EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAOCG00000020590 (Gene tree)
Gene ID: 111565094
Gene Symbol: celf4
Alias: zgc:92761
Full Name: CUGBP Elav-like family member 4
Gene Type: protein_coding
Species: Amphiprion_ocellaris
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 92615 bases
Position: chrNXFZ01006374.1:215779-308393
Accession: 111565094
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAOCP00000015753	RRM_1	PF00076.22	4e-53	1	3
ENSAOCP00000015753	RRM_1	PF00076.22	4e-53	2	3
ENSAOCP00000015753	RRM_1	PF00076.22	4e-53	3	3
ENSAOCP00000015750	RRM_1	PF00076.22	3.1e-42	1	3
ENSAOCP00000015750	RRM_1	PF00076.22	3.1e-42	2	3
ENSAOCP00000015750	RRM_1	PF00076.22	3.1e-42	3	3

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAOCT00000031994	-	1326	-	ENSAOCP00000015750	441 (aa)	-	-
ENSAOCT00000032000	-	2049	XM_023265077	ENSAOCP00000015753	525 (aa)	XP_023120845	UPI000B8F3A59

Gene Model

Click here to download ENSAOCG00000020590's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSAOCG00000020590's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSAOCG00000020590	celf4	91	45.418	ENSAOCG00000022110	-	92	44.600
ENSAOCG00000020590	celf4	58	69.962	ENSAOCG00000019919	-	78	69.922
ENSAOCG00000020590	celf4	92	66.667	ENSAOCG00000020552	celf3a	100	66.599
ENSAOCG00000020590	celf4	55	41.975	ENSAOCG00000019468	ELAVL2	77	41.975
ENSAOCG00000020590	celf4	76	77.181	ENSAOCG00000007824	celf3b	100	75.839
ENSAOCG00000020590	celf4	53	46.154	ENSAOCG00000023751	-	92	45.679
ENSAOCG00000020590	celf4	58	41.860	ENSAOCG00000005054	elavl3	85	41.860
ENSAOCG00000020590	celf4	64	32.222	ENSAOCG00000018765	tia1l	53	34.568
ENSAOCG00000020590	celf4	62	32.500	ENSAOCG00000008301	rbms2a	62	32.500
ENSAOCG00000020590	celf4	91	45.142	ENSAOCG00000001252	celf1	82	80.952
ENSAOCG00000020590	celf4	50	45.679	ENSAOCG00000020018	elavl1a	91	45.679
ENSAOCG00000020590	celf4	86	95.238	ENSAOCG00000000908	si:dkey-205h23.2	99	95.238
ENSAOCG00000020590	celf4	57	38.462	ENSAOCG00000014482	-	53	32.099

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAOCG00000020590	celf4	100	85.301	ENSG00000101489	CELF4	100	94.030	Homo_sapiens
ENSAOCG00000020590	celf4	100	100.000	ENSAPOG00000002964	celf4	100	100.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAOCG00000020590	celf4	88	81.931	ENSAMEG00000017059	CELF4	99	75.876	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAOCG00000020590	celf4	100	94.796	ENSACIG00000018097	celf4	100	94.796	Amphilophus_citrinellus
ENSAOCG00000020590	celf4	100	99.773	ENSAPEG00000002940	celf4	99	99.773	Amphiprion_percula
ENSAOCG00000020590	celf4	100	99.546	ENSATEG00000023731	celf4	100	99.546	Anabas_testudineus
ENSAOCG00000020590	celf4	74	68.664	ENSAPLG00000007830	-	100	71.618	Anas_platyrhynchos
ENSAOCG00000020590	celf4	54	73.592	ENSACAG00000012428	CELF4	92	75.465	Anolis_carolinensis
ENSAOCG00000020590	celf4	100	85.301	ENSANAG00000029499	CELF4	99	85.746	Aotus_nancymaae
ENSAOCG00000020590	celf4	100	99.810	ENSACLG00000011828	celf4	100	99.810	Astatotilapia_calliptera
ENSAOCG00000020590	celf4	100	94.095	ENSAMXG00000007935	celf4	100	94.095	Astyanax_mexicanus
ENSAOCG00000020590	celf4	100	85.235	ENSBTAG00000004940	CELF4	98	92.683	Bos_taurus
ENSAOCG00000020590	celf4	100	83.406	ENSCJAG00000021135	CELF4	99	83.843	Callithrix_jacchus
