EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAPEG00000001112 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: tnpo1
Alias: Kapbeta2|karyopherin beta 2
Full Name: transportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Amphiprion_percula
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 25800 bases
Position: chr16:17557932-17583731
Accession: ZDB-GENE-080819-1
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAPEP00000001565	IBN_N	PF03810.19	1.7e-15	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAPET00000001599	-	6311	-	ENSAPEP00000001565	890 (aa)	-	UPI000C3095B0

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSAPEG00000001112	tnpo1	99	86.599	ENSAPEG00000008429	tnpo2	99	86.599
ENSAPEG00000001112	tnpo1	99	87.162	ENSAPEG00000013268	-	99	87.162

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	93.933	ENSG00000083312	TNPO1	100	94.819	Homo_sapiens
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	99.888	ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	99.888	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	92.984	ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	93.096	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAPEG00000001112	tnpo1	87	98.320	ENSACIG00000003711	tnpo1	99	98.320	Amphilophus_citrinellus
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	100.000	ENSAOCG00000008154	tnpo1	100	100.000	Amphiprion_ocellaris
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	98.989	ENSATEG00000010408	tnpo1	100	98.989	Anabas_testudineus
ENSAPEG00000001112	tnpo1	99	89.853	ENSAPLG00000009619	-	97	90.826	Anas_platyrhynchos
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	94.157	ENSACAG00000009599	TNPO1	100	94.157	Anolis_carolinensis
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	83.820	ENSANAG00000025351	-	99	83.820	Aotus_nancymaae
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	58.869	ENSANAG00000027118	-	99	61.086	Aotus_nancymaae
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	93.483	ENSANAG00000022453	-	99	93.483	Aotus_nancymaae
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	96.854	ENSACLG00000027223	tnpo1	100	96.854	Astatotilapia_calliptera
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	95.179	ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	94.731	Astyanax_mexicanus
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	94.045	ENSBTAG00000007979	TNPO1	99	94.045	Bos_taurus
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	93.596	ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	93.596	Callithrix_jacchus
ENSAPEG00000001112	tnpo1	96	93.932	ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	93.932	Canis_familiaris
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	91.573	ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	91.573	Canis_lupus_dingo
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	93.933	ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	93.933	Capra_hircus
ENSAPEG00000001112	tnpo1	99	90.395	ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	92.749	Carlito_syrichta
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	93.483	ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	93.483	Cebus_capucinus
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	93.933	ENSCATG00000043792	TNPO1	100	93.933	Cercocebus_atys
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	93.483	ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	93.483	Chinchilla_lanigera
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	93.933	ENSCSAG00000015616	TNPO1	99	93.933	Chlorocebus_sabaeus
ENSAPEG00000001112	tnpo1	94	82.241	ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	82.241	Choloepus_hoffmanni
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	94.382	ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	94.382	Chrysemys_picta_bellii
ENSAPEG00000001112	tnpo1	99	76.655	ENSCSAVG00000010981	-	99	76.094	Ciona_savignyi
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	93.933	ENSCANG00000004353	TNPO1	99	93.933	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	93.820	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	93.820	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAPEG00000001112	tnpo1	96	94.035	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	100	94.035	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	96.966	ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	96.966	Cynoglossus_semilaevis
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	97.865	ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	97.865	Cyprinodon_variegatus
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	95.286	ENSDARG00000035390	tnpo1	100	94.837	Danio_rerio
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	88.242	ENSDNOG00000006647	TNPO1	99	88.242	Dasypus_novemcinctus
ENSAPEG00000001112	tnpo1	93	94.217	ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	94.210	Dipodomys_ordii
ENSAPEG00000001112	tnpo1	99	58.737	FBgn0035693	CG8219	99	58.174	Drosophila_melanogaster
ENSAPEG00000001112	tnpo1	86	95.506	ENSETEG00000017805	TNPO1	89	95.506	Echinops_telfairi
ENSAPEG00000001112	tnpo1	94	85.476	ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.476	Eptatretus_burgeri
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	93.933	ENSEASG00005018055	TNPO1	100	93.933	Equus_asinus_asinus
