EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAPEG00000018858 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: syf2
Alias: hm:zeh0031|zeh0031|zgc:113871|zgc:92835
Full Name: SYF2 pre-mRNA-splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Amphiprion_percula
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 11609 bases
Position: chr18:31625010-31636618
Accession: ZDB-GENE-040801-170
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAPEP00000026563	SYF2	PF08231.12	7.5e-55	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAPET00000027273	-	5860	-	ENSAPEP00000026563	259 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSAPEG00000018858's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSAPEG00000018858's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAPEG00000018858	syf2	83	85.185	ENSG00000117614	SYF2	95	80.932	Homo_sapiens
ENSAPEG00000018858	syf2	92	99.160	ENSAPOG00000001174	syf2	100	99.160	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAPEG00000018858	syf2	94	77.459	ENSAMEG00000010115	-	98	77.459	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAPEG00000018858	syf2	75	85.128	ENSAMEG00000010134	-	100	85.128	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAPEG00000018858	syf2	91	91.064	ENSACIG00000023688	syf2	94	91.064	Amphilophus_citrinellus
ENSAPEG00000018858	syf2	100	99.614	ENSAOCG00000022046	syf2	100	99.614	Amphiprion_ocellaris
ENSAPEG00000018858	syf2	85	100.000	ENSAOCG00000010912	syf2	69	100.000	Amphiprion_ocellaris
ENSAPEG00000018858	syf2	92	93.697	ENSATEG00000007745	syf2	100	93.697	Anabas_testudineus
ENSAPEG00000018858	syf2	77	85.000	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	85.000	Anas_platyrhynchos
ENSAPEG00000018858	syf2	64	71.257	ENSACAG00000026777	-	100	71.257	Anolis_carolinensis
ENSAPEG00000018858	syf2	79	84.804	ENSACAG00000013653	-	100	84.804	Anolis_carolinensis
ENSAPEG00000018858	syf2	83	85.648	ENSANAG00000032473	SYF2	99	80.417	Aotus_nancymaae
ENSAPEG00000018858	syf2	92	90.756	ENSACLG00000019916	syf2	100	90.756	Astatotilapia_calliptera
ENSAPEG00000018858	syf2	92	86.975	ENSAMXG00000004051	syf2	100	86.975	Astyanax_mexicanus
ENSAPEG00000018858	syf2	88	82.684	ENSBTAG00000001651	SYF2	98	82.684	Bos_taurus
ENSAPEG00000018858	syf2	80	52.857	WBGene00019402	syf-2	90	52.133	Caenorhabditis_elegans
ENSAPEG00000018858	syf2	83	85.648	ENSCJAG00000046570	SYF2	95	81.356	Callithrix_jacchus
ENSAPEG00000018858	syf2	83	84.259	ENSCAFG00000012895	-	99	76.613	Canis_familiaris
ENSAPEG00000018858	syf2	83	79.630	ENSCAFG00000030331	-	93	78.899	Canis_familiaris
ENSAPEG00000018858	syf2	70	76.923	ENSCAFG00020021094	-	95	76.923	Canis_lupus_dingo
ENSAPEG00000018858	syf2	83	84.259	ENSCAFG00020021091	-	99	76.613	Canis_lupus_dingo
ENSAPEG00000018858	syf2	92	80.000	ENSCHIG00000020874	SYF2	99	80.000	Capra_hircus
ENSAPEG00000018858	syf2	92	80.417	ENSTSYG00000005114	SYF2	99	80.417	Carlito_syrichta
ENSAPEG00000018858	syf2	76	84.343	ENSCAPG00000010006	SYF2	100	84.343	Cavia_aperea
