EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSAPLG00000002440 (Gene tree)
Gene ID: 101803593
Gene Symbol: PRPF3
Alias: -
Full Name: pre-mRNA processing factor 3
Gene Type: protein_coding
Species: Anas_platyrhynchos
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 10036 bases
Position: chrKB753150.1:1342-11377
Accession: 101803593
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSAPLP00000001929	PRP3	PF08572.10	1.7e-80	1	1
ENSAPLP00000001929	PWI	PF01480.17	1.7e-13	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSAPLT00000002508	PRPF3-201	2055	XM_005031308	ENSAPLP00000001929	684 (aa)	XP_005031365	R0KYC6

Gene Model

Click here to download ENSAPLG00000002440's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
apla03040	Spliceosome	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSAPLG00000002440's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	95.029	ENSG00000117360	PRPF3	100	95.029	Homo_sapiens
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	72.316	ENSAPOG00000015584	prpf3	99	73.446	Acanthochromis_polyacanthus
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	94.883	ENSAMEG00000001630	PRPF3	100	94.883	Ailuropoda_melanoleuca
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	72.175	ENSACIG00000007876	prpf3	99	71.610	Amphilophus_citrinellus
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	72.222	ENSAOCG00000011449	prpf3	99	73.647	Amphiprion_ocellaris
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	71.773	ENSATEG00000023583	prpf3	99	72.624	Anabas_testudineus
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	92.722	ENSACAG00000003176	PRPF3	100	92.868	Anolis_carolinensis
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	95.029	ENSANAG00000026138	PRPF3	100	95.029	Aotus_nancymaae
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	73.121	ENSACLG00000020127	prpf3	99	73.121	Astatotilapia_calliptera
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	74.085	ENSAMXG00000007306	prpf3	99	74.085	Astyanax_mexicanus
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	95.029	ENSBTAG00000013946	PRPF3	100	95.029	Bos_taurus
ENSAPLG00000002440	PRPF3	81	38.840	WBGene00010844	prp-3	95	36.364	Caenorhabditis_elegans
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	95.029	ENSCJAG00000009926	PRPF3	100	95.029	Callithrix_jacchus
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	95.029	ENSCAFG00000011820	PRPF3	100	95.029	Canis_familiaris
ENSAPLG00000002440	PRPF3	80	94.526	ENSCAFG00020019653	PRPF3	100	94.526	Canis_lupus_dingo
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	95.029	ENSCHIG00000015434	PRPF3	100	95.029	Capra_hircus
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	94.591	ENSTSYG00000001383	PRPF3	100	94.591	Carlito_syrichta
ENSAPLG00000002440	PRPF3	93	79.121	ENSCAPG00000017812	PRPF3	95	79.435	Cavia_aperea
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	94.591	ENSCPOG00000008068	PRPF3	100	94.591	Cavia_porcellus
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	95.029	ENSCCAG00000026380	PRPF3	100	95.029	Cebus_capucinus
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	80.116	ENSCATG00000041778	PRPF3	100	80.116	Cercocebus_atys
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	94.883	ENSCLAG00000015009	PRPF3	100	94.883	Chinchilla_lanigera
ENSAPLG00000002440	PRPF3	76	96.296	ENSCHOG00000011645	PRPF3	76	96.296	Choloepus_hoffmanni
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	96.491	ENSCPBG00000008216	PRPF3	100	96.491	Chrysemys_picta_bellii
ENSAPLG00000002440	PRPF3	61	59.524	ENSCING00000003312	-	99	58.810	Ciona_intestinalis
ENSAPLG00000002440	PRPF3	80	55.054	ENSCSAVG00000008720	-	94	55.135	Ciona_savignyi
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	94.298	ENSCANG00000036769	PRPF3	100	94.298	Colobus_angolensis_palliatus
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	95.029	ENSCGRG00001019100	Prpf3	100	95.029	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	95.029	ENSCGRG00000007322	Prpf3	100	95.029	Cricetulus_griseus_crigri
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	72.394	ENSCSEG00000002532	prpf3	99	71.871	Cynoglossus_semilaevis
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	73.333	ENSCVAG00000009318	prpf3	99	73.475	Cyprinodon_variegatus