ENSAOCG00000020590	celf4	100	80.225	ENSCHIG00000007169	CELF4	98	92.683	Capra_hircus
ENSAOCG00000020590	celf4	90	71.259	ENSTSYG00000000816	CELF4	84	88.344	Carlito_syrichta
ENSAOCG00000020590	celf4	100	73.801	ENSCPOG00000035956	CELF4	99	75.092	Cavia_porcellus
ENSAOCG00000020590	celf4	100	85.301	ENSCCAG00000028373	CELF4	99	85.746	Cebus_capucinus
ENSAOCG00000020590	celf4	100	85.301	ENSCATG00000045293	CELF4	99	85.746	Cercocebus_atys
ENSAOCG00000020590	celf4	100	78.044	ENSCLAG00000008344	CELF4	99	79.336	Chinchilla_lanigera
ENSAOCG00000020590	celf4	90	79.644	ENSCSAG00000017933	CELF4	100	81.425	Chlorocebus_sabaeus
ENSAOCG00000020590	celf4	93	75.127	ENSCPBG00000005237	CELF4	93	80.952	Chrysemys_picta_bellii
ENSAOCG00000020590	celf4	100	85.301	ENSCANG00000036735	CELF4	99	85.746	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAOCG00000020590	celf4	78	70.673	ENSCGRG00001018085	Celf4	89	72.356	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAOCG00000020590	celf4	100	99.238	ENSCSEG00000007074	celf4	99	100.000	Cynoglossus_semilaevis
ENSAOCG00000020590	celf4	100	97.743	ENSCVAG00000017617	celf4	99	97.743	Cyprinodon_variegatus
ENSAOCG00000020590	celf4	100	94.667	ENSDARG00000070045	celf4	100	96.296	Danio_rerio
ENSAOCG00000020590	celf4	90	76.790	ENSDNOG00000032492	CELF4	99	79.012	Dasypus_novemcinctus
ENSAOCG00000020590	celf4	100	78.044	ENSDORG00000007169	Celf4	99	79.336	Dipodomys_ordii
ENSAOCG00000020590	celf4	91	80.576	ENSETEG00000007432	-	72	79.137	Echinops_telfairi
ENSAOCG00000020590	celf4	100	85.301	ENSEASG00005016534	CELF4	99	85.746	Equus_asinus_asinus
ENSAOCG00000020590	celf4	100	78.601	ENSECAG00000008810	CELF4	99	79.012	Equus_caballus
ENSAOCG00000020590	celf4	88	65.261	ENSEEUG00000003763	CELF4	99	61.746	Erinaceus_europaeus
ENSAOCG00000020590	celf4	100	85.491	ENSFCAG00000045234	CELF4	99	85.938	Felis_catus
ENSAOCG00000020590	celf4	90	80.662	ENSFALG00000009188	CELF4	98	81.679	Ficedula_albicollis
ENSAOCG00000020590	celf4	100	74.354	ENSFDAG00000010287	CELF4	99	74.539	Fukomys_damarensis
ENSAOCG00000020590	celf4	100	78.639	ENSFHEG00000003431	celf4	99	83.015	Fundulus_heteroclitus
ENSAOCG00000020590	celf4	100	78.558	ENSGMOG00000008703	celf4	100	78.558	Gadus_morhua
ENSAOCG00000020590	celf4	86	92.683	ENSGMOG00000011747	-	74	92.683	Gadus_morhua
ENSAOCG00000020590	celf4	100	98.857	ENSGAFG00000021515	celf4	94	98.633	Gambusia_affinis
ENSAOCG00000020590	celf4	100	91.288	ENSGACG00000008752	celf4	100	91.271	Gasterosteus_aculeatus
ENSAOCG00000020590	celf4	71	85.185	ENSGAGG00000017672	-	86	90.217	Gopherus_agassizii
ENSAOCG00000020590	celf4	60	79.522	ENSGAGG00000023014	-	98	79.522	Gopherus_agassizii
ENSAOCG00000020590	celf4	100	85.301	ENSGGOG00000013920	CELF4	99	85.746	Gorilla_gorilla
ENSAOCG00000020590	celf4	100	99.619	ENSHBUG00000021618	celf4	100	99.619	Haplochromis_burtoni
ENSAOCG00000020590	celf4	100	78.969	ENSHGLG00000003130	CELF4	99	78.969	Heterocephalus_glaber_female
ENSAOCG00000020590	celf4	100	77.491	ENSHGLG00100006394	CELF4	99	78.782	Heterocephalus_glaber_male
ENSAOCG00000020590	celf4	100	94.369	ENSHCOG00000012195	celf4	99	94.369	Hippocampus_comes
ENSAOCG00000020590	celf4	100	84.760	ENSIPUG00000010810	celf4	96	83.796	Ictalurus_punctatus