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	93.933	ENSECAG00000024424	TNPO1	99	93.933	Equus_caballus
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	89.216	ENSELUG00000002821	tnpo1	100	88.829	Esox_lucius
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	93.933	ENSFCAG00000013181	TNPO1	100	93.933	Felis_catus
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	94.270	ENSFALG00000010292	TNPO1	100	94.270	Ficedula_albicollis
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	93.596	ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	93.596	Fukomys_damarensis
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	98.092	ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	98.092	Fundulus_heteroclitus
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	93.281	ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	93.281	Gadus_morhua
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	93.483	ENSGALG00000015014	TNPO1	100	93.483	Gallus_gallus
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	97.646	ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	97.646	Gambusia_affinis
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	97.191	ENSGACG00000015841	tnpo1	99	97.191	Gasterosteus_aculeatus
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	94.270	ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	94.270	Gopherus_agassizii
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	78.587	ENSGGOG00000022535	-	98	78.587	Gorilla_gorilla
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	93.933	ENSGGOG00000026800	TNPO1	100	93.933	Gorilla_gorilla
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	98.652	ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	98.652	Haplochromis_burtoni
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	93.483	ENSHGLG00000000970	-	99	93.483	Heterocephalus_glaber_female
ENSAPEG00000001112	tnpo1	97	73.372	ENSHGLG00100000963	-	99	72.674	Heterocephalus_glaber_male
ENSAPEG00000001112	tnpo1	96	93.575	ENSHGLG00100017090	-	99	93.575	Heterocephalus_glaber_male
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	94.045	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	94.045	Jaculus_jaculus
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	97.753	ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	97.753	Kryptolebias_marmoratus
ENSAPEG00000001112	tnpo1	91	94.945	ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	94.945	Labrus_bergylta
ENSAPEG00000001112	tnpo1	96	87.442	ENSLACG00000012199	TNPO1	100	87.442	Latimeria_chalumnae
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	95.506	ENSLOCG00000011092	tnpo1	97	95.506	Lepisosteus_oculatus
ENSAPEG00000001112	tnpo1	97	93.303	ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	93.303	Loxodonta_africana
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	93.933	ENSMFAG00000003636	TNPO1	99	93.933	Macaca_fascicularis
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	93.820	ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	93.905	Macaca_mulatta
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	93.933	ENSMNEG00000044581	TNPO1	99	93.933	Macaca_nemestrina
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	93.933	ENSMLEG00000030740	TNPO1	99	93.933	Mandrillus_leucophaeus
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	99.101	ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	99.101	Mastacembelus_armatus
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	98.202	ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	98.202	Maylandia_zebra
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	93.820	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	93.820	Mesocricetus_auratus
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	90.225	ENSMICG00000008468	TNPO1	99	90.225	Microcebus_murinus
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	93.820	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	93.820	Microtus_ochrogaster
ENSAPEG00000001112	tnpo1	87	97.809	ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	97.809	Mola_mola
ENSAPEG00000001112	tnpo1	99	94.681	ENSMODG00000001721	TNPO1	80	94.681	Monodelphis_domestica
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	97.978	ENSMALG00000009782	tnpo1	100	97.978	Monopterus_albus
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	93.820	MGP_CAROLIEiJ_G0018826	Tnpo1	100	94.052	Mus_caroli
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	93.820	ENSMUSG00000009470	Tnpo1	100	94.052	Mus_musculus
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	93.933	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	94.176	Mus_pahari
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	93.596	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	100	93.820	Mus_spretus
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	93.933	ENSMPUG00000014387	TNPO1	99	93.933	Mustela_putorius_furo
ENSAPEG00000001112	tnpo1	96	93.597	ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	93.597	Myotis_lucifugus
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	93.933	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	93.933	Nannospalax_galili
ENSAPEG00000001112	tnpo1	87	98.450	ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	98.450	Neolamprologus_brichardi
