EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAPLG00000001673 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: LIG4
Alias: -
Full Name: DNA ligase 4
Gene Type: protein_coding
Species: Anas_platyrhynchos
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 2637 bases
Position: chrKB743282.1:636554-639190
Accession: 6601
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAPLP00000001095	RNA_ligase	PF09414.10	8.6e-11	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAPLT00000001666	LIG4-201	2637	-	ENSAPLP00000001095	878 (aa)	-	U3I1H5

Gene Model

Click here to download ENSAPLG00000001673's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
apla03450	Non-homologous end-joining	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSAPLG00000001673's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	76.136	ENSG00000174405	LIG4	100	76.303	Homo_sapiens
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	67.426	ENSAPOG00000000866	lig4	96	67.426	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	73.295	ENSAMEG00000019685	LIG4	96	73.295	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	67.123	ENSACIG00000018309	lig4	96	67.123	Amphilophus_citrinellus
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	67.084	ENSAOCG00000011768	lig4	96	67.084	Amphiprion_ocellaris
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	67.198	ENSAPEG00000017815	lig4	96	67.198	Amphiprion_percula
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	67.123	ENSATEG00000005583	lig4	96	67.123	Anabas_testudineus
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	78.815	ENSACAG00000014566	LIG4	97	78.815	Anolis_carolinensis
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	74.659	ENSANAG00000012446	LIG4	97	74.659	Aotus_nancymaae
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	67.314	ENSACLG00000027051	lig4	96	67.314	Astatotilapia_calliptera
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	66.173	ENSAMXG00000008192	lig4	91	66.173	Astyanax_mexicanus
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	74.717	ENSBTAG00000015868	LIG4	97	74.717	Bos_taurus
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	74.659	ENSCJAG00000014689	LIG4	97	74.659	Callithrix_jacchus
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	74.432	ENSCAFG00000006031	LIG4	97	74.432	Canis_familiaris
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	74.432	ENSCAFG00020021230	LIG4	97	74.432	Canis_lupus_dingo
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	74.263	ENSCHIG00000001019	LIG4	97	74.263	Capra_hircus
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	74.545	ENSCAPG00000006284	LIG4	97	74.545	Cavia_aperea
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	74.432	ENSCPOG00000014266	LIG4	97	74.432	Cavia_porcellus
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	74.773	ENSCCAG00000019971	LIG4	97	74.773	Cebus_capucinus
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	75.114	ENSCATG00000021075	LIG4	97	75.114	Cercocebus_atys
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	74.432	ENSCLAG00000003376	LIG4	97	74.432	Chinchilla_lanigera
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	75.341	ENSCSAG00000000211	LIG4	97	75.341	Chlorocebus_sabaeus
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	83.636	ENSCPBG00000023291	LIG4	96	83.636	Chrysemys_picta_bellii
ENSAPLG00000001673	LIG4	68	46.333	ENSCING00000009536	-	91	46.333	Ciona_intestinalis
ENSAPLG00000001673	LIG4	83	45.479	ENSCSAVG00000010336	-	96	45.479	Ciona_savignyi
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	74.773	ENSCANG00000005805	LIG4	97	74.773	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	73.273	ENSCGRG00001012072	Lig4	97	73.273	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	73.273	ENSCGRG00000013417	Lig4	97	73.273	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAPLG00000001673	LIG4	97	67.995	ENSCSEG00000013905	lig4	92	67.995	Cynoglossus_semilaevis
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	67.237	ENSCVAG00000007896	lig4	96	67.237	Cyprinodon_variegatus
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	66.438	ENSDARG00000060620	lig4	96	66.438	Danio_rerio
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	75.369	ENSDNOG00000000513	LIG4	97	75.369	Dasypus_novemcinctus
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	75.682	ENSDORG00000027303	Lig4	97	75.682	Dipodomys_ordii
ENSAPLG00000001673	LIG4	84	33.205	FBgn0030506	Lig4	83	33.205	Drosophila_melanogaster
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	71.964	ENSETEG00000015563	LIG4	98	72.304	Echinops_telfairi
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	43.045	ENSEBUG00000014243	lig4	96	42.950	Eptatretus_burgeri
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	74.545	ENSEASG00005022073	LIG4	97	74.545	Equus_asinus_asinus
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	74.091	ENSECAG00000003257	LIG4	97	74.091	Equus_caballus
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	67.995	ENSELUG00000006787	lig4	96	67.995	Esox_lucius