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	74.148	ENSDARG00000086425	prpf3	99	73.826	Danio_rerio
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	85.673	ENSDNOG00000005904	PRPF3	100	88.304	Dasypus_novemcinctus
ENSAPLG00000002440	PRPF3	93	94.488	ENSDORG00000008664	Prpf3	100	94.488	Dipodomys_ordii
ENSAPLG00000002440	PRPF3	81	53.710	FBgn0036915	Prp3	99	53.916	Drosophila_melanogaster
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	94.006	ENSETEG00000019124	PRPF3	100	94.006	Echinops_telfairi
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	63.934	ENSEBUG00000011680	prpf3	99	63.661	Eptatretus_burgeri
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	94.883	ENSEASG00005001566	PRPF3	100	94.883	Equus_asinus_asinus
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	95.029	ENSECAG00000019840	PRPF3	100	95.029	Equus_caballus
ENSAPLG00000002440	PRPF3	85	95.745	ENSEEUG00000007338	PRPF3	85	95.745	Erinaceus_europaeus
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	66.524	ENSELUG00000013624	prpf3	99	66.952	Esox_lucius
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	95.029	ENSFCAG00000013940	PRPF3	100	95.029	Felis_catus
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	94.444	ENSFDAG00000010365	PRPF3	100	94.444	Fukomys_damarensis
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	73.994	ENSFHEG00000021746	prpf3	99	73.994	Fundulus_heteroclitus
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	72.624	ENSGMOG00000008535	prpf3	99	72.908	Gadus_morhua
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	99.854	ENSGALG00000028205	PRPF3	100	99.854	Gallus_gallus
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	71.920	ENSGAFG00000012671	prpf3	99	72.063	Gambusia_affinis
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	71.388	ENSGACG00000011792	prpf3	99	72.096	Gasterosteus_aculeatus
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	96.345	ENSGAGG00000013765	PRPF3	100	95.993	Gopherus_agassizii
ENSAPLG00000002440	PRPF3	86	95.528	ENSGGOG00000013174	PRPF3	100	95.528	Gorilla_gorilla
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	73.121	ENSHBUG00000003493	prpf3	99	73.121	Haplochromis_burtoni
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	67.398	ENSHGLG00000016033	-	100	67.398	Heterocephalus_glaber_female
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	94.591	ENSHGLG00000016569	PRPF3	100	94.591	Heterocephalus_glaber_female
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	67.398	ENSHGLG00100008951	-	100	67.398	Heterocephalus_glaber_male
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	94.591	ENSHGLG00100007590	PRPF3	100	94.591	Heterocephalus_glaber_male
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	68.839	ENSHCOG00000014058	prpf3	99	68.839	Hippocampus_comes
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	73.000	ENSIPUG00000000902	PRPF3	99	73.714	Ictalurus_punctatus
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	95.029	ENSSTOG00000001889	PRPF3	100	95.029	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	71.408	ENSKMAG00000001390	prpf3	99	71.550	Kryptolebias_marmoratus
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	71.388	ENSLBEG00000026310	prpf3	99	72.521	Labrus_bergylta
ENSAPLG00000002440	PRPF3	93	82.418	ENSLACG00000010541	PRPF3	100	83.203	Latimeria_chalumnae
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	95.029	ENSLAFG00000004713	PRPF3	100	95.029	Loxodonta_africana
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	95.029	ENSMFAG00000039791	PRPF3	100	95.029	Macaca_fascicularis
ENSAPLG00000002440	PRPF3	90	94.959	ENSMMUG00000016301	PRPF3	98	95.114	Macaca_mulatta
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	95.029	ENSMNEG00000038161	PRPF3	100	95.029	Macaca_nemestrina
ENSAPLG00000002440	PRPF3	99	64.359	ENSMLEG00000041065	-	98	64.212	Mandrillus_leucophaeus
ENSAPLG00000002440	PRPF3	86	95.122	ENSMLEG00000040609	PRPF3	100	95.122	Mandrillus_leucophaeus
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	72.380	ENSMAMG00000014968	prpf3	99	73.229	Mastacembelus_armatus
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	71.067	ENSMZEG00005015970	prpf3	99	71.429	Maylandia_zebra
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	99.854	ENSMGAG00000000707	PRPF3	100	99.854	Meleagris_gallopavo