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	93.933	ENSNLEG00000004572	TNPO1	100	93.933	Nomascus_leucogenys
ENSAPEG00000001112	tnpo1	90	88.753	ENSOPRG00000012390	TNPO1	89	88.730	Ochotona_princeps
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	93.258	ENSODEG00000001771	TNPO1	99	93.258	Octodon_degus
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	97.879	ENSONIG00000011151	tnpo1	99	97.879	Oreochromis_niloticus
ENSAPEG00000001112	tnpo1	92	94.634	ENSOANG00000015785	TNPO1	100	94.634	Ornithorhynchus_anatinus
ENSAPEG00000001112	tnpo1	96	87.850	ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	87.850	Oryctolagus_cuniculus
ENSAPEG00000001112	tnpo1	87	97.536	ENSORLG00000003182	tnpo1	99	97.536	Oryzias_latipes
ENSAPEG00000001112	tnpo1	99	97.745	ENSORLG00020011559	tnpo1	99	97.745	Oryzias_latipes_hni
ENSAPEG00000001112	tnpo1	99	98.083	ENSORLG00015019113	tnpo1	99	98.083	Oryzias_latipes_hsok
ENSAPEG00000001112	tnpo1	99	97.520	ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	97.520	Oryzias_melastigma
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	93.933	ENSOGAG00000000808	TNPO1	99	93.933	Otolemur_garnettii
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	94.045	ENSOARG00000005038	TNPO1	84	94.045	Ovis_aries
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	93.933	ENSPPAG00000042518	TNPO1	99	93.933	Pan_paniscus
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	93.933	ENSPPRG00000022336	TNPO1	100	93.933	Panthera_pardus
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	93.933	ENSPTIG00000018839	TNPO1	100	93.933	Panthera_tigris_altaica
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	93.933	ENSPTRG00000016972	TNPO1	99	93.933	Pan_troglodytes
ENSAPEG00000001112	tnpo1	94	82.597	ENSPTRG00000047731	-	100	82.597	Pan_troglodytes
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	93.933	ENSPANG00000006074	TNPO1	99	93.933	Papio_anubis
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	91.798	ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	91.798	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	94.494	ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	94.494	Pelodiscus_sinensis
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	94.725	ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	94.501	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSAPEG00000001112	tnpo1	96	94.035	ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	94.035	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	94.944	ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	94.944	Phascolarctos_cinereus
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	97.648	ENSPFOG00000011447	tnpo1	100	97.648	Poecilia_formosa
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	97.648	ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	97.648	Poecilia_latipinna
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	98.090	ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	98.090	Poecilia_mexicana
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	97.870	ENSPREG00000020705	tnpo1	100	97.870	Poecilia_reticulata
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	93.820	ENSPPYG00000015545	TNPO1	99	93.820	Pongo_abelii
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	93.933	ENSPCOG00000004254	TNPO1	99	93.933	Propithecus_coquereli
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	93.820	ENSPVAG00000013051	TNPO1	99	93.820	Pteropus_vampyrus
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	98.429	ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	98.429	Pundamilia_nyererei
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	94.058	ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	94.507	Pygocentrus_nattereri
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	93.820	ENSRNOG00000014999	Tnpo1	100	93.820	Rattus_norvegicus
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	93.933	ENSRBIG00000021642	TNPO1	100	93.933	Rhinopithecus_bieti
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	93.933	ENSRROG00000035271	TNPO1	99	93.933	Rhinopithecus_roxellana
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	93.596	ENSSBOG00000029256	TNPO1	100	93.596	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSAPEG00000001112	tnpo1	96	94.971	ENSSHAG00000007120	TNPO1	99	94.971	Sarcophilus_harrisii
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	96.857	ENSSFOG00015015448	tnpo1	100	96.857	Scleropages_formosus
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ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	93.933	ENSSSCG00000027293	TNPO1	100	93.933	Sus_scrofa
ENSAPEG00000001112	tnpo1	99	92.188	ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	92.188	Taeniopygia_guttata
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	97.191	ENSTRUG00000018491	tnpo1	100	97.191	Takifugu_rubripes
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ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	93.933	ENSVVUG00000007338	TNPO1	100	93.933	Vulpes_vulpes
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	92.360	ENSXETG00000016812	tnpo1	99	92.360	Xenopus_tropicalis
ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	97.868	ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	97.868	Xiphophorus_maculatus