EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAOCG00000022046 (Gene tree)
Gene ID: 111578477
Gene Symbol: syf2 (1 of many)
Alias: hm:zeh0031|zeh0031|zgc:113871|zgc:92835
Full Name: pre-mRNA-splicing factor syf2
Gene Type: protein_coding
Species: Amphiprion_ocellaris
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 8693 bases
Position: chrNXFZ01003332.1:5371-14063
Accession: 111578477
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAOCP00000030718	SYF2	PF08231.12	5.3e-55	1	1
ENSAOCP00000030708	SYF2	PF08231.12	6.9e-55	1	1
ENSAOCP00000030722	SYF2	PF08231.12	8.6e-55	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAOCT00000025967	-	708	-	ENSAOCP00000030718	235 (aa)	-	-
ENSAOCT00000025974	-	846	-	ENSAOCP00000030722	281 (aa)	-	-
ENSAOCT00000025942	-	780	XM_023285313	ENSAOCP00000030708	259 (aa)	XP_023141081	-

Gene Model

Click here to download ENSAOCG00000022046's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSAOCG00000022046's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSAOCG00000022046	syf2	93	98.643	ENSAOCG00000010912	syf2	69	100.000

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAOCG00000022046	syf2	99	79.832	ENSG00000117614	SYF2	98	80.252	Homo_sapiens
ENSAOCG00000022046	syf2	100	97.899	ENSAPOG00000001174	syf2	100	99.160	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAOCG00000022046	syf2	95	83.408	ENSAMEG00000010115	-	98	77.459	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAOCG00000022046	syf2	83	85.128	ENSAMEG00000010134	-	100	85.128	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAOCG00000022046	syf2	99	91.810	ENSACIG00000023688	syf2	94	91.064	Amphilophus_citrinellus
ENSAOCG00000022046	syf2	100	99.614	ENSAPEG00000018858	syf2	100	99.614	Amphiprion_percula
ENSAOCG00000022046	syf2	92	94.470	ENSATEG00000007745	syf2	100	93.697	Anabas_testudineus
ENSAOCG00000022046	syf2	85	85.000	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	85.000	Anas_platyrhynchos
ENSAOCG00000022046	syf2	71	71.257	ENSACAG00000026777	-	100	71.257	Anolis_carolinensis
ENSAOCG00000022046	syf2	87	84.804	ENSACAG00000013653	-	100	84.804	Anolis_carolinensis
ENSAOCG00000022046	syf2	92	85.648	ENSANAG00000032473	SYF2	99	80.417	Aotus_nancymaae
ENSAOCG00000022046	syf2	95	91.928	ENSACLG00000019916	syf2	100	90.756	Astatotilapia_calliptera
ENSAOCG00000022046	syf2	100	86.555	ENSAMXG00000004051	syf2	100	86.975	Astyanax_mexicanus
ENSAOCG00000022046	syf2	97	82.684	ENSBTAG00000001651	SYF2	98	82.684	Bos_taurus
ENSAOCG00000022046	syf2	89	52.857	WBGene00019402	syf-2	100	49.789	Caenorhabditis_elegans
ENSAOCG00000022046	syf2	99	80.672	ENSCJAG00000046570	SYF2	98	80.672	Callithrix_jacchus
ENSAOCG00000022046	syf2	92	79.630	ENSCAFG00000030331	-	93	78.899	Canis_familiaris
ENSAOCG00000022046	syf2	92	84.259	ENSCAFG00000012895	-	99	76.613	Canis_familiaris
ENSAOCG00000022046	syf2	77	76.923	ENSCAFG00020021094	-	95	76.923	Canis_lupus_dingo
ENSAOCG00000022046	syf2	92	84.259	ENSCAFG00020021091	-	99	76.613	Canis_lupus_dingo
ENSAOCG00000022046	syf2	100	79.424	ENSCHIG00000020874	SYF2	100	79.424	Capra_hircus
