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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSAPEG00000002315 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: rpp38
Alias: fc10d08|wu:fc10d08|zgc:92924
Full Name: ribonuclease P/MRP 38 subunit
Gene Type: protein_coding
Species: Amphiprion_percula
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 825 bases
Position: chr7:34408491-34409315
Accession: ZDB-GENE-040718-258
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAPEP00000003184	Ribosomal_L7Ae	PF01248.26	1.6e-10	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAPET00000003257	-	825	-	ENSAPEP00000003184	274 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAPEG00000002315	rpp38	96	45.683	ENSG00000152464	RPP38	99	46.386	Homo_sapiens
ENSAPEG00000002315	rpp38	95	88.346	ENSAPOG00000001240	rpp38	95	88.346	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAPEG00000002315	rpp38	96	43.116	ENSAMEG00000018832	RPP38	94	42.804	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAPEG00000002315	rpp38	95	72.263	ENSACIG00000011592	rpp38	97	72.993	Amphilophus_citrinellus
ENSAPEG00000002315	rpp38	100	92.440	ENSAOCG00000017293	rpp38	100	92.784	Amphiprion_ocellaris
ENSAPEG00000002315	rpp38	98	70.545	ENSATEG00000000731	rpp38	97	70.787	Anabas_testudineus
ENSAPEG00000002315	rpp38	90	44.841	ENSAPLG00000002054	RPP38	90	45.059	Anas_platyrhynchos
ENSAPEG00000002315	rpp38	95	71.321	ENSACLG00000016962	rpp38	96	72.015	Astatotilapia_calliptera
ENSAPEG00000002315	rpp38	95	71.161	ENSACLG00000016958	rpp38	96	72.015	Astatotilapia_calliptera
ENSAPEG00000002315	rpp38	95	44.906	ENSAMXG00000025023	rpp38	93	44.906	Astyanax_mexicanus
ENSAPEG00000002315	rpp38	96	42.391	ENSBTAG00000007702	RPP38	94	42.754	Bos_taurus
ENSAPEG00000002315	rpp38	96	44.203	ENSCAFG00000024373	RPP38	94	43.750	Canis_familiaris
ENSAPEG00000002315	rpp38	96	44.203	ENSCAFG00020008008	RPP38	94	43.750	Canis_lupus_dingo
ENSAPEG00000002315	rpp38	96	42.029	ENSCHIG00000012484	RPP38	94	42.391	Capra_hircus
ENSAPEG00000002315	rpp38	97	45.126	ENSCPOG00000003981	RPP38	93	44.853	Cavia_porcellus
ENSAPEG00000002315	rpp38	96	43.617	ENSCLAG00000010194	RPP38	94	43.321	Chinchilla_lanigera
ENSAPEG00000002315	rpp38	93	45.353	ENSCSAG00000019055	RPP38	94	45.221	Chlorocebus_sabaeus
ENSAPEG00000002315	rpp38	96	46.403	ENSCHOG00000004335	RPP38	94	46.154	Choloepus_hoffmanni
ENSAPEG00000002315	rpp38	96	42.857	ENSCGRG00001001395	Rpp38	94	43.478	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAPEG00000002315	rpp38	96	42.857	ENSCGRG00000017441	Rpp38	94	43.478	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAPEG00000002315	rpp38	95	60.526	ENSCSEG00000001721	rpp38	96	60.526	Cynoglossus_semilaevis
ENSAPEG00000002315	rpp38	95	61.029	ENSCVAG00000001676	rpp38	95	60.870	Cyprinodon_variegatus
ENSAPEG00000002315	rpp38	96	49.819	ENSDARG00000040350	rpp38	95	49.635	Danio_rerio
ENSAPEG00000002315	rpp38	96	43.841	ENSDNOG00000040314	RPP38	94	43.416	Dasypus_novemcinctus
ENSAPEG00000002315	rpp38	96	44.776	ENSDORG00000009783	Rpp38	93	44.487	Dipodomys_ordii
ENSAPEG00000002315	rpp38	96	43.956	ENSETEG00000002839	RPP38	94	43.657	Echinops_telfairi
ENSAPEG00000002315	rpp38	96	44.891	ENSEASG00005019783	RPP38	93	44.610	Equus_asinus_asinus
ENSAPEG00000002315	rpp38	99	41.115	ENSEEUG00000014677	RPP38	92	41.912	Erinaceus_europaeus
ENSAPEG00000002315	rpp38	95	52.921	ENSELUG00000010160	rpp38	96	52.921	Esox_lucius
ENSAPEG00000002315	rpp38	96	45.091	ENSFCAG00000022449	RPP38	94	44.928	Felis_catus
