EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAPLG00000001066 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Anas_platyrhynchos
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 738 bases
Position: chrKB746604.1:7494-8231
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAPLP00000000480	MMR_HSR1	PF01926.23	1.3e-05	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAPLT00000001048	-	738	-	ENSAPLP00000000480	246 (aa)	-	U3HZR0

Gene Model

Click here to download ENSAPLG00000001066's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSAPLG00000001066's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAPLG00000001066	-	95	57.009	ENSG00000281887	GIMAP1-GIMAP5	68	57.009	Homo_sapiens
ENSAPLG00000001066	-	95	42.149	ENSG00000196329	GIMAP5	79	42.149	Homo_sapiens
ENSAPLG00000001066	-	83	51.471	ENSACAG00000028535	-	75	51.471	Anolis_carolinensis
ENSAPLG00000001066	-	80	47.500	ENSACAG00000017193	-	88	47.500	Anolis_carolinensis
ENSAPLG00000001066	-	76	54.301	ENSACAG00000016862	-	91	54.301	Anolis_carolinensis
ENSAPLG00000001066	-	93	43.038	ENSACAG00000016727	-	82	43.038	Anolis_carolinensis
ENSAPLG00000001066	-	86	46.445	ENSBTAG00000039588	-	71	46.445	Bos_taurus
ENSAPLG00000001066	-	86	48.585	ENSBTAG00000004894	-	77	51.515	Bos_taurus
ENSAPLG00000001066	-	85	49.038	ENSBTAG00000000715	-	65	49.038	Bos_taurus
ENSAPLG00000001066	-	92	43.966	ENSCJAG00000020126	-	75	43.966	Callithrix_jacchus
ENSAPLG00000001066	-	84	49.275	ENSCAFG00000024817	-	60	49.275	Canis_familiaris
ENSAPLG00000001066	-	76	50.802	ENSCAFG00020006487	-	74	49.474	Canis_lupus_dingo
ENSAPLG00000001066	-	86	48.341	ENSCHIG00000013093	-	71	48.341	Capra_hircus
ENSAPLG00000001066	-	86	46.919	ENSCHIG00000000607	-	71	46.919	Capra_hircus
ENSAPLG00000001066	-	86	45.498	ENSCHIG00000020434	-	81	48.503	Capra_hircus
ENSAPLG00000001066	-	86	45.972	ENSCHIG00000000431	-	68	45.972	Capra_hircus
ENSAPLG00000001066	-	87	48.372	ENSTSYG00000010016	-	78	47.186	Carlito_syrichta
ENSAPLG00000001066	-	93	43.043	ENSCAPG00000007631	-	74	43.043	Cavia_aperea
ENSAPLG00000001066	-	93	43.043	ENSCPOG00000003376	-	74	43.043	Cavia_porcellus
ENSAPLG00000001066	-	91	45.217	ENSCCAG00000009203	-	75	45.217	Cebus_capucinus
ENSAPLG00000001066	-	95	44.635	ENSCLAG00000001246	-	75	44.635	Chinchilla_lanigera
ENSAPLG00000001066	-	93	45.217	ENSCLAG00000001322	-	72	45.217	Chinchilla_lanigera
ENSAPLG00000001066	-	91	45.652	ENSCSAG00000006865	-	71	45.652	Chlorocebus_sabaeus
ENSAPLG00000001066	-	80	52.525	ENSCPBG00000005548	-	68	52.525	Chrysemys_picta_bellii
ENSAPLG00000001066	-	91	45.217	ENSCANG00000029802	-	75	45.217	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAPLG00000001066	-	93	46.087	ENSCGRG00001024196	-	74	46.087	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAPLG00000001066	-	93	46.087	ENSCGRG00001024272	-	76	46.087	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAPLG00000001066	-	93	46.087	ENSCGRG00000014686	-	76	46.087	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAPLG00000001066	-	93	46.087	ENSCGRG00000015177	-	74	46.087	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAPLG00000001066	-	83	50.246	ENSECAG00000029716	-	64	50.246	Equus_caballus
ENSAPLG00000001066	-	83	49.754	ENSECAG00000007663	-	65	49.754	Equus_caballus
ENSAPLG00000001066	-	93	46.087	ENSECAG00000007668	-	75	46.087	Equus_caballus
