EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAPEG00000022447 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: si:dkey-98f17.5
Alias: -
Full Name: si:dkey-98f17.5
Gene Type: protein_coding
Species: Amphiprion_percula
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 18128 bases
Position: chr5:25175820-25193947
Accession: ZDB-GENE-060526-354
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAPEP00000031660	MMR_HSR1	PF01926.23	9.1e-07	1	1
ENSAPEP00000031679	MMR_HSR1	PF01926.23	9.7e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAPET00000032494	-	4647	-	ENSAPEP00000031660	439 (aa)	-	-
ENSAPET00000032513	-	4594	-	ENSAPEP00000031679	448 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	60.000	ENSAPEG00000014910	si:ch211-11k18.4	99	60.000

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	60.000	ENSAPOG00000018833	si:ch211-11k18.4	99	60.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	98.438	ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	100	98.438	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	94.420	ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	100	94.420	Amphilophus_citrinellus
ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	58.758	ENSACIG00000006696	si:ch211-11k18.4	99	58.758	Amphilophus_citrinellus
ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	60.222	ENSAOCG00000014284	si:ch211-11k18.4	99	60.222	Amphiprion_ocellaris
ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	99.554	ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	100	99.554	Amphiprion_ocellaris
ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	91.741	ENSATEG00000007188	si:dkey-98f17.5	100	91.741	Anabas_testudineus
ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	60.667	ENSATEG00000004775	si:ch211-11k18.4	99	60.667	Anabas_testudineus
ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	99	58.036	ENSACAG00000028632	-	99	58.259	Anolis_carolinensis
ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	92.634	ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	100	92.634	Astatotilapia_calliptera
ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	59.513	ENSACLG00000007907	si:ch211-11k18.4	99	59.513	Astatotilapia_calliptera
ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	60.573	ENSAMXG00000017817	si:ch211-11k18.4	99	60.573	Astyanax_mexicanus
ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	82.628	ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	100	82.628	Astyanax_mexicanus
ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	77	62.319	ENSCING00000020807	-	91	62.319	Ciona_intestinalis
ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	98	55.682	ENSCSAVG00000009987	-	98	56.136	Ciona_savignyi
ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	89.509	ENSCSEG00000017512	si:dkey-98f17.5	95	89.781	Cynoglossus_semilaevis
ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	60.000	ENSCSEG00000017661	si:ch211-11k18.4	99	60.000	Cynoglossus_semilaevis
ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	90.848	ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	100	90.848	Cyprinodon_variegatus
ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	60.444	ENSCVAG00000015346	si:ch211-11k18.4	99	60.444	Cyprinodon_variegatus
ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	61.111	ENSDARG00000087869	si:ch211-11k18.4	100	74.490	Danio_rerio
ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	98	83.864	ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	83.864	Danio_rerio
ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	79	56.215	ENSEBUG00000007620	si:dkey-98f17.5	95	56.215	Eptatretus_burgeri
ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	99	81.166	ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	99	81.166	Esox_lucius
ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	90.848	ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	100	90.848	Fundulus_heteroclitus
ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	59.645	ENSFHEG00000019820	si:ch211-11k18.4	99	59.645	Fundulus_heteroclitus
ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	89	55.362	ENSGMOG00000003492	si:ch211-11k18.4	99	55.362	Gadus_morhua
ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	91.071	ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	91.071	Gambusia_affinis
ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	60.667	ENSGAFG00000005677	si:ch211-11k18.4	99	60.667	Gambusia_affinis
ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	58	94.961	ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	94.961	Gasterosteus_aculeatus
ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	80	67.500	ENSGACG00000013134	si:ch211-11k18.4	99	61.692	Gasterosteus_aculeatus
ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	59.735	ENSHBUG00000020638	si:ch211-11k18.4	99	59.735	Haplochromis_burtoni
ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	93.080	ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	100	93.080	Haplochromis_burtoni
ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	58.889	ENSHCOG00000014773	si:ch211-11k18.4	99	58.889	Hippocampus_comes
ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	99	86.486	ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	97	86.486	Hippocampus_comes
ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	96	60.277	ENSIPUG00000016678	si:ch211-11k18.4	99	60.277	Ictalurus_punctatus
ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	78.396	ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	99	78.396	Ictalurus_punctatus
ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	81	59.452	ENSIPUG00000016694	si:ch211-11k18.4	81	59.452	Ictalurus_punctatus
ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	92.411	ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	100	92.411	Kryptolebias_marmoratus
ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	59.778	ENSKMAG00000009327	si:ch211-11k18.4	99	60.000	Kryptolebias_marmoratus
ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	91.964	ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	100	91.964	Labrus_bergylta
ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	99	62.247	ENSLACG00000006280	si:ch211-11k18.4	98	62.697	Latimeria_chalumnae
ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	99	69.369	ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	69.369	Latimeria_chalumnae
ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	62.584	ENSLACG00000004899	-	99	62.584	Latimeria_chalumnae
ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	99	75.168	ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	75.168	Lepisosteus_oculatus
ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	92.634	ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	100	92.634	Mastacembelus_armatus
ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	96	60.739	ENSMAMG00000002536	si:ch211-11k18.4	99	60.739	Mastacembelus_armatus
ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	92.857	ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	100	92.857	Maylandia_zebra
ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	59.292	ENSMZEG00005008941	si:ch211-11k18.4	99	59.292	Maylandia_zebra
ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	58.315	ENSMMOG00000012485	si:ch211-11k18.4	99	58.315	Mola_mola
ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	98	91.116	ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	91.116	Monopterus_albus
ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	60.444	ENSMALG00000019735	si:ch211-11k18.4	99	60.444	Monopterus_albus
ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	96	60.277	ENSNBRG00000002220	si:ch211-11k18.4	98	60.277	Neolamprologus_brichardi
ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	92.634	ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	92.634	Neolamprologus_brichardi
ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	59.513	ENSONIG00000019412	si:ch211-11k18.4	99	59.513	Oreochromis_niloticus
ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	94.196	ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	100	94.196	Oreochromis_niloticus
ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	87.946	ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	100	87.946	Oryzias_latipes
ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	61.111	ENSORLG00000012015	si:ch211-11k18.4	99	61.111	Oryzias_latipes
ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	60.889	ENSORLG00020012386	si:ch211-11k18.4	99	60.889	Oryzias_latipes_hni
ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	90.625	ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	100	90.625	Oryzias_latipes_hni
ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	61.111	ENSORLG00015022862	si:ch211-11k18.4	99	61.111	Oryzias_latipes_hsok
ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	90.848	ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	100	90.848	Oryzias_latipes_hsok
ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	92.188	ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	92.188	Oryzias_melastigma
ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	61.333	ENSOMEG00000018686	si:ch211-11k18.4	99	61.333	Oryzias_melastigma
ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	58.824	ENSPKIG00000018807	si:ch211-11k18.4	99	60.307	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	77.283	ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	77.283	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	58.129	ENSPKIG00000023918	-	98	58.129	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	59.956	ENSPMGG00000016507	si:ch211-11k18.4	99	59.956	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	86.830	ENSPMGG00000019065	si:dkey-98f17.5	100	86.830	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	62.000	ENSPFOG00000007976	si:ch211-11k18.4	99	62.000	Poecilia_formosa
ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	90.244	ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	100	90.244	Poecilia_formosa
ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	90.625	ENSPLAG00000003709	si:dkey-98f17.5	100	90.625	Poecilia_latipinna
ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	61.778	ENSPLAG00000019794	si:ch211-11k18.4	99	61.778	Poecilia_latipinna
ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	62.000	ENSPMEG00000024198	si:ch211-11k18.4	99	62.818	Poecilia_mexicana
ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	90.848	ENSPMEG00000018709	si:dkey-98f17.5	94	90.848	Poecilia_mexicana
ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	98	88.155	ENSPREG00000000708	si:dkey-98f17.5	100	88.155	Poecilia_reticulata
ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	98	59.453	ENSPREG00000015319	si:ch211-11k18.4	98	59.453	Poecilia_reticulata
ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	93.080	ENSPNYG00000017266	si:dkey-98f17.5	100	93.080	Pundamilia_nyererei
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ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	59.692	ENSPNAG00000022138	si:ch211-11k18.4	99	59.912	Pygocentrus_nattereri
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ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	90.625	ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	100	90.625	Scophthalmus_maximus
ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	59.556	ENSSMAG00000009651	si:ch211-11k18.4	99	59.556	Scophthalmus_maximus
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