ENSAPEG00000002315	rpp38	90	44.531	ENSFALG00000014804	RPP38	88	44.747	Ficedula_albicollis
ENSAPEG00000002315	rpp38	96	43.571	ENSFDAG00000018669	RPP38	94	43.273	Fukomys_damarensis
ENSAPEG00000002315	rpp38	95	64.855	ENSFHEG00000013741	rpp38	96	65.704	Fundulus_heteroclitus
ENSAPEG00000002315	rpp38	90	46.304	ENSGALG00000008794	RPP38	86	46.304	Gallus_gallus
ENSAPEG00000002315	rpp38	58	76.730	ENSGACG00000009258	rpp38	99	76.730	Gasterosteus_aculeatus
ENSAPEG00000002315	rpp38	95	71.161	ENSHBUG00000010937	rpp38	96	72.015	Haplochromis_burtoni
ENSAPEG00000002315	rpp38	96	45.290	ENSHGLG00000012144	RPP38	94	45.018	Heterocephalus_glaber_female
ENSAPEG00000002315	rpp38	95	47.710	ENSIPUG00000022879	rpp38	95	47.710	Ictalurus_punctatus
ENSAPEG00000002315	rpp38	96	44.565	ENSSTOG00000025699	RPP38	92	45.018	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAPEG00000002315	rpp38	96	44.912	ENSJJAG00000007523	Rpp38	94	44.484	Jaculus_jaculus
ENSAPEG00000002315	rpp38	96	65.328	ENSKMAG00000003986	rpp38	90	64.751	Kryptolebias_marmoratus
ENSAPEG00000002315	rpp38	98	68.683	ENSLBEG00000006853	rpp38	96	68.750	Labrus_bergylta
ENSAPEG00000002315	rpp38	95	40.138	ENSLACG00000006502	RPP38	95	40.138	Latimeria_chalumnae
ENSAPEG00000002315	rpp38	100	45.424	ENSLOCG00000018347	rpp38	93	46.429	Lepisosteus_oculatus
ENSAPEG00000002315	rpp38	91	46.693	ENSLAFG00000000509	RPP38	88	46.429	Loxodonta_africana
ENSAPEG00000002315	rpp38	93	44.610	ENSMMUG00000007679	RPP38	94	44.853	Macaca_mulatta
ENSAPEG00000002315	rpp38	97	71.956	ENSMAMG00000012774	rpp38	95	72.180	Mastacembelus_armatus
ENSAPEG00000002315	rpp38	95	71.910	ENSMZEG00005003189	rpp38	96	72.761	Maylandia_zebra
ENSAPEG00000002315	rpp38	95	71.161	ENSMZEG00005003200	rpp38	96	72.015	Maylandia_zebra
ENSAPEG00000002315	rpp38	90	47.451	ENSMGAG00000008217	RPP38	86	47.451	Meleagris_gallopavo
ENSAPEG00000002315	rpp38	96	43.262	ENSMAUG00000003644	Rpp38	94	43.321	Mesocricetus_auratus
ENSAPEG00000002315	rpp38	96	42.199	ENSMOCG00000007020	Rpp38	94	41.877	Microtus_ochrogaster
ENSAPEG00000002315	rpp38	97	64.576	ENSMMOG00000003446	rpp38	96	65.799	Mola_mola
ENSAPEG00000002315	rpp38	95	47.744	ENSMODG00000024091	RPP38	94	47.744	Monodelphis_domestica
ENSAPEG00000002315	rpp38	97	66.667	ENSMALG00000002356	rpp38	96	66.308	Monopterus_albus
ENSAPEG00000002315	rpp38	96	45.487	MGP_CAROLIEiJ_G0023133	Rpp38	94	45.788	Mus_caroli
ENSAPEG00000002315	rpp38	96	45.126	ENSMUSG00000049950	Rpp38	94	45.421	Mus_musculus
ENSAPEG00000002315	rpp38	99	46.975	MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	94	46.667	Mus_pahari
ENSAPEG00000002315	rpp38	96	45.421	MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	94	44.981	Mus_spretus
ENSAPEG00000002315	rpp38	96	44.203	ENSMPUG00000018523	RPP38	94	43.911	Mustela_putorius_furo
ENSAPEG00000002315	rpp38	93	43.071	ENSMLUG00000002153	RPP38	94	43.704	Myotis_lucifugus
ENSAPEG00000002315	rpp38	96	43.158	ENSNGAG00000011066	Rpp38	94	43.214	Nannospalax_galili
ENSAPEG00000002315	rpp38	95	72.015	ENSNBRG00000006994	rpp38	97	72.761	Neolamprologus_brichardi
ENSAPEG00000002315	rpp38	95	72.180	ENSONIG00000020467	rpp38	95	72.556	Oreochromis_niloticus
ENSAPEG00000002315	rpp38	94	42.545	ENSOCUG00000024367	-	94	43.750	Oryctolagus_cuniculus
ENSAPEG00000002315	rpp38	94	43.704	ENSOCUG00000022768	-	94	44.118	Oryctolagus_cuniculus
ENSAPEG00000002315	rpp38	95	64.552	ENSORLG00000009219	rpp38	95	64.835	Oryzias_latipes
ENSAPEG00000002315	rpp38	95	64.684	ENSORLG00020011503	rpp38	92	65.328	Oryzias_latipes_hni