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	95.029	ENSMAUG00000017112	Prpf3	100	95.029	Mesocricetus_auratus
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	94.737	ENSMICG00000015386	PRPF3	100	94.737	Microcebus_murinus
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	95.029	ENSMOCG00000000242	Prpf3	100	95.029	Microtus_ochrogaster
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	67.898	ENSMMOG00000016131	prpf3	99	68.697	Mola_mola
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	95.468	ENSMODG00000018774	PRPF3	100	95.468	Monodelphis_domestica
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	71.429	ENSMALG00000007257	prpf3	99	72.286	Monopterus_albus
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	94.591	MGP_CAROLIEiJ_G0025354	Prpf3	100	94.591	Mus_caroli
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	94.591	ENSMUSG00000015748	Prpf3	100	94.591	Mus_musculus
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	94.444	MGP_PahariEiJ_G0026798	Prpf3	100	94.444	Mus_pahari
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	94.591	MGP_SPRETEiJ_G0026298	Prpf3	100	94.591	Mus_spretus
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	93.139	ENSMPUG00000005080	PRPF3	100	93.139	Mustela_putorius_furo
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	94.453	ENSMLUG00000004646	-	100	94.453	Myotis_lucifugus
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	95.029	ENSNGAG00000000910	Prpf3	100	95.029	Nannospalax_galili
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	70.909	ENSNBRG00000003462	prpf3	99	71.189	Neolamprologus_brichardi
ENSAPLG00000002440	PRPF3	90	94.959	ENSNLEG00000009841	PRPF3	99	95.114	Nomascus_leucogenys
ENSAPLG00000002440	PRPF3	83	96.460	ENSMEUG00000008733	PRPF3	89	96.460	Notamacropus_eugenii
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	94.737	ENSOPRG00000010139	PRPF3	100	94.737	Ochotona_princeps
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	70.043	ENSODEG00000014412	-	100	70.043	Octodon_degus
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	94.298	ENSODEG00000011363	-	100	94.298	Octodon_degus
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	70.927	ENSONIG00000006394	prpf3	99	71.429	Oreochromis_niloticus
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	64.731	ENSOANG00000015441	PRPF3	100	64.731	Ornithorhynchus_anatinus
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	95.029	ENSOCUG00000011760	PRPF3	100	95.029	Oryctolagus_cuniculus
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	73.219	ENSORLG00000010330	prpf3	99	73.219	Oryzias_latipes
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	73.219	ENSORLG00020009054	prpf3	99	73.219	Oryzias_latipes_hni
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	72.934	ENSORLG00015015016	prpf3	99	72.934	Oryzias_latipes_hsok
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	73.066	ENSOMEG00000000940	prpf3	99	73.209	Oryzias_melastigma
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	89.635	ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	89.635	Otolemur_garnettii
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	95.029	ENSOARG00000020798	PRPF3	100	95.029	Ovis_aries
ENSAPLG00000002440	PRPF3	99	72.741	ENSPPAG00000043769	-	99	72.741	Pan_paniscus
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	94.883	ENSPPAG00000030983	PRPF3	100	94.883	Pan_paniscus
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	95.029	ENSPPRG00000000731	PRPF3	100	95.029	Panthera_pardus
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	95.029	ENSPTIG00000005516	PRPF3	100	95.029	Panthera_tigris_altaica
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	95.029	ENSPTRG00000001254	PRPF3	100	95.029	Pan_troglodytes
ENSAPLG00000002440	PRPF3	99	71.852	ENSPTRG00000047819	-	99	71.852	Pan_troglodytes
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	94.883	ENSPANG00000000499	PRPF3	100	94.883	Papio_anubis
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	74.750	ENSPKIG00000010501	prpf3	99	75.464	Paramormyrops_kingsleyae
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	96.930	ENSPSIG00000014877	PRPF3	100	96.930	Pelodiscus_sinensis
