EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAPEG00000022286 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: srpra
Alias: id:ibd1064|srpr|wu:fd12f02
Full Name: SRP receptor subunit alpha
Gene Type: protein_coding
Species: Amphiprion_percula
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 6182 bases
Position: chr9:15230422-15236603
Accession: ZDB-GENE-030219-11
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAPEP00000031412	SRP54	PF00448.22	4e-48	1	1
ENSAPEP00000031400	SRP54	PF00448.22	6.1e-48	1	1
ENSAPEP00000031412	SRP54_N	PF02881.19	4.7e-10	1	1
ENSAPEP00000031400	SRP54_N	PF02881.19	6e-10	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAPET00000032244	-	1773	-	ENSAPEP00000031412	590 (aa)	-	-
ENSAPET00000032232	-	2234	-	ENSAPEP00000031400	705 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSAPEG00000022286's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSAPEG00000022286's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAPEG00000022286	srpra	100	67.239	ENSG00000182934	SRPRA	100	67.884	Homo_sapiens
ENSAPEG00000022286	srpra	92	99.231	ENSAPOG00000017588	srpra	100	99.231	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAPEG00000022286	srpra	100	67.031	ENSAMEG00000000117	SRPRA	100	67.125	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAPEG00000022286	srpra	92	87.692	ENSACIG00000021588	srpra	100	88.923	Amphilophus_citrinellus
ENSAPEG00000022286	srpra	100	99.661	ENSAOCG00000018884	srpra	100	99.846	Amphiprion_ocellaris
ENSAPEG00000022286	srpra	92	91.104	ENSATEG00000023578	srpra	95	96.657	Anabas_testudineus
ENSAPEG00000022286	srpra	93	66.126	ENSAPLG00000016079	SRPRA	99	70.436	Anas_platyrhynchos
ENSAPEG00000022286	srpra	92	73.735	ENSACAG00000000108	SRPRA	100	70.865	Anolis_carolinensis
ENSAPEG00000022286	srpra	100	66.562	ENSANAG00000020346	SRPRA	100	67.634	Aotus_nancymaae
ENSAPEG00000022286	srpra	92	90.308	ENSACLG00000000518	srpra	100	90.154	Astatotilapia_calliptera
ENSAPEG00000022286	srpra	100	75.410	ENSAMXG00000009975	srpra	100	74.262	Astyanax_mexicanus
ENSAPEG00000022286	srpra	100	64.472	ENSBTAG00000014105	SRPRA	100	67.939	Bos_taurus
ENSAPEG00000022286	srpra	99	48.341	WBGene00009521	F38A1.8	99	48.024	Caenorhabditis_elegans
ENSAPEG00000022286	srpra	100	65.728	ENSCJAG00000008752	SRPRA	100	67.381	Callithrix_jacchus
ENSAPEG00000022286	srpra	100	62.730	ENSCAFG00000010474	SRPRA	100	66.107	Canis_familiaris
ENSAPEG00000022286	srpra	100	64.417	ENSCAFG00020010608	SRPRA	100	67.786	Canis_lupus_dingo
ENSAPEG00000022286	srpra	100	67.239	ENSCHIG00000012423	SRPRA	100	67.481	Capra_hircus
ENSAPEG00000022286	srpra	88	79.339	ENSTSYG00000005187	SRPRA	90	86.984	Carlito_syrichta
ENSAPEG00000022286	srpra	94	68.027	ENSCAPG00000007098	SRPRA	91	88.722	Cavia_aperea
ENSAPEG00000022286	srpra	100	65.062	ENSCPOG00000014976	SRPRA	91	88.722	Cavia_porcellus
ENSAPEG00000022286	srpra	100	66.719	ENSCCAG00000025602	SRPRA	100	67.031	Cebus_capucinus