ENSAOCG00000022046	syf2	98	81.197	ENSTSYG00000005114	SYF2	99	80.417	Carlito_syrichta
ENSAOCG00000022046	syf2	84	84.343	ENSCAPG00000010006	SYF2	100	84.343	Cavia_aperea
ENSAOCG00000022046	syf2	98	82.251	ENSCPOG00000005326	SYF2	97	80.083	Cavia_porcellus
ENSAOCG00000022046	syf2	92	85.648	ENSCCAG00000022459	SYF2	99	80.417	Cebus_capucinus
ENSAOCG00000022046	syf2	99	79.412	ENSCATG00000026917	SYF2	98	79.412	Cercocebus_atys
ENSAOCG00000022046	syf2	98	83.550	ENSCLAG00000008474	SYF2	93	83.550	Chinchilla_lanigera
ENSAOCG00000022046	syf2	98	81.385	ENSCSAG00000000948	SYF2	95	80.508	Chlorocebus_sabaeus
ENSAOCG00000022046	syf2	73	66.092	ENSCHOG00000005273	-	98	64.972	Choloepus_hoffmanni
ENSAOCG00000022046	syf2	95	85.333	ENSCPBG00000025073	SYF2	97	80.738	Chrysemys_picta_bellii
ENSAOCG00000022046	syf2	90	54.930	ENSCING00000003017	-	89	55.399	Ciona_intestinalis
ENSAOCG00000022046	syf2	90	51.174	ENSCSAVG00000006627	-	97	51.174	Ciona_savignyi
ENSAOCG00000022046	syf2	99	69.748	ENSCANG00000037322	SYF2	98	69.748	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAOCG00000022046	syf2	97	82.609	ENSCGRG00001020733	Syf2	100	80.992	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAOCG00000022046	syf2	83	85.714	ENSCGRG00000005095	Syf2	96	85.859	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAOCG00000022046	syf2	93	88.991	ENSCSEG00000000117	syf2	99	86.076	Cynoglossus_semilaevis
ENSAOCG00000022046	syf2	95	92.377	ENSCVAG00000019543	syf2	100	90.377	Cyprinodon_variegatus
ENSAOCG00000022046	syf2	99	86.441	ENSDARG00000004706	syf2	100	85.714	Danio_rerio
ENSAOCG00000022046	syf2	97	82.328	ENSDNOG00000047605	SYF2	95	82.328	Dasypus_novemcinctus
ENSAOCG00000022046	syf2	97	83.983	ENSDORG00000001274	Syf2	100	80.738	Dipodomys_ordii
ENSAOCG00000022046	syf2	93	55.909	FBgn0033556	CG12343	97	55.909	Drosophila_melanogaster
ENSAOCG00000022046	syf2	88	70.531	ENSETEG00000015729	SYF2	100	67.249	Echinops_telfairi
ENSAOCG00000022046	syf2	84	59.898	ENSEBUG00000015402	syf2	95	59.898	Eptatretus_burgeri
ENSAOCG00000022046	syf2	98	82.479	ENSEASG00005004224	-	100	80.000	Equus_asinus_asinus
ENSAOCG00000022046	syf2	99	72.881	ENSEASG00005004232	-	98	72.881	Equus_asinus_asinus
ENSAOCG00000022046	syf2	100	81.172	ENSECAG00000010440	-	100	81.172	Equus_caballus
ENSAOCG00000022046	syf2	97	83.117	ENSECAG00000012023	-	94	83.117	Equus_caballus
ENSAOCG00000022046	syf2	74	69.399	ENSEEUG00000015084	SYF2	100	69.399	Erinaceus_europaeus
ENSAOCG00000022046	syf2	99	87.179	ENSELUG00000003465	syf2	99	87.815	Esox_lucius
ENSAOCG00000022046	syf2	93	84.932	ENSFCAG00000043095	-	99	77.016	Felis_catus
ENSAOCG00000022046	syf2	93	85.845	ENSFCAG00000010324	-	81	80.913	Felis_catus
ENSAOCG00000022046	syf2	87	81.863	ENSFALG00000000460	SYF2	100	73.984	Ficedula_albicollis
ENSAOCG00000022046	syf2	93	84.932	ENSFDAG00000008310	SYF2	90	84.932	Fukomys_damarensis
ENSAOCG00000022046	syf2	96	76.991	ENSFHEG00000007238	syf2	100	76.991	Fundulus_heteroclitus
ENSAOCG00000022046	syf2	91	92.093	ENSGMOG00000019138	syf2	96	92.093	Gadus_morhua