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	66.908	ENSPMGG00000007776	prpf3	99	67.052	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	95.029	ENSPEMG00000011672	Prpf3	100	95.029	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSAPLG00000002440	PRPF3	63	72.146	ENSPMAG00000005588	prpf3	99	70.419	Petromyzon_marinus
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	95.468	ENSPCIG00000008795	PRPF3	100	95.468	Phascolarctos_cinereus
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	72.380	ENSPFOG00000013638	prpf3	99	72.419	Poecilia_formosa
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	72.636	ENSPLAG00000018103	prpf3	99	72.779	Poecilia_latipinna
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	72.350	ENSPMEG00000023546	prpf3	99	72.493	Poecilia_mexicana
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	72.350	ENSPREG00000017216	prpf3	99	72.350	Poecilia_reticulata
ENSAPLG00000002440	PRPF3	75	83.301	ENSPPYG00000018646	-	100	83.301	Pongo_abelii
ENSAPLG00000002440	PRPF3	93	94.654	ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	94.654	Pongo_abelii
ENSAPLG00000002440	PRPF3	87	94.257	ENSPCAG00000014908	PRPF3	87	94.257	Procavia_capensis
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	94.883	ENSPCOG00000013828	PRPF3	100	94.883	Propithecus_coquereli
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	94.444	ENSPVAG00000013472	PRPF3	100	94.444	Pteropus_vampyrus
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	73.121	ENSPNYG00000004279	prpf3	99	73.121	Pundamilia_nyererei
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	73.380	ENSPNAG00000001799	prpf3	99	74.085	Pygocentrus_nattereri
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	94.444	ENSRNOG00000025629	Prpf3	100	94.444	Rattus_norvegicus
ENSAPLG00000002440	PRPF3	83	93.617	ENSRBIG00000028854	PRPF3	98	93.617	Rhinopithecus_bieti
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	95.029	ENSRROG00000027464	PRPF3	100	95.029	Rhinopithecus_roxellana
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	88.158	ENSSBOG00000033104	PRPF3	93	95.745	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	95.036	ENSSHAG00000009548	PRPF3	100	95.036	Sarcophilus_harrisii
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	74.648	ENSSFOG00015022014	prpf3	99	74.648	Scleropages_formosus
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	72.511	ENSSMAG00000015739	prpf3	99	72.651	Scophthalmus_maximus
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	69.054	ENSSDUG00000006840	prpf3	99	70.057	Seriola_dumerili
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	71.469	ENSSLDG00000015423	prpf3	99	72.448	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	95.029	ENSSARG00000011064	PRPF3	100	95.029	Sorex_araneus
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	92.939	ENSSPUG00000000809	PRPF3	100	92.939	Sphenodon_punctatus
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	71.690	ENSSPAG00000018721	prpf3	99	73.475	Stegastes_partitus
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	95.029	ENSSSCG00000030119	PRPF3	100	95.029	Sus_scrofa
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	84.088	ENSTGUG00000004552	PRPF3	100	84.088	Taeniopygia_guttata
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	72.754	ENSTRUG00000014923	prpf3	99	72.754	Takifugu_rubripes
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	73.654	ENSTNIG00000008058	prpf3	100	73.475	Tetraodon_nigroviridis
ENSAPLG00000002440	PRPF3	82	95.833	ENSTBEG00000014072	PRPF3	88	95.833	Tupaia_belangeri
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	89.181	ENSTTRG00000010616	PRPF3	100	89.181	Tursiops_truncatus
ENSAPLG00000002440	PRPF3	80	94.718	ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	94.718	Ursus_americanus
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	95.029	ENSUMAG00000003720	PRPF3	100	95.029	Ursus_maritimus
ENSAPLG00000002440	PRPF3	89	97.024	ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	97.024	Vicugna_pacos
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	95.029	ENSVVUG00000007933	PRPF3	100	95.029	Vulpes_vulpes
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	86.192	ENSXETG00000018654	prpf3	100	86.192	Xenopus_tropicalis
ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	72.350	ENSXMAG00000016347	prpf3	99	72.493	Xiphophorus_maculatus