ENSAPEG00000022286	srpra	100	64.571	ENSCATG00000039354	SRPRA	100	68.092	Cercocebus_atys
ENSAPEG00000022286	srpra	100	65.571	ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	68.293	Chinchilla_lanigera
ENSAPEG00000022286	srpra	100	66.927	ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	67.939	Chlorocebus_sabaeus
ENSAPEG00000022286	srpra	55	86.735	ENSCHOG00000010015	-	73	86.735	Choloepus_hoffmanni
ENSAPEG00000022286	srpra	92	73.750	ENSCPBG00000011128	SRPRA	100	70.732	Chrysemys_picta_bellii
ENSAPEG00000022286	srpra	99	56.773	ENSCING00000008954	-	100	57.508	Ciona_intestinalis
ENSAPEG00000022286	srpra	99	60.064	ENSCSAVG00000005602	-	100	59.551	Ciona_savignyi
ENSAPEG00000022286	srpra	100	64.417	ENSCANG00000032337	SRPRA	100	68.293	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAPEG00000022286	srpra	100	64.769	ENSCGRG00001017670	Srpr	100	68.445	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAPEG00000022286	srpra	100	64.769	ENSCGRG00000009892	Srpr	90	88.889	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAPEG00000022286	srpra	100	85.691	ENSCSEG00000002374	srpra	100	87.289	Cynoglossus_semilaevis
ENSAPEG00000022286	srpra	100	79.507	ENSCVAG00000019881	srpra	100	87.596	Cyprinodon_variegatus
ENSAPEG00000022286	srpra	100	74.923	ENSDARG00000061124	srpra	100	79.389	Danio_rerio
ENSAPEG00000022286	srpra	100	66.564	ENSDNOG00000010821	SRPRA	100	66.767	Dasypus_novemcinctus
ENSAPEG00000022286	srpra	100	64.961	ENSDORG00000016719	Srpr	100	68.598	Dipodomys_ordii
ENSAPEG00000022286	srpra	99	50.629	FBgn0010391	Gtp-bp	100	52.896	Drosophila_melanogaster
ENSAPEG00000022286	srpra	100	66.355	ENSETEG00000013956	SRPRA	100	67.322	Echinops_telfairi
ENSAPEG00000022286	srpra	63	73.037	ENSEBUG00000002602	srpra	93	70.976	Eptatretus_burgeri
ENSAPEG00000022286	srpra	100	67.028	ENSEASG00005022980	SRPRA	100	67.477	Equus_asinus_asinus
ENSAPEG00000022286	srpra	100	67.028	ENSECAG00000014692	SRPRA	100	67.477	Equus_caballus
ENSAPEG00000022286	srpra	100	62.500	ENSEEUG00000007920	SRPRA	100	62.709	Erinaceus_europaeus
ENSAPEG00000022286	srpra	92	89.759	ENSELUG00000017643	srpra	100	86.503	Esox_lucius
ENSAPEG00000022286	srpra	78	61.209	ENSFCAG00000030894	-	99	61.959	Felis_catus
ENSAPEG00000022286	srpra	100	67.028	ENSFCAG00000011274	-	100	67.674	Felis_catus
ENSAPEG00000022286	srpra	99	64.110	ENSFALG00000005048	SRPRA	99	67.123	Ficedula_albicollis
ENSAPEG00000022286	srpra	100	65.258	ENSFDAG00000016229	SRPRA	92	83.916	Fukomys_damarensis
ENSAPEG00000022286	srpra	92	89.247	ENSFHEG00000016959	srpra	100	89.555	Fundulus_heteroclitus
ENSAPEG00000022286	srpra	100	79.360	ENSGMOG00000013244	srpra	100	83.231	Gadus_morhua
ENSAPEG00000022286	srpra	100	66.413	ENSGALG00000030759	SRPRA	100	70.183	Gallus_gallus
ENSAPEG00000022286	srpra	100	84.314	ENSGAFG00000000453	srpra	100	90.154	Gambusia_affinis
ENSAPEG00000022286	srpra	92	86.217	ENSGACG00000006550	srpra	100	85.692	Gasterosteus_aculeatus