ENSAPEG00000018858	syf2	93	80.083	ENSCPOG00000005326	SYF2	97	80.083	Cavia_porcellus
ENSAPEG00000018858	syf2	83	85.648	ENSCCAG00000022459	SYF2	99	80.417	Cebus_capucinus
ENSAPEG00000018858	syf2	91	80.508	ENSCATG00000026917	SYF2	95	80.508	Cercocebus_atys
ENSAPEG00000018858	syf2	94	80.328	ENSCLAG00000008474	SYF2	96	80.328	Chinchilla_lanigera
ENSAPEG00000018858	syf2	91	80.508	ENSCSAG00000000948	SYF2	95	80.508	Chlorocebus_sabaeus
ENSAPEG00000018858	syf2	66	66.092	ENSCHOG00000005273	-	98	64.972	Choloepus_hoffmanni
ENSAPEG00000018858	syf2	86	85.333	ENSCPBG00000025073	SYF2	97	80.738	Chrysemys_picta_bellii
ENSAPEG00000018858	syf2	81	54.930	ENSCING00000003017	-	89	55.399	Ciona_intestinalis
ENSAPEG00000018858	syf2	81	51.174	ENSCSAVG00000006627	-	97	51.174	Ciona_savignyi
ENSAPEG00000018858	syf2	91	70.763	ENSCANG00000037322	SYF2	94	70.763	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAPEG00000018858	syf2	92	80.992	ENSCGRG00001020733	Syf2	100	80.992	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAPEG00000018858	syf2	76	85.714	ENSCGRG00000005095	Syf2	96	85.859	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAPEG00000018858	syf2	84	88.991	ENSCSEG00000000117	syf2	99	86.076	Cynoglossus_semilaevis
ENSAPEG00000018858	syf2	92	90.377	ENSCVAG00000019543	syf2	100	90.377	Cyprinodon_variegatus
ENSAPEG00000018858	syf2	92	85.714	ENSDARG00000004706	syf2	100	85.714	Danio_rerio
ENSAPEG00000018858	syf2	96	77.419	ENSDNOG00000047605	SYF2	99	77.419	Dasypus_novemcinctus
ENSAPEG00000018858	syf2	92	80.738	ENSDORG00000001274	Syf2	100	80.738	Dipodomys_ordii
ENSAPEG00000018858	syf2	84	55.909	FBgn0033556	CG12343	97	55.909	Drosophila_melanogaster
ENSAPEG00000018858	syf2	80	70.531	ENSETEG00000015729	SYF2	100	67.249	Echinops_telfairi
ENSAPEG00000018858	syf2	76	59.898	ENSEBUG00000015402	syf2	95	59.898	Eptatretus_burgeri
ENSAPEG00000018858	syf2	92	80.000	ENSEASG00005004224	-	100	80.000	Equus_asinus_asinus
ENSAPEG00000018858	syf2	92	71.667	ENSEASG00005004232	-	99	71.667	Equus_asinus_asinus
ENSAPEG00000018858	syf2	95	78.543	ENSECAG00000010440	-	97	83.117	Equus_caballus
ENSAPEG00000018858	syf2	88	83.117	ENSECAG00000012023	-	94	83.117	Equus_caballus
ENSAPEG00000018858	syf2	65	71.930	ENSEEUG00000015084	SYF2	93	71.930	Erinaceus_europaeus
ENSAPEG00000018858	syf2	92	87.815	ENSELUG00000003465	syf2	99	87.815	Esox_lucius
ENSAPEG00000018858	syf2	92	80.913	ENSFCAG00000010324	-	81	80.913	Felis_catus
ENSAPEG00000018858	syf2	96	77.016	ENSFCAG00000043095	-	99	77.016	Felis_catus
ENSAPEG00000018858	syf2	79	81.863	ENSFALG00000000460	SYF2	100	73.984	Ficedula_albicollis
ENSAPEG00000018858	syf2	94	78.279	ENSFDAG00000008310	SYF2	96	78.279	Fukomys_damarensis
ENSAPEG00000018858	syf2	87	76.991	ENSFHEG00000007238	syf2	100	76.991	Fundulus_heteroclitus
ENSAPEG00000018858	syf2	83	92.093	ENSGMOG00000019138	syf2	96	92.093	Gadus_morhua
ENSAPEG00000018858	syf2	86	83.784	ENSGALG00000013639	SYF2	97	76.735	Gallus_gallus
ENSAPEG00000018858	syf2	92	89.076	ENSGAFG00000019435	syf2	100	89.076	Gambusia_affinis