ENSAOCG00000022046	syf2	94	83.784	ENSGALG00000013639	SYF2	94	80.085	Gallus_gallus
ENSAOCG00000022046	syf2	100	88.235	ENSGAFG00000019435	syf2	100	89.076	Gambusia_affinis
ENSAOCG00000022046	syf2	94	90.090	ENSGACG00000007305	syf2	100	88.703	Gasterosteus_aculeatus
ENSAOCG00000022046	syf2	95	85.778	ENSGAGG00000010670	SYF2	98	80.645	Gopherus_agassizii
ENSAOCG00000022046	syf2	99	79.832	ENSGGOG00000012796	SYF2	98	80.252	Gorilla_gorilla
ENSAOCG00000022046	syf2	99	90.086	ENSHBUG00000020477	syf2	100	90.336	Haplochromis_burtoni
ENSAOCG00000022046	syf2	94	72.851	ENSHGLG00000004304	-	93	72.973	Heterocephalus_glaber_female
ENSAOCG00000022046	syf2	94	84.234	ENSHGLG00000014393	SYF2	91	84.234	Heterocephalus_glaber_female
ENSAOCG00000022046	syf2	94	84.234	ENSHGLG00100014722	SYF2	91	84.234	Heterocephalus_glaber_male
ENSAOCG00000022046	syf2	100	87.815	ENSHCOG00000012904	syf2	81	86.235	Hippocampus_comes
ENSAOCG00000022046	syf2	97	88.596	ENSIPUG00000019859	syf2	100	86.611	Ictalurus_punctatus
ENSAOCG00000022046	syf2	62	80.137	ENSSTOG00000023984	SYF2	100	80.137	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAOCG00000022046	syf2	85	85.427	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	85.427	Jaculus_jaculus
ENSAOCG00000022046	syf2	100	90.336	ENSKMAG00000013856	syf2	100	91.176	Kryptolebias_marmoratus
ENSAOCG00000022046	syf2	93	94.064	ENSLBEG00000014425	syf2	100	92.857	Labrus_bergylta
ENSAOCG00000022046	syf2	98	80.087	ENSLACG00000012064	SYF2	97	80.087	Latimeria_chalumnae
ENSAOCG00000022046	syf2	98	86.580	ENSLOCG00000002728	syf2	95	85.714	Lepisosteus_oculatus
ENSAOCG00000022046	syf2	97	83.550	ENSLAFG00000023150	-	94	83.550	Loxodonta_africana
ENSAOCG00000022046	syf2	78	56.522	ENSLAFG00000030814	-	100	56.522	Loxodonta_africana
ENSAOCG00000022046	syf2	99	79.412	ENSMFAG00000041831	SYF2	98	79.412	Macaca_fascicularis
ENSAOCG00000022046	syf2	92	84.259	ENSMMUG00000002968	SYF2	98	79.832	Macaca_mulatta
ENSAOCG00000022046	syf2	99	79.412	ENSMNEG00000030180	SYF2	98	79.412	Macaca_nemestrina
ENSAOCG00000022046	syf2	99	79.412	ENSMLEG00000030248	SYF2	98	79.412	Mandrillus_leucophaeus
ENSAOCG00000022046	syf2	92	94.931	ENSMAMG00000010403	syf2	98	92.083	Mastacembelus_armatus
ENSAOCG00000022046	syf2	99	90.213	ENSMZEG00005006429	syf2	100	90.336	Maylandia_zebra
ENSAOCG00000022046	syf2	85	84.925	ENSMGAG00000002019	SYF2	100	84.925	Meleagris_gallopavo
ENSAOCG00000022046	syf2	97	83.043	ENSMAUG00000018974	Syf2	100	80.992	Mesocricetus_auratus
ENSAOCG00000022046	syf2	85	85.427	ENSMICG00000016191	SYF2	100	85.427	Microcebus_murinus
ENSAOCG00000022046	syf2	97	83.478	ENSMOCG00000022938	Syf2	100	81.405	Microtus_ochrogaster
ENSAOCG00000022046	syf2	98	89.610	ENSMMOG00000002396	syf2	97	89.610	Mola_mola
ENSAOCG00000022046	syf2	94	80.804	ENSMODG00000013951	-	98	80.804	Monodelphis_domestica
ENSAOCG00000022046	syf2	99	91.026	ENSMALG00000010706	syf2	100	91.701	Monopterus_albus
ENSAOCG00000022046	syf2	94	86.036	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	100	81.818	Mus_caroli
ENSAOCG00000022046	syf2	94	86.036	ENSMUSG00000028821	Syf2	100	81.818	Mus_musculus