ENSAPEG00000022286	srpra	92	73.750	ENSGAGG00000021157	SRPRA	100	70.884	Gopherus_agassizii
ENSAPEG00000022286	srpra	100	66.250	ENSGGOG00000012962	SRPRA	100	67.884	Gorilla_gorilla
ENSAPEG00000022286	srpra	92	90.154	ENSHBUG00000000119	srpra	100	90.000	Haplochromis_burtoni
ENSAPEG00000022286	srpra	100	65.062	ENSHGLG00000001597	SRPR	94	89.394	Heterocephalus_glaber_female
ENSAPEG00000022286	srpra	100	65.062	ENSHGLG00100006449	SRPR	94	89.394	Heterocephalus_glaber_male
ENSAPEG00000022286	srpra	100	85.596	ENSHCOG00000010749	srpra	100	87.596	Hippocampus_comes
ENSAPEG00000022286	srpra	93	71.078	ENSIPUG00000000867	srpra	99	74.919	Ictalurus_punctatus
ENSAPEG00000022286	srpra	100	66.094	ENSSTOG00000009897	SRPRA	100	68.445	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAPEG00000022286	srpra	100	67.547	ENSJJAG00000020272	Srpr	100	67.786	Jaculus_jaculus
ENSAPEG00000022286	srpra	92	88.497	ENSKMAG00000002280	srpra	100	89.110	Kryptolebias_marmoratus
ENSAPEG00000022286	srpra	92	91.859	ENSLBEG00000009608	srpra	100	92.012	Labrus_bergylta
ENSAPEG00000022286	srpra	92	77.475	ENSLACG00000017781	SRPRA	100	71.450	Latimeria_chalumnae
ENSAPEG00000022286	srpra	100	72.114	ENSLOCG00000002733	srpra	100	76.596	Lepisosteus_oculatus
ENSAPEG00000022286	srpra	100	63.761	ENSLAFG00000010252	SRPRA	100	67.884	Loxodonta_africana
ENSAPEG00000022286	srpra	100	67.031	ENSMFAG00000032606	SRPRA	100	68.092	Macaca_fascicularis
ENSAPEG00000022286	srpra	100	67.031	ENSMMUG00000007938	SRPRA	100	68.092	Macaca_mulatta
ENSAPEG00000022286	srpra	100	67.239	ENSMNEG00000030709	SRPRA	100	68.445	Macaca_nemestrina
ENSAPEG00000022286	srpra	100	64.571	ENSMLEG00000043404	SRPRA	100	68.092	Mandrillus_leucophaeus
ENSAPEG00000022286	srpra	92	89.385	ENSMAMG00000000473	srpra	100	90.000	Mastacembelus_armatus
ENSAPEG00000022286	srpra	92	90.308	ENSMZEG00005013432	srpra	100	90.154	Maylandia_zebra
ENSAPEG00000022286	srpra	93	65.584	ENSMGAG00000000732	SRPRA	100	69.919	Meleagris_gallopavo
ENSAPEG00000022286	srpra	100	65.674	ENSMAUG00000015648	Srpr	100	68.445	Mesocricetus_auratus
ENSAPEG00000022286	srpra	100	65.469	ENSMICG00000015981	SRPRA	100	67.428	Microcebus_murinus
ENSAPEG00000022286	srpra	100	64.308	ENSMOCG00000008311	Srpr	100	67.835	Microtus_ochrogaster
ENSAPEG00000022286	srpra	100	86.914	ENSMMOG00000005019	srpra	100	85.299	Mola_mola
ENSAPEG00000022286	srpra	100	67.293	ENSMODG00000004576	-	100	67.270	Monodelphis_domestica
ENSAPEG00000022286	srpra	92	92.000	ENSMALG00000011343	srpra	100	92.000	Monopterus_albus
ENSAPEG00000022286	srpra	100	66.144	MGP_CAROLIEiJ_G0031951	Srpr	86	90.152	Mus_caroli
ENSAPEG00000022286	srpra	100	67.398	ENSMUSG00000032042	Srpr	86	89.394	Mus_musculus
ENSAPEG00000022286	srpra	100	67.239	MGP_PahariEiJ_G0014816	Srpr	86	89.394	Mus_pahari
ENSAPEG00000022286	srpra	100	62.836	MGP_SPRETEiJ_G0033075	Srpr	90	82.759	Mus_spretus
ENSAPEG00000022286	srpra	100	65.781	ENSMPUG00000006626	SRPRA	100	67.023	Mustela_putorius_furo