ENSAPEG00000002315	rpp38	95	65.056	ENSORLG00015017702	rpp38	92	65.683	Oryzias_latipes_hsok
ENSAPEG00000002315	rpp38	89	64.683	ENSOMEG00000005414	rpp38	95	64.130	Oryzias_melastigma
ENSAPEG00000002315	rpp38	97	45.683	ENSOGAG00000008059	RPP38	95	45.255	Otolemur_garnettii
ENSAPEG00000002315	rpp38	96	42.391	ENSOARG00000004534	RPP38	94	42.754	Ovis_aries
ENSAPEG00000002315	rpp38	96	46.403	ENSPPAG00000041577	RPP38	86	46.154	Pan_paniscus
ENSAPEG00000002315	rpp38	96	44.727	ENSPPRG00000015329	RPP38	94	45.221	Panthera_pardus
ENSAPEG00000002315	rpp38	96	44.364	ENSPTIG00000007188	RPP38	94	44.853	Panthera_tigris_altaica
ENSAPEG00000002315	rpp38	96	46.403	ENSPTRG00000002318	RPP38	86	46.154	Pan_troglodytes
ENSAPEG00000002315	rpp38	93	47.955	ENSPKIG00000025652	rpp38	93	47.810	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAPEG00000002315	rpp38	92	43.774	ENSPSIG00000001527	RPP38	90	43.462	Pelodiscus_sinensis
ENSAPEG00000002315	rpp38	96	43.972	ENSPEMG00000008375	Rpp38	94	45.255	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAPEG00000002315	rpp38	96	48.708	ENSPCIG00000009096	RPP38	89	48.315	Phascolarctos_cinereus
ENSAPEG00000002315	rpp38	76	62.326	ENSPFOG00000016823	rpp38	95	61.765	Poecilia_formosa
ENSAPEG00000002315	rpp38	99	61.484	ENSPLAG00000007626	rpp38	96	61.397	Poecilia_latipinna
ENSAPEG00000002315	rpp38	95	55.970	ENSPMEG00000020392	rpp38	96	56.343	Poecilia_mexicana
ENSAPEG00000002315	rpp38	93	64.286	ENSPREG00000017744	rpp38	92	64.314	Poecilia_reticulata
ENSAPEG00000002315	rpp38	96	45.683	ENSPPYG00000002113	RPP38	94	45.255	Pongo_abelii
ENSAPEG00000002315	rpp38	93	43.284	ENSPVAG00000007155	RPP38	94	43.542	Pteropus_vampyrus
ENSAPEG00000002315	rpp38	95	71.536	ENSPNYG00000004293	rpp38	96	72.388	Pundamilia_nyererei
ENSAPEG00000002315	rpp38	89	46.964	ENSPNAG00000010633	rpp38	94	46.768	Pygocentrus_nattereri
ENSAPEG00000002315	rpp38	96	46.619	ENSRNOG00000038025	Rpp38	94	46.209	Rattus_norvegicus
ENSAPEG00000002315	rpp38	96	47.601	ENSSHAG00000015529	RPP38	94	47.744	Sarcophilus_harrisii
ENSAPEG00000002315	rpp38	95	68.321	ENSSMAG00000018276	rpp38	91	68.504	Scophthalmus_maximus
ENSAPEG00000002315	rpp38	95	68.657	ENSSDUG00000001651	rpp38	96	70.522	Seriola_dumerili
ENSAPEG00000002315	rpp38	95	70.370	ENSSLDG00000014355	rpp38	96	71.269	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSAPEG00000002315	rpp38	99	38.849	ENSSARG00000012099	RPP38	93	38.491	Sorex_araneus
ENSAPEG00000002315	rpp38	92	42.966	ENSSPUG00000008560	-	90	42.636	Sphenodon_punctatus
ENSAPEG00000002315	rpp38	97	44.803	ENSSPUG00000018363	-	95	44.526	Sphenodon_punctatus
ENSAPEG00000002315	rpp38	95	45.956	ENSSPUG00000005237	-	89	45.736	Sphenodon_punctatus
ENSAPEG00000002315	rpp38	95	76.981	ENSSPAG00000020387	rpp38	95	76.981	Stegastes_partitus
ENSAPEG00000002315	rpp38	99	42.517	ENSSSCG00000027110	RPP38	94	42.349	Sus_scrofa
ENSAPEG00000002315	rpp38	90	44.314	ENSTGUG00000001366	RPP38	90	44.531	Taeniopygia_guttata
ENSAPEG00000002315	rpp38	98	62.230	ENSTNIG00000001334	rpp38	97	62.963	Tetraodon_nigroviridis
ENSAPEG00000002315	rpp38	96	43.750	ENSTTRG00000004420	RPP38	94	43.463	Tursiops_truncatus
ENSAPEG00000002315	rpp38	96	43.841	ENSUAMG00000002618	RPP38	94	43.542	Ursus_americanus
ENSAPEG00000002315	rpp38	96	42.806	ENSUMAG00000012382	RPP38	94	43.956	Ursus_maritimus
ENSAPEG00000002315	rpp38	96	44.203	ENSVVUG00000005272	RPP38	94	43.911	Vulpes_vulpes
ENSAPEG00000002315	rpp38	88	40.945	ENSXETG00000003419	rpp38	89	40.945	Xenopus_tropicalis