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	73.864	ENSFCAG00000031985	LIG4	97	73.864	Felis_catus
ENSAPLG00000001673	LIG4	90	90.355	ENSFALG00000004214	LIG4	96	90.355	Ficedula_albicollis
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	74.432	ENSFDAG00000008973	LIG4	97	74.432	Fukomys_damarensis
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	67.540	ENSFHEG00000007398	lig4	87	67.503	Fundulus_heteroclitus
ENSAPLG00000001673	LIG4	86	64.058	ENSGMOG00000012843	lig4	96	64.058	Gadus_morhua
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	92.816	ENSGALG00000016854	LIG4	96	92.816	Gallus_gallus
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	67.198	ENSGAFG00000019779	lig4	92	67.198	Gambusia_affinis
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	65.068	ENSGACG00000014135	lig4	96	65.068	Gasterosteus_aculeatus
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	76.023	ENSGGOG00000027771	LIG4	97	76.023	Gorilla_gorilla
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	67.086	ENSHBUG00000006245	lig4	96	67.086	Haplochromis_burtoni
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	73.977	ENSHGLG00000000718	LIG4	97	73.977	Heterocephalus_glaber_female
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	73.977	ENSHGLG00100003265	LIG4	97	73.977	Heterocephalus_glaber_male
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	66.210	ENSHCOG00000012010	lig4	96	66.210	Hippocampus_comes
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	67.617	ENSIPUG00000013748	lig4	96	67.617	Ictalurus_punctatus
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	73.636	ENSSTOG00000024303	LIG4	97	73.636	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	72.955	ENSJJAG00000006750	Lig4	97	72.955	Jaculus_jaculus
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	65.982	ENSKMAG00000001149	lig4	96	65.982	Kryptolebias_marmoratus
ENSAPLG00000001673	LIG4	94	67.189	ENSLBEG00000014578	lig4	100	67.189	Labrus_bergylta
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	74.914	ENSLACG00000003282	LIG4	96	74.914	Latimeria_chalumnae
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	70.909	ENSLOCG00000008901	lig4	95	70.909	Lepisosteus_oculatus
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	73.469	ENSLAFG00000031152	LIG4	97	73.469	Loxodonta_africana
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	75.341	ENSMFAG00000037235	LIG4	97	75.341	Macaca_fascicularis
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	75.114	ENSMMUG00000008874	LIG4	97	75.114	Macaca_mulatta
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	75.341	ENSMNEG00000023575	LIG4	97	75.341	Macaca_nemestrina
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	75.227	ENSMLEG00000026720	LIG4	97	75.227	Mandrillus_leucophaeus
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	67.352	ENSMAMG00000008472	lig4	96	67.352	Mastacembelus_armatus
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	67.314	ENSMZEG00005001855	lig4	96	67.314	Maylandia_zebra
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	92.816	ENSMGAG00000015532	LIG4	96	92.816	Meleagris_gallopavo
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	72.676	ENSMOCG00000019000	Lig4	97	72.676	Microtus_ochrogaster
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	66.438	ENSMMOG00000004390	lig4	96	66.438	Mola_mola
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	77.866	ENSMODG00000025064	LIG4	97	78.345	Monodelphis_domestica
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	66.895	ENSMALG00000008555	lig4	96	66.895	Monopterus_albus
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	73.977	MGP_CAROLIEiJ_G0030809	Lig4	97	73.977	Mus_caroli
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	73.750	ENSMUSG00000049717	Lig4	97	73.750	Mus_musculus
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	73.977	MGP_PahariEiJ_G0021270	Lig4	97	73.977	Mus_pahari
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	73.750	MGP_SPRETEiJ_G0031917	Lig4	97	73.750	Mus_spretus
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	73.750	ENSMPUG00000018675	LIG4	97	73.750	Mustela_putorius_furo
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	75.114	ENSMLUG00000001267	LIG4	97	75.114	Myotis_lucifugus
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	72.841	ENSNGAG00000013258	Lig4	97	72.841	Nannospalax_galili
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	67.086	ENSNBRG00000021252	lig4	96	67.086	Neolamprologus_brichardi
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	75.114	ENSNLEG00000007888	LIG4	97	75.114	Nomascus_leucogenys
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	73.977	ENSOPRG00000005765	LIG4	97	73.977	Ochotona_princeps
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	73.977	ENSODEG00000019683	LIG4	97	73.977	Octodon_degus
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	67.086	ENSONIG00000011969	lig4	95	67.086	Oreochromis_niloticus
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	74.545	ENSOCUG00000015734	LIG4	97	74.545	Oryctolagus_cuniculus
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	66.629	ENSORLG00000004041	lig4	96	66.856	Oryzias_latipes