ENSAPEG00000018858	syf2	86	90.090	ENSGACG00000007305	syf2	100	88.703	Gasterosteus_aculeatus
ENSAPEG00000018858	syf2	86	85.778	ENSGAGG00000010670	SYF2	98	80.645	Gopherus_agassizii
ENSAPEG00000018858	syf2	83	85.185	ENSGGOG00000012796	SYF2	95	80.932	Gorilla_gorilla
ENSAPEG00000018858	syf2	92	90.336	ENSHBUG00000020477	syf2	100	90.336	Haplochromis_burtoni
ENSAPEG00000018858	syf2	86	84.234	ENSHGLG00000014393	SYF2	91	84.234	Heterocephalus_glaber_female
ENSAPEG00000018858	syf2	86	72.523	ENSHGLG00000004304	-	93	72.973	Heterocephalus_glaber_female
ENSAPEG00000018858	syf2	86	84.234	ENSHGLG00100014722	SYF2	91	84.234	Heterocephalus_glaber_male
ENSAPEG00000018858	syf2	95	86.235	ENSHCOG00000012904	syf2	81	86.235	Hippocampus_comes
ENSAPEG00000018858	syf2	92	86.611	ENSIPUG00000019859	syf2	100	86.611	Ictalurus_punctatus
ENSAPEG00000018858	syf2	56	80.137	ENSSTOG00000023984	SYF2	100	80.137	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAPEG00000018858	syf2	77	85.427	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	85.427	Jaculus_jaculus
ENSAPEG00000018858	syf2	92	91.176	ENSKMAG00000013856	syf2	100	91.176	Kryptolebias_marmoratus
ENSAPEG00000018858	syf2	92	92.857	ENSLBEG00000014425	syf2	100	92.857	Labrus_bergylta
ENSAPEG00000018858	syf2	89	80.087	ENSLACG00000012064	SYF2	97	80.087	Latimeria_chalumnae
ENSAPEG00000018858	syf2	92	85.714	ENSLOCG00000002728	syf2	95	85.714	Lepisosteus_oculatus
ENSAPEG00000018858	syf2	88	83.550	ENSLAFG00000023150	-	94	83.550	Loxodonta_africana
ENSAPEG00000018858	syf2	71	56.522	ENSLAFG00000030814	-	100	56.522	Loxodonta_africana
ENSAPEG00000018858	syf2	91	80.508	ENSMFAG00000041831	SYF2	95	80.508	Macaca_fascicularis
ENSAPEG00000018858	syf2	83	84.259	ENSMMUG00000002968	SYF2	95	80.085	Macaca_mulatta
ENSAPEG00000018858	syf2	91	80.508	ENSMNEG00000030180	SYF2	95	80.508	Macaca_nemestrina
ENSAPEG00000018858	syf2	91	80.508	ENSMLEG00000030248	SYF2	95	80.508	Mandrillus_leucophaeus
ENSAPEG00000018858	syf2	93	92.083	ENSMAMG00000010403	syf2	98	92.083	Mastacembelus_armatus
ENSAPEG00000018858	syf2	92	90.336	ENSMZEG00005006429	syf2	100	90.336	Maylandia_zebra
ENSAPEG00000018858	syf2	77	84.925	ENSMGAG00000002019	SYF2	100	84.925	Meleagris_gallopavo
ENSAPEG00000018858	syf2	92	80.992	ENSMAUG00000018974	Syf2	100	80.992	Mesocricetus_auratus
ENSAPEG00000018858	syf2	77	85.427	ENSMICG00000016191	SYF2	100	85.427	Microcebus_murinus
ENSAPEG00000018858	syf2	92	81.405	ENSMOCG00000022938	Syf2	100	81.405	Microtus_ochrogaster
ENSAPEG00000018858	syf2	89	89.610	ENSMMOG00000002396	syf2	97	89.610	Mola_mola
ENSAPEG00000018858	syf2	86	80.804	ENSMODG00000013951	-	98	80.804	Monodelphis_domestica
ENSAPEG00000018858	syf2	92	91.286	ENSMALG00000010706	syf2	100	91.701	Monopterus_albus
ENSAPEG00000018858	syf2	92	81.818	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	100	81.818	Mus_caroli
ENSAPEG00000018858	syf2	92	81.818	ENSMUSG00000028821	Syf2	100	81.818	Mus_musculus
ENSAPEG00000018858	syf2	92	81.818	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	100	81.818	Mus_pahari