ENSAPLG00000001066	-	83	48.039	ENSEEUG00000006852	-	82	47.162	Erinaceus_europaeus
ENSAPLG00000001066	-	94	46.383	ENSFCAG00000042622	-	76	46.383	Felis_catus
ENSAPLG00000001066	-	80	48.020	ENSGAGG00000015825	-	71	48.020	Gopherus_agassizii
ENSAPLG00000001066	-	73	54.444	ENSGAGG00000015829	-	85	54.444	Gopherus_agassizii
ENSAPLG00000001066	-	95	57.009	ENSGGOG00000014216	-	71	57.009	Gorilla_gorilla
ENSAPLG00000001066	-	83	54.680	ENSSTOG00000021076	-	65	54.680	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAPLG00000001066	-	79	35.955	ENSKMAG00000007013	-	72	35.754	Kryptolebias_marmoratus
ENSAPLG00000001066	-	83	48.039	ENSMFAG00000044951	-	63	48.039	Macaca_fascicularis
ENSAPLG00000001066	-	84	57.407	ENSMMUG00000001270	-	73	54.229	Macaca_mulatta
ENSAPLG00000001066	-	84	47.826	ENSMNEG00000028821	-	67	47.826	Macaca_nemestrina
ENSAPLG00000001066	-	91	44.783	ENSMLEG00000029622	-	75	44.783	Mandrillus_leucophaeus
ENSAPLG00000001066	-	98	46.400	ENSMICG00000035983	-	80	46.400	Microcebus_murinus
ENSAPLG00000001066	-	93	47.863	ENSMICG00000027282	-	75	47.863	Microcebus_murinus
ENSAPLG00000001066	-	80	48.223	ENSMOCG00000002213	-	88	48.223	Microtus_ochrogaster
ENSAPLG00000001066	-	94	44.156	ENSMOCG00000018608	-	78	44.156	Microtus_ochrogaster
ENSAPLG00000001066	-	92	45.175	ENSMODG00000003669	-	71	45.175	Monodelphis_domestica
ENSAPLG00000001066	-	98	46.473	MGP_CAROLIEiJ_G0028354	Gimap5	78	46.473	Mus_caroli
ENSAPLG00000001066	-	93	47.391	MGP_CAROLIEiJ_G0028355	Gimap3	76	47.391	Mus_caroli
ENSAPLG00000001066	-	93	46.957	ENSMUSG00000039264	Gimap3	76	46.957	Mus_musculus
ENSAPLG00000001066	-	98	46.058	ENSMUSG00000043505	Gimap5	78	46.058	Mus_musculus
ENSAPLG00000001066	-	98	45.228	MGP_PahariEiJ_G0022104	Gimap5	78	45.228	Mus_pahari
ENSAPLG00000001066	-	96	46.414	MGP_PahariEiJ_G0022105	Gimap3	78	46.414	Mus_pahari
ENSAPLG00000001066	-	95	44.872	ENSMLUG00000028966	-	76	44.872	Myotis_lucifugus
ENSAPLG00000001066	-	80	39.698	ENSMLUG00000022809	-	77	39.698	Myotis_lucifugus
ENSAPLG00000001066	-	83	50.732	ENSMLUG00000025954	-	97	50.732	Myotis_lucifugus
ENSAPLG00000001066	-	94	48.305	ENSMLUG00000007287	-	76	48.305	Myotis_lucifugus
ENSAPLG00000001066	-	81	46.500	ENSMLUG00000026545	-	65	46.500	Myotis_lucifugus
ENSAPLG00000001066	-	83	48.276	ENSMLUG00000023466	-	71	48.276	Myotis_lucifugus
ENSAPLG00000001066	-	94	45.923	ENSNGAG00000020526	-	78	45.923	Nannospalax_galili
ENSAPLG00000001066	-	96	46.610	ENSNGAG00000022013	-	76	46.610	Nannospalax_galili
ENSAPLG00000001066	-	95	42.975	ENSNLEG00000003844	-	79	42.975	Nomascus_leucogenys
ENSAPLG00000001066	-	81	52.736	ENSMEUG00000000849	-	73	52.736	Notamacropus_eugenii
ENSAPLG00000001066	-	81	53.234	ENSMEUG00000016596	-	73	53.234	Notamacropus_eugenii
ENSAPLG00000001066	-	98	41.803	ENSODEG00000011306	-	79	41.803	Octodon_degus
ENSAPLG00000001066	-	83	48.768	ENSOCUG00000005976	-	64	48.768	Oryctolagus_cuniculus
ENSAPLG00000001066	-	85	48.095	ENSOCUG00000025892	-	91	48.095	Oryctolagus_cuniculus
ENSAPLG00000001066	-	93	45.652	ENSOGAG00000009145	-	75	45.652	Otolemur_garnettii
ENSAPLG00000001066	-	83	47.783	ENSOARG00000001645	-	66	47.783	Ovis_aries
ENSAPLG00000001066	-	86	47.867	ENSOARG00000001589	-	61	47.867	Ovis_aries
ENSAPLG00000001066	-	82	45.503	ENSOARG00000001183	-	91	45.503	Ovis_aries
ENSAPLG00000001066	-	86	45.972	ENSOARG00000001288	-	68	45.972	Ovis_aries