ENSAOCG00000022046	syf2	94	86.036	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	100	81.818	Mus_pahari
ENSAOCG00000022046	syf2	94	86.036	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	100	81.818	Mus_spretus
ENSAOCG00000022046	syf2	92	84.259	ENSMPUG00000015802	-	89	84.018	Mustela_putorius_furo
ENSAOCG00000022046	syf2	93	84.932	ENSMPUG00000015801	-	89	84.932	Mustela_putorius_furo
ENSAOCG00000022046	syf2	96	82.096	ENSMLUG00000001885	SYF2	94	82.096	Myotis_lucifugus
ENSAOCG00000022046	syf2	94	84.234	ENSNGAG00000007912	Syf2	100	78.455	Nannospalax_galili
ENSAOCG00000022046	syf2	99	81.172	ENSNBRG00000010720	syf2	100	81.070	Neolamprologus_brichardi
ENSAOCG00000022046	syf2	99	79.832	ENSNLEG00000035185	SYF2	98	80.252	Nomascus_leucogenys
ENSAOCG00000022046	syf2	97	81.818	ENSOPRG00000012870	SYF2	100	79.424	Ochotona_princeps
ENSAOCG00000022046	syf2	98	73.593	ENSODEG00000014338	-	98	70.082	Octodon_degus
ENSAOCG00000022046	syf2	98	81.385	ENSODEG00000017664	-	99	78.099	Octodon_degus
ENSAOCG00000022046	syf2	95	92.377	ENSONIG00000008213	syf2	100	91.176	Oreochromis_niloticus
ENSAOCG00000022046	syf2	86	85.149	ENSOANG00000009552	SYF2	100	85.149	Ornithorhynchus_anatinus
ENSAOCG00000022046	syf2	92	85.648	ENSOCUG00000013050	SYF2	95	81.780	Oryctolagus_cuniculus
ENSAOCG00000022046	syf2	98	90.000	ENSORLG00000028820	syf2	100	89.270	Oryzias_latipes
ENSAOCG00000022046	syf2	100	88.655	ENSORLG00020018333	syf2	100	88.655	Oryzias_latipes_hni
ENSAOCG00000022046	syf2	100	88.655	ENSORLG00015014665	syf2	100	88.655	Oryzias_latipes_hsok
ENSAOCG00000022046	syf2	100	89.916	ENSOMEG00000013911	syf2	100	90.336	Oryzias_melastigma
ENSAOCG00000022046	syf2	98	82.833	ENSOGAG00000009962	SYF2	95	82.833	Otolemur_garnettii
ENSAOCG00000022046	syf2	83	57.436	ENSOARG00000006269	-	100	57.436	Ovis_aries
ENSAOCG00000022046	syf2	100	78.138	ENSOARG00000006348	-	100	78.138	Ovis_aries
ENSAOCG00000022046	syf2	99	79.832	ENSPPAG00000036579	SYF2	98	80.252	Pan_paniscus
ENSAOCG00000022046	syf2	93	85.845	ENSPPRG00000001638	-	99	78.313	Panthera_pardus
ENSAOCG00000022046	syf2	93	84.932	ENSPPRG00000001651	-	99	77.016	Panthera_pardus
ENSAOCG00000022046	syf2	92	86.111	ENSPTIG00000005711	-	80	85.780	Panthera_tigris_altaica
ENSAOCG00000022046	syf2	93	84.932	ENSPTIG00000007036	-	99	77.016	Panthera_tigris_altaica
ENSAOCG00000022046	syf2	99	79.832	ENSPTRG00000000352	SYF2	98	80.252	Pan_troglodytes
ENSAOCG00000022046	syf2	99	79.412	ENSPANG00000008139	SYF2	98	79.412	Papio_anubis
ENSAOCG00000022046	syf2	100	86.809	ENSPKIG00000008130	syf2	100	86.809	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAOCG00000022046	syf2	98	81.277	ENSPSIG00000011816	SYF2	91	81.277	Pelodiscus_sinensis
ENSAOCG00000022046	syf2	98	88.745	ENSPMGG00000008755	syf2	98	83.200	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSAOCG00000022046	syf2	97	83.043	ENSPEMG00000008283	Syf2	100	80.992	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAOCG00000022046	syf2	94	84.234	ENSPCIG00000014235	SYF2	89	84.234	Phascolarctos_cinereus
ENSAOCG00000022046	syf2	100	88.511	ENSPFOG00000004116	syf2	100	86.777	Poecilia_formosa