ENSAOCG00000020590	celf4	100	77.306	ENSJJAG00000016892	Celf4	99	78.598	Jaculus_jaculus
ENSAOCG00000020590	celf4	100	98.667	ENSKMAG00000019602	celf4	100	98.667	Kryptolebias_marmoratus
ENSAOCG00000020590	celf4	100	98.866	ENSLBEG00000000940	celf4	99	98.866	Labrus_bergylta
ENSAOCG00000020590	celf4	93	81.638	ENSLOCG00000004792	celf4	99	81.638	Lepisosteus_oculatus
ENSAOCG00000020590	celf4	100	78.004	ENSLAFG00000021352	CELF4	99	79.298	Loxodonta_africana
ENSAOCG00000020590	celf4	100	85.301	ENSMFAG00000042983	CELF4	99	85.746	Macaca_fascicularis
ENSAOCG00000020590	celf4	100	78.395	ENSMMUG00000006866	CELF4	99	78.807	Macaca_mulatta
ENSAOCG00000020590	celf4	100	85.301	ENSMNEG00000033449	CELF4	99	85.746	Macaca_nemestrina
ENSAOCG00000020590	celf4	91	78.818	ENSMLEG00000028543	CELF4	99	74.593	Mandrillus_leucophaeus
ENSAOCG00000020590	celf4	100	99.320	ENSMAMG00000018573	celf4	99	99.320	Mastacembelus_armatus
ENSAOCG00000020590	celf4	100	95.692	ENSMZEG00005026879	celf4	99	95.692	Maylandia_zebra
ENSAOCG00000020590	celf4	66	62.784	ENSMGAG00000017029	CELF4	100	62.571	Meleagris_gallopavo
ENSAOCG00000020590	celf4	100	83.406	ENSMICG00000006984	CELF4	99	83.843	Microcebus_murinus
ENSAOCG00000020590	celf4	100	77.675	ENSMOCG00000011985	Celf4	99	78.967	Microtus_ochrogaster
ENSAOCG00000020590	celf4	100	98.413	ENSMMOG00000012281	celf4	100	98.413	Mola_mola
ENSAOCG00000020590	celf4	78	70.757	ENSMODG00000000306	CELF4	91	71.018	Monodelphis_domestica
ENSAOCG00000020590	celf4	100	99.619	ENSMALG00000001696	celf4	100	99.619	Monopterus_albus
ENSAOCG00000020590	celf4	100	78.969	MGP_CAROLIEiJ_G0022058	Celf4	100	81.441	Mus_caroli
ENSAOCG00000020590	celf4	100	83.843	ENSMUSG00000024268	Celf4	99	83.843	Mus_musculus
ENSAOCG00000020590	celf4	100	78.969	MGP_PahariEiJ_G0018792	Celf4	100	81.441	Mus_pahari
ENSAOCG00000020590	celf4	100	78.969	MGP_SPRETEiJ_G0022969	Celf4	100	81.400	Mus_spretus
ENSAOCG00000020590	celf4	94	71.090	ENSMPUG00000001027	CELF4	81	92.857	Mustela_putorius_furo
ENSAOCG00000020590	celf4	90	77.073	ENSMLUG00000001755	CELF4	100	79.268	Myotis_lucifugus
ENSAOCG00000020590	celf4	100	79.151	ENSNGAG00000000761	Celf4	99	79.336	Nannospalax_galili
ENSAOCG00000020590	celf4	100	95.692	ENSNBRG00000018194	celf4	99	95.692	Neolamprologus_brichardi
ENSAOCG00000020590	celf4	73	79.795	ENSMEUG00000007202	-	100	70.984	Notamacropus_eugenii
ENSAOCG00000020590	celf4	88	81.329	ENSOPRG00000014415	CELF4	89	81.329	Ochotona_princeps
ENSAOCG00000020590	celf4	100	78.044	ENSODEG00000018464	CELF4	99	79.336	Octodon_degus
ENSAOCG00000020590	celf4	100	99.810	ENSONIG00000019463	celf4	100	99.810	Oreochromis_niloticus
ENSAOCG00000020590	celf4	91	84.767	ENSOCUG00000024790	CELF4	75	85.258	Oryctolagus_cuniculus
ENSAOCG00000020590	celf4	100	99.619	ENSORLG00000008913	celf4	100	99.619	Oryzias_latipes
ENSAOCG00000020590	celf4	100	99.619	ENSORLG00020008454	celf4	100	99.619	Oryzias_latipes_hni
ENSAOCG00000020590	celf4	100	99.619	ENSORLG00015004115	celf4	100	99.619	Oryzias_latipes_hsok
ENSAOCG00000020590	celf4	100	99.810	ENSOMEG00000002391	celf4	100	99.810	Oryzias_melastigma
ENSAOCG00000020590	celf4	94	80.000	ENSOGAG00000010018	CELF4	100	81.647	Otolemur_garnettii
ENSAOCG00000020590	celf4	66	75.214	ENSOARG00000005276	CELF4	100	77.778	Ovis_aries