ENSAPEG00000022286	srpra	100	64.264	ENSMLUG00000017334	SRPRA	100	67.975	Myotis_lucifugus
ENSAPEG00000022286	srpra	100	67.812	ENSNGAG00000015686	Srpr	100	67.530	Nannospalax_galili
ENSAPEG00000022286	srpra	92	89.692	ENSNBRG00000017311	srpra	100	89.538	Neolamprologus_brichardi
ENSAPEG00000022286	srpra	99	62.047	ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	67.464	Nomascus_leucogenys
ENSAPEG00000022286	srpra	93	66.167	ENSMEUG00000004956	SRPRA	100	66.938	Notamacropus_eugenii
ENSAPEG00000022286	srpra	92	74.755	ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	64.526	Ochotona_princeps
ENSAPEG00000022286	srpra	100	64.715	ENSODEG00000004730	SRPRA	100	68.043	Octodon_degus
ENSAPEG00000022286	srpra	92	90.154	ENSONIG00000005324	srpra	100	90.000	Oreochromis_niloticus
ENSAPEG00000022286	srpra	100	66.041	ENSOCUG00000017057	SRPRA	100	68.092	Oryctolagus_cuniculus
ENSAPEG00000022286	srpra	92	86.923	ENSORLG00000014676	srpra	100	85.692	Oryzias_latipes
ENSAPEG00000022286	srpra	92	87.077	ENSORLG00020009240	srpra	100	86.308	Oryzias_latipes_hni
ENSAPEG00000022286	srpra	100	80.604	ENSORLG00015015405	srpra	100	86.154	Oryzias_latipes_hsok
ENSAPEG00000022286	srpra	100	82.792	ENSOMEG00000005872	srpra	100	86.769	Oryzias_melastigma
ENSAPEG00000022286	srpra	100	66.823	ENSOGAG00000008926	SRPRA	100	67.737	Otolemur_garnettii
ENSAPEG00000022286	srpra	100	63.580	ENSOARG00000012397	SRPRA	100	65.008	Ovis_aries
ENSAPEG00000022286	srpra	100	67.239	ENSPPAG00000030813	SRPRA	100	67.884	Pan_paniscus
ENSAPEG00000022286	srpra	100	67.028	ENSPPRG00000001542	SRPRA	100	67.674	Panthera_pardus
ENSAPEG00000022286	srpra	100	66.873	ENSPTIG00000006989	SRPRA	100	67.523	Panthera_tigris_altaica
ENSAPEG00000022286	srpra	100	67.239	ENSPTRG00000028360	SRPRA	100	67.884	Pan_troglodytes
ENSAPEG00000022286	srpra	100	67.031	ENSPANG00000010858	SRPRA	100	68.092	Papio_anubis
ENSAPEG00000022286	srpra	90	81.282	ENSPKIG00000016106	srpra	100	76.911	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAPEG00000022286	srpra	85	74.820	ENSPSIG00000012009	SRPRA	100	71.336	Pelodiscus_sinensis
ENSAPEG00000022286	srpra	100	78.527	ENSPMGG00000001393	srpra	100	84.816	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSAPEG00000022286	srpra	100	65.116	ENSPEMG00000018279	Srpr	100	68.140	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAPEG00000022286	srpra	99	61.395	ENSPMAG00000009559	srpra	99	63.247	Petromyzon_marinus
ENSAPEG00000022286	srpra	100	65.991	ENSPCIG00000010207	SRPRA	100	67.683	Phascolarctos_cinereus
ENSAPEG00000022286	srpra	92	90.308	ENSPFOG00000003114	srpra	100	90.308	Poecilia_formosa
ENSAPEG00000022286	srpra	100	87.584	ENSPLAG00000007323	srpra	100	90.615	Poecilia_latipinna
ENSAPEG00000022286	srpra	100	87.184	ENSPMEG00000015658	srpra	100	90.154	Poecilia_mexicana
ENSAPEG00000022286	srpra	100	86.847	ENSPREG00000004937	srpra	100	90.308	Poecilia_reticulata