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	67.122	ENSORLG00020019607	lig4	96	67.349	Oryzias_latipes_hni
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	66.894	ENSORLG00015017754	lig4	96	67.122	Oryzias_latipes_hsok
ENSAPLG00000001673	LIG4	74	70.706	ENSOMEG00000003459	lig4	94	70.706	Oryzias_melastigma
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	74.318	ENSOGAG00000032120	LIG4	96	74.318	Otolemur_garnettii
ENSAPLG00000001673	LIG4	81	78.011	ENSOARG00000005590	LIG4	94	78.011	Ovis_aries
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	75.568	ENSPPAG00000032998	LIG4	97	75.568	Pan_paniscus
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	74.205	ENSPPRG00000017804	LIG4	97	74.205	Panthera_pardus
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	74.318	ENSPTIG00000010051	LIG4	97	74.318	Panthera_tigris_altaica
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	75.682	ENSPTRG00000006025	LIG4	97	75.682	Pan_troglodytes
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	75.227	ENSPANG00000007562	LIG4	97	75.227	Papio_anubis
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	68.415	ENSPKIG00000011645	lig4	95	68.415	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	83.827	ENSPSIG00000001504	LIG4	96	83.827	Pelodiscus_sinensis
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	64.920	ENSPMGG00000013486	lig4	96	64.920	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	73.613	ENSPEMG00000000076	Lig4	97	73.613	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	77.324	ENSPCIG00000021882	LIG4	97	77.324	Phascolarctos_cinereus
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	67.389	ENSPFOG00000000797	lig4	96	67.503	Poecilia_formosa
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	67.389	ENSPLAG00000001196	lig4	96	67.503	Poecilia_latipinna
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	67.503	ENSPMEG00000021353	lig4	96	67.617	Poecilia_mexicana
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	67.389	ENSPREG00000007323	lig4	96	67.503	Poecilia_reticulata
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	75.227	ENSPPYG00000005540	LIG4	97	75.227	Pongo_abelii
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	73.409	ENSPVAG00000016403	LIG4	97	73.409	Pteropus_vampyrus
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	67.200	ENSPNYG00000009660	lig4	96	67.200	Pundamilia_nyererei
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	66.895	ENSPNAG00000028056	lig4	96	66.895	Pygocentrus_nattereri
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	66.895	ENSPNAG00000028069	LIG4	96	66.895	Pygocentrus_nattereri
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	72.500	ENSRNOG00000014605	Lig4	97	72.500	Rattus_norvegicus
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	73.636	ENSRBIG00000039962	LIG4	97	73.636	Rhinopithecus_bieti
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	74.659	ENSRROG00000006040	LIG4	97	74.659	Rhinopithecus_roxellana
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	74.773	ENSSBOG00000019029	LIG4	97	74.773	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	74.066	ENSSHAG00000009525	LIG4	97	74.774	Sarcophilus_harrisii
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	67.275	ENSSFOG00015012835	lig4	96	67.275	Scleropages_formosus
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	63.813	ENSSMAG00000011267	lig4	96	63.813	Scophthalmus_maximus
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	67.045	ENSSDUG00000010343	lig4	96	67.045	Seriola_dumerili
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	66.023	ENSSLDG00000003239	lig4	96	66.023	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	71.977	ENSSARG00000006573	LIG4	97	71.977	Sorex_araneus
ENSAPLG00000001673	LIG4	96	81.807	ENSSPUG00000002444	LIG4	100	81.807	Sphenodon_punctatus
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	66.933	ENSSPAG00000001609	lig4	96	66.933	Stegastes_partitus
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	74.943	ENSSSCG00000009540	LIG4	97	74.943	Sus_scrofa
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	90.992	ENSTGUG00000010795	LIG4	97	90.992	Taeniopygia_guttata
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	67.009	ENSTRUG00000009984	lig4	96	67.009	Takifugu_rubripes
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	66.363	ENSTNIG00000010348	lig4	96	66.591	Tetraodon_nigroviridis
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	74.773	ENSTBEG00000017741	LIG4	97	74.773	Tupaia_belangeri
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	73.977	ENSTTRG00000012660	LIG4	97	73.977	Tursiops_truncatus
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	73.182	ENSUAMG00000003773	LIG4	97	73.182	Ursus_americanus
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	73.432	ENSXETG00000002654	lig4	96	73.349	Xenopus_tropicalis
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	67.275	ENSXCOG00000017401	lig4	96	67.275	Xiphophorus_couchianus
ENSAPLG00000001673	LIG4	99	67.617	ENSXMAG00000015142	lig4	96	67.617	Xiphophorus_maculatus