ENSAPEG00000018858	syf2	92	81.818	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	100	81.818	Mus_spretus
ENSAPEG00000018858	syf2	83	84.259	ENSMPUG00000015802	-	89	84.018	Mustela_putorius_furo
ENSAPEG00000018858	syf2	85	84.932	ENSMPUG00000015801	-	89	84.932	Mustela_putorius_furo
ENSAPEG00000018858	syf2	87	82.096	ENSMLUG00000001885	SYF2	94	82.096	Myotis_lucifugus
ENSAPEG00000018858	syf2	92	78.455	ENSNGAG00000007912	Syf2	100	78.455	Nannospalax_galili
ENSAPEG00000018858	syf2	92	81.070	ENSNBRG00000010720	syf2	100	81.070	Neolamprologus_brichardi
ENSAPEG00000018858	syf2	83	85.185	ENSNLEG00000035185	SYF2	95	80.932	Nomascus_leucogenys
ENSAPEG00000018858	syf2	92	79.424	ENSOPRG00000012870	SYF2	100	79.424	Ochotona_princeps
ENSAPEG00000018858	syf2	94	70.082	ENSODEG00000014338	-	98	70.082	Octodon_degus
ENSAPEG00000018858	syf2	93	78.099	ENSODEG00000017664	-	99	78.099	Octodon_degus
ENSAPEG00000018858	syf2	92	91.176	ENSONIG00000008213	syf2	100	91.176	Oreochromis_niloticus
ENSAPEG00000018858	syf2	78	85.149	ENSOANG00000009552	SYF2	100	85.149	Ornithorhynchus_anatinus
ENSAPEG00000018858	syf2	83	85.648	ENSOCUG00000013050	SYF2	95	81.780	Oryctolagus_cuniculus
ENSAPEG00000018858	syf2	90	89.270	ENSORLG00000028820	syf2	100	89.270	Oryzias_latipes
ENSAPEG00000018858	syf2	92	88.655	ENSORLG00020018333	syf2	100	88.655	Oryzias_latipes_hni
ENSAPEG00000018858	syf2	92	88.655	ENSORLG00015014665	syf2	100	88.655	Oryzias_latipes_hsok
ENSAPEG00000018858	syf2	92	90.336	ENSOMEG00000013911	syf2	100	90.336	Oryzias_melastigma
ENSAPEG00000018858	syf2	91	82.627	ENSOGAG00000009962	SYF2	95	82.627	Otolemur_garnettii
ENSAPEG00000018858	syf2	75	57.436	ENSOARG00000006269	-	100	57.436	Ovis_aries
ENSAPEG00000018858	syf2	88	81.545	ENSOARG00000006348	-	94	81.545	Ovis_aries
ENSAPEG00000018858	syf2	83	85.185	ENSPPAG00000036579	SYF2	95	80.932	Pan_paniscus
ENSAPEG00000018858	syf2	96	77.016	ENSPPRG00000001651	-	99	77.016	Panthera_pardus
ENSAPEG00000018858	syf2	95	78.313	ENSPPRG00000001638	-	99	78.313	Panthera_pardus
ENSAPEG00000018858	syf2	83	86.111	ENSPTIG00000005711	-	80	85.780	Panthera_tigris_altaica
ENSAPEG00000018858	syf2	96	77.016	ENSPTIG00000007036	-	99	77.016	Panthera_tigris_altaica
ENSAPEG00000018858	syf2	83	85.185	ENSPTRG00000000352	SYF2	95	80.932	Pan_troglodytes
ENSAPEG00000018858	syf2	91	80.508	ENSPANG00000008139	SYF2	95	80.508	Papio_anubis
ENSAPEG00000018858	syf2	92	86.134	ENSPKIG00000008130	syf2	100	86.134	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAPEG00000018858	syf2	89	81.277	ENSPSIG00000011816	SYF2	91	81.277	Pelodiscus_sinensis
ENSAPEG00000018858	syf2	93	83.200	ENSPMGG00000008755	syf2	98	83.200	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSAPEG00000018858	syf2	92	80.992	ENSPEMG00000008283	Syf2	100	80.992	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAPEG00000018858	syf2	86	84.234	ENSPCIG00000014235	SYF2	89	84.234	Phascolarctos_cinereus
ENSAPEG00000018858	syf2	93	86.777	ENSPFOG00000004116	syf2	100	86.777	Poecilia_formosa