ENSAPEG00000022286	srpra	88	86.842	ENSPPYG00000004045	SRPRA	100	86.842	Pongo_abelii
ENSAPEG00000022286	srpra	63	90.698	ENSPCAG00000003801	-	62	90.698	Procavia_capensis
ENSAPEG00000022286	srpra	100	65.625	ENSPCOG00000025726	SRPRA	100	67.786	Propithecus_coquereli
ENSAPEG00000022286	srpra	92	74.878	ENSPVAG00000000993	SRPRA	100	67.727	Pteropus_vampyrus
ENSAPEG00000022286	srpra	92	90.308	ENSPNYG00000012371	srpra	100	90.154	Pundamilia_nyererei
ENSAPEG00000022286	srpra	100	73.261	ENSPNAG00000013476	srpra	100	79.448	Pygocentrus_nattereri
ENSAPEG00000022286	srpra	100	64.706	ENSRNOG00000010543	Srpra	100	68.140	Rattus_norvegicus
ENSAPEG00000022286	srpra	100	67.500	ENSRBIG00000008702	SRPRA	100	68.092	Rhinopithecus_bieti
ENSAPEG00000022286	srpra	100	66.927	ENSRROG00000029494	SRPRA	100	68.092	Rhinopithecus_roxellana
ENSAPEG00000022286	srpra	55	41.860	YDR292C	-	52	42.249	Saccharomyces_cerevisiae
ENSAPEG00000022286	srpra	100	66.406	ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	67.481	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSAPEG00000022286	srpra	93	66.722	ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	66.883	Sarcophilus_harrisii
ENSAPEG00000022286	srpra	100	80.776	ENSSFOG00015008837	srpra	100	80.607	Scleropages_formosus
ENSAPEG00000022286	srpra	100	85.502	ENSSMAG00000002783	srpra	100	84.992	Scophthalmus_maximus
ENSAPEG00000022286	srpra	100	88.963	ENSSDUG00000013920	srpra	100	87.960	Seriola_dumerili
ENSAPEG00000022286	srpra	99	87.660	ENSSLDG00000008601	srpra	99	87.660	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSAPEG00000022286	srpra	80	82.927	ENSSARG00000012434	SRPRA	86	82.927	Sorex_araneus
ENSAPEG00000022286	srpra	100	66.202	ENSSPUG00000018221	SRPRA	100	68.598	Sphenodon_punctatus
ENSAPEG00000022286	srpra	92	96.012	ENSSPAG00000005103	srpra	100	96.012	Stegastes_partitus
ENSAPEG00000022286	srpra	100	66.563	ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	67.732	Sus_scrofa
ENSAPEG00000022286	srpra	93	64.123	ENSTGUG00000000815	SRPRA	100	67.311	Taeniopygia_guttata
ENSAPEG00000022286	srpra	100	83.961	ENSTRUG00000006856	srpra	100	86.923	Takifugu_rubripes
ENSAPEG00000022286	srpra	100	74.885	ENSTNIG00000010316	srpra	100	82.202	Tetraodon_nigroviridis
ENSAPEG00000022286	srpra	100	67.551	ENSTTRG00000001558	SRPRA	100	66.667	Tursiops_truncatus
ENSAPEG00000022286	srpra	100	64.319	ENSUAMG00000005510	SRPRA	100	67.584	Ursus_americanus
ENSAPEG00000022286	srpra	87	71.149	ENSUMAG00000002269	SRPRA	100	62.150	Ursus_maritimus
ENSAPEG00000022286	srpra	66	90.698	ENSVPAG00000001077	SRPRA	75	90.698	Vicugna_pacos
ENSAPEG00000022286	srpra	100	64.571	ENSVVUG00000020094	SRPRA	100	67.634	Vulpes_vulpes
ENSAPEG00000022286	srpra	100	52.180	ENSXETG00000003920	srpra	100	61.562	Xenopus_tropicalis
ENSAPEG00000022286	srpra	100	79.153	ENSXCOG00000001286	srpra	98	97.460	Xiphophorus_couchianus
ENSAPEG00000022286	srpra	92	89.692	ENSXMAG00000028401	srpra	100	89.692	Xiphophorus_maculatus