ENSAOCG00000022046	syf2	99	89.224	ENSPLAG00000006691	syf2	100	89.270	Poecilia_latipinna
ENSAOCG00000022046	syf2	100	86.134	ENSPMEG00000011684	syf2	100	86.555	Poecilia_mexicana
ENSAOCG00000022046	syf2	92	91.667	ENSPREG00000003009	syf2	100	89.076	Poecilia_reticulata
ENSAOCG00000022046	syf2	99	80.252	ENSPPYG00000001713	SYF2	98	80.252	Pongo_abelii
ENSAOCG00000022046	syf2	99	56.540	ENSPCOG00000027011	SYF2	100	55.967	Propithecus_coquereli
ENSAOCG00000022046	syf2	94	74.324	ENSPVAG00000005841	SYF2	98	69.388	Pteropus_vampyrus
ENSAOCG00000022046	syf2	95	91.928	ENSPNYG00000004979	syf2	100	90.336	Pundamilia_nyererei
ENSAOCG00000022046	syf2	99	87.179	ENSPNAG00000015570	syf2	100	86.975	Pygocentrus_nattereri
ENSAOCG00000022046	syf2	94	86.036	ENSRNOG00000060597	Syf2	100	81.818	Rattus_norvegicus
ENSAOCG00000022046	syf2	99	77.311	ENSRBIG00000042970	SYF2	98	77.311	Rhinopithecus_bieti
ENSAOCG00000022046	syf2	99	79.412	ENSRROG00000001347	SYF2	98	79.412	Rhinopithecus_roxellana
ENSAOCG00000022046	syf2	92	85.185	ENSSBOG00000020184	SYF2	97	80.000	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSAOCG00000022046	syf2	94	83.784	ENSSHAG00000015630	-	89	83.784	Sarcophilus_harrisii
ENSAOCG00000022046	syf2	87	84.951	ENSSHAG00000007152	-	100	84.951	Sarcophilus_harrisii
ENSAOCG00000022046	syf2	94	88.688	ENSSFOG00015023647	syf2	100	84.454	Scleropages_formosus
ENSAOCG00000022046	syf2	98	90.043	ENSSMAG00000009867	syf2	100	89.916	Scophthalmus_maximus
ENSAOCG00000022046	syf2	93	94.954	ENSSDUG00000013072	syf2	100	92.017	Seriola_dumerili
ENSAOCG00000022046	syf2	93	94.954	ENSSLDG00000012677	syf2	100	92.017	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSAOCG00000022046	syf2	98	63.675	ENSSARG00000012889	SYF2	99	62.656	Sorex_araneus
ENSAOCG00000022046	syf2	98	83.478	ENSSPUG00000005251	SYF2	93	80.833	Sphenodon_punctatus
ENSAOCG00000022046	syf2	100	93.697	ENSSPAG00000009626	syf2	100	94.958	Stegastes_partitus
ENSAOCG00000022046	syf2	97	82.251	ENSSSCG00000037481	SYF2	94	82.251	Sus_scrofa
ENSAOCG00000022046	syf2	63	54.967	ENSTGUG00000001126	SYF2	86	54.857	Taeniopygia_guttata
ENSAOCG00000022046	syf2	98	87.013	ENSTRUG00000001499	syf2	96	84.937	Takifugu_rubripes
ENSAOCG00000022046	syf2	94	87.387	ENSTNIG00000016912	syf2	99	87.727	Tetraodon_nigroviridis
ENSAOCG00000022046	syf2	98	60.944	ENSTBEG00000017370	SYF2	99	59.671	Tupaia_belangeri
ENSAOCG00000022046	syf2	92	85.185	ENSTTRG00000003550	SYF2	100	79.098	Tursiops_truncatus
ENSAOCG00000022046	syf2	95	83.408	ENSUAMG00000002897	SYF2	90	83.408	Ursus_americanus
ENSAOCG00000022046	syf2	92	83.796	ENSUMAG00000013108	SYF2	90	82.960	Ursus_maritimus
ENSAOCG00000022046	syf2	94	83.784	ENSVPAG00000005705	SYF2	99	79.668	Vicugna_pacos
ENSAOCG00000022046	syf2	87	84.390	ENSVVUG00000027181	-	100	77.823	Vulpes_vulpes
ENSAOCG00000022046	syf2	92	84.259	ENSVVUG00000027175	-	99	76.613	Vulpes_vulpes
ENSAOCG00000022046	syf2	98	78.632	ENSXETG00000022797	syf2	99	75.000	Xenopus_tropicalis
ENSAOCG00000022046	syf2	100	88.235	ENSXMAG00000022698	syf2	100	88.655	Xiphophorus_maculatus