ENSAPEG00000018858	syf2	90	89.270	ENSPLAG00000006691	syf2	100	89.270	Poecilia_latipinna
ENSAPEG00000018858	syf2	92	86.555	ENSPMEG00000011684	syf2	100	86.555	Poecilia_mexicana
ENSAPEG00000018858	syf2	92	89.076	ENSPREG00000003009	syf2	100	89.076	Poecilia_reticulata
ENSAPEG00000018858	syf2	91	80.932	ENSPPYG00000001713	SYF2	95	80.932	Pongo_abelii
ENSAPEG00000018858	syf2	92	55.967	ENSPCOG00000027011	SYF2	100	55.967	Propithecus_coquereli
ENSAPEG00000018858	syf2	95	69.388	ENSPVAG00000005841	SYF2	98	69.388	Pteropus_vampyrus
ENSAPEG00000018858	syf2	92	90.336	ENSPNYG00000004979	syf2	100	90.336	Pundamilia_nyererei
ENSAPEG00000018858	syf2	92	86.975	ENSPNAG00000015570	syf2	100	86.975	Pygocentrus_nattereri
ENSAPEG00000018858	syf2	92	81.818	ENSRNOG00000060597	Syf2	100	81.818	Rattus_norvegicus
ENSAPEG00000018858	syf2	91	78.390	ENSRBIG00000042970	SYF2	95	78.390	Rhinopithecus_bieti
ENSAPEG00000018858	syf2	91	80.508	ENSRROG00000001347	SYF2	95	80.508	Rhinopithecus_roxellana
ENSAPEG00000018858	syf2	83	85.185	ENSSBOG00000020184	SYF2	97	80.000	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSAPEG00000018858	syf2	79	84.951	ENSSHAG00000007152	-	100	84.951	Sarcophilus_harrisii
ENSAPEG00000018858	syf2	86	83.784	ENSSHAG00000015630	-	89	83.784	Sarcophilus_harrisii
ENSAPEG00000018858	syf2	92	84.454	ENSSFOG00015023647	syf2	100	84.454	Scleropages_formosus
ENSAPEG00000018858	syf2	92	89.916	ENSSMAG00000009867	syf2	100	89.916	Scophthalmus_maximus
ENSAPEG00000018858	syf2	92	92.017	ENSSDUG00000013072	syf2	100	92.017	Seriola_dumerili
ENSAPEG00000018858	syf2	92	92.017	ENSSLDG00000012677	syf2	100	92.017	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSAPEG00000018858	syf2	92	62.656	ENSSARG00000012889	SYF2	99	62.656	Sorex_araneus
ENSAPEG00000018858	syf2	93	80.833	ENSSPUG00000005251	SYF2	93	80.833	Sphenodon_punctatus
ENSAPEG00000018858	syf2	92	94.958	ENSSPAG00000009626	syf2	100	94.958	Stegastes_partitus
ENSAPEG00000018858	syf2	88	82.251	ENSSSCG00000037481	SYF2	94	82.251	Sus_scrofa
ENSAPEG00000018858	syf2	58	54.967	ENSTGUG00000001126	SYF2	86	54.857	Taeniopygia_guttata
ENSAPEG00000018858	syf2	92	85.833	ENSTRUG00000001499	syf2	96	84.937	Takifugu_rubripes
ENSAPEG00000018858	syf2	86	87.387	ENSTNIG00000016912	syf2	99	87.387	Tetraodon_nigroviridis
ENSAPEG00000018858	syf2	92	59.671	ENSTBEG00000017370	SYF2	99	59.671	Tupaia_belangeri
ENSAPEG00000018858	syf2	92	78.838	ENSTTRG00000003550	SYF2	99	79.668	Tursiops_truncatus
ENSAPEG00000018858	syf2	86	83.408	ENSUAMG00000002897	SYF2	90	83.408	Ursus_americanus
ENSAPEG00000018858	syf2	83	83.796	ENSUMAG00000013108	SYF2	90	82.960	Ursus_maritimus
ENSAPEG00000018858	syf2	92	79.668	ENSVPAG00000005705	SYF2	99	79.668	Vicugna_pacos
ENSAPEG00000018858	syf2	83	84.259	ENSVVUG00000027175	-	99	76.613	Vulpes_vulpes
ENSAPEG00000018858	syf2	79	84.390	ENSVVUG00000027181	-	100	77.823	Vulpes_vulpes
ENSAPEG00000018858	syf2	97	75.000	ENSXETG00000022797	syf2	99	75.000	Xenopus_tropicalis
ENSAPEG00000018858	syf2	92	88.655	ENSXMAG00000022698	syf2	100	88.655	Xiphophorus_maculatus