ENSAPLG00000001066	-	95	57.009	ENSPPAG00000042001	-	70	57.009	Pan_paniscus
ENSAPLG00000001066	-	83	48.529	ENSPPRG00000017393	-	66	48.529	Panthera_pardus
ENSAPLG00000001066	-	83	48.529	ENSPTIG00000012405	-	66	48.529	Panthera_tigris_altaica
ENSAPLG00000001066	-	95	56.075	ENSPTRG00000028356	-	70	56.075	Pan_troglodytes
ENSAPLG00000001066	-	95	56.075	ENSPTRG00000034465	GIMAP1	70	56.075	Pan_troglodytes
ENSAPLG00000001066	-	91	45.217	ENSPANG00000030896	-	75	45.217	Papio_anubis
ENSAPLG00000001066	-	86	46.930	ENSPSIG00000006796	-	97	50.251	Pelodiscus_sinensis
ENSAPLG00000001066	-	87	45.581	ENSPSIG00000016016	-	68	45.581	Pelodiscus_sinensis
ENSAPLG00000001066	-	89	49.362	ENSPSIG00000000508	-	92	49.362	Pelodiscus_sinensis
ENSAPLG00000001066	-	80	56.566	ENSPSIG00000013467	-	87	56.566	Pelodiscus_sinensis
ENSAPLG00000001066	-	87	49.767	ENSPSIG00000000573	-	90	49.767	Pelodiscus_sinensis
ENSAPLG00000001066	-	58	53.521	ENSPSIG00000004906	-	93	53.521	Pelodiscus_sinensis
ENSAPLG00000001066	-	93	46.087	ENSPEMG00000019236	-	76	46.087	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAPLG00000001066	-	94	45.022	ENSPEMG00000014554	-	78	45.022	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAPLG00000001066	-	92	47.137	ENSPCIG00000008658	-	71	47.137	Phascolarctos_cinereus
ENSAPLG00000001066	-	76	43.316	ENSPCIG00000001766	-	66	43.316	Phascolarctos_cinereus
ENSAPLG00000001066	-	95	42.149	ENSPPYG00000018173	-	73	42.149	Pongo_abelii
ENSAPLG00000001066	-	93	46.154	ENSPCOG00000016811	-	75	46.154	Propithecus_coquereli
ENSAPLG00000001066	-	93	43.478	ENSRNOG00000008416	Gimap5	75	43.478	Rattus_norvegicus
ENSAPLG00000001066	-	91	45.652	ENSRBIG00000035290	-	75	45.652	Rhinopithecus_bieti
ENSAPLG00000001066	-	91	45.652	ENSRROG00000028817	-	71	45.652	Rhinopithecus_roxellana
ENSAPLG00000001066	-	94	43.723	ENSSBOG00000032164	-	75	43.723	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSAPLG00000001066	-	80	50.254	ENSSHAG00000000843	-	83	50.254	Sarcophilus_harrisii
ENSAPLG00000001066	-	87	47.442	ENSSARG00000004634	-	72	47.442	Sorex_araneus
ENSAPLG00000001066	-	83	51.961	ENSSPUG00000009848	-	71	51.961	Sphenodon_punctatus
ENSAPLG00000001066	-	85	53.846	ENSSPUG00000010063	-	71	53.846	Sphenodon_punctatus
ENSAPLG00000001066	-	82	53.960	ENSSPUG00000003272	-	50	53.960	Sphenodon_punctatus
ENSAPLG00000001066	-	96	48.729	ENSSPUG00000010046	-	79	48.729	Sphenodon_punctatus
ENSAPLG00000001066	-	82	53.731	ENSSPUG00000009833	-	77	53.731	Sphenodon_punctatus
ENSAPLG00000001066	-	78	53.646	ENSSPUG00000009917	-	69	77.778	Sphenodon_punctatus
ENSAPLG00000001066	-	82	53.960	ENSSPUG00000010036	-	69	53.960	Sphenodon_punctatus
ENSAPLG00000001066	-	83	54.412	ENSSPUG00000009760	-	93	54.412	Sphenodon_punctatus
ENSAPLG00000001066	-	69	54.706	ENSSPUG00000014119	-	78	54.706	Sphenodon_punctatus
ENSAPLG00000001066	-	80	48.744	ENSSPUG00000009907	-	90	48.241	Sphenodon_punctatus
ENSAPLG00000001066	-	83	47.291	ENSSSCG00000039407	-	66	47.291	Sus_scrofa
ENSAPLG00000001066	-	94	46.753	ENSTBEG00000000035	-	77	46.753	Tupaia_belangeri
ENSAPLG00000001066	-	83	50.739	ENSTTRG00000003204	-	69	50.739	Tursiops_truncatus
ENSAPLG00000001066	-	83	50.739	ENSTTRG00000011008	-	84	50.739	Tursiops_truncatus
ENSAPLG00000001066	-	86	50.490	ENSUMAG00000018133	-	69	50.490	Ursus_maritimus
ENSAPLG00000001066	-	85	48.558	ENSVPAG00000011693	-	68	48.558	Vicugna_pacos