ENSAOCG00000020590	celf4	91	82.759	ENSPPAG00000020644	CELF4	99	77.846	Pan_paniscus
ENSAOCG00000020590	celf4	100	85.301	ENSPPRG00000007683	CELF4	99	85.746	Panthera_pardus
ENSAOCG00000020590	celf4	100	85.301	ENSPTRG00000009982	CELF4	99	85.746	Pan_troglodytes
ENSAOCG00000020590	celf4	100	85.301	ENSPANG00000006365	CELF4	99	85.746	Papio_anubis
ENSAOCG00000020590	celf4	100	90.991	ENSPKIG00000017421	celf4	99	90.315	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAOCG00000020590	celf4	90	80.662	ENSPSIG00000015538	CELF4	98	81.679	Pelodiscus_sinensis
ENSAOCG00000020590	celf4	100	77.860	ENSPEMG00000019299	Celf4	99	79.151	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAOCG00000020590	celf4	80	95.556	ENSPLAG00000012151	celf4	89	95.556	Poecilia_latipinna
ENSAOCG00000020590	celf4	100	85.874	ENSPMEG00000015313	celf4	97	100.000	Poecilia_mexicana
ENSAOCG00000020590	celf4	100	99.238	ENSPREG00000021231	celf4	100	99.238	Poecilia_reticulata
ENSAOCG00000020590	celf4	82	82.432	ENSPCAG00000000126	CELF4	81	78.125	Procavia_capensis
ENSAOCG00000020590	celf4	100	78.645	ENSPVAG00000009204	CELF4	99	79.055	Pteropus_vampyrus
ENSAOCG00000020590	celf4	100	95.692	ENSPNYG00000004131	celf4	99	95.692	Pundamilia_nyererei
ENSAOCG00000020590	celf4	100	93.714	ENSPNAG00000006426	celf4	100	93.714	Pygocentrus_nattereri
ENSAOCG00000020590	celf4	87	73.127	ENSRNOG00000014503	Celf4	100	79.091	Rattus_norvegicus
ENSAOCG00000020590	celf4	100	85.491	ENSRBIG00000035924	CELF4	99	85.938	Rhinopithecus_bieti
ENSAOCG00000020590	celf4	100	85.301	ENSRROG00000014839	CELF4	99	85.746	Rhinopithecus_roxellana
ENSAOCG00000020590	celf4	100	84.410	ENSSBOG00000030001	CELF4	99	84.855	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSAOCG00000020590	celf4	85	76.731	ENSSHAG00000009193	CELF4	96	77.008	Sarcophilus_harrisii
ENSAOCG00000020590	celf4	100	85.811	ENSSFOG00015010874	celf4	100	84.280	Scleropages_formosus
ENSAOCG00000020590	celf4	100	97.575	ENSSMAG00000009331	celf4	100	100.000	Scophthalmus_maximus
ENSAOCG00000020590	celf4	100	81.876	ENSSLDG00000018548	celf4	100	81.876	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSAOCG00000020590	celf4	100	85.075	ENSSPAG00000018307	celf4	100	85.075	Stegastes_partitus
ENSAOCG00000020590	celf4	100	83.660	ENSSSCG00000003748	CELF4	99	92.857	Sus_scrofa
ENSAOCG00000020590	celf4	90	80.662	ENSTGUG00000001649	CELF4	98	81.679	Taeniopygia_guttata
ENSAOCG00000020590	celf4	100	96.145	ENSTRUG00000015481	celf4	100	96.145	Takifugu_rubripes
ENSAOCG00000020590	celf4	99	83.636	ENSTNIG00000010679	celf4	99	83.030	Tetraodon_nigroviridis
ENSAOCG00000020590	celf4	90	86.207	ENSTBEG00000010647	CELF4	87	86.207	Tupaia_belangeri
ENSAOCG00000020590	celf4	100	78.439	ENSTTRG00000016826	CELF4	99	78.850	Tursiops_truncatus
ENSAOCG00000020590	celf4	83	76.963	ENSUAMG00000005506	CELF4	83	77.749	Ursus_americanus
ENSAOCG00000020590	celf4	55	82.000	ENSVPAG00000009042	-	70	82.000	Vicugna_pacos
ENSAOCG00000020590	celf4	100	79.876	ENSVVUG00000027721	CELF4	99	80.882	Vulpes_vulpes
ENSAOCG00000020590	celf4	90	78.325	ENSXETG00000020486	celf4	98	79.310	Xenopus_tropicalis
ENSAOCG00000020590	celf4	90	85.649	ENSXCOG00000017592	celf4	97	80.911	Xiphophorus_couchianus
ENSAOCG00000020590	celf4	100	98.667	ENSXMAG00000018178	celf4	100	98.667	Xiphophorus_maculatus