1	99	82.500	Rhinopithecus_roxellana
ENSAOCG00000014859	sbno1	95	73.071	ENSSBOG00000015422	SBNO1	99	72.595	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSAOCG00000014859	sbno1	99	81.131	ENSSFOG00015019025	sbno1	100	81.471	Scleropages_formosus
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